基因總覽
sulfotransferase family 1C member 4 是由蛋白質編碼基因 SULT1C4 產生的 sulfotransferase,屬於 sulfotransferase 1 家族。此蛋白質以硫酸基轉移反應修飾酚類化合物,底物範圍也包括雌激素類物質與蒽環類抗腫瘤藥物。現有資料指出其家族歸屬與主要受質類型,但未提供胺基酸長度、結構域或更細部的結構特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000272452 ★ | 108,377,954–108,388,989 | 7 |
| ENST00000409309 | 108,377,954–108,388,989 | 5 |
| ENST00000957540 | 108,377,954–108,388,989 | 4 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SULT1C4 催化硫酸基共軛反應,使用 3'-phospho-5'-adenylyl sulfate(PAPS)作為硫酸基供體,將硫酸基轉移至酚類化合物。反應可概括為酚類受質與 PAPS 生成芳基硫酸酯、adenosine 3',5'-bisphosphate 及 H(+),因此其作用是以化學修飾改變底物的形式。
它也可硫酸化雌激素類化合物,但不同底物的相對適合程度並不相同。資料指出,飲食中的黃酮類植物雌激素及環境雌激素(例如 bisphenol A)是比 17beta-estradiol(E2)更好的受質。對 E2 的反應可生成 17beta-estradiol 3-sulfate;對 bisphenol A 的反應則生成 bisphenyl A sulfate,並伴隨 PAPS 轉化為 adenosine 3',5'-bisphosphate 和 H(+)。
SULT1C4 也介導抗腫瘤蒽環類藥物 doxorubicin 及其類似物 epirubicin 的硫酸化。現有資料支持這些化合物可作為其反應底物,但未進一步說明硫酸化對藥物作用或生理結果的影響,因此不宜據此推定其效應方向。
Promoter 與基因調控
>SULT1C4 ENST00000272452 GRCh38 chr2:108376954-108378054 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGTCCCCACATAATGATGGCCCAAGGAACTCGCTTCCTCAATTTTTGCTTAGTTTTACTCATTCATTCTT TCGAGAAATAGAAGAATGCCAGACACTAGGCATACAGCTATCAAACAGTGAGAAAACAACAGGCCCCATT TCATGTGCCTTAGAGTGTAGTGAAGGAGACAGAAAATGCCAACAAGTAAACACGCAAAAACTAACTGTCA ATGGTTGCTCTAAAGGAACACAAAGTGCCATGAGCAAGGAAATAGGAGGGACCTACTTGAGATGACATAG AAAGTCAAAGAAGGCTTCTCCAGAAAGGGGGCATCAAAGCTGGGACACGAAGAAAGAGAATCAGACAGCC AGACACACAAGAGCCGACAAGATCTCCAGAAGGAGTGCTGCCATGGGGAGCAAGTGTGGCATGGCCCTGG GGTGCAGGCCAGGCCGGGGGCAGGGACTGAAGCAAGTTGTGAAATTTCTGATTATCAGGGGCAGAATGGA TTCCTAAGGCAGCCACTGTCTTCTGTTAACTCTGGAGTTTTCTGCATCCCTTTTGCTTTAAATGAGGCAT ACATGTTTTCATAGCTGTGATGAAACCCCTACAATTCTCCAGTTTAGCATTATTTATTTTACTCTTAAAA AATAACAAAGCTGACCCTGGCAGATGTTTGTACTGGGAGATTCAGATCCATCCAGGCCCCCACTGTTAAT AGCCCACGGGAAAGTCCCTGCAGTCTCTCAGGGAAGTCATTCTGTGTAGAATCTGTAATTTCACAGGCAA GTCCTGCAACTTTTTAATTGTTTAAAATTCCCAGAAGGAATAATTACTGAAATTATCTATGAAGGGTTTA ATGGACACAGACATGAGAGCTATAAACAATGTGATACTATGTCCTGTTAACTCACAGAGAACGGAAGGGC TGGAACGGGACCCAGCCAGCAGGGTTTGTGACCGCCTCTGCTGTGACGTCACAGCCTGGTGAGGAGGGGG CTGCAGTTCCTCAGGAAACTGCCAGTGGACAAATTCATAAACAAGAGCTCCAGTTCCCTGGAACCTGAGT CGGGAGACCTGCAGCTCACTTTCTCCCTGTTTGCTGGCCAGCAGGGTTTGT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SULT1C4_1 ↗ | 2:108,377,970 | 正股 | 108,377,921–108,377,980 |
| SULT1C4_2 ↗ | 2:108,378,147 | 正股 | 108,378,098–108,378,157 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR2_BRHPM · promoter · 108377464–108378195 · regulatory
· motif · 108376821–108376836 · motif
· motif · 108376984–108376997 · motif
蛋白質結構域與序列
蛋白質三維結構
細胞內定位
SULT1C4 被註解位於細胞質與胞質溶膠。 現有資料未指出定位會隨條件或異構型而改變。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SULT1C4 使用 3'-phospho-5'-adenylyl sulfate(PAPS)作為硫酸基供體,催化酚類化合物的硫酸基共軛。它也能硫酸化雌激素類物質;相較於 17beta-estradiol(E2),飲食中的黃酮類植物雌激素及環境雌激素 bisphenol A 是較佳受質。此外,SULT1C4 介導抗腫瘤蒽環類藥物 doxorubicin 及其類似物 epirubicin 的硫酸化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Sulfotransferase that utilizes 3'-phospho-5'-adenylyl sulfate (PAPS) as sulfonate donor to catalyze the sulfate conjugation of phenolic compounds. Can also sulfonate estrogenic compounds, however, the dietary flavonoids (phytoestrogen) and environmental estrogens, like bisphenol A are better substrates than 17beta-estradiol (E2). Mediates the sulfation of doxorubicin and its analog epirubicin, two antitumor anthracyclines PMID 17425406 ↗ · PMID 26948952 ↗ · PMID 28222028 ↗ · PMID 9852044 ↗ |
| 分子活性 | a phenol + 3'-phosphoadenylyl sulfate = an aryl sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源a phenol + 3'-phosphoadenylyl sulfate = an aryl sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) PMID 17425406 ↗ · PMID 26948952 ↗ · PMID 28222028 ↗ · PMID 9852044 ↗ |
| 分子活性 | 17beta-estradiol + 3'-phosphoadenylyl sulfate = 17beta-estradiol 3-sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源17beta-estradiol + 3'-phosphoadenylyl sulfate = 17beta-estradiol 3-sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) PMID 28222028 ↗ |
| 分子活性 | bisphenol A + 3'-phosphoadenylyl sulfate = bisphenyl A sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源bisphenol A + 3'-phosphoadenylyl sulfate = bisphenyl A sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) PMID 28222028 ↗ |
| 細胞定位 | SULT1C4 的定位註解為細胞質及胞質溶膠。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCCAGTGGACAAATTCATAAACAAGAGCTCCAGTTCCCTG40GAACCTGAGTCGGGAGACCTGCAGCTCACTTTCTCCCTGT80TTGCTGGCCAGCAGGGTTTGTGGCCGCCTCTGCTGTGACG120CCACAGCCTGGTGAGGAGGGGGCTGCAGTTCCTCAGGAAA160CTGCCAGTGGACAAAGTCATAAACAAGAGTTCCAGTTCCC200TGGAACCTGAGTCGGGAGGCCTGCAACTCACTTTCTCCCT240GTTTGCTGGCCCAGACAGGCCTGTGCTAGAGGGCTGGATA280GTGTGGTAGTGTGGTGGATAGAGTGCTGCCTCTATCCACA320ACGCAGCCATATGCTGACTGAAGATAACTTTGTGTCTGGA360AGAGCCCTCTGATTTCTTACACTAATGGCCTTACACGACA400TGGAGGATTTTACATTTGATGGAACAAAGCGCTTAAGTGT440CAACTACGTGAAGGGAATTCTTCAACCGACAGACACCTGT480GACATCTGGGATAAGATCTGGAACTTCCAAGCCAAGCCTG520ATGACCTGCTTATTTCTACCTATCCTAAAGCAGGAACAAC560ATGGACTCAGGAGATAGTGGAATTAATACAAAATGAAGGT600GATGTGGAGAAAAGTAAACGGGCACCGACTCATCAACGAT640TTCCTTTCCTCGAAATGAAAATCCCATCCTTAGGATCTGG680TTTGGAACAAGCTCATGCAATGCCCTCACCACGGATCCTG720AAAACACATCTTCCCTTTCACTTGCTGCCACCATCCTTGC760TAGAGAAAAACTGTAAGATAATCTATGTAGCAAGAAATCC800CAAGGACAACATGGTGTCCTATTACCATTTCCAAAGAATG840AATAAAGCTCTTCCTGCTCCAGGAACATGGGAAGAGTATT880TTGAGACTTTTCTGGCTGGGAAAGTGTGCTGGGGCTCCTG920GCATGAACATGTGAAAGGATGGTGGGAAGCCAAAGACAAA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。