演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SULT1C4SULT1C

sulfotransferase family 1C member 4

SULT1C4 是一種 sulfotransferase,使用 PAPS 作為硫酸基供體,可修飾多種酚類化合物;其底物包括植物雌激素、環境雌激素及部分抗腫瘤藥物。

Homo sapiens2q12.3UniProt O75897
OFFICIAL SYMBOL
SULT1C4
CHROMOSOME
2
UNIPROT
O75897
PDB / ALPHAFOLD
2AD1
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

sulfotransferase family 1C member 4 是由蛋白質編碼基因 SULT1C4 產生的 sulfotransferase,屬於 sulfotransferase 1 家族。此蛋白質以硫酸基轉移反應修飾酚類化合物,底物範圍也包括雌激素類物質與蒽環類抗腫瘤藥物。現有資料指出其家族歸屬與主要受質類型,但未提供胺基酸長度、結構域或更細部的結構特徵。

Official symbol
SULT1C4
Gene name
sulfotransferase family 1C member 4
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11457
UniProt
O75897
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SULT1CSULT1C2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 22q12.3
chr2 · 242,193,529 bp · GRCh38chr2p25.3 · 1–4400000 · gnegchr2p25.2 · 4400001–6900000 · gpos50chr2p25.1 · 6900001–12000000 · gnegchr2p24.3 · 12000001–16500000 · gpos75chr2p24.2 · 16500001–19000000 · gnegchr2p24.1 · 19000001–23800000 · gpos75chr2p23.3 · 23800001–27700000 · gnegchr2p23.2 · 27700001–29800000 · gpos25chr2p23.1 · 29800001–31800000 · gnegchr2p22.3 · 31800001–36300000 · gpos75chr2p22.2 · 36300001–38300000 · gnegchr2p22.1 · 38300001–41500000 · gpos50chr2p21 · 41500001–47500000 · gnegchr2p16.3 · 47500001–52600000 · gpos100chr2p16.2 · 52600001–54700000 · gnegchr2p16.1 · 54700001–61000000 · gpos100chr2p15 · 61000001–63900000 · gnegchr2p14 · 63900001–68400000 · gpos50chr2p13.3 · 68400001–71300000 · gnegchr2p13.2 · 71300001–73300000 · gpos50chr2p13.1 · 73300001–74800000 · gnegchr2p12 · 74800001–83100000 · gpos100chr2p11.2 · 83100001–91800000 · gnegchr2p11.1 · 91800001–93900000 · acenchr2q11.1 · 93900001–96000000 · acenchr2q11.2 · 96000001–102100000 · gnegchr2q12.1 · 102100001–105300000 · gpos50chr2q12.2 · 105300001–106700000 · gnegchr2q12.3 · 106700001–108700000 · gpos25chr2q13 · 108700001–112200000 · gnegchr2q14.1 · 112200001–118100000 · gpos50chr2q14.2 · 118100001–121600000 · gnegchr2q14.3 · 121600001–129100000 · gpos50chr2q21.1 · 129100001–131700000 · gnegchr2q21.2 · 131700001–134300000 · gpos25chr2q21.3 · 134300001–136100000 · gnegchr2q22.1 · 136100001–141500000 · gpos100chr2q22.2 · 141500001–143400000 · gnegchr2q22.3 · 143400001–147900000 · gpos100chr2q23.1 · 147900001–149000000 · gnegchr2q23.2 · 149000001–149600000 · gpos25chr2q23.3 · 149600001–154000000 · gnegchr2q24.1 · 154000001–158900000 · gpos75chr2q24.2 · 158900001–162900000 · gnegchr2q24.3 · 162900001–168900000 · gpos75chr2q31.1 · 168900001–177100000 · gnegchr2q31.2 · 177100001–179700000 · gpos50chr2q31.3 · 179700001–182100000 · gnegchr2q32.1 · 182100001–188500000 · gpos75chr2q32.2 · 188500001–191100000 · gnegchr2q32.3 · 191100001–196600000 · gpos75chr2q33.1 · 196600001–202500000 · gnegchr2q33.2 · 202500001–204100000 · gpos50chr2q33.3 · 204100001–208200000 · gnegchr2q34 · 208200001–214500000 · gpos100chr2q35 · 214500001–220700000 · gnegchr2q36.1 · 220700001–224300000 · gpos75chr2q36.2 · 224300001–225200000 · gnegchr2q36.3 · 225200001–230100000 · gpos100chr2q37.1 · 230100001–234700000 · gnegchr2q37.2 · 234700001–236400000 · gpos50chr2q37.3 · 236400001–242193529 · gnegSULT1C4pq1 bp242,193,529 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr2:108,377,911–108,388,990
Gene span
11,080 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000272452 ★108,377,954–108,388,9897
ENST00000409309108,377,954–108,388,9895
ENST00000957540108,377,954–108,388,9894

顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SULT1C4 催化硫酸基共軛反應,使用 3'-phospho-5'-adenylyl sulfate(PAPS)作為硫酸基供體,將硫酸基轉移至酚類化合物。反應可概括為酚類受質與 PAPS 生成芳基硫酸酯、adenosine 3',5'-bisphosphate 及 H(+),因此其作用是以化學修飾改變底物的形式。

它也可硫酸化雌激素類化合物,但不同底物的相對適合程度並不相同。資料指出,飲食中的黃酮類植物雌激素及環境雌激素(例如 bisphenol A)是比 17beta-estradiol(E2)更好的受質。對 E2 的反應可生成 17beta-estradiol 3-sulfate;對 bisphenol A 的反應則生成 bisphenyl A sulfate,並伴隨 PAPS 轉化為 adenosine 3',5'-bisphosphate 和 H(+)。

SULT1C4 也介導抗腫瘤蒽環類藥物 doxorubicin 及其類似物 epirubicin 的硫酸化。現有資料支持這些化合物可作為其反應底物,但未進一步說明硫酸化對藥物作用或生理結果的影響,因此不宜據此推定其效應方向。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 108377954 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SULT1C4 ENST00000272452 GRCh38 chr2:108376954-108378054 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGTCCCCACATAATGATGGCCCAAGGAACTCGCTTCCTCAATTTTTGCTTAGTTTTACTCATTCATTCTT
TCGAGAAATAGAAGAATGCCAGACACTAGGCATACAGCTATCAAACAGTGAGAAAACAACAGGCCCCATT
TCATGTGCCTTAGAGTGTAGTGAAGGAGACAGAAAATGCCAACAAGTAAACACGCAAAAACTAACTGTCA
ATGGTTGCTCTAAAGGAACACAAAGTGCCATGAGCAAGGAAATAGGAGGGACCTACTTGAGATGACATAG
AAAGTCAAAGAAGGCTTCTCCAGAAAGGGGGCATCAAAGCTGGGACACGAAGAAAGAGAATCAGACAGCC
AGACACACAAGAGCCGACAAGATCTCCAGAAGGAGTGCTGCCATGGGGAGCAAGTGTGGCATGGCCCTGG
GGTGCAGGCCAGGCCGGGGGCAGGGACTGAAGCAAGTTGTGAAATTTCTGATTATCAGGGGCAGAATGGA
TTCCTAAGGCAGCCACTGTCTTCTGTTAACTCTGGAGTTTTCTGCATCCCTTTTGCTTTAAATGAGGCAT
ACATGTTTTCATAGCTGTGATGAAACCCCTACAATTCTCCAGTTTAGCATTATTTATTTTACTCTTAAAA
AATAACAAAGCTGACCCTGGCAGATGTTTGTACTGGGAGATTCAGATCCATCCAGGCCCCCACTGTTAAT
AGCCCACGGGAAAGTCCCTGCAGTCTCTCAGGGAAGTCATTCTGTGTAGAATCTGTAATTTCACAGGCAA
GTCCTGCAACTTTTTAATTGTTTAAAATTCCCAGAAGGAATAATTACTGAAATTATCTATGAAGGGTTTA
ATGGACACAGACATGAGAGCTATAAACAATGTGATACTATGTCCTGTTAACTCACAGAGAACGGAAGGGC
TGGAACGGGACCCAGCCAGCAGGGTTTGTGACCGCCTCTGCTGTGACGTCACAGCCTGGTGAGGAGGGGG
CTGCAGTTCCTCAGGAAACTGCCAGTGGACAAATTCATAAACAAGAGCTCCAGTTCCCTGGAACCTGAGT
CGGGAGACCTGCAGCTCACTTTCTCCCTGTTTGCTGGCCAGCAGGGTTTGT
SULT1C4 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SULT1C4_1 ↗2:108,377,970正股108,377,921–108,377,980
SULT1C4_2 ↗2:108,378,147正股108,378,098–108,378,157

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR2_BRHPM · promoter · 108377464–108378195 · regulatory

· motif · 108376821–108376836 · motif

· motif · 108376984–108376997 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:302 aa

SULT1C4 屬於 sulfotransferase 1 家族。現有蛋白質註解未提供其結構域、特定功能區域或序列特徵的細節。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2AD1…

PDB · 2AD1

X-ray · 2.00 A · A=7-302

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytosol

SULT1C4 被註解位於細胞質與胞質溶膠。 現有資料未指出定位會隨條件或異構型而改變。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SULT1CSULT1C4
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SULT1C4 使用 3'-phospho-5'-adenylyl sulfate(PAPS)作為硫酸基供體,催化酚類化合物的硫酸基共軛。它也能硫酸化雌激素類物質;相較於 17beta-estradiol(E2),飲食中的黃酮類植物雌激素及環境雌激素 bisphenol A 是較佳受質。此外,SULT1C4 介導抗腫瘤蒽環類藥物 doxorubicin 及其類似物 epirubicin 的硫酸化。含實驗來源
證據與來源

Sulfotransferase that utilizes 3'-phospho-5'-adenylyl sulfate (PAPS) as sulfonate donor to catalyze the sulfate conjugation of phenolic compounds. Can also sulfonate estrogenic compounds, however, the dietary flavonoids (phytoestrogen) and environmental estrogens, like bisphenol A are better substrates than 17beta-estradiol (E2). Mediates the sulfation of doxorubicin and its analog epirubicin, two antitumor anthracyclines

PMID 17425406 ↗ · PMID 26948952 ↗ · PMID 28222028 ↗ · PMID 9852044 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性a phenol + 3'-phosphoadenylyl sulfate = an aryl sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+)含實驗來源
證據與來源

a phenol + 3'-phosphoadenylyl sulfate = an aryl sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+)

PMID 17425406 ↗ · PMID 26948952 ↗ · PMID 28222028 ↗ · PMID 9852044 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性17beta-estradiol + 3'-phosphoadenylyl sulfate = 17beta-estradiol 3-sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+)含實驗來源
證據與來源

17beta-estradiol + 3'-phosphoadenylyl sulfate = 17beta-estradiol 3-sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+)

PMID 28222028 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性bisphenol A + 3'-phosphoadenylyl sulfate = bisphenyl A sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+)含實驗來源
證據與來源

bisphenol A + 3'-phosphoadenylyl sulfate = bisphenyl A sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+)

PMID 28222028 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SULT1C4 的定位註解為細胞質及胞質溶膠。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm, cytosol

PMID 28222028 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000272452 · 2,850 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCCAGTGGACAAATTCATAAACAAGAGCTCCAGTTCCCTG40
41GAACCTGAGTCGGGAGACCTGCAGCTCACTTTCTCCCTGT80
81TTGCTGGCCAGCAGGGTTTGTGGCCGCCTCTGCTGTGACG120
121CCACAGCCTGGTGAGGAGGGGGCTGCAGTTCCTCAGGAAA160
161CTGCCAGTGGACAAAGTCATAAACAAGAGTTCCAGTTCCC200
201TGGAACCTGAGTCGGGAGGCCTGCAACTCACTTTCTCCCT240
241GTTTGCTGGCCCAGACAGGCCTGTGCTAGAGGGCTGGATA280
281GTGTGGTAGTGTGGTGGATAGAGTGCTGCCTCTATCCACA320
321ACGCAGCCATATGCTGACTGAAGATAACTTTGTGTCTGGA360
361AGAGCCCTCTGATTTCTTACACTAATGGCCTTACACGACA400
401TGGAGGATTTTACATTTGATGGAACAAAGCGCTTAAGTGT440
441CAACTACGTGAAGGGAATTCTTCAACCGACAGACACCTGT480
481GACATCTGGGATAAGATCTGGAACTTCCAAGCCAAGCCTG520
521ATGACCTGCTTATTTCTACCTATCCTAAAGCAGGAACAAC560
561ATGGACTCAGGAGATAGTGGAATTAATACAAAATGAAGGT600
601GATGTGGAGAAAAGTAAACGGGCACCGACTCATCAACGAT640
641TTCCTTTCCTCGAAATGAAAATCCCATCCTTAGGATCTGG680
681TTTGGAACAAGCTCATGCAATGCCCTCACCACGGATCCTG720
721AAAACACATCTTCCCTTTCACTTGCTGCCACCATCCTTGC760
761TAGAGAAAAACTGTAAGATAATCTATGTAGCAAGAAATCC800
801CAAGGACAACATGGTGTCCTATTACCATTTCCAAAGAATG840
841AATAAAGCTCTTCCTGCTCCAGGAACATGGGAAGAGTATT880
881TTGAGACTTTTCTGGCTGGGAAAGTGTGCTGGGGCTCCTG920
921GCATGAACATGTGAAAGGATGGTGGGAAGCCAAAGACAAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。