基因總覽
SULT1C2 是一個蛋白質編碼基因,其產物正式名稱為 sulfotransferase family 1C member 2,歸屬於 sulfotransferase 1 家族。此蛋白質具有硫酸轉移酶活性,主要角色是催化酚類化合物的硫酸化;其反應使用 3'-phospho-5'-adenylyl sulfate(PAPS)作為硫酸基供體。來源亦指出,該酵素對不同受質具有選擇性,並非所有類似化合物都會接受其硫酸轉移作用。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000251481 ★ | 108,288,895–108,309,915 | 8 |
| ENST00000326853 | 108,288,639–108,310,568 | 9 |
| ENST00000409880 | 108,288,639–108,310,568 | 7 |
| ENST00000437390 | 108,288,639–108,310,568 | 8 |
| ENST00000900823 | 108,288,639–108,310,568 | 8 |
| ENST00000939529 | 108,288,639–108,310,568 | 9 |
| ENST00000947596 | 108,288,639–108,310,568 | 9 |
| ENST00001140334 | 108,288,639–108,310,568 | 8 |
| ENST00000438339 | 108,288,906–108,304,650 | 5 |
| ENST00000409067 | 108,293,679–108,308,693 | 6 |
顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SULT1C2 利用 3'-phospho-5'-adenylyl sulfate(PAPS)提供硫酸基,催化酚類化合物形成硫酸結合物;反應同時產生 adenosine 3',5'-bisphosphate 與 H⁺。這項活性有受質選擇性:來源指出,該酵素不會將硫酸基轉移至類固醇、dopamine、acetaminophen 或 alpha-naphthol。
在粒線體中,SULT1C2 也可催化 cholesterol 硫酸化,生成 cholesterol sulfate。依相似性推定,這項反應會改變粒線體膜的組織,並影響蛋白質複合體的移動性;相關變化可增加 state-III respiration,進而調節粒線體呼吸。此部分的功能敘述屬於相似性推論。
SULT1C2 亦可催化致癌物 N-hydroxy-2-acetylaminofluorene 的硫酸化,形成反應性很高的中間產物。這些中間產物能形成 DNA 加合物,並可能造成致突變作用;來源描述的是潛在後果,並未將其表述為必然結果。
Promoter 與基因調控
>SULT1C2 ENST00000251481 GRCh38 chr2:108287895-108288995 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGAGCCAAGATTGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGGAGTGAAACACCATCTCAAAAAAAAAAAA AAAAAGAAAAAAGAAAGAAAAAGAAAGTTCAATTTATTGGGAAAAAAAGAGCCCTTTGGAAACAAGGAGG AAGAAGAAGTGTCGGCAAAGAAGCATTAGGAGGTTCAGGGTCAAAGAAGACAAGGAAAGCTTTGGCAAGA AGGGCAGATGGGGTGCAGAATTATGCTTCAATTCCAGAAAGGAAAGCACTGGGGTAGATACAAGGTTGGG GCTGGCAGAAGAGTAGCAGTTCAGAGATCATTAACACTTGATCCATTTAATTTCCCAGGTAACCAAAGAC ACCATGGAATATAATCTGCCTCCACTAAAGTGTACCTTTTGTACAATAAGGCAAAGAAAAAATAAGTACA CACCTAAGCTCTAGACTTTTGTTCTATCCTCTCTGCATTTTCGGTGTGGATGAATACAACTTGGGAAGAA AGGAAAGAAGAACCAGCAGTTTTAAGCACTTACTATTTGCTCTGCAAAGTGTATTCATCAACATTGTTGC TTTCAATCTTAAAGCATGGATTGGAGACAGGCAGTATTACCCACACTTCATAGATGCAGAAATTAAATCT CAGGCTAAGGAGGAAGGAAAAGGGAGTTCACCAAATAAGCAGGAGCCTACCTGAAGCCTGATGCATCTGG TCCTAGAGCCAACCTTCCATTTCCCCCCAGCCCCCACCTGTTTAAGCTTCGAGGCCAGTGGGAGGAGGGA GGGGCCAGGCAGCTGAGGGCCAGGAAAGATGTGAAAAACTCTAGCTGGTGACCGAGAGGAGGAGTAGAGT GTGCCCTTAGTTCATATGAACTAGAGGGAGTTGGTATTTGCACAGCAGTCAGGGTCACATGAGTGATCAT GGTACAGTGAGAAGTTCTCCCTCCCAGGGCCAGGTCACAGGGTTTGTTTCTGTTCAATCCGGATTCTTCC AGTAAAAGCTTCAACTTCCCACACTGAAGCTGAGAGCCTCCCAAAGTGCTGGCTACCTGCTGAGCGCCCC CGTAACTCTGACACAGTAGTAATTTGAGCCTCTGCAATTGCCGTCTGCTTC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SULT1C2_1 ↗ | 2:108,288,895 | 正股 | 108,288,846–108,288,905 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR2_93KZHJ · promoter · 108288540–108288925 · regulatory
ENSR2_5XGP2N · CTCF_binding_site · 108288712–108288733 · regulatory
ENSR2_856Z28 · enhancer · 108288926–108289090 · regulatory
· motif · 108285205–108285215 · motif
· motif · 108287361–108287370 · motif
· motif · 108287361–108287370 · motif
· motif · 108288714–108288730 · motif
蛋白質結構域與序列
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 SULT1C2 標示於細胞質、溶酶體與粒線體。 這些定位資訊的證據為相似性推定;來源未提供不同異構型或定位變化條件的說明。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- TINF2Q9BSI4 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SULT1C2 使用 PAPS 催化酚類化合物的硫酸化,但不會將硫酸基轉移至類固醇、dopamine、acetaminophen 或 alpha-naphthol。在粒線體中,依相似性推定,它可使 cholesterol 形成 cholesterol sulfate,改變膜組織與蛋白質複合體移動性,增加 state-III respiration,從而調節粒線體呼吸。此外,它可硫酸化致癌物 N-hydroxy-2-acetylaminofluorene,產生能形成 DNA 加合物並可能導致致突變作用的高反應性中間產物。 | 含實驗來源 | 證據與來源Sulfotransferase that utilizes 3'-phospho-5'-adenylyl sulfate (PAPS) to catalyze the sulfate conjugation of phenolic compounds. Does not transfer sulfate to steroids, dopamine, acetaminophen, or alpha-naphthol. Except in mitochondria, where it can add sulfate to cholesterol producing cholesterol sulfate, which alters mitochondrial membrane organization, and impacts protein complex mobility increasing state-III respiration, thereby modulating mitochondrial respiration (By similarity). Catalyzes the sulfation of the carcinogenic N-hydroxy-2-acetylaminofluorene leading to highly reactive intermediates capable of forming DNA adducts, potentially resulting in mutagenesis PMID 10481272 ↗ · PMID 10783263 ↗ · PMID 9852044 ↗ |
| 分子活性 | a phenol + 3'-phosphoadenylyl sulfate = an aryl sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源a phenol + 3'-phosphoadenylyl sulfate = an aryl sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) PMID 10481272 ↗ · PMID 10783263 ↗ · PMID 9852044 ↗ |
| 分子活性 | cholesterol + 3'-phosphoadenylyl sulfate = cholesterol sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) | 推論支持 | 證據與來源cholesterol + 3'-phosphoadenylyl sulfate = cholesterol sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) |
| 細胞定位 | 資料將 SULT1C2 標示於細胞質、溶酶體與粒線體;這些定位資訊依相似性推定,未提供定位改變條件或異構型差異。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
ACACTGAAGCTGAGAGCCTCCCAAAGTGCTGGCTACCTGC40TGAGCGCCCCCGTAACTCTGACACAGTAGTAATTTGAGCC80TCTGCAATTGCCGTCTGCTTCCTGTGAAAGTCCTTTCCGT120GCCCACTGACCCTTGAGTGGGCCTTTGAGCTGCTGACTTT160CAGCTGGAACTTGAAGGGACCCCAACCCTGAGACACTATG200GCCCTGACCTCAGACCTGGGGAAACAGATAAAACTGAAAG240AGGTGGAGGGGACCCTCCTGCAGCCTGCAACTGTGGACAA280CTGGAGCCAGATCCAGAGCTTCGAGGCCAAACCAGATGAT320CTCCTCATCTGCACCTACCCTAAAGCAGGGACAACGTGGA360TTCAGGAAATTGTGGATATGATTGAACAGAATGGGGACGT400GGAGAAGTGCCAGCGAGCCATCATCCAACACCGCCATCCT440TTCATTGAGTGGGCTCGGCCACCCCAACCTTCTGGTGTGG480AAAAAGCCAAAGCAATGCCCTCTCCACGGATACTAAAGAC520TCACCTTTCCACTCAGCTGCTGCCACCGTCTTTCTGGGAA560AACAACTGCAAGTTCCTTTATGTAGCTCGAAATGCCAAAG600ACTGTATGGTTTCCTACTACCATTTCCAAAGGATGAACCA640CATGCTTCCTGACCCTGGTACCTGGGAAGAGTATTTTGAA680ACCTTCATCAATGGAAAAGTGGTTTGGGGTTCCTGGTTTG720ACCACGTGAAAGGATGGTGGGAGATGAAAGACAGACACCA760GATTCTCTTCCTCTTCTATGAGGACATAAAGAGGGACCCA800AAGCATGAAATTCGGAAGGTGATGCAGTTCATGGGAAAGA840AGGTGGATGAAACAGTGCTAGATAAAATTGTCCAGGAGAC880GTCATTTGAGAAAATGAAAGAAAATCCCATGACAAATCGT920TCTACAGTTTCCAAATCTATCTTGGACCAGTCAATTTCCT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。