基因總覽
SULT1A3 是蛋白質編碼基因,產物屬於 sulfotransferase 1 家族。sulfotransferase family 1A member 3 以 3'-phospho-5'-adenylyl sulfate(PAPS)作為硫酸基供體,能作用於多類酚性分子。其底物涵蓋神經傳導物質、酚類與兒茶酚類藥物,以及甲狀腺素類分子。這些基本特性界定了其作為硫酸轉移酶家族成員的分子類別與底物範圍。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000338971 ★ | 30,199,255–30,204,310 | 8 |
| ENST00000857355 | 30,198,059–30,204,324 | 6 |
| ENST00000960950 | 30,198,059–30,204,324 | 7 |
| ENST00000960951 | 30,198,084–30,204,324 | 8 |
| ENST00000960952 | 30,199,215–30,204,324 | 8 |
| ENST00000857351 | 30,199,255–30,204,324 | 8 |
| ENST00001132802 | 30,199,255–30,204,324 | 8 |
| ENST00000857352 | 30,199,678–30,204,324 | 8 |
| ENST00000395138 | 30,199,860–30,204,324 | 8 |
| ENST00000857353 | 30,199,879–30,204,324 | 8 |
| ENST00000857354 | 30,199,888–30,204,324 | 8 |
| ENST00000563322 | 30,200,729–30,203,920 | 7 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SULT1A3 的酵素功能是把硫酸基轉移至受質,反應使用 PAPS 作為供體,並形成硫酸化產物。它可催化酚性單胺的硫酸化,包括 dopamine、(R)-adrenaline、(R)-noradrenaline 與 serotonin;來源也指出其可作用於酚類及兒茶酚類藥物。以 dopamine 為例,硫酸化可發生在 3-O 或 4-O 位置;serotonin 形成 O-sulfate,而兩種兒茶酚胺分別可形成 4'-O-sulfate。
此酵素也催化甲狀腺素類分子的硫酸化,受質包括 T4、T3、rT3 與 3,3'-T2。其受質偏好順序為 3,3'-T2 > rT3 > T3 > T4,顯示這些相近分子並非同等受質。反應產物為相應的硫酸化分子,並伴隨 adenosine 3',5'-bisphosphate 生成;不同受質的硫酸化反應均使用 PAPS。
因此,來源所支持的功能範圍包括多種單胺及甲狀腺素類分子的硫酸化。資料未進一步說明這些反應在特定生理條件下的調控方式或整體生理後果,故不據此推定其對神經傳導或甲狀腺素作用的影響。
Promoter 與基因調控
>SULT1A3 ENST00000338971 GRCh38 chr16:30198255-30199355 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGGGTTTCACCATGTTGGCCAGCTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCTGCTGCATCGACCTCC CAAAGTACTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCTCAGCCTCTTTCTTGTTCTATATGTCCATGCTCTG CTCCACTTCTGCCCCTTCACTCTGCCCCCACACATCACTCCAGACTGGCCTTGTGGTCAGAGCCTGGAAT GCCTGGGCTGCTGGGGGCCTGTGGACTGCACTGGGCCAGAACCCCTGCCGCCTTCAAGACTGGCCTGTAG CCAGCAGGTAGGTGACTTTTCCCAGGCCGGCCTATCCCACCTTTCCCCTCCACTCACTCACCTCCCTTGC CTGGGTCAATTAGAGAAAGCTTGTCGGCCAGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAG GCCGAGGCGGGCGGATCATCTGAGCTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCCGTCT CTACTAAAAATACAAAAATTAACCGGATGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGA GGCAGAAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGGGGAGGTTACAGTGAGCGGAGATCGTGCTACTGCATTGCAGC CTGGGCGAGAGAGCGAGTCTCCATCTCATATAAAAAAAAGAAAAAGAAAGAAAGAAAGCTTGTCTGTTGG CCTGCCCTGCAGGGTGGAGTTCAGAGGGAAGGTCAGGAGCCTAGTGACAGCTCAAAAAAAAAAAAACCCA AATACCAATGTTGGCCCCTTTTGCCTTTCATTCATGTGTTTTCTATACACTAAACTCACATATTGGGTTT GCAGATCACTCCAAGCTTGGCTGGAGCTGTGGTGGTAAGGAGGGTAATAGAGAAGCTTCCCCACCCTCAA CCCCACCCCTTCCTTCCTGGAGTTCCCAGCCCTGACTTTAGATCCCTCCCACACTGGACCTTCAAAACCC TCAGGGCAGAGAGCAGCCCTACACTCCCTACACCACACCCATACTCAGCCCCTGCAGGCAAGGAGAGAAC AGGTCAGGTTCCCGAGAGCTCAGGTGAGTGACACGTTGGAATGGCCCAGGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SULT1A3_1 ↗ | 16:30,199,255 | 正股 | 30,199,206–30,199,265 |
| SULT1A3_2 ↗ | 16:30,199,853 | 正股 | 30,199,804–30,199,863 |
| SULT1A3_3 ↗ | 16:30,200,780 | 正股 | 30,200,731–30,200,790 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR16_8TZ6L · promoter · 30194296–30194443 · regulatory
ENSR16_9FZM6 · promoter · 30198886–30199265 · regulatory
ENSR16_9FZMB · promoter · 30199370–30199870 · regulatory
ENSR16_B7ZS8 · enhancer · 30199871–30200421 · regulatory
· motif · 30195466–30195482 · motif
· motif · 30197156–30197165 · motif
· motif · 30197156–30197165 · motif
· motif · 30198766–30198775 · motif
· motif · 30199592–30199606 · motif
· motif · 30199797–30199811 · motif
· motif · 30199797–30199811 · motif
· motif · 30199800–30199808 · motif
· motif · 30199854–30199863 · motif
· motif · 30199944–30199960 · motif
· motif · 30199944–30199960 · motif
· motif · 30200081–30200095 · motif
· motif · 30200081–30200095 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:295 aa
sulfotransferase family 1A member 3 屬於 sulfotransferase 1 家族。來源未提供其結構域、胺基酸序列特徵或其他蛋白質區域註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
sulfotransferase family 1A member 3 定位於細胞質。 來源未提供定位變化條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
sulfotransferase family 1A member 3 可形成同源二聚體(Homodimer)。來源未列出其他結合夥伴或複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 14 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SULT1A3 使用 PAPS 作為硫酸基供體,可催化 dopamine、(R)-adrenaline、(R)-noradrenaline、serotonin 等酚性單胺,以及酚類和兒茶酚類藥物的硫酸化;也作用於 T4、T3、rT3 與 3,3'-T2,偏好順序為 3,3'-T2 > rT3 > T3 > T4。 | 含實驗來源 | 證據與來源Sulfotransferase that utilizes 3'-phospho-5'-adenylyl sulfate (PAPS) as sulfonate donor to catalyze the sulfate conjugation of phenolic monoamines (neurotransmitters such as dopamine, (R)-adrenaline/epinephrine, (R)-noradrenaline/norepinephrine and serotonin) and phenolic and catechol drugs. Catalyzes the sulfation of T4 (L-thyroxine/3,5,3',5'-tetraiodothyronine), T3 (3,5,3'-triiodothyronine), rT3 (3,3',5'-triiodothyronine) and 3,3'-T2 (3,3'-diiodothyronine), with a substrate preference of 3,3'-T2 > rT3 > T3 > T4 PMID 10199779 ↗ · PMID 14622112 ↗ · PMID 15358107 ↗ · PMID 29524394 ↗ · PMID 8093002 ↗ |
| 分子活性 | a phenol + 3'-phosphoadenylyl sulfate = an aryl sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源a phenol + 3'-phosphoadenylyl sulfate = an aryl sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) PMID 8093002 ↗ |
| 分子活性 | 4-nitrophenol + 3'-phosphoadenylyl sulfate = 4-nitrophenyl sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate | 含實驗來源 | 證據與來源4-nitrophenol + 3'-phosphoadenylyl sulfate = 4-nitrophenyl sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate PMID 8093002 ↗ |
| 分子活性 | dopamine + 3'-phosphoadenylyl sulfate = dopamine 3-O-sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源dopamine + 3'-phosphoadenylyl sulfate = dopamine 3-O-sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) PMID 14622112 ↗ · PMID 15358107 ↗ · PMID 29524394 ↗ · PMID 8093002 ↗ |
| 分子活性 | dopamine + 3'-phosphoadenylyl sulfate = dopamine 4-O-sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源dopamine + 3'-phosphoadenylyl sulfate = dopamine 4-O-sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) PMID 14622112 ↗ · PMID 15358107 ↗ · PMID 29524394 ↗ · PMID 8093002 ↗ |
| 分子活性 | serotonin + 3'-phosphoadenylyl sulfate = serotonin O-sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源serotonin + 3'-phosphoadenylyl sulfate = serotonin O-sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) PMID 29524394 ↗ |
| 分子活性 | (R)-adrenaline + 3'-phosphoadenylyl sulfate = (R)-adrenaline 4'-O-sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源(R)-adrenaline + 3'-phosphoadenylyl sulfate = (R)-adrenaline 4'-O-sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) PMID 29524394 ↗ |
| 分子活性 | (R)-noradrenaline + 3'-phosphoadenylyl sulfate = (R)-noradrenaline 4'-O-sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源(R)-noradrenaline + 3'-phosphoadenylyl sulfate = (R)-noradrenaline 4'-O-sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) PMID 29524394 ↗ |
| 分子活性 | 3,3',5-triiodo-L-thyronine + 3'-phosphoadenylyl sulfate = 3,3',5-triiodo-L-thyronine sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源3,3',5-triiodo-L-thyronine + 3'-phosphoadenylyl sulfate = 3,3',5-triiodo-L-thyronine sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) PMID 10199779 ↗ |
| 分子活性 | 3,3',5'-triiodo-L-thyronine + 3'-phosphoadenylyl sulfate = 3,3',5'-triiodo-L-thyronine sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源3,3',5'-triiodo-L-thyronine + 3'-phosphoadenylyl sulfate = 3,3',5'-triiodo-L-thyronine sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) PMID 10199779 ↗ |
| 分子活性 | 3,3'-diiodo-L-thyronine + 3'-phosphoadenylyl sulfate = 3,3'-diiodo-L-thyronine sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源3,3'-diiodo-L-thyronine + 3'-phosphoadenylyl sulfate = 3,3'-diiodo-L-thyronine sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) PMID 10199779 ↗ |
| 分子活性 | L-thyroxine + 3'-phosphoadenylyl sulfate = L-thyroxine sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源L-thyroxine + 3'-phosphoadenylyl sulfate = L-thyroxine sulfate + adenosine 3',5'-bisphosphate + H(+) PMID 10199779 ↗ |
| 交互作用 | Homodimer | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | SULT1A3 定位於細胞質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ACACTCCCTACACCACACCCATACTCAGCCCCTGCAGGCA40AGGAGAGAACAGGTCAGGTTCCCGAGAGCTCAGGAACATG80GAGCTGATCCAGGACACCTCCCGCCCGCCACTGGAGTACG120TGAAGGGGGTCCCGCTCATCAAGTACTTTGCAGAGGCACT160GGGGCCCCTGCAGAGCTTCCAAGCCCGACCTGATGACCTG200CTCATCAACACCTACCCCAAGTCTGGCACCACCTGGGTGA240GCCAGATACTGGACATGATCTACCAGGGCGGCGACCTAGA280GAAGTGTAACCGGGCTCCCATCTACGTACGGGTGCCCTTC320CTTGAGGTCAATGATCCAGGGGAACCCTCAGGGCTGGAGA360CTCTGAAAGACACACCGCCCCCACGGCTCATCAAGTCACA400CCTGCCCCTGGCTCTGCTCCCTCAGACTCTGTTGGATCAG440AAGGTCAAGGTGGTCTATGTTGCCCGAAACCCAAAGGACG480TGGCGGTCTCCTACTACCATTTCCACCGTATGGAAAAGGC520GCACCCTGAGCCTGGGACCTGGGACAGCTTCCTGGAAAAG560TTCATGGCTGGAGAAGTGTCCTACGGGTCCTGGTACCAGC600ACGTGCAGGAGTGGTGGGAGCTGAGCCGCACCCACCCTGT640TCTCTACCTCTTCTATGAAGACATGAAGGAGAACCCCAAA680AGGGAGATTCAAAAGATCCTGGAGTTTGTGGGGCGCTCCC720TGCCAGAGGAGACCATGGACTTCATGGTTCAGCACACGTC760GTTCAAGGAGATGAAGAAGAACCCTATGACCAACTACACC800ACCGTCCCCCAGGAGCTCATGGACCACAGCATCTCCCCCT840TCATGAGGAAAGGCATGGCTGGGGACTGGAAGACCACCTT880CACCGTGGCGCAGAATGAGCGCTTCGATGCGGACTATGCG920GAGAAGATGGCAGGCTGCAGCCTCAGCTTCCGCTCTGAGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。