演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SUCLG2

succinate-CoA ligase GDP-forming subunit beta

SUCLG2 編碼 succinate-CoA ligase GDP-forming subunit beta,是粒線體 GTP-specific succinyl-CoA synthetase 的 β 次單元,參與檸檬酸循環中的 GTP 生成。

Homo sapiens3p14.1UniProt Q96I99
OFFICIAL SYMBOL
SUCLG2
CHROMOSOME
3
UNIPROT
Q96I99
PDB / ALPHAFOLD
6WCV
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SUCLG2 是蛋白質編碼基因,其產物為 succinate-CoA ligase GDP-forming subunit beta,屬於 succinate/malate CoA ligase beta subunit 家族中的 GTP-specific subunit beta 分支。此蛋白質為 GTP-specific succinyl-CoA synthetase 的 β 次單元,與 α 次單元組成異源二聚體。蛋白質全長 432 個胺基酸,具有粒線體轉運胜肽,並含 ATP-grasp 結構域;這些特徵描述其蛋白質組成與家族歸屬。

Official symbol
SUCLG2
Gene name
succinate-CoA ligase GDP-forming subunit beta
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11450
UniProt
Q96I99
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 33p14.1
chr3 · 198,295,559 bp · GRCh38chr3p26.3 · 1–2800000 · gpos50chr3p26.2 · 2800001–4000000 · gnegchr3p26.1 · 4000001–8100000 · gpos50chr3p25.3 · 8100001–11600000 · gnegchr3p25.2 · 11600001–13200000 · gpos25chr3p25.1 · 13200001–16300000 · gnegchr3p24.3 · 16300001–23800000 · gpos100chr3p24.2 · 23800001–26300000 · gnegchr3p24.1 · 26300001–30800000 · gpos75chr3p23 · 30800001–32000000 · gnegchr3p22.3 · 32000001–36400000 · gpos50chr3p22.2 · 36400001–39300000 · gnegchr3p22.1 · 39300001–43600000 · gpos75chr3p21.33 · 43600001–44100000 · gnegchr3p21.32 · 44100001–44200000 · gpos50chr3p21.31 · 44200001–50600000 · gnegchr3p21.2 · 50600001–52300000 · gpos25chr3p21.1 · 52300001–54400000 · gnegchr3p14.3 · 54400001–58600000 · gpos50chr3p14.2 · 58600001–63800000 · gnegchr3p14.1 · 63800001–69700000 · gpos50chr3p13 · 69700001–74100000 · gnegchr3p12.3 · 74100001–79800000 · gpos75chr3p12.2 · 79800001–83500000 · gnegchr3p12.1 · 83500001–87100000 · gpos75chr3p11.2 · 87100001–87800000 · gnegchr3p11.1 · 87800001–90900000 · acenchr3q11.1 · 90900001–94000000 · acenchr3q11.2 · 94000001–98600000 · gvarchr3q12.1 · 98600001–100300000 · gnegchr3q12.2 · 100300001–101200000 · gpos25chr3q12.3 · 101200001–103100000 · gnegchr3q13.11 · 103100001–106500000 · gpos75chr3q13.12 · 106500001–108200000 · gnegchr3q13.13 · 108200001–111600000 · gpos50chr3q13.2 · 111600001–113700000 · gnegchr3q13.31 · 113700001–117600000 · gpos75chr3q13.32 · 117600001–119300000 · gnegchr3q13.33 · 119300001–122200000 · gpos75chr3q21.1 · 122200001–124100000 · gnegchr3q21.2 · 124100001–126100000 · gpos25chr3q21.3 · 126100001–129500000 · gnegchr3q22.1 · 129500001–134000000 · gpos25chr3q22.2 · 134000001–136000000 · gnegchr3q22.3 · 136000001–139000000 · gpos25chr3q23 · 139000001–143100000 · gnegchr3q24 · 143100001–149200000 · gpos100chr3q25.1 · 149200001–152300000 · gnegchr3q25.2 · 152300001–155300000 · gpos50chr3q25.31 · 155300001–157300000 · gnegchr3q25.32 · 157300001–159300000 · gpos50chr3q25.33 · 159300001–161000000 · gnegchr3q26.1 · 161000001–167900000 · gpos100chr3q26.2 · 167900001–171200000 · gnegchr3q26.31 · 171200001–176000000 · gpos75chr3q26.32 · 176000001–179300000 · gnegchr3q26.33 · 179300001–183000000 · gpos75chr3q27.1 · 183000001–184800000 · gnegchr3q27.2 · 184800001–186300000 · gpos25chr3q27.3 · 186300001–188200000 · gnegchr3q28 · 188200001–192600000 · gpos75chr3q29 · 192600001–198295559 · gnegSUCLG2pq1 bp198,295,559 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr3:67,240,707–67,654,630
Gene span
413,924 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000307227 ★67,374,719–67,654,61211
ENST0000111596667,240,707–67,654,63012
ENST0000113082867,240,707–67,654,6309
ENST0000111596767,357,269–67,654,63012
ENST0000111596867,357,448–67,654,63012
ENST0000111596967,358,590–67,654,63012
ENST0000049311267,360,460–67,654,63011
ENST0000090641367,373,485–67,654,63010
ENST0000046056767,374,719–67,528,2225
ENST0000095187067,374,719–67,654,63011
ENST0000104052967,374,719–67,654,63011
ENST0000109239067,374,719–67,654,6308

顯示 12/25 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SUCLG2 的蛋白質產物是 GTP-specific succinyl-CoA synthetase 的 β 次單元,參與檸檬酸循環(TCA)。該酵素催化 succinyl-CoA 水解,並與 GTP 合成相偶聯;這是 TCA 中唯一的受質層級磷酸化步驟。反應可表示為 GTP、succinate 與 CoA 生成 succinyl-CoA、GDP 與 phosphate,亦即 succinate 與 CoA 轉為 succinyl-CoA 時伴隨 GTP 消耗及 GDP、磷酸生成。

β 次單元負責酵素的核苷酸專一性,並結合受質 succinate;CoA 與 phosphate 的結合位置則位於 α 次單元。這些分工說明反應所需的不同受質與核苷酸辨識由異源二聚體的不同次單元提供。每個次單元結合一個 Mg(2+) 離子。

除 succinyl-CoA 相關反應外,該酵素也能以 GTP 專一性催化 itaconyl-CoA synthetase 與 malyl-CoA synthetase 反應。來源並將其功能列於碳水化合物代謝及 TCA 中由 succinyl-CoA 經 ligase 路徑生成 succinate 的步驟。上述不同反應共同呈現此蛋白質所在酵素在有機酸與 CoA 形式轉換中的催化範圍;其中次單元對核苷酸專一性的作用,依來源所述為相似性推定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 67654612 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SUCLG2 ENST00000307227 GRCh38 chr3:67654512-67655612 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCTTTTATTCCCTTATTTGGCCCCACCCTCATCCTGCTGATTGGTCCATTTTACAGAGTGCCAATTGGTC
CATTTTACAGAGTGCTGATTGGTCCCTTTTTAAAGAGTGCTGATTGGTGCATTTACAAACGTTTAGCTAG
ACACAGAGCGCTGATTGGTGCGTTTTTACAGAGTGCCGATTGGTGTGTTTACAAACCTTTAGCCAGACAC
AGAGCACTGATTGGTGCATTTACAATCCTTTAGCTAACAGAAAAGTTCTCCAAGTCCCCACCTGATTAGC
TAGACACAGAGGGCTGGCTGGTGTATTTACAAACCTTTAGCTAGACACAGAGCGCTGATTGGTGCATTTA
CAATCATTTAGCTAGACAGAGAAGTTCTCCAAGTCCCCAACCGACCCACCCGGCTTCATCTCTCAGCTTT
ACATTGATTTTAGGTTAAGGATAGAACAAAACAAAACACCCACAACTCCTTAAGGGATGGAGAGCCTCCA
ATGGCCTCTCCTTGACTCACCTGAAGCCCTGGGCTGCAGGAACCTCACCTGTCTCTATTCGTTAAAGTCT
CAGCTCAAACACCACTGTCCCAGATAGGCCTCGTGACCGCAGGACTAGACCACGGTTCTCTGCGGAGGGC
GTCAGCTCCGTGAGCCACCCTTCCAGCACCCACTGCCATGGCGAATATTTGCTTGTTTGGCCATCCAGGG
ACTGTTTGAGCCCCAAGACCGCAGGGCTCGGGGTCTGTCTTTGCTCAGGACGATAACCTGGGGACTGGAC
AGTAGGCCCTCAGGCCTTGGGACCGCTCAAAGTGAACCGGGGCCGGGTGGGGGACCCAGGGCTCTGCAGC
CTTAAGAACGCCTGTGCCCCCGGGACGCAGGGGTCAGGCCCGGCCCGGCCCAGACCGCCTCTGCCTCCTC
CTCCTTTTCCTCCCCGCGCCCGCTTCTCCTCTGACCCCTCCTCCCGCTGCTCCTCCTCCGCCTCCTTCCC
CTGCCCGCGCCCGCCCTACTGCCCCGTGCCGAGTTTCCTGTTTAAGATGGCGTCCCCCGTAGCAGCGCAG
GCCGGGAAGCTTCTGCGAGCCCTAGCGCTGCGGCCCCGCTTCCTGGCGGCC
SUCLG2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SUCLG2_1 ↗3:67,654,602負股67,654,592–67,654,651

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR3_9ZT2W · promoter · 67654095–67654595 · regulatory

ENSR3_9ZT33 · promoter · 67654597–67655057 · regulatory

ENSR3_9ZT37 · promoter · 67655143–67655643 · regulatory

ENSR3_BHFJ7 · enhancer · 67655644–67656514 · regulatory

· motif · 67650253–67650267 · motif

· motif · 67653383–67653395 · motif

· motif · 67653452–67653463 · motif

· motif · 67653987–67654009 · motif

· motif · 67653987–67654009 · motif

· motif · 67654023–67654032 · motif

· motif · 67654077–67654093 · motif

· motif · 67654086–67654095 · motif

· motif · 67654086–67654095 · motif

· motif · 67654088–67654104 · motif

· motif · 67654088–67654104 · motif

· motif · 67654227–67654237 · motif

· motif · 67654406–67654418 · motif

· motif · 67654408–67654415 · motif

· motif · 67654488–67654501 · motif

· motif · 67654639–67654652 · motif

· motif · 67654663–67654675 · motif

· motif · 67654665–67654672 · motif

· motif · 67654733–67654745 · motif

· motif · 67654736–67654743 · motif

· motif · 67654882–67654897 · motif

· motif · 67654937–67654947 · motif

· motif · 67655590–67655605 · motif

· motif · 67655590–67655605 · motif

· motif · 67655653–67655668 · motif

· motif · 67655660–67655668 · motif

· motif · 67655775–67655787 · motif

· motif · 67655777–67655784 · motif

· motif · 67655959–67655974 · motif

· motif · 67655972–67655994 · motif

· motif · 67655972–67655994 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:432 aa

1 aa432 aa結構域轉運胜肽
依 Q96I99 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

蛋白質全長為 432 個胺基酸;第 1–37 位為粒線體轉運胜肽,第 46–274 位註記為 ATP-grasp 結構域。此蛋白質屬於 succinate/malate CoA ligase beta subunit 家族中的 GTP-specific subunit beta 分支。

轉運胜肽Mitochondrion1–37 aa
結構域ATP-grasp46–274 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 6WCV…

PDB · 6WCV

X-ray · 1.52 A · B=38-432

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Mitochondrion

其序列第 1–37 位註記為粒線體轉運胜肽;來源未提供定位變動條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SUCLG2SUCLG2HSCBSUCLG1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

SUCLG2 的 β 次單元與 α 次單元形成異源二聚體。此複合體中,β 次單元決定對 GTP 的專一性;來源未進一步指出特定實體結合夥伴或其他互作關係。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能GTP-specific succinyl-CoA synthetase 參與檸檬酸循環,將 succinyl-CoA 水解與 GTP 合成偶聯,構成循環中唯一的受質層級磷酸化步驟。β 次單元提供核苷酸專一性並結合 succinate;CoA 與 phosphate 的結合位置在 α 次單元。該酵素也能以 GTP 專一性催化 itaconyl-CoA synthetase 與 malyl-CoA synthetase 反應;次單元分工的描述屬相似性推定。含實驗來源
證據與來源

GTP-specific succinyl-CoA synthetase functions in the citric acid cycle (TCA), coupling the hydrolysis of succinyl-CoA to the synthesis of GTP and thus represents the only step of substrate-level phosphorylation in the TCA. The beta subunit provides nucleotide specificity of the enzyme and binds the substrate succinate, while the binding sites for coenzyme A and phosphate are found in the alpha subunit (By similarity). Also able to act as a GTP-specific itaconyl- and malyl-CoA synthetase

PMID 40108300 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性GTP + succinate + CoA = succinyl-CoA + GDP + phosphate含實驗來源
證據與來源

GTP + succinate + CoA = succinyl-CoA + GDP + phosphate

PMID 40108300 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性此蛋白質每個次單元結合一個 Mg(2+) 離子。來源僅提供每個次單元的結合數量,未描述結合條件、實驗系統或此離子結合所造成的功能結果。資料庫紀錄
證據與來源

Binds 1 Mg(2+) ion per subunit.

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性來源將此蛋白質相關反應列於碳水化合物代謝與三羧酸循環,並標示為經由 ligase 路徑由 succinyl-CoA 生成 succinate 的步驟。該路徑所列步驟數為一步中的一步,未提供其他條件或實驗細節。資料庫紀錄
證據與來源

Carbohydrate metabolism; tricarboxylic acid cycle; succinate from succinyl-CoA (ligase route): step 1/1

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用該酵素由 α 次單元與 β 次單元組成異源二聚體。β 次單元負責決定酵素對 GTP 的專一性;來源未提供其他次單元特性或更具體的分子互作資訊。推論支持
證據與來源

Heterodimer of an alpha and a beta subunit. The beta subunit determines specificity for GTP

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位來源將 SUCLG2 蛋白質定位於粒線體,未提供其他亞細胞位置、定位改變條件或不同異構型之間的定位差異。推論支持
證據與來源

Mitochondrion

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000307227 · 2,350 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCCCCGTGCCGAGTTTCCTGTTTAAGATGGCGTCCCCCGT40
41AGCAGCGCAGGCCGGGAAGCTTCTGCGAGCCCTAGCGCTG80
81CGGCCCCGCTTCCTGGCGGCCGGGTCCCAGGCAGTTCAAT120
121TAACCTCCAGAAGATGGCTGAACCTGCAGGAATACCAGAG160
161CAAGAAACTGATGTCTGACAACGGAGTGAGAGTTCAAAGA200
201TTCTTTGTAGCAGACACTGCAAATGAAGCTCTCGAGGCTG240
241CTAAGAGACTAAATGCAAAAGAAATTGTTTTAAAAGCCCA280
281GATCTTAGCTGGAGGAAGAGGAAAAGGTGTCTTCAATAGT320
321GGTTTGAAAGGAGGTGTTCATTTAACAAAAGACCCTAATG360
361TTGTGGGACAGCTGGCTAAACAGATGATTGGGTACAATCT400
401AGCGACAAAACAAACTCCAAAAGAAGGTGTGAAAGTTAAC440
441AAGGTGATGGTTGCTGAAGCCTTGGATATTTCCAGAGAAA480
481CCTACCTGGCAATTCTGATGGACCGGTCCTGCAATGGCCC520
521CGTGCTGGTGGGCAGCCCCCAGGGGGGCGTCGACATTGAA560
561GAGGTGGCTGCTTCAAACCCGGAGCTCATTTTTAAGGAGC600
601AAATTGACATTTTTGAAGGAATAAAGGACAGCCAAGCTCA640
641GCGGATGGCCGAAAATCTAGGCTTCGTTGGGCCTTTGAAA680
681AGCCAGGCTGCAGATCAAATTACGAAGCTGTATAATCTCT720
721TCCTGAAAATTGATGCTACTCAGGTGGAAGTGAATCCCTT760
761TGGTGAAACTCCAGAAGGACAAGTTGTCTGTTTTGATGCC800
801AAGATAAACTTTGATGACAACGCAGAATTCCGACAAAAAG840
841ACATATTTGCTATGGACGACAAATCAGAGAATGAGCCCAT880
881TGAAAATGAAGCTGCCAAATATGATCTAAAATACATAGGA920
921CTAGATGGGAACATTGCCTGCTTTGTGAATGGTGCTGGGC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。