演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

STYX

serine/threonine/tyrosine interacting protein

STYX(serine/threonine/tyrosine interacting protein)是蛋白質磷酸酶家族的非受體型成員,但不具催化活性;它可調節 MAPK1/MAPK3 的細胞內作用,並影響 FBXW7 複合體的組裝。

Homo sapiens14q22.1UniProt Q8WUJ0
OFFICIAL SYMBOL
STYX
CHROMOSOME
14
UNIPROT
Q8WUJ0
PDB / ALPHAFOLD
2R0B
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

STYX 的正式名稱為 serine/threonine/tyrosine interacting protein,屬於蛋白質編碼基因。其產物歸入 protein-tyrosine phosphatase 家族中的 non-receptor class subfamily,具有酪胺酸蛋白質磷酸酶相關結構,但來源將其描述為催化失活的 phosphatase,因此不應視為具磷酸酶催化活性的蛋白質。STYX 的特性與功能主要來自其調節其他蛋白質及其所在複合體的能力,而非酵素催化作用。

Official symbol
STYX
Gene name
serine/threonine/tyrosine interacting protein
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11447
UniProt
Q8WUJ0
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1414q22.1
chr14 · 107,043,718 bp · GRCh38chr14p13 · 1–3600000 · gvarchr14p12 · 3600001–8000000 · stalkchr14p11.2 · 8000001–16100000 · gvarchr14p11.1 · 16100001–17200000 · acenchr14q11.1 · 17200001–18200000 · acenchr14q11.2 · 18200001–24100000 · gnegchr14q12 · 24100001–32900000 · gpos100chr14q13.1 · 32900001–34800000 · gnegchr14q13.2 · 34800001–36100000 · gpos50chr14q13.3 · 36100001–37400000 · gnegchr14q21.1 · 37400001–43000000 · gpos100chr14q21.2 · 43000001–46700000 · gnegchr14q21.3 · 46700001–50400000 · gpos100chr14q22.1 · 50400001–53600000 · gnegchr14q22.2 · 53600001–55000000 · gpos25chr14q22.3 · 55000001–57600000 · gnegchr14q23.1 · 57600001–61600000 · gpos75chr14q23.2 · 61600001–64300000 · gnegchr14q23.3 · 64300001–67400000 · gpos50chr14q24.1 · 67400001–69800000 · gnegchr14q24.2 · 69800001–73300000 · gpos50chr14q24.3 · 73300001–78800000 · gnegchr14q31.1 · 78800001–83100000 · gpos100chr14q31.2 · 83100001–84400000 · gnegchr14q31.3 · 84400001–89300000 · gpos100chr14q32.11 · 89300001–91400000 · gnegchr14q32.12 · 91400001–94200000 · gpos25chr14q32.13 · 94200001–95800000 · gnegchr14q32.2 · 95800001–100900000 · gpos50chr14q32.31 · 100900001–102700000 · gnegchr14q32.32 · 102700001–103500000 · gpos50chr14q32.33 · 103500001–107043718 · gnegSTYXpq1 bp107,043,718 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr14:52,730,043–52,775,008
Gene span
44,966 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000354586 ★52,730,166–52,774,98911
ENST0000087494952,730,043–52,775,00812
ENST0000087495052,730,155–52,775,00810
ENST0000087495152,730,155–52,775,00810
ENST0000087495252,730,155–52,775,00810
ENST0000087495352,730,155–52,775,00811
ENST0000093821252,730,155–52,775,00810
ENST0000096456452,730,155–52,775,00811
ENST0000112910152,730,155–52,774,94211
ENST0000113343852,730,155–52,775,00811
ENST0000044212352,730,180–52,775,00812

顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

STYX 是催化失活的 phosphatase,可作為 MAPK1/MAPK3(ERK1/ERK2)的核內錨定蛋白。它透過對 MAPK1/MAPK3 進行時空調節,參與細胞命運決定與細胞遷移的調控;來源未進一步說明這些調節如何在不同時間或位置發生,因此不宜延伸推定其具體機制。

STYX 也能影響 FBXW7 的功能。它與 FBXW7 的 F-box 結合,阻止 FBXW7 組裝進 SCF E3 ubiquitin-protein ligase complex,因而抑制該複合體底物的降解。這項作用描述的是透過干預複合體組裝而改變底物降解,不是 STYX 直接執行蛋白質降解或磷酸化反應。

此外,STYX 被報告與精子生成有關,但此項功能標註依據為相似性推論(By similarity),證據性質不同於來源中列出的實驗研究結果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 52730166 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>STYX ENST00000354586 GRCh38 chr14:52729166-52730266 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCGATTACTGGCATGCGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATG
TTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACACGCCTCAGCCGCCCAAAGTGCTGGGAT
TACAGGCGTGAGCCTCCGCGCCCGGCCCAAATCTTTTCACCATGGGTTTACAGGCATAACGCCACCACAC
CCAGGGAATTTTAAAATTGTTTTTTAGAGAGGGGGGTCTTACTATTTTGCTCAGGCTGGCAAACTCCTTT
TAAAAGATATTGAAAGCCATCTGGTTTATTATTTTTATTTCAAAATATAATAATGGAAGAAATTTTACAG
TATTATATACAATTTACTGAGTCAGCTATCAGTTCCTTTTTCTGATTTTTTTCTAGTTGCCATTCTTGAT
ATTTTCTAGGTAATCTAAACTGAGTTGTATTTTCAAGTACTCTTAAAATACTTTAAAAAATTTTAAATTG
AGCCGTTTAATTCTTTGCTTAAAGGTGATGGGTATTTTATTTTCTGTATGGCACCACGTGATTTTAAATT
GAACTCTTCATTTATTAGTCATTTGGTTATAAACTCAGCATAGATTGCGCAGAATTTTGAGAGGGGAGAA
ACTATAGCTTTCCTTTCGGATGCCACTGGTGGGTAGCCTGTTTTGCCTGTTTGTTCTTATGTTAAAGAAG
GGCTCTACGTCCTGTCTGGAAAGGGCGGAGCTGGCTCGGACCGCCCCACTGCCTTTCCCAGGACCTTCAC
TCGTCCTGTCCCACCGCAGCCCCGCCTCCTCCACGCCGGGTGAGCTGTGGCCTAGCAGCATCCGAGGCTC
CGCCCCCCCCACCCCCAAGCGTCTGCGCTCTAGCGAAGGGGCGGAGCAGGGCGGTGGCGCGCTGACACCT
GGCGGCGGCGGAGGGCGGGCAGAAGGCGAGCGTGGGCTGGGATTGGCTGAGGCGACGCGGGTGGAGGGGG
CGGGAAGGAGGCGGGGAGACGGTTGTCGGGCTGGTTCCTGTGCTGGATCCTGGGCGGCCTGAGGGGTACG
GAGACTCTGGGGGAGGGAGACGGCAGCGGCATGGCGGCCGGGTGTAAGACG
STYX 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
STYX_1 ↗14:52,730,185正股52,730,136–52,730,195

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR14_BDGJQ · promoter · 52729676–52730190 · regulatory

ENSR14_5GDTHP · CTCF_binding_site · 52730064–52730085 · regulatory

ENSR14_BDGJT · enhancer · 52730191–52731208 · regulatory

· motif · 52729954–52729964 · motif

· motif · 52730002–52730012 · motif

· motif · 52730007–52730017 · motif

· motif · 52730011–52730021 · motif

· motif · 52730042–52730052 · motif

· motif · 52730066–52730082 · motif

· motif · 52730074–52730087 · motif

· motif · 52730102–52730115 · motif

· motif · 52730136–52730149 · motif

· motif · 52730141–52730151 · motif

· motif · 52730152–52730162 · motif

· motif · 52730224–52730234 · motif

· motif · 52734153–52734164 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:223 aa

1 aa223 aa結構域功能區域基序
依 Q8WUJ0 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

STYX 蛋白長 223 個胺基酸,屬於 protein-tyrosine phosphatase 家族的 non-receptor class subfamily。第 28–176 位胺基酸標註為 Tyrosine-protein phosphatase 結構域;此結構特徵不代表具有催化活性,來源指出 STYX 為催化失活的 phosphatase。第 76–78 位有與 FBXW7 互作相關的 FQQ motif;第 197–223 位則標註為無序區域。

結構域Tyrosine-protein phosphatase28–176 aa
功能區域Disordered197–223 aa
基序Interaction with FBXW776–78 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2R0B…

PDB · 2R0B

X-ray · 1.60 A · A=26-177

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus;Cytoplasm, cytosol

STYX 位於細胞核與細胞質溶膠,且主要定位於細胞核。 來源未提供定位改變的條件或異構型間差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
STYXSTYXFBXW7
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
  • FBXW7Q969H0 · UniProt INTERACTION · 10 experiments · 2 筆來源紀錄
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

STYX 與 MAPK1 互作,且此互作不受 MAPK1 的磷酸化狀態影響;另有與 CARHSP1/Crhsp-24 互作的相似性註記。STYX 透過 FQQ motif 直接結合 FBXW7 isoform 1 與 isoform 3 的 F-box domain,但不與 isoform 2 互作。此結合會阻止 FBXW7 與 SCF(FBXW7) 複合體成分 SKP1 互作,並與抑制 FBXW7 組裝進該複合體的功能相符。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能STYX 是催化失活的 phosphatase,可在細胞核中錨定 MAPK1/MAPK3,並透過時空調節參與細胞命運決定與細胞遷移。它也能結合 FBXW7 的 F-box,阻止其組裝進 SCF E3 ubiquitin-protein ligase complex,進而抑制該複合體底物的降解;另有依相似性推論其參與精子生成的註記。含實驗來源
證據與來源

Catalytically inactive phosphatase. Acts as a nuclear anchor for MAPK1/MAPK3 (ERK1/ERK2). Modulates cell-fate decisions and cell migration by spatiotemporal regulation of MAPK1/MAPK3 (ERK1/ERK2). By binding to the F-box of FBXW7, prevents the assembly of FBXW7 into the SCF E3 ubiquitin-protein ligase complex, and thereby inhibits degradation of its substrates. Plays a role in spermatogenesis (By similarity)

PMID 23847209 ↗ · PMID 28007894 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用STYX 與 MAPK1 互作,且不受 MAPK1 磷酸化狀態影響;與 CARHSP1/Crhsp-24 的互作則依相似性註記。STYX 透過 FQQ motif 直接結合 FBXW7 isoform 1 和 3 的 F-box domain,並阻止 FBXW7 與 SCF(FBXW7) 成分 SKP1 互作;不與 FBXW7 isoform 2 互作。含實驗來源
證據與來源

Interacts with MAPK1; independently of MAPK1 phosphorylation status. Interacts with CARHSP1/Crhsp-24 (By similarity). Interacts (via FQQ motif) with FBXW7 isoforms 1 (via F-box domain) and 3 (via F-box domain); the interaction is direct and prevents FBXW7 interaction with SKP1, a component of the SCF(FBXW7) complex. Does not interact with FBXW7 isoform 2

PMID 23847209 ↗ · PMID 28007894 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位STYX 位於細胞核與細胞質溶膠,且主要定位於細胞核。含實驗來源
證據與來源

Nucleus; Cytoplasm, cytosol; Predominantly localizes to the nucleus

PMID 23847209 ↗ · PMID 28007894 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000354586 · 4,864 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGTTGTCGGGCTGGTTCCTGTGCTGGATCCTGGGCGGCCT40
41GAGGGGTACGGAGACTCTGGGGGAGGGAGACGGCAGCGGC80
81ATGGCGGCCGGGTGTAAGACGCCCGACCCTCCTCTTCCCT120
121GTCTTCGCCGCCGCCGCTGCTGGAGTCACTGGGACCCTGT160
161AGTCTGCGTGTGTTAGTTGTAATCCCGCCGCCCTCCTGTC200
201AGCCCTCCGCTCCGCCGGCCCTCCTTCCTTCCGCCGCCGC240
241AGCCAGCCCGAGGGTCGGCCGGCTGTGTAACACTCTCCCA280
281CCCCACCCACCAGCCCGCGGGCCAGCACCATGGAGGACGT320
321GAAGCTGGAGTTCCCTTCCCTTCCACAGTGCAAGGAAGAC360
361GCCGAGGAGTGGACCTACCCTATGAGACGAGAGATGCAGG400
401AAATTTTACCTGGATTGTTCTTAGGCCCATATTCATCTGC440
441TATGAAAAGCAAGCTACCTGTACTACAGAAACATGGAATA480
481ACCCATATAATATGCATACGACAAAATATTGAAGCAAACT520
521TTATTAAACCAAACTTTCAGCAGTTATTTAGATATTTAGT560
561CCTGGATATTGCAGATAATCCAGTTGAAAATATAATACGT600
601TTTTTCCCTATGACTAAGGAATTTATTGATGGGAGCTTAC640
641AAATGGGAGGAAAAGTTCTTGTGCATGGAAATGCAGGGAT680
681CTCCAGAAGTGCAGCCTTTGTTATTGCATACATTATGGAA720
721ACATTTGGAATGAAGTACAGAGATGCTTTTGCTTATGTTC760
761AAGAAAGAAGATTTTGTATTAATCCTAATGCTGGATTTGT800
801CCATCAACTTCAGGAATATGAAGCCATCTACCTAGCAAAA840
841TTAACAATACAGATGATGTCACCACTCCAGATAGAAAGGT880
881CATTATCTGTTCATTCTGGTACCACAGGCAGTTTGAAGAG920
921AACACATGAAGAAGAGGATGATTTTGGAACCATGCAAGTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。