基因總覽
STYX 的正式名稱為 serine/threonine/tyrosine interacting protein,屬於蛋白質編碼基因。其產物歸入 protein-tyrosine phosphatase 家族中的 non-receptor class subfamily,具有酪胺酸蛋白質磷酸酶相關結構,但來源將其描述為催化失活的 phosphatase,因此不應視為具磷酸酶催化活性的蛋白質。STYX 的特性與功能主要來自其調節其他蛋白質及其所在複合體的能力,而非酵素催化作用。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000354586 ★ | 52,730,166–52,774,989 | 11 |
| ENST00000874949 | 52,730,043–52,775,008 | 12 |
| ENST00000874950 | 52,730,155–52,775,008 | 10 |
| ENST00000874951 | 52,730,155–52,775,008 | 10 |
| ENST00000874952 | 52,730,155–52,775,008 | 10 |
| ENST00000874953 | 52,730,155–52,775,008 | 11 |
| ENST00000938212 | 52,730,155–52,775,008 | 10 |
| ENST00000964564 | 52,730,155–52,775,008 | 11 |
| ENST00001129101 | 52,730,155–52,774,942 | 11 |
| ENST00001133438 | 52,730,155–52,775,008 | 11 |
| ENST00000442123 | 52,730,180–52,775,008 | 12 |
顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
STYX 是催化失活的 phosphatase,可作為 MAPK1/MAPK3(ERK1/ERK2)的核內錨定蛋白。它透過對 MAPK1/MAPK3 進行時空調節,參與細胞命運決定與細胞遷移的調控;來源未進一步說明這些調節如何在不同時間或位置發生,因此不宜延伸推定其具體機制。
STYX 也能影響 FBXW7 的功能。它與 FBXW7 的 F-box 結合,阻止 FBXW7 組裝進 SCF E3 ubiquitin-protein ligase complex,因而抑制該複合體底物的降解。這項作用描述的是透過干預複合體組裝而改變底物降解,不是 STYX 直接執行蛋白質降解或磷酸化反應。
此外,STYX 被報告與精子生成有關,但此項功能標註依據為相似性推論(By similarity),證據性質不同於來源中列出的實驗研究結果。
Promoter 與基因調控
>STYX ENST00000354586 GRCh38 chr14:52729166-52730266 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCGATTACTGGCATGCGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATG TTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGATCCACACGCCTCAGCCGCCCAAAGTGCTGGGAT TACAGGCGTGAGCCTCCGCGCCCGGCCCAAATCTTTTCACCATGGGTTTACAGGCATAACGCCACCACAC CCAGGGAATTTTAAAATTGTTTTTTAGAGAGGGGGGTCTTACTATTTTGCTCAGGCTGGCAAACTCCTTT TAAAAGATATTGAAAGCCATCTGGTTTATTATTTTTATTTCAAAATATAATAATGGAAGAAATTTTACAG TATTATATACAATTTACTGAGTCAGCTATCAGTTCCTTTTTCTGATTTTTTTCTAGTTGCCATTCTTGAT ATTTTCTAGGTAATCTAAACTGAGTTGTATTTTCAAGTACTCTTAAAATACTTTAAAAAATTTTAAATTG AGCCGTTTAATTCTTTGCTTAAAGGTGATGGGTATTTTATTTTCTGTATGGCACCACGTGATTTTAAATT GAACTCTTCATTTATTAGTCATTTGGTTATAAACTCAGCATAGATTGCGCAGAATTTTGAGAGGGGAGAA ACTATAGCTTTCCTTTCGGATGCCACTGGTGGGTAGCCTGTTTTGCCTGTTTGTTCTTATGTTAAAGAAG GGCTCTACGTCCTGTCTGGAAAGGGCGGAGCTGGCTCGGACCGCCCCACTGCCTTTCCCAGGACCTTCAC TCGTCCTGTCCCACCGCAGCCCCGCCTCCTCCACGCCGGGTGAGCTGTGGCCTAGCAGCATCCGAGGCTC CGCCCCCCCCACCCCCAAGCGTCTGCGCTCTAGCGAAGGGGCGGAGCAGGGCGGTGGCGCGCTGACACCT GGCGGCGGCGGAGGGCGGGCAGAAGGCGAGCGTGGGCTGGGATTGGCTGAGGCGACGCGGGTGGAGGGGG CGGGAAGGAGGCGGGGAGACGGTTGTCGGGCTGGTTCCTGTGCTGGATCCTGGGCGGCCTGAGGGGTACG GAGACTCTGGGGGAGGGAGACGGCAGCGGCATGGCGGCCGGGTGTAAGACG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| STYX_1 ↗ | 14:52,730,185 | 正股 | 52,730,136–52,730,195 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR14_BDGJQ · promoter · 52729676–52730190 · regulatory
ENSR14_5GDTHP · CTCF_binding_site · 52730064–52730085 · regulatory
ENSR14_BDGJT · enhancer · 52730191–52731208 · regulatory
· motif · 52729954–52729964 · motif
· motif · 52730002–52730012 · motif
· motif · 52730007–52730017 · motif
· motif · 52730011–52730021 · motif
· motif · 52730042–52730052 · motif
· motif · 52730066–52730082 · motif
· motif · 52730074–52730087 · motif
· motif · 52730102–52730115 · motif
· motif · 52730136–52730149 · motif
· motif · 52730141–52730151 · motif
· motif · 52730152–52730162 · motif
· motif · 52730224–52730234 · motif
· motif · 52734153–52734164 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:223 aa
STYX 蛋白長 223 個胺基酸,屬於 protein-tyrosine phosphatase 家族的 non-receptor class subfamily。第 28–176 位胺基酸標註為 Tyrosine-protein phosphatase 結構域;此結構特徵不代表具有催化活性,來源指出 STYX 為催化失活的 phosphatase。第 76–78 位有與 FBXW7 互作相關的 FQQ motif;第 197–223 位則標註為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
STYX 位於細胞核與細胞質溶膠,且主要定位於細胞核。 來源未提供定位改變的條件或異構型間差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- FBXW7Q969H0 · UniProt INTERACTION · 10 experiments · 2 筆來源紀錄
STYX 與 MAPK1 互作,且此互作不受 MAPK1 的磷酸化狀態影響;另有與 CARHSP1/Crhsp-24 互作的相似性註記。STYX 透過 FQQ motif 直接結合 FBXW7 isoform 1 與 isoform 3 的 F-box domain,但不與 isoform 2 互作。此結合會阻止 FBXW7 與 SCF(FBXW7) 複合體成分 SKP1 互作,並與抑制 FBXW7 組裝進該複合體的功能相符。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | STYX 是催化失活的 phosphatase,可在細胞核中錨定 MAPK1/MAPK3,並透過時空調節參與細胞命運決定與細胞遷移。它也能結合 FBXW7 的 F-box,阻止其組裝進 SCF E3 ubiquitin-protein ligase complex,進而抑制該複合體底物的降解;另有依相似性推論其參與精子生成的註記。 | 含實驗來源 | 證據與來源Catalytically inactive phosphatase. Acts as a nuclear anchor for MAPK1/MAPK3 (ERK1/ERK2). Modulates cell-fate decisions and cell migration by spatiotemporal regulation of MAPK1/MAPK3 (ERK1/ERK2). By binding to the F-box of FBXW7, prevents the assembly of FBXW7 into the SCF E3 ubiquitin-protein ligase complex, and thereby inhibits degradation of its substrates. Plays a role in spermatogenesis (By similarity) PMID 23847209 ↗ · PMID 28007894 ↗ |
| 交互作用 | STYX 與 MAPK1 互作,且不受 MAPK1 磷酸化狀態影響;與 CARHSP1/Crhsp-24 的互作則依相似性註記。STYX 透過 FQQ motif 直接結合 FBXW7 isoform 1 和 3 的 F-box domain,並阻止 FBXW7 與 SCF(FBXW7) 成分 SKP1 互作;不與 FBXW7 isoform 2 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with MAPK1; independently of MAPK1 phosphorylation status. Interacts with CARHSP1/Crhsp-24 (By similarity). Interacts (via FQQ motif) with FBXW7 isoforms 1 (via F-box domain) and 3 (via F-box domain); the interaction is direct and prevents FBXW7 interaction with SKP1, a component of the SCF(FBXW7) complex. Does not interact with FBXW7 isoform 2 PMID 23847209 ↗ · PMID 28007894 ↗ |
| 細胞定位 | STYX 位於細胞核與細胞質溶膠,且主要定位於細胞核。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus; Cytoplasm, cytosol; Predominantly localizes to the nucleus PMID 23847209 ↗ · PMID 28007894 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GGTTGTCGGGCTGGTTCCTGTGCTGGATCCTGGGCGGCCT40GAGGGGTACGGAGACTCTGGGGGAGGGAGACGGCAGCGGC80ATGGCGGCCGGGTGTAAGACGCCCGACCCTCCTCTTCCCT120GTCTTCGCCGCCGCCGCTGCTGGAGTCACTGGGACCCTGT160AGTCTGCGTGTGTTAGTTGTAATCCCGCCGCCCTCCTGTC200AGCCCTCCGCTCCGCCGGCCCTCCTTCCTTCCGCCGCCGC240AGCCAGCCCGAGGGTCGGCCGGCTGTGTAACACTCTCCCA280CCCCACCCACCAGCCCGCGGGCCAGCACCATGGAGGACGT320GAAGCTGGAGTTCCCTTCCCTTCCACAGTGCAAGGAAGAC360GCCGAGGAGTGGACCTACCCTATGAGACGAGAGATGCAGG400AAATTTTACCTGGATTGTTCTTAGGCCCATATTCATCTGC440TATGAAAAGCAAGCTACCTGTACTACAGAAACATGGAATA480ACCCATATAATATGCATACGACAAAATATTGAAGCAAACT520TTATTAAACCAAACTTTCAGCAGTTATTTAGATATTTAGT560CCTGGATATTGCAGATAATCCAGTTGAAAATATAATACGT600TTTTTCCCTATGACTAAGGAATTTATTGATGGGAGCTTAC640AAATGGGAGGAAAAGTTCTTGTGCATGGAAATGCAGGGAT680CTCCAGAAGTGCAGCCTTTGTTATTGCATACATTATGGAA720ACATTTGGAATGAAGTACAGAGATGCTTTTGCTTATGTTC760AAGAAAGAAGATTTTGTATTAATCCTAATGCTGGATTTGT800CCATCAACTTCAGGAATATGAAGCCATCTACCTAGCAAAA840TTAACAATACAGATGATGTCACCACTCCAGATAGAAAGGT880CATTATCTGTTCATTCTGGTACCACAGGCAGTTTGAAGAG920AACACATGAAGAAGAGGATGATTTTGGAACCATGCAAGTG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。