演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

STXBP2UNC18B

syntaxin binding protein 2

STXBP2 編碼 syntaxin binding protein 2,屬於 STXBP/unc-18/SEC1 家族,參與囊泡運輸,並協助自然殺手細胞釋放細胞毒性顆粒。

Homo sapiens19p13.2UniProt Q15833
OFFICIAL SYMBOL
STXBP2
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q15833
PDB / ALPHAFOLD
4CCA
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

STXBP2 是蛋白質編碼基因,產物 syntaxin binding protein 2 屬於 STXBP/unc-18/SEC1 家族。此蛋白質與 SNARE(soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor-attachment protein receptors)相關,參與細胞內囊泡運輸及膜融合所需的分子組裝。來源提供的蛋白質序列長度為 593 個胺基酸,並註記其中一段區域為無序區。其主要角色與自然殺手細胞的細胞毒性顆粒胞吐有關;更具體的分子作用方式見功能說明。

Official symbol
STXBP2
Gene name
syntaxin binding protein 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11445
UniProt
Q15833
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
UNC18BHunc18bUnc18-2MUNC18-2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919p13.2
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25STXBP2pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:7,636,772–7,647,875
Gene span
11,104 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000221283 ★7,637,110–7,647,87319
ENST000004417797,637,099–7,647,87519
ENST000004142847,637,099–7,647,87519
ENST000006007027,637,099–7,647,87518
ENST000009755957,637,099–7,647,87520
ENST000009756017,637,099–7,647,87518
ENST000009756027,637,099–7,647,87517
ENST000010491727,637,099–7,647,87519
ENST000010770787,637,099–7,647,87518
ENST000010770797,637,099–7,647,87517
ENST000011388697,637,099–7,647,87519
ENST000005959507,637,105–7,642,1186

顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

STXBP2 參與細胞內囊泡運輸,作用與 SNARE 蛋白有關。SNARE 是膜融合所需的重要蛋白質;STXBP2 與其互動,協助形成可執行膜融合的功能性複合體。這項作用使 STXBP2 不只涉及囊泡運輸,也參與特定細胞中顆粒內容物的釋放。

在自然殺手細胞中,STXBP2 促進 STX11、SNAP23 與 VAMP8 組成 SNARE 複合體。此複合體於細胞膜處組裝,並介導細胞毒性顆粒胞吐所需的膜融合。換言之,STXBP2 的功能與自然殺手細胞將細胞毒性顆粒釋放至細胞外的過程相連;來源所述的作用重點,是促進具功能的 SNARE 複合體形成,而非將顆粒運輸或融合歸因於 STXBP2 單獨完成。

因此,STXBP2 連結了囊泡運輸相關的 SNARE 組裝與自然殺手細胞顆粒胞吐。來源支持其參與這些過程及其促進複合體組裝的作用,但未進一步說明其他細胞類型中的作用細節。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 7637110 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>STXBP2 ENST00000221283 GRCh38 chr19:7636110-7637210 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTAGGGCAGCATGGATCCTTTCCTATCTCCCCCAGACCTTCGGGTCTGATTCACTCCCTATGTCCCATGT
AAGTGGCAGGGGGCTTGGTACCTTCATCAACACGGCCGAGCGAAGGAACCAGCTCAGACCAGCAAGAGTC
TGTTTGCACACATACCTCGCACCTTAAATCGGAGACCTCATTTTGTATGGGTGCTGCTGGGGCTGTGCCT
TCCAAGCGACAGGACACACAGCAGAAGCAGCTTCTGAAATTCCGAGTGTGTGTCTGTGTTTGCAAGCATT
TGAGGGCGTCACTCACCCCATGTGTGTATCAGCATGTTAATTCGATTGTTGGTCCACGAGGGTAAGCGTT
GCGCCTCCCGGAAGAGGGTAAGGCTGTGACAAATGCCCCCTGGGGACAGGCTCCTGGCTTGAACCCAGCA
GGCTCACTCGTCGTGGCCTTGGATTAGGGATCCCGCTAAGCCTCGGTTTCCTCGTCGGCACCGCAGTCCA
GGTCGGAACATTGGGCAGGACTGAATGAAAATTATGTCCAGGTGCCTGCACACAAGAGGTCTCCAGGCCT
CCTGAATCCATCAAAAGTTATCCAAGACGGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCCTCTAAACCCTGAAGTACAGA
AGGCAAGTGGGTCAAGATCCCAGGCCCAGACAGTGGCGGCCCGGTGGCATCGAGTGGGTGCCGTGTATCT
TGCAGGCACAGAACCTCCCGGGGAAGATGGAGGGATTATTGCCCTGCGATCCTGCTTCGCACGCAAGCCA
GGAAGTGTGTGTCTGAACTCCCATCTGTGAGCGTGTCGTCGAGGTGTGCACCTCCAGCGACTTCGTGCTC
GGCAGCGCGGACGCACCTGCCCGTCCTCCCCGCCAGGGACTCAACTTCCTGGGCCTGGGCGAGAACCGAC
GGCGGGGAGGGGCCAGGTGCGCAGGGGGCGGGGACAGGGCCCGCGGGGCGGGGTCCACGTGGGTGACGCG
CGGGGCCACGCCCCCACCTTGGGACACACCCGGAAGCGGCGGCGGCGCCCCTCGGGGAAGATGGCGCCCT
CGGGGCTGAAGGCGGTGGTGGGGGAAAGTGAGTGCCTCTCCGGGGCCGGGC
STXBP2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
STXBP2_1 ↗19:7,637,121正股7,637,072–7,637,131

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_B3HWS · enhancer · 7636288–7636979 · regulatory

ENSR19_883NL · promoter · 7636980–7637140 · regulatory

ENSR19_CQGH · enhancer · 7637141–7638201 · regulatory

ENSR19_883R6 · enhancer · 7641405–7641554 · regulatory

· motif · 7636875–7636886 · motif

· motif · 7636918–7636927 · motif

· motif · 7636961–7636970 · motif

· motif · 7637031–7637040 · motif

· motif · 7637043–7637053 · motif

· motif · 7637075–7637091 · motif

· motif · 7637075–7637091 · motif

· motif · 7637094–7637104 · motif

· motif · 7637116–7637127 · motif

· motif · 7637116–7637127 · motif

· motif · 7637118–7637127 · motif

· motif · 7637268–7637278 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:593 aa

1 aa593 aa功能區域
依 Q15833 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

syntaxin binding protein 2 屬於 STXBP/unc-18/SEC1 家族。來源註記其蛋白質長度為 593 個胺基酸,並在第 444 至 466 位胺基酸標示一段無序區;此區域資訊為序列註解,來源未提供更進一步的結構或功能說明。

功能區域Disordered444–466 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 4CCA…

PDB · 4CCA

X-ray · 2.60 A · A=1-593

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Cytolytic granule membrane

STXBP2 被註記為細胞膜與細胞毒性顆粒膜上的周邊膜蛋白;在活化的免疫細胞中,亦於免疫突觸富集。 來源未提供不同異構型或定位變化條件的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Cytolytic granule membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
UNC18BSTXBP2STX11
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

STXBP2 與 STX11 有直接互作,並促進 STX11、SNAP23 與 VAMP8 組成可介導膜融合的 SNARE 複合體,參與細胞毒性顆粒胞吐。另有與 STX1A、STX2 及 STX3 互作的註記,但此項為相似性推定。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

STXBP2 相關變異可導致家族性噬血細胞性淋巴組織球增生症 5(FHL5),此病為罕見的自體隱性疾病,可伴有或不伴有微絨毛包涵體病。其特徵包括免疫失調、高細胞激素血症及自然殺手細胞功能缺陷,並可能出現發燒、肝脾腫大與血球減少;部分患者另有神經異常。嬰兒早期發病者可能先出現嚴重腹瀉,與類似微絨毛包涵體病的腸病有關;較晚發病者則可能病程較長且沒有腹瀉。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能STXBP2 透過與 SNARE 互動參與細胞內囊泡運輸。SNARE 是膜融合所需的重要蛋白質;STXBP2 促進 STX11、SNAP23 與 VAMP8 在細胞膜組裝成功能性複合體,進而調節自然殺手細胞的細胞毒性顆粒胞吐。含實驗來源
證據與來源

Functions in intracellular vesicle trafficking through interaction with SNAREs (soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor-attachment protein receptors) which are essential proteins for membrane fusion. By promoting the assembly of functional STX11/SNAP23/VAMP8 SNARE complexes at the plasma membrane, regulates cytotoxic granule exocytosis in natural killer (NK) cells

PMID 19804848 ↗ · PMID 19884660 ↗ · PMID 26771955 ↗ · PMID 28265073 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用STXBP2 與 STX11 有直接互作,並促進 STX11、SNAP23 與 VAMP8 組成介導膜融合、參與細胞毒性顆粒胞吐的功能性 SNARE 複合體。另有與 STX1A、STX2 和 STX3 互作的註記,但這些關係是依相似性推定。含實驗來源
證據與來源

Interacts with STX1A, STX2 and STX3 (By similarity). Interacts with STX11; the interaction is direct and promotes the assembly of functional STX11/SNAP23/VAMP8 SNARE complexes mediating membrane fusion in cytotoxic granule exocytosis

PMID 19804848 ↗ · PMID 19884660 ↗ · PMID 24910990 ↗ · PMID 26771955 ↗ · PMID 28265073 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位STXBP2 被註記為細胞膜及細胞毒性顆粒膜上的周邊膜蛋白;在活化的免疫細胞中,STXBP2 於免疫突觸富集。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Peripheral membrane protein; Cytolytic granule membrane / Peripheral membrane protein; Enriched at the immunological synapse in activated immune cells

PMID 24910990 ↗ · PMID 26771955 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯STXBP2 相關變異會造成罕見的自體隱性家族性噬血細胞性淋巴組織球增生症 5(FHL5),可伴有或不伴有微絨毛包涵體病。疾病涉及免疫失調、高細胞激素血症、自然殺手細胞功能缺陷及多器官受活化淋巴球與巨噬細胞浸潤;表現可包括發燒、肝脾腫大、血球減少,較少見神經異常。部分嬰兒早期出現嚴重腹瀉,與類似微絨毛包涵體病的腸病有關;較晚發病者可能病程較長且沒有腹瀉。含實驗來源
證據與來源

Hemophagocytic lymphohistiocytosis, familial, 5, with or without microvillus inclusion disease FHL5 A rare, autosomal recessive disorder characterized by immune dysregulation with hypercytokinemia, defective function of natural killer cell, and massive infiltration of several organs by activated lymphocytes and macrophages. The clinical features of the disease include fever, hepatosplenomegaly, cytopenia, and less frequently neurological abnormalities ranging from irritability and hypotonia to seizures, cranial nerve deficits and ataxia. Some patients may present in early infancy with severe diarrhea, prior to the onset of typical FHL features, whereas others present later in childhood and have a more protracted course without diarrhea. The early-onset diarrhea is due to enteropathy reminiscent of microvillus inclusion disease. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 613101

PMID 19804848 ↗ · PMID 19884660 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000221283 · 1,885 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGGACACACCCGGAAGCGGCGGCGGCGCCCCTCGGGGAAG40
41ATGGCGCCCTCGGGGCTGAAGGCGGTGGTGGGGGAAAAAA80
81TTCTGAGCGGAGTTATTCGGAGTGTCAAGAAGGATGGGGA120
121GTGGAAGGTGCTTATCATGGATCACCCAAGCATGCGCATC160
161TTGTCTTCCTGCTGCAAAATGTCAGATATCCTGGCTGAGG200
201GCATCACCATTGTTGAAGACATCAACAAACGGCGGGAACC240
241CATTCCCAGTCTGGAGGCCATTTATTTGCTGAGCCCCACG280
281GAGAAGTCGGTTCAGGCCCTGATCAAAGACTTCCAGGGGA320
321CCCCGACTTTCACCTACAAAGCGGCCCATATCTTCTTCAC360
361CGACACCTGCCCCGAGCCCCTGTTCAGTGAGCTAGGCCGC400
401TCTCGTCTGGCAAAGGTGGTGAAGACGTTGAAGGAGATTC440
441ACCTTGCCTTCCTCCCCTACGAGGCCCAGGTGTTCTCCCT480
481CGATGCTCCCCACAGCACCTACAACCTCTACTGCCCCTTC520
521CGGGCAGAGGAGCGCACGCGGCAGCTCGAGGTGCTGGCCC560
561AGCAGATTGCCACGCTGTGCGCCACCCTGCAGGAGTACCC600
601GGCCATCCGCTACCGCAAGGGCCCAGAGGACACAGCCCAG640
641TTGGCCCACGCCGTCCTGGCCAAGCTGAACGCCTTCAAGG680
681CAGACACTCCCAGTCTGGGCGAGGGCCCAGAGAAAACCCG720
721CTCCCAGCTGCTGATAATGGACCGGGCAGCTGACCCCGTG760
761TCCCCACTACTGCATGAGCTCACGTTCCAGGCCATGGCGT800
801ATGATCTGCTGGACATAGAGCAGGACACATACAGGTATGA840
841GACCACCGGGCTGAGCGAGGCGCGGGAGAAGGCCGTCTTG880
881CTGGACGAGGACGATGACTTGTGGGTGGAGCTTCGCCACA920
921TGCATATCGCAGATGTGTCCAAGAAGGTCACGGAGCTCCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。