演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

STX8CARB

syntaxin 8

STX8 編碼 syntaxin 8,屬於 syntaxin 家族的囊泡運輸蛋白,參與早期分泌途徑;它也可能促進順面高基氏體膜至內質網的逆向運輸。

Homo sapiens17p13.1UniProt Q9UNK0
OFFICIAL SYMBOL
STX8
CHROMOSOME
17
UNIPROT
Q9UNK0
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

STX8 是一個蛋白質編碼基因,產物 syntaxin 8 屬於 syntaxin 家族,為囊泡運輸相關蛋白。其功能註解指出它參與早期分泌途徑,並可能與細胞內膜系統之間的運輸有關。蛋白質具有單次穿膜的第四型膜蛋白架構:大部分區域位於細胞質側,另有短小區段位於囊泡側。這種拓樸配置是 syntaxin 8 的基本結構特徵。

Official symbol
STX8
Gene name
syntaxin 8
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11443
UniProt
Q9UNK0
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CARB

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717p13.1
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegSTX8pq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr17:9,250,149–9,576,591
Gene span
326,443 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000306357 ★9,250,471–9,575,8208
ENST000005744319,250,471–9,575,8377
ENST000009518489,250,471–9,575,8645
ENST000010425589,250,471–9,575,8648
ENST000010999029,250,471–9,575,8645
ENST000011354619,250,471–9,575,8648
ENST000011082139,490,553–9,575,8645
ENST000005730169,505,148–9,576,5916

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

syntaxin 8 是囊泡運輸蛋白,來源註記將其功能置於早期分泌途徑。這表示它與細胞內膜系統間的運輸過程相關,但現有資料沒有進一步說明它在此途徑中的具體作用方式或運輸貨物。

另一項可能功能是介導由順面高基氏體膜返回內質網的逆向運輸。此作用以「可能」描述,因此應視為推定,而非已確立的機制;資料也未提供其發生條件、所需分子或實驗觀察細節。

因此,現有功能資訊支持的重點是 syntaxin 8 與囊泡運輸及早期分泌途徑的關聯,以及它可能參與順面高基氏體至內質網的逆向運輸。來源未進一步界定這些作用的分子步驟或更廣泛的生物學後果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 9575820 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>STX8 ENST00000306357 GRCh38 chr17:9575720-9576820 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTACACGTCCTCCGAATTCCTAAACCAGCCAGCCCAAAGATGCTGGAGGCCTCACCATTGAAGCCGATCA
CGGCGTCAAGTTCCAGCTCCGCCACTTGGGCCTCCGGCGAAATTTTGTTATCCATCCTTGGGAGGTTCTG
ATTACTTTGCTCTCCTCCCTAGTGGCTGCAGCGTCTTCTGGTCGTTATGGTAACGGACGAGCGCATGCGC
TCCAGCTCCACGCCCGCGCAGAAACCCAGCCTGCCGAGTTCGAGTTCATTAGCATTCTTGGAAATGAAGG
GGTATGGGGACTGGAAGAGAGATGGGGTGGGACTCCTCTTCTTTTTTTTTGTGCTATTTCTCTGGAAATT
TAGGGGATGGCACTAACTGCGCAGAACTAATTCCTCCATCCCCTTGTGTAGAGTCTGTGACTTCTTAGTA
ACTCTAAAATCAAGCACCGAATGAATGGCATTTAAAAAATATGTAATCAGGCGTACAGGACTGATAGGAA
GGCTGCTATAAAAAATATATATAATTGATACTTCTTTGGGCCCCTGTTTGGAGCAGTGTGAAAAAAATTT
TAAAGATTTTTTAAAAAGCGTTGAGGTATAATTTACATATCATAAAGTTAACTTAAAGTAGGTTGTAGTG
AGTTTACGCAGCGTGCAAGTCTCACCGCAATCTAGTGTTTTGTTTATTGTTTTGTTTTTGAAGCAGGATA
AATTTTTAAGTAACTGCTACAGAGAGGTCTTGCAGCGCTCCCACCTTCCTGGGAAAATGCTTTGTTTCTA
TTTAACAATTTTAACTGAGCTTAGCAGTTCGCGTCTCTTGGTGGGAGTAGATTGCTCCAGTGTACTGTCC
GCAGGGGAGCGCTTTGCTTTCTCTGATTATAGTTCTGAGGCCCTAGCTACTCACTTTGCAAACTCCAGGC
TCCGGTCGCGCACGGGACGAACTGCGGGGAGTGAGCCGCGCGGGCCGCCGTAGTCAGCTGCTAAGAGCAG
GAAGAGTCCGAGCGGCGGGCGGAGTCTGCAGGATGGCACCGGACCCCTGGTGAGTCCCGGGTGAGGGCGG
CGGTGCGTGGAGGGACCTTCGGGGAGGCCGGGCTTCCGGAGAGCAGGCAAT
STX8 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
STX8_1 ↗17:9,575,820負股9,575,810–9,575,869
STX8_2 ↗17:9,576,591負股9,576,581–9,576,640

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_B3WBC · enhancer · 9575180–9575809 · regulatory

ENSR17_B3WBG · promoter · 9575810–9576692 · regulatory

ENSR17_548S23 · CTCF_binding_site · 9576149–9576170 · regulatory

ENSR17_B3WBK · enhancer · 9576693–9577642 · regulatory

ENSR17_548S7K · CTCF_binding_site · 9577339–9577360 · regulatory

· motif · 9575759–9575775 · motif

· motif · 9576003–9576014 · motif

· motif · 9576151–9576167 · motif

· motif · 9576591–9576602 · motif

· motif · 9576591–9576602 · motif

· motif · 9576610–9576621 · motif

· motif · 9576610–9576621 · motif

· motif · 9577341–9577357 · motif

· motif · 9577750–9577759 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:236 aa

1 aa236 aa結構域跨膜區拓樸區域
依 Q9UNK0 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

syntaxin 8 全長 236 個胺基酸,屬於 syntaxin 家族。其第 1–215 位胺基酸區段位於細胞質,第 216–232 位形成螺旋狀穿膜區,作為第四型膜蛋白的錨定段;第 233–236 位位於囊泡側。第 145–207 位含有 t-SNARE coiled-coil homology 結構域。

拓樸區域Cytoplasmic1–215 aa
跨膜區Helical; Anchor for type IV membrane protein216–232 aa
拓樸區域Vesicular233–236 aa
結構域t-SNARE coiled-coil homology145–207 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9UNK0…

AlphaFold · Q9UNK0

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Membrane

syntaxin 8 是單次穿膜蛋白,主要與早期內體相關;依相似性推定,它也較少出現在晚期內體、細胞膜與被覆小窩。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 50 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CARBSTX8AMIGO1ASGR2BCL2L13BIKBSNDCD300ECD79ACERS4CLDN9CPLX4CREB3L1DHRS9EBPERGIC3FAM174AFAM209AFFAR2FKBP7FNDC9GJA8GJB1GORABGPR151GPR152GPR42GPX8JAGN1JSRP1KCNMB1MCEEMCL1MFFMGST2MGST3MMGT1MS4A3MTERF3NCR3LG1NDUFAF1NDUFAF2PEX12RETREG3RNASEKSAR1ASCN3BSGPL1SLC10A6SLC18A1SSMEM1STAR
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 66 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

STX8 與 STX7、VTI1B、VAMP8 形成 SNARE 複合體,並屬於含有 STX7、VAMP8 與 VTI1B 的 SNARE 核心複合體;該複合體參與晚期內體的同型融合。另有依相似性註記的互作:STX8 與 VAMP8、HECTD3 及 TPC1 互作。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能STX8 是參與囊泡運輸的蛋白質,功能與早期分泌途徑相關;它可能藉由介導順面高基氏體膜至內質網的逆向運輸發揮作用。此運輸機制以可能性描述,並非確定的功能結論。資料庫紀錄
證據與來源

Vesicle trafficking protein that functions in the early secretory pathway, possibly by mediating retrograde transport from cis-Golgi membranes to the ER

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用STX8 與 STX7、VTI1B、VAMP8 形成 SNARE 複合體,並屬於包含 STX7、VAMP8、VTI1B 的 SNARE 核心複合體;該複合體參與晚期內體的同型融合。此外,STX8 與 VAMP8、HECTD3、TPC1 的互作均以相似性證據註記。推論支持
證據與來源

Forms a SNARE complex with STX7, VTI1B and VAMP8 which functions in the homotypic fusion of late endosomes. Part of the SNARE core complex containing STX7, VAMP8 and VTI1B. Interacts with VAMP8 (By similarity). Interacts with HECTD3 (By similarity). Interacts with TPC1 (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位STX8 是單次穿膜的第四型膜蛋白,主要與早期內體相關;依相似性推定,它也少量存在於晚期內體、細胞膜及被覆小窩。早期內體是其偏好的定位,其他位置則屬較次要的分布。推論支持
證據與來源

Membrane / Single-pass type IV membrane protein; Preferentially associated with the early endosome. To a lesser extent, also present in late endosome, the plasma membrane and coated pits (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000306357 · 830 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGAGTCTGCAGGATGGCACCGGACCCCTGGTTCTCCACAT40
41ACGATTCTACTTGTCAAATTGCCCAAGAAATTGCTGAGAA80
81AATTCAACAACGAAATCAATATGAAAGAAAAGGTGAAAAG120
121GCACCAAAGCTTACCGTGACAATCAGAGCTTTGTTGCAGA160
161ACCTGAAGGAAAAGATCGCCCTTTTGAAGGACTTATTGCT200
201AAGAGCTGTGTCAACACATCAGATAACACAGCTTGAAGGG240
241GACCGAAGACAGAACCTCTTGGATGATCTTGTAACTCGAG280
281AGAGACTACTTCTGGCATCCTTTAAGAATGAGGGTGCCGA320
321ACCAGATCTAATCAGGTCCAGCCTGATGAGTGAAGAGGCT360
361AAGCGAGGAGCACCCAACCCTTGGCTCTTTGAGGAGCCAG400
401AGGAGACCAGAGGCTTGGGTTTTGATGAAATCCGGCAACA440
441GCAGCAGAAAATTATCCAAGAACAGGACGCAGGCCTTGAT480
481GCCCTTTCCTCTATCATAAGTCGCCAAAAACAAATGGGGC520
521AGGAAATTGGGAATGAATTGGATGAACAAAATGAGATAAT560
561TGACGACCTTGCCAACCTAGTGGAGAACACAGATGAAAAA600
601CTTCGCAATGAAACCAGGCGGGTAAACATGGTGGACAGAA640
641AGTCAGCCTCTTGTGGGATGATCATGGTGATTTTACTGCT680
681GCTTGTGGCTATCGTGGTTGTTGCAGTCTGGCCGACCAAC720
721TGATGGCAGTAAAGAGACCACCAGCAGTGACACCTGCCAA760
761TGACAGATGCAAGCCCAACACCCTTTTGGTACGCAAAACC800
801TGCTCTCAATAAATTCCCCCAAAGCTCTGA830

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。