演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

STX7

syntaxin 7

STX7 是編碼 syntaxin 7 的基因;其產物可能參與內膜系統中的囊泡運輸與膜融合。

Homo sapiens6q23.2UniProt O15400
OFFICIAL SYMBOL
STX7
CHROMOSOME
6
UNIPROT
O15400
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

STX7 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 syntaxin 7。其產物參與細胞內膜系統相關過程;現有資料描述它可能參與從質膜到早期內體的蛋白質運輸,也與內吞胞器融合及內體間的運輸有關。這些資料提供的是功能概述,未說明該基因產物的其他基本分子特徵。

Official symbol
STX7
Gene name
syntaxin 7
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11442
UniProt
O15400
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 66q23.2
chr6 · 170,805,979 bp · GRCh38chr6p25.3 · 1–2300000 · gnegchr6p25.2 · 2300001–4200000 · gpos25chr6p25.1 · 4200001–7100000 · gnegchr6p24.3 · 7100001–10600000 · gpos50chr6p24.2 · 10600001–11600000 · gnegchr6p24.1 · 11600001–13400000 · gpos25chr6p23 · 13400001–15200000 · gnegchr6p22.3 · 15200001–25200000 · gpos75chr6p22.2 · 25200001–27100000 · gnegchr6p22.1 · 27100001–30500000 · gpos50chr6p21.33 · 30500001–32100000 · gnegchr6p21.32 · 32100001–33500000 · gpos25chr6p21.31 · 33500001–36600000 · gnegchr6p21.2 · 36600001–40500000 · gpos25chr6p21.1 · 40500001–46200000 · gnegchr6p12.3 · 46200001–51800000 · gpos100chr6p12.2 · 51800001–53000000 · gnegchr6p12.1 · 53000001–57200000 · gpos100chr6p11.2 · 57200001–58500000 · gnegchr6p11.1 · 58500001–59800000 · acenchr6q11.1 · 59800001–62600000 · acenchr6q11.2 · 62600001–62700000 · gnegchr6q12 · 62700001–69200000 · gpos100chr6q13 · 69200001–75200000 · gnegchr6q14.1 · 75200001–83200000 · gpos50chr6q14.2 · 83200001–84200000 · gnegchr6q14.3 · 84200001–87300000 · gpos50chr6q15 · 87300001–92500000 · gnegchr6q16.1 · 92500001–98900000 · gpos100chr6q16.2 · 98900001–100000000 · gnegchr6q16.3 · 100000001–105000000 · gpos100chr6q21 · 105000001–114200000 · gnegchr6q22.1 · 114200001–117900000 · gpos75chr6q22.2 · 117900001–118100000 · gnegchr6q22.31 · 118100001–125800000 · gpos100chr6q22.32 · 125800001–126800000 · gnegchr6q22.33 · 126800001–130000000 · gpos75chr6q23.1 · 130000001–130900000 · gnegchr6q23.2 · 130900001–134700000 · gpos50chr6q23.3 · 134700001–138300000 · gnegchr6q24.1 · 138300001–142200000 · gpos75chr6q24.2 · 142200001–145100000 · gnegchr6q24.3 · 145100001–148500000 · gpos75chr6q25.1 · 148500001–152100000 · gnegchr6q25.2 · 152100001–155200000 · gpos50chr6q25.3 · 155200001–160600000 · gnegchr6q26 · 160600001–164100000 · gpos50chr6q27 · 164100001–170805979 · gnegSTX7pq1 bp170,805,979 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr6:132,409,374–132,513,999
Gene span
104,626 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000367941 ★132,445,867–132,513,11610
ENST00001130746132,409,374–132,513,3153
ENST00001139390132,445,867–132,513,31510
ENST00000862289132,452,625–132,512,85310
ENST00000862290132,457,915–132,512,80510
ENST00000942368132,457,932–132,513,3158
ENST00000862291132,459,023–132,513,31511
ENST00000862292132,459,513–132,513,3154
ENST00000942369132,459,514–132,513,11610
ENST00000862293132,460,583–132,513,99910
ENST00000367937132,461,714–132,513,31510

顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

syntaxin 7 可能參與內吞路徑中的蛋白質運輸與膜融合。資料指出,它可能協助蛋白質由質膜運送至早期內體,也可能參與內吞胞器之間的同型融合;「可能參與」反映來源所保留的不確定性。

此外,syntaxin 7 介導由早期內體前往晚期內體及溶酶體的內吞運輸。這項作用將內吞貨物在不同胞器間的移動與後續路徑連結起來;來源未進一步說明其所運送的特定貨物或調控方式。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 132513116 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>STX7 ENST00000367941 GRCh38 chr6:132513016-132514116 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGTGTTCCTTCAATGATTGAAATGTTTCTTCCTACGTTCACCAGCCACTTCCTAATTCTCAAGTACAATG
CACTACTTTCAGTTCTTTATTTACTTGAACTTTGTGTAACAGGTGACATCATGGACAATTCCCTCCTTTT
TTCCTTCATTCTCTAGTTTACCTTTTCCTGGTTTATTTCCTATCTTGTGGGTTACTCGTTTTCAGGGTTA
TTCTTTCTCTGTCCATCTCTCTTAAGCAGACAACATTCCACACTTAGTGTTGGTGAGTTCCAATCAGAAT
TCTATCCTGGGTTTTGTTTTTTTCCACCTAAGTGCGTCTGGACTTTTGATATCACCTATCCGGGTAATCA
TTTTAGAAAATAGTGTTGCCTTAATATAGGCAAAGGCTAAGCCAATCTATCTTCTAATTAATTTGGAGAG
GGCTTTCTTTCATTTGTAGCAATTGATGCTTTTCATCTAACAATTACAATATATTTGCATATTTATCATT
GGAACTGTCTCTGCTTGTTTTAAACCCTGTGAAAACTACGCCCTGCTTTTCAGGAATGCTTAGAATGACT
TGTATGTACTAGGAAAACTTGTTTACAAGTGAGCACCCAGAGATGACTCTTCACTTATTCCTTCATTGTT
CCTGCTAGGATTGTGTACTCGCCTTTGCATTTTTCGATAGAGCTGTCAACGCGATCTACTGCAGTTAAAG
GTTAGCAAACAAGACAGGCAAGAGCTAATGGGGCGGGGTGAAGACCCGCGTGCAAGAAGGCTGGCTTCAC
CAGATAAAGAAGACAACTGTCCTCCATTCTGTCCTTTTTTGCACGCAGGCTAAGAGGCGTTCACCATCTC
TACGTCAGGCTTCAAAGAACAGCTCCCTTGCAATTTTGCTGATACCCCCATTCCTTAGCTTGGAACCGGA
GGGGCGGTGAGGGCCGCTGTCACTCAGCCCCGCGGGCCAATAGAAAAGGGGTGAACCCCGCCTTCTTCCT
GAGTTGTGCTGCGGGCATGCGCACTGGGCGTCCCCACGCCACCGCCCATCAGCTGAGAATTGCAGCTGAG
GGCTCCGGGGTAGGTGGGTGACGGCGGTCGGAGGTGTAGGAGGGAGCCGTG
STX7 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
STX7_1 ↗6:132,513,116負股132,513,106–132,513,165

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR6_BZB37 · enhancer · 132510988–132511783 · regulatory

ENSR6_CH62N · enhancer · 132511930–132513105 · regulatory

ENSR6_5366JL7 · CTCF_binding_site · 132512365–132512386 · regulatory

ENSR6_5366JNR · CTCF_binding_site · 132512921–132512942 · regulatory

ENSR6_BZB3H · promoter · 132513106–132513688 · regulatory

· motif · 132510482–132510497 · motif

· motif · 132510482–132510497 · motif

· motif · 132511325–132511341 · motif

· motif · 132511325–132511341 · motif

· motif · 132511336–132511352 · motif

· motif · 132511336–132511352 · motif

· motif · 132511411–132511426 · motif

· motif · 132511713–132511728 · motif

· motif · 132511750–132511762 · motif

· motif · 132511752–132511774 · motif

· motif · 132511752–132511774 · motif

· motif · 132512290–132512301 · motif

· motif · 132512293–132512308 · motif

· motif · 132512367–132512383 · motif

· motif · 132512557–132512570 · motif

· motif · 132512567–132512580 · motif

· motif · 132512606–132512619 · motif

· motif · 132512609–132512624 · motif

· motif · 132512615–132512627 · motif

· motif · 132512617–132512624 · motif

· motif · 132512617–132512632 · motif

· motif · 132512714–132512727 · motif

· motif · 132512923–132512939 · motif

· motif · 132512932–132512949 · motif

· motif · 132512987–132513000 · motif

· motif · 132513029–132513038 · motif

· motif · 132513114–132513125 · motif

· motif · 132513114–132513125 · motif

· motif · 132513234–132513245 · motif

· motif · 132513993–132514006 · motif

· motif · 132513993–132514006 · motif

· motif · 132514058–132514071 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:261 aa

1 aa261 aa結構域功能區域跨膜區拓樸區域
依 O15400 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

syntaxin 7 屬於 syntaxin family,全長 261 個胺基酸。其第 2–238 位胺基酸位於細胞質側,第 239–259 位形成跨膜螺旋,作為單次跨膜蛋白的錨定區;第 260–261 位位於囊泡側。第 165–227 位具有 t-SNARE coiled-coil homology domain;第 129–148 位則註解為無序區域。

拓樸區域Cytoplasmic2–238 aa
跨膜區Helical; Anchor for type IV membrane protein239–259 aa
拓樸區域Vesicular260–261 aa
結構域t-SNARE coiled-coil homology165–227 aa
功能區域Disordered129–148 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O15400…

AlphaFold · O15400

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Early endosome membrane

syntaxin 7 位於早期內體膜,註解為單次跨膜的 type IV membrane protein。 資料未提供其在不同條件下的定位變化或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 43 個夥伴 · 最多顯示 50 個
STX7STX7ANKS6AQP6ARL13BCERS4CISD2CREB3L1CYBRD1EBPELOVL5FAM174AFAM210BFKBP7GJC3HSD17B11HSD17B13JAGN1LIME1LSMEM2MFFMGST3MRM1MTUS1REEP1RETREG3RIC3SAR1ASLC10A1SLC10A6STX1ASTX2STX4TM4SF19TMEM205TMEM241TMEM267TMEM80TMPRSS2TMX2VAMP8VPS11VPS18YKT6ZFYVE27
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 43 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

syntaxin 7 與 VTI1B、STX8 和 VAMP8 形成 SNARE 複合體,參與晚期內體的同型融合。它也被列為由 STX7、STX8、VAMP7 和 VTI1B 組成的 SNARE 複合體成員;此複合體被描述為晚期內體與溶酶體異型融合所需,並標註為依相似性推定。另有資料記載 syntaxin 7 與 VPS11、VPS16、VPS18、VPS33A 及 TPC1 互作;TPC1 的互作同樣標註為依相似性推定。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能syntaxin 7 可能參與由質膜至早期內體的蛋白質運輸,也可能參與內吞胞器的同型融合;此外,它介導由早期內體前往晚期內體及溶酶體的內吞運輸。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in protein trafficking from the plasma membrane to the early endosome (EE) as well as in homotypic fusion of endocytic organelles. Mediates the endocytic trafficking from early endosomes to late endosomes and lysosomes

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用syntaxin 7 與 VTI1B、STX8、VAMP8 形成參與晚期內體同型融合的 SNARE 複合體;另為 STX7、STX8、VAMP7、VTI1B 複合體成員,該複合體依相似性推定為晚期內體與溶酶體異型融合所需。syntaxin 7 亦與 VPS11、VPS16、VPS18、VPS33A 及 TPC1 互作;TPC1 互作依相似性推定。含實驗來源
證據與來源

Forms a SNARE complex with VTI1B, STX8 and VAMP8 which functions in the homotypic fusion of late endosomes. Component of the SNARE complex composed of STX7, STX8, VAMP7 and VTI1B that is required for heterotypic fusion of late endosomes with lysosomes (By similarity). Interacts with VPS11, VPS16 and VPS18. Interacts with VPS33A. Interacts with TPC1 (By similarity)

PMID 11382755 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位syntaxin 7 定位於早期內體膜,並註解為單次跨膜的 type IV membrane protein。推論支持
證據與來源

Early endosome membrane / Single-pass type IV membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000367941 · 15,845 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCACTGGGCGTCCCCACGCCACCGCCCATCAGCTGAGAAT40
41TGCAGCTGAGGGCTCCGGGGTAGGTGGGTGACGGCGGTCG80
81GAGGTGTAGGAGGGAGCCGTGGAGGTCCAGGTGACTGCTT120
121AGAAAACTGCACAGCATCTGATGAAATTAGCGAATAAGAA160
161CATCAACCATGTCTTACACTCCAGGAGTTGGTGGTGACCC200
201CGCCCAGTTGGCCCAGAGGATCTCTTCTAACATCCAGAAG240
241ATCACACAGTGTTCTGTGGAAATACAAAGAACTCTGAATC280
281AACTTGGAACACCTCAAGATTCACCTGAATTGAGGCAACA320
321GTTGCAACAGAAGCAGCAGTATACTAACCAGCTTGCCAAA360
361GAAACAGATAAGTACATTAAAGAGTTTGGATCTCTGCCCA400
401CCACCCCCAGTGAACAGCGTCAAAGGAAAATACAGAAGGA440
441TCGCTTAGTGGCAGAGTTCACAACATCACTGACAAACTTC480
481CAGAAGGTCCAGAGGCAGGCTGCTGAGCGAGAGAAAGAGT520
521TTGTTGCTCGAGTAAGAGCCAGTTCCAGAGTGTCTGGCAG560
561TTTTCCTGAGGACAGCTCAAAAGAAAGGAATCTTGTATCC600
601TGGGAAAGCCAAACTCAACCTCAAGTGCAGGTGCAGGATG640
641AAGAAATTACAGAGGATGACCTCCGTCTTATTCATGAGAG680
681AGAATCTTCTATCAGGCAACTTGAAGCTGATATTATGGAT720
721ATTAATGAAATATTTAAAGATTTGGGAATGATGATTCATG760
761AACAAGGAGATGTAATAGATAGCATAGAAGCCAATGTGGA800
801AAATGCAGAGGTGCACGTTCAGCAAGCAAATCAGCAGCTG840
841TCAAGGGCAGCAGATTATCAGCGCAAATCCAGAAAAACCC880
881TGTGCATCATCATTCTTATCCTTGTCATTGGAGTTGCGAT920
921TATCAGTCTCATCATATGGGGATTGAACCACTGAAGTTAT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。