基因總覽
STX6 是蛋白質編碼基因，產物 syntaxin 6 屬於 syntaxin 家族，並具有 SNARE 相關功能。其蛋白質含有細胞質區域與單次跨膜區，跨膜區位於蛋白質末端；另有 t-SNARE coiled-coil homology 區域。這些特徵構成 syntaxin 6 的基本分子形態。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000258301 ★ | 180,972,725–181,022,870 | 8 |
| ENST00000542060 | 180,972,712–181,023,121 | 6 |
| ENST00001145618 | 180,972,725–181,023,121 | 8 |
| ENST00000996770 | 180,973,031–181,023,121 | 9 |
| ENST00000996769 | 180,973,039–181,023,121 | 8 |
| ENST00001040822 | 180,974,960–181,023,121 | 7 |
| ENST00001040821 | 180,974,962–181,023,121 | 8 |
| ENST00001107691 | 180,982,744–181,023,121 | 7 |
| ENST00001107692 | 180,982,744–181,023,121 | 8 |
| ENST00000996771 | 180,987,745–181,023,121 | 6 |
| ENST00001113129 | 180,993,963–181,023,121 | 4 |
顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
syntaxin 6 是 SNARE，參與運輸囊泡移向目標膜的過程。來源指出，它可將胞內體導向 trans-Golgi network，因此可能參與逆向運輸；此功能敘述使用「可能」，不應視為已確定的路徑作用。
syntaxin 6 也與 SNARE STX12 一同促進囊泡由胞內體移向細胞膜，因而可能參與內吞回收路徑。這項描述將 STX6 與 STX12 的作用置於同一囊泡運輸情境中，但來源並未進一步界定其作用步驟或調控條件。
Promoter 與基因調控
>STX6 ENST00000258301 GRCh38 chr1:181022770-181023870 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GAACTTATTTTCTTATCTACAAAATGAGAAAAATGGATGGTGTGGTGGCTCACGCCCATAATCCCACCAC TTTGGGAGGCAGAGGCAGGAGGATCATGTGAGCTCAGGTGTTCAAGGCCAGCCTAGGAAATATACTGAGA GCCCCATCTCTATAAAAAATTTAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCTCACCTGTAGTCCCAGCTACTCG GGAGGCTGAGGCCGGAGGATCGCTTGAGCCCAGGAGGTCAAGGGTGCAGTGAGCTGTGATTGTGCCACTA CACTCCAGCCAGGGTGACAGAGAGAGACCCTGCCCCCCAAAAAGGGGGAGGGGGGAATAATACTTTCCCC CAAAGGATACTGAGATGATGCATACACAACCTTTAGCACACTGTCCAACACAAAGCAAGACCTACTTAAA GGATCTGTGTAACATTATAATCAGATACTATGCTTCATTTTAAGTCGAGGACCAGATAGATTTATAAATT ACATACTGTCAAAATTAAGTATTAAAAGTAGAGGAAAGGTAAGAGGATTTTGCAAATCAGGTACAACTAC AGCTTATCCTGAAAAGCCGACTGCCTAGTTCTGAGGGAACAAGCCACTCCTCACCCTCAAGCTTGAGGAG AGGGCTGTAGAAGCCCGCCCACCTCCACCGCCCCGAGGGCTCCGCCTCCAGGGCCGAGGGACGCAGGCGT AAGCCCCGCCCACTGGGGGGGGGGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGA GAGAGGAGAGAGAGGAGAGAGAGGAGAGAGAGGAGAGAGAGGAGAGAGAGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA GATATATGCCCTGGTCACGTGAGCGGGGTGCGGAAGTCGTGTTTCAGGCGGCGTTCGTGATTGGCCGCGG CCGAGGGTCCCGGGGGTGGGGTCAGGCCCTCCGACGCTTCGGGAGGAGCCGGGACTGGAGGCTGCCGAGG GGGCCGGCGCCCGAGTCCGGGATTCGGCCAGTGGTGCTGAGCGAGTGCTGGACCAGCGGCCGTCCTGTGC ACCTGGCCTGTGCGCGTGCCCGCTGCTCGGCTTCACCCAGACTAAGGCGCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| STX6_1 ↗ | 1:181,022,869 | 負股 | 181,022,859–181,022,918 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：255 aa
syntaxin 6 長 255 個胺基酸，具有細胞質區域（第 2–234 位）及位於第 235–255 位的螺旋狀跨膜區，作為 IV 型膜蛋白的錨定區。第 163–225 位註記為 t-SNARE coiled-coil homology；第 2–168 位則被標示為與 VPS51 互作所需區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
syntaxin 6 位於高基氏體膜、trans-Golgi network 膜及回收胞內體膜，並以單次跨膜的 IV 型膜蛋白形式註記。 來源未提供定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 27 個夥伴
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STX6、STX12、VAMP4 與 VTI1A 曾被辨識於同一複合體。另有資料指出 STX6 與 EEA1、VPS45A、MARCHF2、MARCHF3、GOPC、BLTP3B、BAIAP3 及 VPS13B 互作；部分互作為相似性推定。STX6 與 BLTP3B 的互作涉及 BLTP3B 的 C 端 coiled-coil domain，與 BAIAP3 的互作則在有鈣時增加。STX6 與 MARCHF2 的互作會促進 MARCHF2 介導的 CFTR 泛素化與降解。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | STX6 是促進運輸囊泡移向目標膜的 SNARE；它可將胞內體導向 trans-Golgi network，可能參與逆向運輸，並與 STX12 一同促進囊泡由胞內體移至細胞膜，可能參與內吞回收路徑。 | 推論支持 | 證據與來源SNARE promoting movement of transport vesicles to target membranes. Targets endosomes to the trans-Golgi network, and may therefore function in retrograde trafficking. Together with SNARE STX12, promotes movement of vesicles from endosomes to the cell membrane, and may therefore function in the endocytic recycling pathway |
| 交互作用 | STX6 與 STX12、VAMP4、VTI1A 同處一複合體，並與多種蛋白質互作，其中部分為相似性推定。它與 BLTP3B 的互作涉及其 C 端 coiled-coil domain，與 BAIAP3 的互作會在有鈣時增加；與 MARCHF2 的互作促進 MARCHF2 介導的 CFTR 泛素化及降解。 | 含實驗來源 | 證據與來源Identified in a complex containing STX6, STX12, VAMP4 and VTI1A. Binds EEA1 (By similarity). Interacts with VPS45A (By similarity). Interacts with MARCHF2; the interaction promotes MARCHF2-mediated ubiquitination and degradation of CFTR. Interacts with MARCHF3 (By similarity). Interacts with GOPC. Interacts with BLTP3B (via C-terminal coiled-coil domain). Interacts with BAIAP3; this interaction is increased in the presence of calcium. Interacts with VPS13B (By similarity) PMID 11384996 ↗ · PMID 17159904 ↗ · PMID 20163565 ↗ · PMID 23818989 ↗ · PMID 28626000 ↗ · PMID 35499567 ↗ |
| 細胞定位 | STX6 被註記為單次跨膜的 IV 型膜蛋白，定位於高基氏體膜、trans-Golgi network 膜及回收胞內體膜。 | 含實驗來源 | 證據與來源Golgi apparatus membrane / Single-pass type IV membrane protein; Golgi apparatus, trans-Golgi network membrane / Single-pass type IV membrane protein; Recycling endosome membrane / Single-pass type IV membrane protein PMID 23818989 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GATTCGGCCAGTGGTGCTGAGCGAGTGCTGGACCAGCGGC40CGTCCTGTGCACCTGGCCTGTGCGCGTGCCCGCTGCTCGG80CTTCACCCAGACTAAGGCGCGGGCAGCTGCGGGAACAGGC120GGGGTGGGCGGAGGGAGACCGGGAGGCACGGGCGCCCTGT160GCGCGGAGGAGGTGAAGGCGGCCGGGGCCGGGACGCCATG200TCCATGGAGGACCCCTTCTTTGTGGTGAAAGGAGAGGTAC240AGAAAGCAGTCAACACTGCCCAGGGATTGTTTCAGAGATG280GACAGAGCTCCTCCAGGACCCCTCCACAGCAACAAGGGAA320GAAATCGACTGGACCACCAACGAGCTGAGAAATAACCTCC360GGAGCATAGAGTGGGATCTAGAGGACCTTGATGAAACCAT400CAGCATAGTTGAAGCAAATCCTAGAAAATTTAACCTTGAT440GCAACTGAATTGAGTATAAGAAAAGCCTTCATTACAAGTA480CTCGGCAAGTTGTCAGGGACATGAAAGATCAGATGTCAAC520TTCATCTGTGCAGGCATTAGCTGAAAGAAAAAATAGACAG560GCACTGCTGGGAGACAGTGGCAGCCAGAACTGGAGCACTG600GAACAACAGATAAATATGGGCGTCTGGACCGAGAGCTCCA640GAGAGCCAATTCTCATTTCATTGAGGAGCAGCAGGCACAG680CAGCAGTTGATCGTGGAACAGCAGGATGAGCAGTTGGAGC720TGGTCTCTGGCAGCATCGGGGTGCTGAAGAACATGTCCCA760GCGCATCGGAGGGGAGCTGGAGGAACAGGCAGTTATGTTG800GAAGATTTCTCTCACGAATTGGAGAGCACTCAGTCCCGGC840TGGACAATGTGATGAAGAAACTTGCAAAAGTATCTCATAT880GACCAGTGATCGGCGCCAATGGTGTGCCATAGCCATCCTC920TTTGCAGTCCTGTTGGTTGTGCTCATCCTCTTCTTAGTGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。