基因總覽
STX17 是人類的蛋白質編碼基因，正式名稱為 syntaxin 17。其產物屬於 syntaxin 家族，也是 SNARE 蛋白；SNARE 蛋白是促進細胞膜融合的重要蛋白。syntaxin 17 的膜結構包含兩段跨膜螺旋，並帶有 t-SNARE coiled-coil homology 區域。這些特徵與其參與膜融合的角色相符；來源亦指出，它是自噬體上的 SNARE。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000259400 ★ | 99,906,654–99,974,534 | 8 |
| ENST00000531035 | 99,906,654–99,951,184 | 5 |
| ENST00000861130 | 99,906,654–99,974,534 | 9 |
| ENST00000992849 | 99,906,654–99,974,534 | 7 |
| ENST00001048439 | 99,906,654–99,974,534 | 7 |
| ENST00001114437 | 99,906,654–99,962,529 | 6 |
| ENST00001118445 | 99,906,654–99,923,017 | 3 |
| ENST00001125595 | 99,906,654–99,962,529 | 7 |
| ENST00000958301 | 99,906,699–99,974,534 | 8 |
| ENST00000861129 | 99,906,702–99,974,534 | 8 |
| ENST00000525640 | 99,906,709–99,974,534 | 8 |
| ENST00000861131 | 99,906,711–99,974,534 | 8 |
顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
STX17 的產物 syntaxin 17 是自噬體上的 SNARE，參與自噬過程中自噬體與溶酶體的膜融合。SNARE 通常位於相對的膜上，組裝成 trans-SNARE complex；此複合體形成延展且平行排列的四股 α 螺旋束，推動兩層膜融合。syntaxin 17 直接參與控制自噬體膜與溶酶體膜的融合，因而有助於自噬體後續與溶酶體結合的步驟。
除自噬相關功能外，syntaxin 17 也可能參與早期分泌路徑。來源提出，它可能維持內質網－高基氏體中間區（ERGIC）與高基氏體的結構，或調節物質在內質網、ERGIC 與高基氏體之間的運輸。這些作用在來源中以可能性描述，尚不能表述為確定功能。
因此，STX17 的功能範圍涵蓋自噬體與溶酶體膜融合，以及可能的早期分泌路徑作用。膜融合由 SNARE 在相對膜面組裝成四股螺旋束所驅動；至於 ERGIC 與高基氏體的結構維持或膜間運輸，則是來源所列的另一種可能角色。
Promoter 與基因調控
>STX17 ENST00000259400 GRCh38 chr9:99905654-99906754 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATACATTATGTCCCCAAAGAAAATCCAAATTGCTTGGTAGATTTGGTGCTTTGTTTTAGAAATTGTCTTT CAAGGCTTTTTAAAGGATCTACAGGCCCCTAATCTTCCCTGTTTACCTCCTACTCTACTGGAAGACCCTA AGAACTCAGTTTCCTTAACTGTGGTTTGAACATCCTGATCACTTCTGAGACAATGCCATTAGTGAATACA TTCTAAGCACGTCATCTGAATATTCACAGACATCTTTTTAAAAGGGCTGGATCTGGAAGTTAGGCCATGA AGAGAGGAGGACCTGTGACTTGGACAAGGCTTCAAAGCCGGCCACCTGCTTGTTCATGTGGTTGCAGCTG GTCTAACTGGAATAACTTGGGAAGGAAATTAGGACACCCAGTTGGAGTTCCAGCTCTGCCATAAGCTGGC TGAACTGGAGTGAGTCACTTAAAACTCTTTGTTAAACCCCAGAGTCATAATCTATAAAATCGGGATAAAG ACGTTTGCCTTAAGCCCTCCACCAGTTTTTGGAGGAAACCACAATTTGCTGAGCTTTAATTTTTACACCT GTTGCAATTAAGATGGCACTCCTGCCCTGTCCACTTCACAGGGCTTTTGGGGACGGGATGGGGAGGCACC ACCTTTCTGAGCTTCAGTTTCAAAACAGAGCTAAGAATACATGCCCAACCCGCAAATAAAATTCTAGGAA GAACAGAGGAAAACGGACAGGAAAACTGCGAAATGCAGTCGGCCATACAAGCATGAATTGTCTTAAACAC AACAAGCAGACCTAAAGAGCGTTTGTGCGTCTCTCTCCTCTTGGCTCGAGTCACAACCCCATAACGTAAA TCAATATCACTTTTGAAAAAGGCTTTCGCTGTTCTCAGCAGCGTCCGCATTTGTACTCACCTGTGCGCCC CCAGCGCCCGGCCTGGGGGCCCTGCGGGGCGGGGGCGGGGGCGGGGGCGGGGCCCAACCCTGCCCACCCC TCGTGATGCCCCGCCCCGTCGCTCCTGCGCCTGCGCCGTGCCCACCGACCGGCCTCGAGCGCCCCGGCGG GAGGTAAGGGGCTCTCTGGAGGCCGCCTTTGGGGGCGTCGGGCCCTCACAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| STX17_1 ↗ | 9:99,906,654 | 正股 | 99,906,605–99,906,664 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR9_BPSC2 · enhancer · 99905816–99906561 · regulatory
ENSR9_84XBCC · promoter · 99906562–99906722 · regulatory
ENSR9_BPSC6 · enhancer · 99906723–99907618 · regulatory
· motif · 99902512–99902523 · motif
· motif · 99906185–99906196 · motif
· motif · 99906589–99906602 · motif
· motif · 99906595–99906608 · motif
· motif · 99906601–99906614 · motif
· motif · 99906659–99906670 · motif
· motif · 99906659–99906670 · motif
· motif · 99906953–99906968 · motif
· motif · 99907068–99907081 · motif
· motif · 99907094–99907103 · motif
· motif · 99907174–99907183 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：302 aa
syntaxin 17 長 302 個胺基酸，具有 t-SNARE coiled-coil homology 區域（胺基酸 162–224）。C 端含兩段跨膜螺旋（229–249、255–275），其間為腔面區段；蛋白質其餘註記區段位於細胞質側。229–275 區域對定位至自噬體是必要且足夠的，末端另有內質網滯留訊號。
蛋白質三維結構
細胞內定位
syntaxin 17 可位於內質網、ERGIC、自噬體及 COPII 包被囊泡等膜，也有細胞質溶膠定位。 細胞飢餓時，它會定位至已完成的自噬體膜；在自噬誘導條件下，則與 RAB39A、RAB39B 共定位於自噬溶酶體。 來源亦列出其位於粒線體膜及自噬溶酶體膜。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 8 個夥伴
- ACSL3O95573 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- SNAP29O95721 · UniProt INTERACTION · 11 experiments
- VAMP8Q9BV40 · UniProt INTERACTION · 11 experiments
- VPS16Q9H269 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VPS33AQ96AX1 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- VPS39Q96JC1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- VPS41P49754 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- Vamp7P70280 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
syntaxin 17 與 SNAP29、VAMP8 組成 SNARE 複合體，參與自噬體與溶酶體融合；另有直接結合 TMED9、TMED10 的記載。它也與 VAMP7、VTI1B、ATG14、RUBCNL/PACER、IRGM、GABARAP、MAP1LC3B、RNF115 及 RAB39A、RAB39B 等互作。與 RAB39A（GTP 結合型）的互作可促進由 STX17-SNAP29-VAMP8 驅動的膜融合；RAB39B 可能涉及不同的自噬功能。另據記載，SARS-CoV-2 ORF3A 存在時，syntaxin 17 與 VAMP8、SNAP29、VPS41 的互作會減少。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SNARE 蛋白對細胞膜融合不可或缺；位於相對膜面的 SNARE 可組成延展、平行排列的四股 α 螺旋束，推動膜融合。STX17 是自噬體上的 SNARE，直接控制自噬體膜與溶酶體膜融合。它也可能參與早期分泌路徑，維持 ERGIC 與高基氏體結構，或調節內質網、ERGIC 和高基氏體間的運輸。 | 含實驗來源 | 證據與來源SNAREs, soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor-attachment protein receptors, are essential proteins for fusion of cellular membranes. SNAREs localized on opposing membranes assemble to form a trans-SNARE complex, an extended, parallel four alpha-helical bundle that drives membrane fusion. STX17 is a SNARE of the autophagosome involved in autophagy through the direct control of autophagosome membrane fusion with the lysosome membrane. May also play a role in the early secretory pathway where it may maintain the architecture of the endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment/ERGIC and Golgi and/or regulate transport between the endoplasmic reticulum, the ERGIC and the Golgi PMID 21545355 ↗ · PMID 23217709 ↗ · PMID 25686604 ↗ · PMID 28306502 ↗ · PMID 28504273 ↗ |
| 交互作用 | STX17 與 SNAP29、VAMP8 組成參與自噬體－溶酶體融合的 SNARE 複合體，並與多種蛋白互作；其中包括直接結合 TMED9、TMED10，以及可能依序列相似性互作的 BET1、SCFD1、SEC22B 和 COPB1。互作亦涉及磷酸化、招募或定位、穩定性及自噬體成熟；TMEM39A 缺失時，與 VAMP8、SNAP29、VPS39、VPS41 的互作增加。RAB39A（GTP 結合型）促進膜融合，而 RAB39B 可能涉及不同的自噬功能。 | 含實驗來源 | 證據與來源Forms a SNARE complex composed of VAMP8, SNAP29 and STX17 involved in fusion of autophagosome with lysosome. Interacts with VAMP7 and VTI1B. Probably interacts with BET1, SCFD1 and SEC22B (By similarity). Interacts with PTPN2 and ABL1; involved in STX17 phosphorylation. Interacts with COPB1 (By similarity). Interacts with TMED9 and TMED10; the interaction is direct. Interacts with ATG14. Interacts with RUBCNL/PACER; promoting targeting of RUBCNL/PACER to autophagosome. Interacts with VAMP8, SNAP29, VPS39 and VPS41; these interactions are increased in the absence of TMEM39A. Interacts with IRGM; promoting STX17 recruitment to autophagosomes. Interacts with ATG8 proteins GABARAP and MAP1LC3B. Interacts with RNF115; this interaction enhances STX17 stability which in turn promotes autophagosome maturation. Interacts with RAB39A (GTP-bound); the interaction promotes autophagosome-lysosome membrane fusion driven by STX17-SNAP29-VAMP8. Interacts with RAB39B; the interaction may promote a different function in autophagy as compared with RAB39A PMID 21545355 ↗ · PMID 23006999 ↗ · PMID 23217709 ↗ · PMID 25686604 ↗ · PMID 28306502 ↗ · PMID 29420192 ↗ · PMID 30704899 ↗ · PMID 31806350 ↗ · PMID 32980859 ↗ · PMID 33422265 ↗ · PMID 37632749 ↗ · PMID 37821429 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境中，存在 SARS-CoV-2 ORF3A 蛋白時，STX17 與 VAMP8、SNAP29 及 VPS41 的互作減少。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) The interactions with VAMP8, SNAP29 and VPS41 are decreased in presence of SARS coronavirus-2/SARS-CoV-2 ORF3A protein PMID 33422265 ↗ |
| 細胞定位 | STX17 被記載位於內質網、平滑內質網、ERGIC、自噬體與 COPII 包被囊泡膜，也見於細胞質溶膠、粒線體膜及自噬溶酶體膜，並以髮夾狀方式插入膜。細胞飢餓時定位至已完成的自噬體膜；自噬誘導條件下，則與 RAB39A、RAB39B 共定位於自噬溶酶體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Endoplasmic reticulum membrane / Multi-pass membrane protein; Smooth endoplasmic reticulum membrane / Multi-pass membrane protein; Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane / Multi-pass membrane protein; Cytoplasmic vesicle, autophagosome membrane / Multi-pass membrane protein; Cytoplasmic vesicle, COPII-coated vesicle membrane / Multi-pass membrane protein; Cytoplasm, cytosol; Mitochondrion membrane / Multi-pass membrane protein; Autolysosome membrane / Multi-pass membrane protein; Has a hairpin-like insertion into membranes. Localizes to the completed autophagosome membrane upon cell starvation. Colocalized with RAB39A and RAB39B in autolysosomes in autophagy-induced conditions PMID 23006999 ↗ · PMID 23217709 ↗ · PMID 25686604 ↗ · PMID 26416964 ↗ · PMID 28306502 ↗ · PMID 29420192 ↗ · PMID 28504273 ↗ · PMID 37821429 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCTCCTGCGCCTGCGCCGTGCCCACCGACCGGCCTCGAGC40GCCCCGGCGGGAGGTTTTTCTATATGAGTGGAGAAGACAG80CTGTTACCAGGGAGGTCATACAACATTTTTTTAGGATGTC120TGAAGATGAAGAAAAAGTGAAATTACGCCGTCTTGAACCA160GCTATCCAGAAATTCATTAAGATAGTAATCCCAACAGACC200TGGAAAGGTTAAGAAAGCACCAGATAAATATTGAGAAGTA240TCAAAGGTGCAGAATCTGGGACAAGTTGCATGAAGAGCAT280ATCAATGCAGGACGTACAGTTCAGCAACTCCGATCCAATA320TCCGAGAAATTGAGAAACTTTGTTTGAAAGTCCGAAAGGA360TGACCTAGTACTTCTGAAGAGAATGATAGATCCTGTTAAA400GAAGAAGCATCAGCAGCAACAGCAGAATTTCTCCAACTCC440ATTTGGAATCTGTAGAAGAACTTAAGAAGCAATTTAATGA480TGAAGAAACTTTGCTACAGCCTCCTTTGACCAGATCCATG520ACTGTTGGTGGAGCATTTCATACTACTGAAGCTGAAGCTA560GTTCTCAGAGTTTGACTCAGATATATGCCTTACCTGAAAT600TCCTCAAGATCAAAATGCTGCAGAATCGTGGGAAACCTTA640GAAGCGGACTTAATTGAACTTAGCCAACTGGTCACTGACT680TCTCTCTCCTAGTGAATTCTCAGCAGGAGAAGATTGACAG720CATTGCAGACCATGTCAACAGTGCTGCTGTGAATGTTGAA760GAGGGAACCAAAAACTTAGGGAAGGCTGCAAAATACAAGC800TGGCAGCTCTGCCTGTGGCAGGTGCACTCATCGGGGGAAT840GGTAGGGGGTCCTATTGGCCTCCTTGCAGGCTTCAAAGTG880GCAGGAATTGCAGCTGCACTTGGTGGTGGGGTGTTGGGCT920TCACAGGTGGAAAATTGATACAAAGAAAGAAACAGAAAAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。