演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

STRNPPP2R6A

striatin

STRN 編碼的 striatin 是可結合 calmodulin 的支架蛋白,為 STRIPAK 複合體的核心組成,參與調節蛋白質磷酸化與多種訊息傳遞路徑。

Homo sapiens2p22.2UniProt O43815
OFFICIAL SYMBOL
STRN
CHROMOSOME
2
UNIPROT
O43815
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

STRN 是蛋白質編碼基因,其產物 striatin 屬於 WD repeat striatin family。這是一種可結合 calmodulin 的支架蛋白,並構成 striatin-interacting phosphatase and kinase(STRIPAK)複合體的核心。蛋白質序列具有多個 WD 重複區,也含有 calmodulin-binding 區域、caveolin-binding 區域及 tankyrase-binding motif;部分區段則被註記為無序區。這些特徵構成 striatin 的基本分子組成,並與其支架蛋白身分相符。

Official symbol
STRN
Gene name
striatin
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11424
UniProt
O43815
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
PPP2R6ASTRN1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 22p22.2
chr2 · 242,193,529 bp · GRCh38chr2p25.3 · 1–4400000 · gnegchr2p25.2 · 4400001–6900000 · gpos50chr2p25.1 · 6900001–12000000 · gnegchr2p24.3 · 12000001–16500000 · gpos75chr2p24.2 · 16500001–19000000 · gnegchr2p24.1 · 19000001–23800000 · gpos75chr2p23.3 · 23800001–27700000 · gnegchr2p23.2 · 27700001–29800000 · gpos25chr2p23.1 · 29800001–31800000 · gnegchr2p22.3 · 31800001–36300000 · gpos75chr2p22.2 · 36300001–38300000 · gnegchr2p22.1 · 38300001–41500000 · gpos50chr2p21 · 41500001–47500000 · gnegchr2p16.3 · 47500001–52600000 · gpos100chr2p16.2 · 52600001–54700000 · gnegchr2p16.1 · 54700001–61000000 · gpos100chr2p15 · 61000001–63900000 · gnegchr2p14 · 63900001–68400000 · gpos50chr2p13.3 · 68400001–71300000 · gnegchr2p13.2 · 71300001–73300000 · gpos50chr2p13.1 · 73300001–74800000 · gnegchr2p12 · 74800001–83100000 · gpos100chr2p11.2 · 83100001–91800000 · gnegchr2p11.1 · 91800001–93900000 · acenchr2q11.1 · 93900001–96000000 · acenchr2q11.2 · 96000001–102100000 · gnegchr2q12.1 · 102100001–105300000 · gpos50chr2q12.2 · 105300001–106700000 · gnegchr2q12.3 · 106700001–108700000 · gpos25chr2q13 · 108700001–112200000 · gnegchr2q14.1 · 112200001–118100000 · gpos50chr2q14.2 · 118100001–121600000 · gnegchr2q14.3 · 121600001–129100000 · gpos50chr2q21.1 · 129100001–131700000 · gnegchr2q21.2 · 131700001–134300000 · gpos25chr2q21.3 · 134300001–136100000 · gnegchr2q22.1 · 136100001–141500000 · gpos100chr2q22.2 · 141500001–143400000 · gnegchr2q22.3 · 143400001–147900000 · gpos100chr2q23.1 · 147900001–149000000 · gnegchr2q23.2 · 149000001–149600000 · gpos25chr2q23.3 · 149600001–154000000 · gnegchr2q24.1 · 154000001–158900000 · gpos75chr2q24.2 · 158900001–162900000 · gnegchr2q24.3 · 162900001–168900000 · gpos75chr2q31.1 · 168900001–177100000 · gnegchr2q31.2 · 177100001–179700000 · gpos50chr2q31.3 · 179700001–182100000 · gnegchr2q32.1 · 182100001–188500000 · gpos75chr2q32.2 · 188500001–191100000 · gnegchr2q32.3 · 191100001–196600000 · gpos75chr2q33.1 · 196600001–202500000 · gnegchr2q33.2 · 202500001–204100000 · gpos50chr2q33.3 · 204100001–208200000 · gnegchr2q34 · 208200001–214500000 · gpos100chr2q35 · 214500001–220700000 · gnegchr2q36.1 · 220700001–224300000 · gpos75chr2q36.2 · 224300001–225200000 · gnegchr2q36.3 · 225200001–230100000 · gpos100chr2q37.1 · 230100001–234700000 · gnegchr2q37.2 · 234700001–236400000 · gpos50chr2q37.3 · 236400001–242193529 · gnegSTRNpq1 bp242,193,529 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr2:36,835,737–36,967,622
Gene span
131,886 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000263918 ★36,837,698–36,966,53618
ENST0000087461136,837,698–36,966,62517
ENST0000087461236,837,698–36,966,62519
ENST0000092777436,837,698–36,966,62518
ENST0000095011936,837,698–36,966,62518
ENST0000095012036,837,698–36,966,62520
ENST0000095012136,837,698–36,966,62516
ENST0000095012236,837,698–36,966,62517
ENST0000114035336,837,698–36,966,62518

顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

striatin 是 STRIPAK 複合體的核心支架蛋白,能結合 calmodulin。STRIPAK 組合多種蛋白質,參與蛋白質去磷酸化與磷酸化的調節;藉由組成不同的複合體,striatin 所在的分子平台可連結磷酸酶、激酶及其他相關因子。來源指出,STRIPAK 對這些磷酸化狀態的調控具有關鍵作用,但未進一步限定 striatin 本身對各個作用步驟的直接貢獻。

STRIPAK 也被描述為多種訊息傳遞路徑的調節者,包括 Hippo、MAPK、核受體相關路徑,以及細胞骨架重塑。這些路徑涵蓋不同的細胞調控面向;現有資料支持 STRIPAK 參與其調節,並未提供各路徑中 striatin 直接作用的細節或方向,因此不宜將複合體層級的角色簡化為單一分子機制。

不同類型的 STRIPAK 複合體與多種生物過程相關,包括細胞生長、分化、凋亡、代謝及免疫調節。這些過程並非都由同一組成或同一作用方式支配;資料將其描述為不同 STRIPAK 類型所涉及的功能,並以「可能」表述這些關聯。因而,striatin 的功能意義主要在於作為複合體核心,參與協調蛋白質磷酸化調節及多路徑訊息,而非來源已明確證實的單一、固定下游效應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 36966536 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>STRN ENST00000263918 GRCh38 chr2:36966436-36967536 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTTGTGATATTTGATTATACGCCAATCTTTGATGACAGAAACGATGTCATTTATCTTAATATTCCCAGCG
CAAGAGAAAACCGATAATCAAAATATTTGTTCAATTAAGTAGAGTAAAAATCAGCGGGAATAAGATAGGA
AAAATGAGACCGAAATAACAGAACATCTATTATTGGATGCTAAAACTTTTACAGGATTTACTGCAGGAGG
ACTGCAAAGGGAAAGAAACTTCAACGGAGCAGTTTTTCAGATGGGCTGTCAACAAACCACAATTTGGAAG
CAGCAGCAGAAAGCTGCGGCGTTGTCTTAGAAAGGTGATCGGCGTTCCTTAGAAATGAAAACTGGTCAGG
TAACAGGTTTGAGCCCCTCGAGTCAAAAGAGAAAGGCAAGAGCGACAGCGACCCGCAGATTGGCAGAATG
GAGGAGCGTCTAGGGTGAGAGAAACTCCGAACACGAAGCCGAAGCGAGAGCACGCAGGGCAGCTGGCGGG
AGAACCCCGGTCCCGCGGCCGCACCGGGTAGCTCGCTTTGAGCCTGTTCCTTCACAGAACGGCCAGGAAG
CCTTAAAAGATGTGCAGCTCGGGCAGGTATCTTGGCGTGACAACTTCCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GTGTGTGTTTTTGAATGCAACAGGGTGCGCCGCCCGCGAACTTCCGCGTGCGAGGAAGACTGGAGACCCG
CCCGCCCGCGCCCAGCCGGCCCCAGAGGAAACCCGCTCTCCCCGCCCAGCCGGCCCCCTACGCGGCGAGC
CGGGGCGGGGCGGGCCCGAGGCCACGCCCAAGCTGAGGCACAGCCCTACAGGCCGCCCGGGCCGCGCTAG
CCCGCGCCCCGCCCCGCGACTACATTTCCCGGCAAGCCCCGGGCCGCCAGCGCGCCGCAGTTGACCCATT
TCCCGGCCCGTCACGGGCTCGGCCGGCCCCCGCGCCCAGGAGGCTGCTCCCTGCTGACTGGGGTGTGGGC
GGGAGCGGCGGAGGGAGGAGGAGGCGCTGCTTGCCGCCGCTGTTGCCTCCGCTGCTGGGCGCCGGGGCAG
CTCCCCGGGTATCTGCGGCCGCCATGGACGAGCAGGCGGGTCCCGGCGTCT
STRN 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
STRN_2 ↗2:36,902,891負股36,902,881–36,902,940
STRN_1 ↗2:36,966,518負股36,966,508–36,966,567

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR2_9JN5D · enhancer · 36963136–36963431 · regulatory

ENSR2_9JN6D · promoter · 36966526–36967026 · regulatory

ENSR2_B9C4F · enhancer · 36968027–36968638 · regulatory

· motif · 36966293–36966304 · motif

· motif · 36966295–36966304 · motif

· motif · 36966336–36966349 · motif

· motif · 36966451–36966467 · motif

· motif · 36966460–36966470 · motif

· motif · 36966548–36966561 · motif

· motif · 36966552–36966562 · motif

· motif · 36966554–36966567 · motif

· motif · 36966558–36966568 · motif

· motif · 36966591–36966604 · motif

· motif · 36966627–36966639 · motif

· motif · 36966681–36966691 · motif

· motif · 36966731–36966744 · motif

· motif · 36966736–36966746 · motif

· motif · 36966756–36966766 · motif

· motif · 36966832–36966842 · motif

· motif · 36966857–36966868 · motif

· motif · 36966857–36966868 · motif

· motif · 36966924–36966935 · motif

· motif · 36966924–36966935 · motif

· motif · 36967265–36967273 · motif

· motif · 36967265–36967280 · motif

· motif · 36968252–36968265 · motif

· motif · 36968252–36968265 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:780 aa

1 aa780 aa功能區域基序重複區
依 O43815 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

striatin 長 780 個胺基酸,屬於 WD repeat striatin family。其序列含六個 WD 重複區(第 461–500、514–553、567–606、662–701、704–743 與 750–780 位),以及 caveolin-binding 區域(55–63 位)和 calmodulin-binding 區域(149–166 位)。第 302–309 位註記為 tankyrase-binding motif;第 124–150、289–310 與 365–387 位則標示為無序區。

重複區WD 1461–500 aa
重複區WD 2514–553 aa
重複區WD 3567–606 aa
重複區WD 4662–701 aa
重複區WD 5704–743 aa
重複區WD 6750–780 aa
功能區域Caveolin-binding55–63 aa
功能區域Disordered124–150 aa
功能區域Calmodulin-binding149–166 aa
功能區域Disordered289–310 aa
功能區域Disordered365–387 aa
基序Tankyrase-binding motif302–309 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O43815…

AlphaFold · O43815

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Membrane;Cell projection, dendritic spine

striatin 位於細胞質、周邊膜及樹突棘等細胞突起。 資料指出它是周邊膜蛋白,並將樹突棘分布的調節與 CTTNBP2 結合相連;這描述的是可能的調節關係,未提供定位隨條件變化的更多細節。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Membrane;Cell projection, dendritic spine。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 12 個夥伴 · 最多顯示 50 個
PPP2R6ASTRNCTTNBP2NLMOB4PDCD10PPP2CAPPP2R1ARINT1STK24STK25STRN3TFIP11TNKS2TRAF3IP3
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 12 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

striatin 是 STRIPAK 核心的一員;此複合體包含 PP2A catalytic 與 scaffolding subunits、作為 PP2A regulatory subunits 的 striatins、MOB4、STRIP1、STRIP2、PDCD10,以及 STE20 kinases 成員,例如 STK24 和 STK26。另有資料指出 striatin 與 CTTNBP2 互作,且此互作可能調節樹突棘分布;glutamate receptors 活化時,striatin 與 CTTNBP2 的互作會減弱。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能striatin 是可結合 calmodulin 的支架蛋白,並位於 STRIPAK 複合體核心。STRIPAK 參與蛋白質磷酸化與去磷酸化調節,也調節 Hippo、MAPK、核受體及細胞骨架重塑等訊息路徑。不同類型的 STRIPAK 複合體可能涉及細胞生長、分化、凋亡、代謝及免疫調節。含實驗來源
證據與來源

Calmodulin-binding scaffolding protein which is the center of the striatin-interacting phosphatase and kinase (STRIPAK) complexes. STRIPAK complexes have critical roles in protein (de)phosphorylation and are regulators of multiple signaling pathways including Hippo, MAPK, nuclear receptor and cytoskeleton remodeling. Different types of STRIPAK complexes are involved in a variety of biological processes such as cell growth, differentiation, apoptosis, metabolism and immune regulation (Probable)

PMID 18782753 ↗ · PMID 26876214 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用striatin 是 STRIPAK 核心成員之一;該複合體包含 PP2A catalytic 與 scaffolding subunits、striatins、MOB4、STRIP1、STRIP2、PDCD10 及部分 STE20 kinases,例如 STK24、STK26。striatin 也與 CTTNBP2 互作,這項互作可能調節樹突棘分布;glutamate receptors 活化會削弱兩者的互作。含實驗來源
證據與來源

Part of the core of STRIPAK complexes composed of PP2A catalytic and scaffolding subunits, the striatins (PP2A regulatory subunits), the striatin-associated proteins MOB4, STRIP1 and STRIP2, PDCD10 and members of the STE20 kinases, such as STK24 and STK26. Interacts with CTTNBP2; this interaction may regulate dendritic spine distribution of STRN. Activation of glutamate receptors weakens the interaction with CTTNBP2 (By similarity)

PMID 18782753 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位striatin 位於細胞質、周邊膜及樹突棘等細胞突起。資料指出,與 CTTNBP2 結合可能調節 striatin 在樹突棘的分布,但未提供更多定位變化條件。推論支持
證據與來源

Cytoplasm; Membrane / Peripheral membrane protein; Cell projection, dendritic spine; CTTNBP2-binding may regulate dendritic spine distribution

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000263918 · 14,174 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GAGGCGCTGCTTGCCGCCGCTGTTGCCTCCGCTGCTGGGC40
41GCCGGGGCAGCTCCCCGGGTATCTGCGGCCGCCATGGACG80
81AGCAGGCGGGTCCCGGCGTCTTCTTCAGCAACAACCACCC120
121GGGCGCCGGCGGTGCCAAGGGGCTCGGGCCTCTGGCGGAG160
161GCTGCCGCGGCCGGCGACGGGGCGGCTGCGGCGGGGGCGG200
201CCCGAGCCCAGTACAGTCTCCCGGGGATCCTGCACTTCCT240
241GCAGCACGAGTGGGCCCGCTTCGAGGTGGAGAGAGCCCAG280
281TGGGAGGTGGAGCGGGCGGAGCTGCAGGCCCAGATTGCCT320
321TCCTGCAGGGAGAAAGGAAGGGCCAAGAAAATTTGAAGAA360
361GGATCTTGTGAGGAGGATCAAAATGTTGGAGTATGCTCTT400
401AAACAGGAAAGAGCCAAATACCACAAGTTGAAATACGGGA440
441CAGAATTGAATCAGGGAGATATGAAGCCTCCAAGCTATGA480
481TTCTGATGAAGGTAATGAAACAGAAGTGCAGCCACAACAA520
521AACAGCCAGTTAATGTGGAAACAAGGTCGACAACTACTCA560
561GACAGTATCTACAGGAGGTGGGTTATACAGATACTATTCT600
601AGATGTGAAATCTAAACGAGTGCGAGCTTTGTTGGGCTTT640
641TCAAGTGATGTCACGGACAGGGAAGATGACAAAAATCAGG680
681ACTCAGTTGTAAATGGCACAGAGGCTGAAGTTAAAGAGAC720
721AGCAATGATTGCAAAATCTGAGTTAACAGATTCTGCCTCC760
761GTGCTGGATAATTTCAAATTCCTTGAAAGTGCAGCTGCAG800
801ATTTCAGTGATGAAGATGAAGATGATGATGTTGATGGAAG840
841AGAGAAAAGCGTCATTGATACTTCAACAATTGTTAGGAAA880
881AAAGCATTGCCTGACAGCGGTGAAGATCGAGATACAAAAG920
921AAGCTCTAAAGGAGTTTGACTTCTTGGTTACATCAGAGGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。