基因總覽
STRADB 是蛋白質編碼基因，產物為 STE20 related adaptor beta。此蛋白屬於蛋白激酶超家族中的 STE Ser/Thr protein kinase family，並歸於 STE20 次家族；雖具有蛋白激酶家族特徵，來源將其描述為假激酶。蛋白全長為 418 個胺基酸，具有一段蛋白激酶結構域。其主要角色與 STK11/LKB1 相關，並可在含 CAB39/MO25 的複合體中參與調節 STK11/LKB1。其關鍵分子作用及複合體關係詳述於功能與交互作用段落。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000194530 ★ | 201,451,740–201,480,846 | 12 |
| ENST00000458269 | 201,387,858–201,478,113 | 6 |
| ENST00000392249 | 201,451,684–201,480,846 | 12 |
| ENST00000861982 | 201,451,684–201,480,850 | 12 |
| ENST00000861984 | 201,451,684–201,480,846 | 11 |
| ENST00000861985 | 201,451,684–201,480,844 | 11 |
| ENST00000861986 | 201,451,684–201,480,715 | 12 |
| ENST00000861988 | 201,451,684–201,480,715 | 10 |
| ENST00000861989 | 201,451,684–201,480,715 | 12 |
| ENST00000861990 | 201,451,684–201,480,715 | 12 |
| ENST00000974588 | 201,451,684–201,480,847 | 11 |
| ENST00000974589 | 201,451,684–201,480,844 | 11 |
顯示 12/28 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
STRADB 的產物是具有假激酶特性的蛋白質，可與 CAB39/MO25 家族成員形成複合體，並結合及活化 STK11/LKB1。來源指出，相關組合可包含 CAB39/MO25alpha 或 CAB39L/MO25beta；此處所述的活化作用依賴複合體情境，而非將 STRADB 單獨描述為具有一般激酶催化功能的蛋白質。
在與 STK11/LKB1 結合時，STRADB 會以假受質（pseudosubstrate）的方式參與作用。它採取類似活性蛋白激酶的閉合構形，並促使 STK11/LKB1 發生構形改變，使後者處於活化構形。這說明 STRADB 可藉由結合與構形調節，影響 STK11/LKB1 的活性；來源將此機制標示為依相似性推定（By similarity），因此不應視為此處已直接確立的普遍機制。
STRADB 也被描述為含 STK11/LKB1、STRAD（STRADA 或 STRADB）及 CAB39/MO25 的三聚體複合體成員。這個複合體可將 STK11/LKB1 錨定於細胞質，並提升其催化活性。由此可見，STRADB 在來源所述的功能脈絡中，是協助形成調節性複合體、定位 STK11/LKB1 並促進其活性的組成部分；資料未進一步說明這些作用如何延伸至特定生理過程。
Promoter 與基因調控
>STRADB ENST00000194530 GRCh38 chr2:201450740-201451840 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATGAGCAAGAGCAAGTAACATCCCTATTATTATGACGCAGATTTTTTTTTAAGTTGAAATTCAATTTTTG GGCTGCTACTAAAAAGGACATGTGCGAATATCTATTATTTACGCTTCAAACTAAAGTCAGCCGTTTTTCT TTTTCAAGATATGTGGCATCTGGCTCAAAATCAATTGCAAGAAAAGCCCAACTCTATTTGACCCAGAAAG AGCTCTTTCCAATACCCTCTCCTCCCACTTACATCACAGATGGCGACTGAAGCTTAAGGTTTAATGCCCG ACCCTAAAGCCACTCATCCTAAAAGACAGGGCTCCAGATGGATGCTGTATGGCAGAGGATAAGGCGCTAT GAGAAGCTGCCAAGCCTCAGATGTGCAGCTGGGCTGAATACCGACGCCAGCGCCTAGCGCCCATTACTTT GCACCCACACTTAGGAAACAACCCACGCCTCACCGCGGGACCCGGACCCAGCCCTCCAGCACCCAGCCTC CGGCTCCGACGTCCGCGCGTGACCTCCGGGTACCGGAGGACCTTGGGACGAGGAGGTCCCTCCGCTTTCC GGGGAAGTTGTCAAGGGCAAGTTCGGGTTCTGCGCGGACAGCTTACTCACTGGAGTGGTTCGGCATCCTC TGTCGTCCGCCCGCGCTTCCTCAGGAAGCCCCTAATGCAGCGGCAGCCTGAAAGCAGCAGCCGAAGCTGC TGCCGCTGCTCCCACTGCCAGCAACCGCCCGGGCGTGGCAGGGACAGGCGGGCGACTTCACAACATCATC ACTCGGCGACCTCGGTTCTGCGGCGACACCGGGTCAATGGCAGCCCCCACACAATTGGGGAAGCCAAAGG AGAGCCACTCTCCCAGCGGCCTCCACGGCCCCAGCGCAAGACCTGCTGGGAATTGTAGTTTCCTGCCCGC CCCGCCTCAAGCTCGAAGGCCCCGCCTTCTCGCTGCCCAGCCCCGGGGAGGGAGGCGGGGCCGCGACCCC GGCGCGGGTGGGGCGAATGCGTTCCCAGCGGGTAGCCTGGGACTGGTGCAGAGTTCCAAGCCCACGGCCC CGGTCGCGGCCTCGCCGCCCTCCCGCGCCCCGCGCCGGGAGCGGGCCTAGA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| STRADB_1 ↗ | 2:201,451,767 | 正股 | 201,451,718–201,451,777 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR2_94XXTL · enhancer · 201448765–201449111 · regulatory
ENSR2_B3GZG5 · enhancer · 201450836–201451447 · regulatory
ENSR2_94XXWD · promoter · 201451448–201451806 · regulatory
ENSR2_B3GZGB · enhancer · 201451807–201452819 · regulatory
· motif · 201448619–201448632 · motif
· motif · 201450987–201450997 · motif
· motif · 201451189–201451206 · motif
· motif · 201451245–201451257 · motif
· motif · 201451250–201451261 · motif
· motif · 201451706–201451719 · motif
· motif · 201451706–201451719 · motif
· motif · 201452216–201452225 · motif
· motif · 201452265–201452278 · motif
· motif · 201452312–201452327 · motif
· motif · 201452575–201452583 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：418 aa
STE20 related adaptor beta 長 418 個胺基酸，並具有位於第 58 至 369 個胺基酸的蛋白激酶結構域註解。其家族分類為蛋白激酶超家族中的 STE Ser/Thr protein kinase family，隸屬 STE20 次家族。雖有此結構域與家族歸屬，來源將其功能性質描述為假激酶。
蛋白質三維結構
細胞內定位
STRADB 被記載位於細胞核與細胞質。 另有資料指出，含 STRADB 的三聚體複合體可將 STK11/LKB1 錨定於細胞質；這是複合體對 STK11/LKB1 的定位描述，不應據此推定 STRADB 本身只位於細胞質。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- CAB39Q9Y376 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- STK11Q15831 · UniProt INTERACTION · 14 experiments
STRADB 是由 STK11/LKB1、STRAD（STRADA 或 STRADB）及 CAB39/MO25（CAB39/MO25alpha 或 CAB39L/MO25beta）組成之三聚體複合體的成員；該複合體可將 STK11/LKB1 錨定於細胞質並刺激其催化活性。另有記載指出 STRADB 與 BIRC4/XIAP 互作。STRADB 與 BIRC4/XIAP 也可能與 TAK1、TRAF6、TAB1 及 TAB2 共存於同一複合體，但此關係以可能性描述。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | STRADB 是假激酶，與 CAB39/MO25（CAB39/MO25alpha 或 CAB39L/MO25beta）形成複合體後，可結合並活化 STK11/LKB1。STRADB 採取活性蛋白激酶常見的閉合構形，並以假受質方式結合 STK11/LKB1，促使其構形轉變為活化狀態；此機制屬於依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Pseudokinase which, in complex with CAB39/MO25 (CAB39/MO25alpha or CAB39L/MO25beta), binds to and activates STK11/LKB1. Adopts a closed conformation typical of active protein kinases and binds STK11/LKB1 as a pseudosubstrate, promoting conformational change of STK11/LKB1 in an active conformation (By similarity) PMID 14517248 ↗ |
| 交互作用 | STRADB 是由 STK11/LKB1、STRAD（STRADA 或 STRADB）及 CAB39/MO25（CAB39/MO25alpha 或 CAB39L/MO25beta）組成的三聚體複合體成員；該複合體可將 STK11/LKB1 錨定於細胞質並刺激其催化活性。STRADB 與 BIRC4/XIAP 互作，且這兩種蛋白可能與 TAK1、TRAF6、TAB1 及 TAB2 共存於一個複合體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of a trimeric complex composed of STK11/LKB1, STRAD (STRADA or STRADB) and CAB39/MO25 (CAB39/MO25alpha or CAB39L/MO25beta): the complex tethers STK11/LKB1 in the cytoplasm and stimulates its catalytic activity. Interacts with BIRC4/XIAP. These two proteins are likely to coexist in a complex with TAK1, TRAF6, TAB1 and TAB2 PMID 12048196 ↗ · PMID 14517248 ↗ |
| 細胞定位 | STRADB 的細胞內定位記載為細胞核與細胞質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GTTCCCAGCGGGTAGCCTGGGACTGGTGCAGAGTTCCAAG40CCCACGGCCCCGGTCGCGGCCTCGCCGCCCTCCCGCGCCC80CGCGCCGGGAGCGGGCCTAGAGCGCTCGCCTCGCCCCTCC120GCGAGCAGGGCTCTGGCGCCCGCCCCTGTCCGCACCGCTG160GCAGCCTGAAGAGAGTCGCTGGCCGTGGTCGCCGCTAGGT200AGGATATATCTGCATCTTGAAAGGAAGATAAAACAAAAGC240CTTCTTTGGAATAGATGGATTTTTGTCACTTTCTGTGTGA280ACTAAAGTGATTCAATGTCTCTTTTGGATTGCTTCTGCAC320TTCAAGAACACAAGTTGAATCACTCAGACCTGAAAAACAG360TCTGAAACCAGTATCCATCAATACTTGGTTGATGAGCCAA400CCCTTTCCTGGTCACGTCCATCCACTAGAGCCAGTGAAGT440ACTATGTTCCACCAACGTTTCTCACTATGAGCTCCAAGTA480GAAATAGGAAGAGGATTTGACAACTTGACTTCTGTCCATC520TTGCACGGCATACTCCCACAGGAACACTGGTAACTATAAA560AATTACAAATCTGGAAAACTGCAATGAAGAACGCCTGAAA600GCTTTACAGAAAGCCGTGATTCTATCCCACTTTTTCCGGC640ATCCCAATATTACAACTTATTGGACAGTTTTCACTGTTGG680CAGCTGGCTTTGGGTTATTTCTCCATTTATGGCCTATGGT720TCAGCAAGTCAACTCTTGAGGACCTATTTTCCTGAAGGAA760TGAGTGAAACTTTAATAAGAAACATTCTCTTTGGAGCCGT800GAGAGGGTTGAACTATCTGCACCAAAATGGCTGTATTCAC840AGGAGTATTAAAGCCAGCCATATCCTCATTTCTGGTGATG880GCCTAGTGACCCTCTCTGGCCTGTCCCATCTGCATAGTTT920GGTTAAGCATGGACAGAGGCATAGGGCTGTGTATGATTTC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。