演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

STOML2SLP-2

stomatin like 2

STOML2(stomatin like 2)編碼粒線體蛋白,可能參與粒線體生成與功能調節,也與活化 T 細胞的訊號調控有關。

Homo sapiens9p13.3UniProt Q9UJZ1
OFFICIAL SYMBOL
STOML2
CHROMOSOME
9
UNIPROT
Q9UJZ1
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

STOML2(stomatin like 2)是蛋白質編碼基因,其產物為粒線體蛋白,屬於 band 7/mec-2 family。蛋白質全長 356 個胺基酸,N 端帶有粒線體轉運胜肽;C 端第 321–356 位胺基酸區域註記為無序區。來源指出,STOML2 可能調節粒線體生成與活性,並與細胞膜上的功能區域組織及 T 細胞活化相關。

Official symbol
STOML2
Gene name
stomatin like 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14559
UniProt
Q9UJZ1
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SLP-2HSPC108

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 99p13.3
chr9 · 138,394,717 bp · GRCh38chr9p24.3 · 1–2200000 · gnegchr9p24.2 · 2200001–4600000 · gpos25chr9p24.1 · 4600001–9000000 · gnegchr9p23 · 9000001–14200000 · gpos75chr9p22.3 · 14200001–16600000 · gnegchr9p22.2 · 16600001–18500000 · gpos25chr9p22.1 · 18500001–19900000 · gnegchr9p21.3 · 19900001–25600000 · gpos100chr9p21.2 · 25600001–28000000 · gnegchr9p21.1 · 28000001–33200000 · gpos100chr9p13.3 · 33200001–36300000 · gnegchr9p13.2 · 36300001–37900000 · gpos25chr9p13.1 · 37900001–39000000 · gnegchr9p12 · 39000001–40000000 · gpos50chr9p11.2 · 40000001–42200000 · gnegchr9p11.1 · 42200001–43000000 · acenchr9q11 · 43000001–45500000 · acenchr9q12 · 45500001–61500000 · gvarchr9q13 · 61500001–65000000 · gnegchr9q21.11 · 65000001–69300000 · gpos25chr9q21.12 · 69300001–71300000 · gnegchr9q21.13 · 71300001–76600000 · gpos50chr9q21.2 · 76600001–78500000 · gnegchr9q21.31 · 78500001–81500000 · gpos50chr9q21.32 · 81500001–84300000 · gnegchr9q21.33 · 84300001–87800000 · gpos50chr9q22.1 · 87800001–89200000 · gnegchr9q22.2 · 89200001–91200000 · gpos25chr9q22.31 · 91200001–93900000 · gnegchr9q22.32 · 93900001–96500000 · gpos25chr9q22.33 · 96500001–99800000 · gnegchr9q31.1 · 99800001–105400000 · gpos100chr9q31.2 · 105400001–108500000 · gnegchr9q31.3 · 108500001–112100000 · gpos25chr9q32 · 112100001–114900000 · gnegchr9q33.1 · 114900001–119800000 · gpos75chr9q33.2 · 119800001–123100000 · gnegchr9q33.3 · 123100001–127500000 · gpos25chr9q34.11 · 127500001–130600000 · gnegchr9q34.12 · 130600001–131100000 · gpos25chr9q34.13 · 131100001–133100000 · gnegchr9q34.2 · 133100001–134500000 · gpos25chr9q34.3 · 134500001–138394717 · gnegSTOML2pq1 bp138,394,717 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr9:35,099,469–35,103,195
Gene span
3,727 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000356493 ★35,099,778–35,103,13110
ENST0000045224835,099,469–35,103,1959
ENST0000061979535,099,469–35,103,1959
ENST0000087320835,099,469–35,103,19510
ENST0000087320935,099,469–35,103,19510
ENST0000094008035,099,469–35,103,19510
ENST0000094008135,099,469–35,103,19510
ENST0000094008235,099,469–35,103,1958
ENST0000094008335,099,469–35,103,19510
ENST0000094008435,099,469–35,103,1959
ENST0000094008535,099,469–35,103,1959
ENST0000094008635,099,469–35,103,19510

顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

STOML2 可能參與粒線體生成及活性調節,並透過影響粒線體膜的組織,連結多種細胞活動。它可刺激心磷脂生合成,並結合富含心磷脂的膜;在這些膜上,STOML2 會募集並穩定部分蛋白質,包括 prohibitins,因此可能協助組織粒線體膜上的功能性微區域。

STOML2 所參與的粒線體調節可能與細胞遷移、細胞增殖、T 細胞活化、鈣離子恆定及細胞對壓力的反應有關。就鈣離子恆定而言,它可能藉由負向調節鈣離子自粒線體外流而發揮作用;這項功能描述仍屬可能性,來源未將其表述為確定機制。

在壓力反應方面,STOML2 是粒線體過度融合所必需的因子。粒線體過度融合是一種促進細胞存活的壓力反應,並會使粒線體 ATP 產量增加。這將 STOML2 與粒線體面對壓力時的形態變化及能量產生相連,但來源未進一步界定其調節過程的細節。

STOML2 也可能調節質膜功能區域的組織,並透過與 T 細胞受體訊號複合體的關聯及對其調節,參與 T 細胞活化。這表示其相關作用不只涉及粒線體膜,也可能延伸至細胞表面的訊號組織;來源將此作用描述為可能參與,而非確定的單一路徑。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 35103131 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>STOML2 ENST00000356493 GRCh38 chr9:35103031-35104131 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGAAACTTGAACTAAGCTCTACTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGGGGAGAGGGTGTGAAGGGGGATGGA
GGGCCTTCCTGGAGCTGGGACTCAGCCCTTTCTACCAGAGAGGCAACAGGCCTGGGCCCATGAGGTCTTA
GGCTAGTCCCTGCTGATTCCTGGGGCCTGGTTTTTCTCCTTTCGGAGGGGTTGGTGGGTAAAGTTCAGCC
GTAGAAGCTGAACTCTGAATTGTAGATCAGGATTCTAATACTGGTTCTATTAATGACTTTAGCCCCTCAG
AACTTCAGTGCCCTCATATGTAAAATGGAGGTGACTACGGAGGTCTCTTGACTACCAGAGCATTAGGGAT
GTGGGCAAGGTGACATGCTCCAGACAAGGTTGAACGTTGAGGCTGTTTGCTGGACTGTATTTAAGACCGG
GCATAACAAACCTTGCTTGGGAAGACAGGGAAGGAGCTGCAGTGTCTTTGAGGAAAGAGGGGAGGGGAAA
ATCTCGGCCCAATCGCCAGGCAATATTAGGCCCAGTTTCCATGGCAACGGGATTGGGGTCAGTCCCCAGT
GGGAGTCCTGGGCACAACACAGCGGGACTACCAGAGAATATCACTATGGCAACCATGGCAACGAGTCAGC
TCCAATCCACTAGTCGCTATGGTGACAGATGGGGGCGATACTACGCTCTGGTGGGCAAACTGAGTCTCGG
GTGAGGACGAATAATTCAGTGCGTGGTGTCTGAGTGATAATGCCCGCGAAAAATAGCCTCCATTTTGGCC
ATCAGGCCGGGGATCTTCGGCGTGAACAGCTAAACCCAGAACAACCACAGCCTTCGCCCTTCTCTAGAAG
GTCTGCGTTTCCCAGGGAACAACTTGACGCGCCGTTCGACCAAGTAACGCTGATTGGGTGAGTGTTGAAG
CGGGGGAGGGAGCTGCCGGAAGTACATCCGGGGGAGCGGAACTGCAAGAGGAAAGGCTCGGGTAGGCTTC
TGGGAGCGACCGCTCCGCTCGTCTCGTTGGTTCCGGAGGTCGCTGCGGCGGTGGGAAATGCTGGCGCGCG
CGGCGCGGGGCACTGGGGCCCTTTTGCTGAGGGTGAGAGCGAGGCAACCTT
STOML2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
STOML2_1 ↗9:35,103,126負股35,103,116–35,103,175

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

STOML2 表現量在活化的 B 細胞與 T 細胞中上升;粒線體受到 chloramphenicol 引發的壓力時,其表現量也會上升。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:356 aa

1 aa356 aa功能區域轉運胜肽
依 Q9UJZ1 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

STOML2 蛋白質全長 356 個胺基酸,屬於 band 7/mec-2 family。第 1–28 位胺基酸註記為粒線體轉運胜肽;第 321–356 位則被註記為無序區。

轉運胜肽Mitochondrion1–28 aa
功能區域Disordered321–356 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9UJZ1…

AlphaFold · Q9UJZ1

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Mitochondrion;Mitochondrion inner membrane;Mitochondrion intermembrane space;Membrane raft;Cytoplasm, cytoskeleton

STOML2 雖未偵測到跨膜結構域,仍表現出粒線體整合膜蛋白的特性。 活化 T 細胞中,它也與肌動蛋白細胞骨架及膜筏相關;少量蛋白質位於質膜,並在活化 T 細胞的免疫突觸富集。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Membrane raft。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 5 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SLP-2STOML2ATXN2GLP1RPEX1RABAC1WFS1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

STOML2 可形成同源寡聚體,並與 MFN2 互作,且可能形成異源寡聚體。它與 PHB1、PHB2 互作,並將兩者募集至富含心磷脂的粒線體膜上加以穩定。STOML2 也與 GRPEL2 的 isoform 2(NERCLIN)互作;此互作可能調節心磷脂含量及粒線體形態。與 CACNA2D2 的互作則是依相似性推定。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能STOML2 是粒線體蛋白,可能調節粒線體生成與活性;它能促進心磷脂生合成,並結合富含心磷脂的膜,募集及穩定包括 prohibitins 在內的蛋白質,可能組織粒線體膜功能微區。它可能關聯細胞遷移、增殖、T 細胞活化、鈣離子恆定與壓力反應;亦可能抑制鈣離子自粒線體外流。STOML2 是壓力下粒線體過度融合所必需,該反應可提高 ATP 產量;它也可能參與質膜功能區域及 T 細胞受體訊號調節。含實驗來源
證據與來源

Mitochondrial protein that probably regulates the biogenesis and the activity of mitochondria. Stimulates cardiolipin biosynthesis, binds cardiolipin-enriched membranes where it recruits and stabilizes some proteins including prohibitin and may therefore act in the organization of functional microdomains in mitochondrial membranes. Through regulation of the mitochondrial function may play a role into several biological processes including cell migration, cell proliferation, T-cell activation, calcium homeostasis and cellular response to stress. May play a role in calcium homeostasis through negative regulation of calcium efflux from mitochondria. Required for mitochondrial hyperfusion a pro-survival cellular response to stress which results in increased ATP production by mitochondria. May also regulate the organization of functional domains at the plasma membrane and play a role in T-cell activation through association with the T-cell receptor signaling complex and its regulation

PMID 17121834 ↗ · PMID 18641330 ↗ · PMID 19597348 ↗ · PMID 19944461 ↗ · PMID 21746876 ↗ · PMID 22623988 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用STOML2 可形成同源寡聚體,並與 MFN2 互作,可能形成異源寡聚體;與 CACNA2D2 的互作依相似性推定。它會與 PHB1、PHB2 互作,將兩者募集至富含心磷脂的粒線體膜並加以穩定。STOML2 也與 GRPEL2 的 isoform 2(NERCLIN)互作,此互作可能調節心磷脂含量及粒線體形態。含實驗來源
證據與來源

Forms homooligomers. Interacts with MFN2; may form heterooligomers. Interacts with CACNA2D2 (By similarity). Interacts with PHB1 and PHB2; recruits them to cardiolipin-enriched mitochondrial membranes and stabilizes them. Interacts with GRPEL2 isoform 2 (NERCLIN); the interaction potentially regulates cardiolipin levels and mitochondrial morphology

PMID 17121834 ↗ · PMID 18339324 ↗ · PMID 21746876 ↗ · PMID 22623988 ↗ · PMID 37463214 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位STOML2 位於粒線體及其內膜,也見於膜筏、細胞骨架相關區域與細胞膜。儘管未偵測到跨膜結構域,它仍表現為粒線體整合膜蛋白。活化 T 細胞中,STOML2 與肌動蛋白細胞骨架及膜筏相關;少量蛋白質位於質膜,並在活化 T 細胞的免疫突觸富集。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Peripheral membrane protein; Mitochondrion; Mitochondrion inner membrane / Lipid-anchor; Mitochondrion intermembrane space; Membrane raft; Cytoplasm, cytoskeleton; Behaves as an integral membrane protein of the mitochondrion despite the absence of a detectable transmembrane domain. Also associates with the actin cytoskeleton and membrane rafts in activated T-cells. A minor pool is associated with the plasma membrane and is enriched at the immunological synapse in activated T-cells

PMID 10713127 ↗ · PMID 18641330 ↗ · PMID 21746876 ↗ · PMID 22623988 ↗ · PMID 19597348 ↗ · PMID 17121834 ↗ · PMID 18339324 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

調控STOML2 表現量在活化的 B 細胞與 T 細胞中上調;粒線體受到 chloramphenicol 引發的壓力時,表現量也會上調。含實驗來源
證據與來源

Up-regulated in activated B- and T-cells and upon mitochondrial stress by chloramphenicol

PMID 18641330 ↗ · PMID 21746876 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000356493 · 1,365 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTCTCGTTGGTTCCGGAGGTCGCTGCGGCGGTGGGAAATG40
41CTGGCGCGCGCGGCGCGGGGCACTGGGGCCCTTTTGCTGA80
81GGGGCTCTCTACTGGCTTCTGGCCGCGCTCCGCGCCGCGC120
121CTCCTCTGGATTGCCCCGAAACACCGTGGTACTGTTCGTG160
161CCGCAGCAGGAGGCCTGGGTGGTGGAGCGAATGGGCCGAT200
201TCCACCGGATCCTGGAGCCTGGTTTGAACATCCTCATCCC240
241TGTGTTAGACCGGATCCGATATGTGCAGAGTCTCAAGGAA280
281ATTGTCATCAACGTGCCTGAGCAGTCGGCTGTGACTCTCG320
321ACAATGTAACTCTGCAAATCGATGGAGTCCTTTACCTGCG360
361CATCATGGACCCTTACAAGGCAAGCTACGGTGTGGAGGAC400
401CCTGAGTATGCCGTCACCCAGCTAGCTCAAACAACCATGA440
441GATCAGAGCTCGGCAAACTCTCTCTGGACAAAGTCTTCCG480
481GGAACGGGAGTCCCTGAATGCCAGCATTGTGGATGCCATC520
521AACCAAGCTGCTGACTGCTGGGGTATCCGCTGCCTCCGTT560
561ATGAGATCAAGGATATCCATGTGCCACCCCGGGTGAAAGA600
601GTCTATGCAGATGCAGGTGGAGGCAGAGCGGCGGAAACGG640
641GCCACAGTTCTAGAGTCTGAGGGGACCCGAGAGTCGGCCA680
681TCAATGTGGCAGAAGGGAAGAAACAGGCCCAGATCCTGGC720
721CTCCGAAGCAGAAAAGGCTGAACAGATAAATCAGGCAGCA760
761GGAGAGGCCAGTGCAGTTCTGGCGAAGGCCAAGGCTAAAG800
801CTGAAGCTATTCGAATCCTGGCTGCAGCTCTGACACAACA840
841TAATGGAGATGCAGCAGCTTCACTGACTGTGGCCGAGCAG880
881TATGTCAGCGCGTTCTCCAAACTGGCCAAGGACTCCAACA920
921CTATCCTACTGCCCTCCAACCCTGGCGATGTCACCAGCAT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。