基因總覽
STK32B 是蛋白質編碼基因,產物屬於 protein kinase 超家族中的 Ser/Thr protein kinase 家族。其蛋白質名稱為 Serine/threonine-protein kinase 32B,序列長 414 個胺基酸。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000282908 ★ | 5,051,480–5,500,989 | 12 |
| ENST00000858431 | 5,051,480–5,500,994 | 11 |
| ENST00001001919 | 5,051,480–5,500,994 | 11 |
| ENST00001134872 | 5,051,480–5,500,994 | 12 |
| ENST00000512636 | 5,139,560–5,500,994 | 11 |
| ENST00000510398 | 5,139,636–5,500,994 | 12 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
STK32B 的蛋白質產物具有絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶反應註解:可利用 ATP,將蛋白質上的絲胺酸或蘇胺酸殘基磷酸化,反應中 ATP 轉為 ADP。這些反應註解的證據標示為與其他蛋白質相似性相關,來源未提供特定受質、細胞情境或生物學結果,因此不宜據此延伸至更具體的功能主張。
Promoter 與基因調控
>STK32B ENST00000282908 GRCh38 chr4:5050480-5051580 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AAAAAGAAAGAAGGGGAGAGAACTGGAGAGAGAGACCAGGTAGGGGACGGGGACTGGGGGACGAGATAGG ATGGAGAGAGTCACAAAGAACCCCTGCTTTCTATCAAAGCACGGACAGTGGTTCCAGGCGCCCAGCAGAT GGCAGGATGTAGCCAAAGATTCCCTGCAGTCCCGGAGAGCTGGGCCCGCAGGACTGCAAGGCAGGGGGAC CTGCCTGTCCCTCAGGGAGCGTCCTGGGAACCCGCGCTCGCCCCACACGTCTTGGGGCGCATCTGCCGCA CCCCTTACTTAGGCACCCGCAACTGTGGCGCGTATCTCCCGATCCAGGCTCCCGCCGCAGGAGCCCAGGG ACCCTCATGCTAGCCTCGCCCCTAAATCGGACGCCGATGCCGCCCAATTTTGGGGGAATCCCGAGACTCA TGCCCAGCCATTCCCAGGGAGAATGGTTTGGGGCAAACTATGGCTGTCTGGGGCCTCAGTTTCCCCATGT ACAATGAAGGGGTCAGATTAGTATCTAATCTTAAGGGGTCAGAAAGTAAACAGATACTTTCATTCATTAA ACACTGAGAAAAACCTTAAGAGGAACAGCGTCGGTTGGAGAGCCAGCAGACACTCCACTGCCCATCCCAA TATGAATGGGCAAATACAGGCTAGCGGGGAGTCCTGGGACTCCCTTCGCAGCCGGGGCCGACTAACCACA GACCTAAGAGCCCCTCTACCTCTAGACCTCCGTCTACTGCGCTCTAAAATATGAACGATGCTTTCTTACT GCTGGGTTGTCGGAGGCGGATGTGGGATGGTGCTAACAAAGCGCGTAGCCGAGGCCTGGCCATAGTGGGT GCTGACAAACCGCTTACTGCCTGCAGGGACCGAGCTCCCGGCCGAGGGAGGAGGGCCGAGCAGGGATTCA GATTCTTCCGGGCCGATCCCTTTCTCAGCTCCTTCCGCCCTGCCGCCGCCCACTGCGTGCTGCCTTCGTC CGTCCCCTCCTCCCCCGCTCCTTCCCCTCCTTCCCCTGCTCCCGCGCCGCCTCGCGTCTCCCGCCCGCTG TAGCCGGCGAGGAGCGCCGCACGTTGGCCCCGGCGCGAGGAGCTCCCGGGT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| STK32B_2 ↗ | 4:5,051,311 | 正股 | 5,051,262–5,051,321 |
| STK32B_1 ↗ | 4:5,051,517 | 正股 | 5,051,468–5,051,527 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR4_53742H · CTCF_binding_site · 5050607–5050628 · regulatory
ENSR4_B323S · promoter · 5050990–5051973 · regulatory
ENSR4_53746L · CTCF_binding_site · 5051500–5051521 · regulatory
ENSR4_7B2LF · enhancer · 5052974–5053075 · regulatory
· motif · 5050609–5050625 · motif
· motif · 5051502–5051518 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:414 aa
Serine/threonine-protein kinase 32B 長 414 個胺基酸。蛋白激酶結構域位於第 23–283 位胺基酸;第 374–396 位胺基酸則註解為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 推論支持 | |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
CTTCCCCTCCTTCCCCTGCTCCCGCGCCGCCTCGCGTCTC40CCGCCCGCTGTAGCCGGCGAGGAGCGCCGCACGTTGGCCC80CGGCGCGAGGAGCTCCCGGGTTCCCGGGCGGGCACTGGAG120TAAGGAGCTGCGAGCGCAGCCCGAGGCGGGGCACGGCGGA160AGGCGCGGCGAGAGCGGGGTCCCTGCGAGCGCAGTCGGAA200GGGCGTCCAGGAGAAGGGGGACGCCGTCCCCGCCCCTGCA240CGGTGCTCGGCCCCCTCGGGCTCCGCGCGCGGCTACAACC280CGGACTGGGCGCGCCCCCGGCATCCCGCATCTCTGCGCGC320GTCCCACATCCCGCATCCGGCATCCCAGCGGCCGGGCATG360TAGCAGCGGCAGCAACGGCGGAATATGGGCGGGAACCACT400CCCACAAGCCCCCCGTGTTTGACGAGAATGAGGAAGTCAA440CTTTGACCATTTTCAGATTCTGCGGGCCATTGGTAAAGGG480AGTTTTGGAAAGGTATGCATCGTGCAGAAGCGAGACACTA520AGAAAATGTATGCAATGAAGTACATGAACAAGCAGAAGTG560CATCGAGAGGGATGAGGTTCGGAATGTTTTCCGGGAGCTG600CAGATCATGCAAGGGCTGGAGCACCCCTTCCTGGTCAATC640TGTGGTACTCCTTCCAGGATGAGGAGGACATGTTCATGGT680GGTGGACCTGCTCCTGGGAGGCGACCTGCGCTACCATCTG720CAGCAGAATGTGCATTTCACAGAGGGGACTGTGAAACTCT760ACATCTGTGAGCTGGCACTGGCCCTGGAGTATCTTCAGAG800GTACCACATCATCCACAGAGACATCAAGCCAGACAATATC840CTGCTGGATGAACACGGACATGTTCACATTACAGACTTCA880ACATAGCGACGGTAGTGAAAGGAGCAGAAAGGGCTTCCTC920CATGGCTGGCACCAAGCCCTACATGGCTCCAGAAGTATTC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。