基因總覽
STK31 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 serine/threonine kinase 31,位於人類第 7 號染色體短臂的 7p15.3 區域。現有基因身分資料未提供其表現、細胞定位或生物學角色的進一步描述;蛋白質家族與結構特色見下方說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000355870 ★ | 23,710,219–23,832,513 | 24 |
| ENST00000422637 | 23,710,203–23,735,607 | 7 |
| ENST00000433467 | 23,710,219–23,832,513 | 23 |
| ENST00001095035 | 23,710,219–23,832,513 | 22 |
| ENST00000456014 | 23,710,255–23,735,628 | 7 |
| ENST00000354639 | 23,710,326–23,832,513 | 24 |
| ENST00000531170 | 23,710,327–23,717,527 | 4 |
| ENST00000444333 | 23,710,378–23,729,116 | 6 |
| ENST00000528479 | 23,722,760–23,832,513 | 21 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
STK31 的蛋白質具有絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶活性。來源所列的兩項反應分別以蛋白質上的 L-seryl 殘基或 L-threonyl 殘基為受質,並以 ATP 供應磷酸基;反應後形成相應的磷酸化蛋白質,同時產生 ADP 與 H⁺。
這些反應描述支持 STK31 可催化蛋白質絲胺酸或蘇胺酸殘基的磷酸化。不過,現有資料沒有指出其特定受質、細胞或生理情境,也未說明此活性參與哪些生物過程,因此不宜據此延伸推定其下游作用。
Promoter 與基因調控
>STK31 ENST00000355870 GRCh38 chr7:23709219-23710319 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ATGTCCATACAAAGACTTGCACACAATAGCAGCTTTATTTGAAACAATTCAAAACTGGAAGCAGTCCAAA CACCTATTAAAAGGTAGATAAACAAATTGTGTTATATTCATGCAGTGGAATAGTAACAGCAATAAAACCC AACAAACTCTTGACACATAGGACGAAATTTATCAATCAAAATAATTATGCTATTGGAAAGAAGCTAGATT AAATGTTCATACTGTATGATTCTATTATCGTAAAATTCTAGAAAATGCAAACTAATATATGGTGACAGAA AGCAGAACGGGAGCTGGGAGGAGTCAGGTATTACAACCGGGCATGAGGAAACTTTGAGGTGATGGAAAAG TTTATCTTAATTGTGGAGGTGATTTCAACAGTGTATACATATGTTCACCCTTAACAAATTATGCACTTTT GATATCTGCAGTTTATTGTACTTTAACCTTCAAGCTGTTAAAAATTAACCGGAGATAATTTTCAATTGTT GTGTAAGGTTTGCCACAAAGTGTAATATCTGCAAAGAAGCAGACAACTAATTTTTTCTTCTTAAGATTGT GGAAAAAGTTGTAATACTACAGAGAGCTGTGGAATCTAAGGATTAGTTGACCAACGCTTGTAAAGCTACC AATCTGAAAAACACATTTTCAGTTACCAAAGTTATTTTCTCTCTTCCATCGTGTAAATAGAATGTCGGGG TTCTTCTAATTTGGGTGTTTCTAAAATTTAAATCCACGTGAACAGATTAGGAAAGACCACGAAATCCTAC GTCACCTCTAAAGTCACAGCTTGAAGCCTTGCGAAAGGAACTGGCCCTAGACCCCACCCCGGCCTATAAA TCACCAGGGCGCAGCCTCAGTGCCTGGGGGTCGGCAGCAGCCAGCGTCAGGCGGCTCCCGCACGCTTCTT CCTAGGCGGCAGGCCGTGGCTGCCACGTGACTCCCGCTAACACCGGATGATGGCGCAGCGCTGTGCACGC AGGCGCAGTGTGGGGCCCTTGCGGTCGAAGCTCACGCGGTAAGCCGCTGCACGTGTGCTACGGCGGGCGG AGGGCCGAAAGTCCAGTATGTGGGTCCAGGGTCACTCTTCTAGAGCTTCCG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| STK31_1 ↗ | 7:23,710,302 | 正股 | 23,710,253–23,710,312 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_9CF59 · enhancer · 23712368–23712743 · regulatory
ENSR7_9CF5H · enhancer · 23713085–23713535 · regulatory
ENSR7_B6P3S · enhancer · 23713712–23714352 · regulatory
· motif · 23706370–23706383 · motif
· motif · 23706370–23706383 · motif
· motif · 23709653–23709668 · motif
· motif · 23709653–23709668 · motif
· motif · 23709655–23709668 · motif
· motif · 23714769–23714783 · motif
· motif · 23714776–23714787 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:1019 aa
STK31 蛋白長 1,019 個胺基酸,屬於 protein kinase superfamily 的 Ser/Thr protein kinase family。註解指出其含有 Tudor domain,位於第 78–137 個胺基酸;Protein kinase domain 位於第 710–1,019 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GCGGTCGAAGCTCACGCGGTAAGCCGCTGCACGTGTGCTA40CGGCGGGCGGAGGGCCGAAAGTCCAGTATGTGGGTCCAGG80GTCACTCTTCTAGAGCTTCCGCAACGGAAAGTGTGAGTTT120TTCAGGAATTGTTCAAATGGATGAAGATACACATTACGAT160AAAGTGGAAGATGTGGTTGGAAGTCACATAGAAGATGCAG200TAACATTTTGGGCCCAGAGTATCAATAGAAATAAGGATAT240CATGAAGATTGGTTGCTCACTGTCTGAAGTTTGCCCCCAG280GCCAGTTCAGTTTTGGGGAATCTTGACCCAAACAAGATTT320ATGGTGGATTATTTTCTGAAGATCAGTGTTGGTACAGATG360CAAAGTACTGAAAATCATCAGCGTTGAAAAGTGTCTGGTG400AGGTACATTGACTATGGAAATACTGAAATTCTAAATCGAT440CTGATATAGTTGAAATTCCTTTGGAGCTGCAGTTTTCTAG480TGTTGCCAAAAAGTATAAACTTTGGGGACTACACATTCCT520TCTGATCAAGAAGTTACCCAGTTTGATCAGGGCACAACCT560TTTTGGGGAGCTTGATTTTTGAAAAGGAAATAAAAATGAG600AATTAAAGCAACCTCTGAAGATGGAACAGTTATTGCTCAG640GCTGAGTATGGCAGTGTGGATATAGGGGAAGAGGTGCTTA680AGAAAGGATTTGCAGAGAAATGCAGACTTGCTTCCAGAAC720TGACATCTGTGAGGAAAAAAAATTGGATCCTGGTCAACTT760GTTCTCAGGAACCTCAAAAGCCCCATTCCTTTGTGGGGGC800ATAGATCAAACCAGTCAACCTTCAGCAGGCCCAAGGGGCA840CTTAAGTGAGAAAATGACTCTTGACTTGAAGGATGAAAAT880GATGCAGGCAATCTTATAACATTTCCAAAGGAAAGTTTGG920CTGTTGGTGACTTTAATTTAGGGTCTAACGTCAGCCTGGA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。