基因總覽
STK3 是蛋白質編碼基因,產物屬於 protein kinase 超家族中的 STE Ser/Thr protein kinase 家族、STE20 亞家族。其蛋白質全長 491 個胺基酸,包含蛋白激酶結構域與 C 端 SARAH 結構域,另有兩段被註記為無序區域。STK3 是細胞訊息傳遞中的激酶,也稱為 Mammalian STE20-like protein kinase 2 或 STE20-like kinase MST2;來源指出它是 Hippo 訊息傳遞路徑的重要組成成員。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000419617 ★ | 98,454,633–98,825,688 | 11 |
| ENST00000523601 | 98,454,631–98,942,571 | 13 |
| ENST00000617590 | 98,454,631–98,825,671 | 9 |
| ENST00000862737 | 98,454,631–98,825,687 | 10 |
| ENST00000862738 | 98,454,631–98,825,682 | 12 |
| ENST00000862739 | 98,454,631–98,825,671 | 10 |
| ENST00000862740 | 98,454,631–98,825,660 | 9 |
| ENST00000862741 | 98,454,631–98,825,646 | 9 |
| ENST00000934522 | 98,454,631–98,825,687 | 10 |
| ENST00000971219 | 98,454,631–98,825,682 | 13 |
| ENST00001134711 | 98,454,631–98,825,688 | 11 |
| ENST00000974439 | 98,454,634–98,825,699 | 11 |
顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
STK3 是一種受壓力活化、促進細胞凋亡的激酶。蛋白質經 caspase 切割後可進入細胞核,促使染色質凝縮,接著引發核小體間 DNA 片段化。它也能磷酸化蛋白質上的絲胺酸或蘇胺酸殘基,將 ATP 的磷酸基轉移至受質並產生 ADP。
在 Hippo 訊息傳遞路徑中,STK3 與 STK4 分別和 SAV1 組成複合體,磷酸化並活化與 MOB1 結合的 LATS1/2。接續的 LATS1/2 活化會磷酸化並抑制 YAP1 與 WWTR1/TAZ。此級聯反應參與器官大小控制及腫瘤抑制,並透過限制細胞增殖、促進細胞凋亡調節細胞命運;其中 LATS2 對 YAP1 的磷酸化會抑制其進入細胞核,影響其調控細胞增殖、死亡與遷移相關基因的能力。STK3 與 STK4 也被指出對抑制成熟肝細胞增殖、避免成人肝臟兼性幹細胞(oval cells)活化,以及抑制腫瘤形成有所必要。
STK3 還參與其他磷酸化調控。它磷酸化 NEK2,並藉由調節 NEK2 在中心體的定位及其磷酸化 CROCC、CEP250 的能力,參與中心體分離。STK3 與 SAV1 協同時,可透過調節 ESR1 的磷酸化活化其轉錄活性;它也能藉由抑制 RAF1 Ser-259 的抑制性磷酸化,正向調節 RAF1 活化。另有來源指出 STK3 磷酸化 MOBKL1A、RASSF2 與 MOBKL1B;對 MOBKL1B 的 Thr-74 磷酸化則與兩者協同活化 STK38 有關。NKX2-1 亦是其磷酸化受質,但此項註記為相似性推論。
Promoter 與基因調控
>STK3 ENST00000419617 GRCh38 chr8:98825588-98826688 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTATGTGAAAGGTATATATGGAATTTAAGGTTAAAAGTATACCCACAATATGGATGCATGCAGTGGTCAG ATTACAATGGGATGAGGGCTGCTGGAATCAGGTTGGGGGAGAGGACCAAAGAGGGGAGGAAACAAACTTT TCTTGAGTATTCTTCCTGGCAGCATAATTTGTGACAGGCTTGCCAGGTTACCCAATGGGACAGCTGCAAG GGCCCAGTGCAACTGAATTTGGTGTACCGAGAGATCTCACTGTACGAATTATTTTCTCGGTAATTAGATG TAATTATTGTGAAATGTAGCGAGGAGCTTGTCCACAATAAAAATCAAACAAGAATTTCCAGAAGTATCCC TAGTACTGTGGCCTACACATGTCAAATGGCTGGGGGAAAACATAACCGATAATTATAAACAGAACTAGAG AGGGAAGCGTGGGCAGTGAGAAAGTAATACTTCAAACGGATTCACACGATGTTAGGATGTGTCGTTGGGA AAGCCAAAGAAATGAGTCAAATTGGATCAGGGCAAACCGTAGTGAGGGCAGGCTAGGGGCGGAGCTCTGG GCCAGCTCAGAGGGACTTGCCCTTCCCCAGCCTAGAGCGGCTCCGGCCTCGCCCCCTAGCTCTAGCGGAA CCTTCTCCTTTTCCCGGTCACGGGGCTCTGGGGCCAGCCAGGCCTTCGTCCCCGGCCCCGCCCACCCGCC GCGGCACCGGCCCCGCCCGCCAACCCAGGCCGCGGCAGGCTCCGCCCCCCGCCGCGGTGCCCGGCTCCGT CCACCTTCTCTGGGCCGCCGCCGCAGGCTGGCGGCCGGCGCGGCCGGGGGCGGGGCGGGGCGGCCGGGGG CGGGGCGGGGCGGCCGGGGGCGGGGCGGGGCGGCCGGGGGCGGGGCGGGGCGGCCGGGGGCGGGGCGGGG CGGCCGGGGGCGGGGCGGGGCGGCCGGGGGCGGGGCGGGGCGGCCGGGGGCGGGGCGGGGCGGGAGGAGC CGCGCTCCTAAGCGGGAGGGAGATCCGCCGCGGAGTTACGGGAAAGTTGGTCCGAGTTCCCAGAGTTTCC CTCTGTGGTGCCCTAGGCTCGGCCGGCCGGTGCCCCGGCTCCTTTCCTCCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| STK3_1 ↗ | 8:98,825,671 | 負股 | 98,825,661–98,825,720 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR8_CCRQR · enhancer · 98824539–98825660 · regulatory
ENSR8_BPLJP · promoter · 98825661–98826178 · regulatory
ENSR8_5T8LH5 · CTCF_binding_site · 98826063–98826084 · regulatory
· motif · 98825242–98825249 · motif
· motif · 98825537–98825547 · motif
· motif · 98826065–98826081 · motif
· motif · 98826157–98826172 · motif
STK3 的活性在有絲分裂期間增加。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:491 aa
STK3 蛋白全長 491 個胺基酸,屬於 protein kinase 超家族的 STE Ser/Thr protein kinase 家族及 STE20 亞家族。其蛋白激酶結構域位於第 27–278 個胺基酸,SARAH 結構域位於第 437–484 個胺基酸;第 301–327 與第 370–392 個胺基酸區段則被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
STK3 可位於細胞質、細胞核及細胞骨架的微管組織中心(中心體)。 經 caspase 切割的形式會在細胞核與細胞質之間往返;Thr-117 磷酸化則會抑制其進入細胞核。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 26 個夥伴
- FAM9BQ8IZU0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FLJ13057Q53SE7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GABARAPO95166 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GABARAPL1Q9H0R8 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GABARAPL2P60520 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GAD1Q99259 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- JPH3Q8WXH2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MAP1LC3BQ9GZQ8 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- MAP1LC3CQ9BXW4 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MOB1AQ9H8S9 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- MOB1BQ7L9L4 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- MOB3BQ86TA1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PLEKHF2Q9H8W4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RAF1P04049 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- RASSF1Q9NS23-2 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- RASSF2P50749 · UniProt INTERACTION · 21 experiments
- RASSF3Q86WH2 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- RASSF4Q9H2L5 · UniProt INTERACTION · 11 experiments
- RASSF5Q8WWW0 · UniProt INTERACTION · 9 experiments · 2 筆來源紀錄
- RASSF6Q6ZTQ3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SAV1Q9H4B6 · UniProt INTERACTION · 29 experiments
- SLMAPQ14BN4 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- SNIP1Q8TAD8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- STK4Q13043 · UniProt INTERACTION · 20 experiments
- TFPTP0C1Z6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
STK3 可經由 coiled-coil 區域形成同源二聚體,並與多種蛋白質互作。它會與 SAV1 結合並使其穩定;與 ESR1 的互作需要 SAV1 存在。STK3 也能透過 SARAH 結構域與 NEK2 isoform 1、RASSF2 結合,並與 RASSF1、RAF1、PKB/AKT1 及 NORE1 互作;NORE1 會抑制 STK3 自我活化。與 RASSF5 的異源二聚化同樣抑制 STK3 自我活化。STK3 會與 MOBKL1B、STK38 形成三元複合體;磷酸化後則可透過 SLMAP 的 FHA 結構域結合,並與 STRIPAK complex 相關聯。它也與 DLG5、LATS1 及 MARK3 互作;DLG5 存在時會抑制 STK3–LATS1 互作,並與 STK3–MARK3 互作相關。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | STK3 是受壓力活化的促凋亡激酶;經 caspase 切割後進入細胞核,引發染色質凝縮及核小體間 DNA 片段化。它參與 Hippo 路徑,與 STK4、SAV1、LATS1/2 和 MOB1 等組成磷酸化級聯,抑制 YAP1、WWTR1/TAZ,進而限制增殖並促進凋亡,參與器官大小控制與腫瘤抑制。STK3/STK4 也被指出可抑制成熟肝細胞增殖、oval cells 活化及腫瘤形成;此外,STK3 磷酸化多種蛋白並影響中心體分離、ESR1 轉錄活性、RAF1 活化及 STK38 活化。NKX2-1 的磷酸化屬相似性推論。 | 含實驗來源 | 證據與來源Stress-activated, pro-apoptotic kinase which, following caspase-cleavage, enters the nucleus and induces chromatin condensation followed by internucleosomal DNA fragmentation. Key component of the Hippo signaling pathway which plays a pivotal role in organ size control and tumor suppression by restricting proliferation and promoting apoptosis. The core of this pathway is composed of a kinase cascade wherein STK3/MST2 and STK4/MST1, in complex with its regulatory protein SAV1, phosphorylates and activates LATS1/2 in complex with its regulatory protein MOB1, which in turn phosphorylates and inactivates YAP1 oncoprotein and WWTR1/TAZ. Phosphorylation of YAP1 by LATS2 inhibits its translocation into the nucleus to regulate cellular genes important for cell proliferation, cell death, and cell migration. STK3/MST2 and STK4/MST1 are required to repress proliferation of mature hepatocytes, to prevent activation of facultative adult liver stem cells (oval cells), and to inhibit tumor formation. Phosphorylates NKX2-1 (By similarity). Phosphorylates NEK2 and plays a role in centrosome disjunction by regulating the localization of NEK2 to centrosome, and its ability to phosphorylate CROCC and CEP250. In conjunction with SAV1, activates the transcriptional activity of ESR1 through the modulation of its phosphorylation. Positively regulates RAF1 activation via suppression of the inhibitory phosphorylation of RAF1 on 'Ser-259'. Phosphorylates MOBKL1A and RASSF2. Phosphorylates MOBKL1B on 'Thr-74'. Acts cooperatively with MOBKL1B to activate STK38 PMID 11278283 ↗ · PMID 15688006 ↗ · PMID 16930133 ↗ · PMID 18328708 ↗ · PMID 18362890 ↗ · PMID 19525978 ↗ · PMID 20212043 ↗ · PMID 21076410 ↗ · PMID 21104395 ↗ · PMID 21723128 ↗ · PMID 23972470 ↗ · PMID 28087714 ↗ · PMID 29063833 ↗ · PMID 30622739 ↗ · PMID 8566796 ↗ · PMID 8816758 ↗ |
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) PMID 15688006 ↗ · PMID 29063833 ↗ |
| 交互作用 | STK3 可透過 coiled-coil 區域形成同源二聚體。它與 SAV1 結合並使其穩定;NORE1 會抑制其自我活化,與 RASSF5 異源二聚化也會抑制自我活化。STK3 與 ESR1 的互作需有 SAV1,並可與 RAF1、RASSF1、PKB/AKT1、NEK2 isoform 1、RASSF2、DLG5、LATS1 及 MARK3 互作;DLG5 會抑制 STK3–LATS1 互作。STK3 可與 MOBKL1B、STK38 形成三元複合體,磷酸化後也能透過 SLMAP 的 FHA 結構域互作並連結至 STRIPAK complex。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer; mediated via the coiled-coil region. Interacts with NORE1, which inhibits autoactivation (By similarity). Interacts with and stabilizes SAV1. Interacts with RAF1, which prevents dimerization and phosphorylation. Interacts with RASSF1. Interacts (via SARAH domain) with isoform 1 of NEK2. Interacts with ESR1 only in the presence of SAV1. Interacts with PKB/AKT1. Forms a tripartite complex with MOBKL1B and STK38. Interacts with RASSF2 (via SARAH domain). Interacts with DLG5 (via PDZ domain 3). Interacts with LATS1; this interaction is inhibited in the presence of DLG5. Interacts with MARK3 in the presence of DLG5. Interacts with RASSF5; this interaction inhibits STK3 autoactivation through heterodimerization. Interacts (when phosphorylated) with SLMAP (via FHA domain); the interaction associates STK3 with the STRIPAK complex PMID 15618521 ↗ · PMID 15688006 ↗ · PMID 16510573 ↗ · PMID 16930133 ↗ · PMID 18362890 ↗ · PMID 19525978 ↗ · PMID 20086174 ↗ · PMID 21076410 ↗ · PMID 21104395 ↗ · PMID 21199877 ↗ · PMID 23972470 ↗ · PMID 28087714 ↗ · PMID 29063833 ↗ · PMID 30622739 ↗ |
| 細胞定位 | STK3 可位於細胞質、細胞核及細胞骨架的微管組織中心(中心體)。經 caspase 切割的 STK3 形式會在細胞核與細胞質之間往返;Thr-117 磷酸化會抑制其進入細胞核。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Nucleus; Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome; The caspase-cleaved form cycles between nucleus and cytoplasm. Phosphorylation at Thr-117 leads to inhibition of nuclear translocation PMID 21145499 ↗ · PMID 29063833 ↗ · PMID 37739411 ↗ |
| 調控 | STK3 的活性在有絲分裂期間增加。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGATCCGCCGCGGAGTTACGGGAAAGTTGGTCCGAGTTCC40CAGAGTTTCCCTCTGTGGTGCCCTAGGCTCGGCCGGCCGG80TGCCCCGGCTCCTTTCCTCCTTTCGGCCTTCGCCGTCCAC120CAGGTCCCTCTCTCTGTCCCCGGCCGCCATGGAGCAGCCG160CCGGCGCCTAAGAGTAAACTAAAAAAGCTGAGTGAAGACA200GTTTGACTAAGCAGCCTGAAGAAGTTTTTGATGTATTAGA240GAAGCTTGGAGAAGGGTCTTATGGAAGTGTATTTAAAGCA280ATACACAAGGAATCCGGTCAAGTTGTCGCAATTAAACAAG320TACCTGTTGAATCAGATCTTCAGGAAATAATCAAAGAAAT360TTCCATAATGCAGCAATGTGACAGCCCATATGTTGTAAAG400TACTATGGCAGTTATTTTAAGAATACAGACCTCTGGATTG440TTATGGAGTACTGTGGCGCTGGCTCTGTCTCAGACATAAT480TAGATTACGAAACAAGACATTAATAGAAGATGAAATTGCA520ACCATTCTTAAATCTACATTGAAAGGACTAGAATATTTGC560ACTTTATGAGAAAAATACACAGAGATATAAAAGCTGGAAA600TATTCTCCTCAATACAGAAGGACATGCAAAATTGGCAGAT640TTTGGAGTGGCTGGTCAGTTAACAGATACAATGGCAAAAC680GCAATACTGTAATAGGAACTCCATTTTGGATGGCTCCTGA720GGTGATTCAAGAAATAGGCTATAACTGTGTGGCCGACATC760TGGTCCCTTGGCATTACTTCTATAGAAATGGCTGAAGGAA800AACCTCCTTATGCTGATATACATCCAATGAGGGCTATTTT840TATGATTCCCACAAATCCACCACCAACATTCAGAAAGCCA880GAACTTTGGTCCGATGATTTCACCGATTTTGTTAAAAAGT920GTTTGGTGAAGAATCCTGAGCAGAGAGCTACTGCAACACA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。