演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

STK25SOK1

serine/threonine kinase 25

STK25 編碼 serine/threonine kinase 25,屬於 STE20 次家族的絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶;其功能與細胞訊號調節及多種細胞過程相關。

Homo sapiens2q37.3UniProt O00506
OFFICIAL SYMBOL
STK25
CHROMOSOME
2
UNIPROT
O00506
PDB / ALPHAFOLD
7Z4V
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

STK25 是蛋白質編碼基因,產物為 serine/threonine kinase 25,屬於蛋白激酶超家族中的 STE Ser/Thr protein kinase family,並歸於 STE20 次家族。作為一種氧化壓力活化的激酶,STK25 參與細胞內訊號調節,並與代謝恆定、神經元極化、細胞移動、高基氏體組織、細胞凋亡及先天免疫等過程相關。其蛋白質具有蛋白激酶結構域,提供催化功能的結構基礎;此外,序列中也有一段被註記為無序區域。

Official symbol
STK25
Gene name
serine/threonine kinase 25
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11404
UniProt
O00506
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SOK1YSK1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 22q37.3
chr2 · 242,193,529 bp · GRCh38chr2p25.3 · 1–4400000 · gnegchr2p25.2 · 4400001–6900000 · gpos50chr2p25.1 · 6900001–12000000 · gnegchr2p24.3 · 12000001–16500000 · gpos75chr2p24.2 · 16500001–19000000 · gnegchr2p24.1 · 19000001–23800000 · gpos75chr2p23.3 · 23800001–27700000 · gnegchr2p23.2 · 27700001–29800000 · gpos25chr2p23.1 · 29800001–31800000 · gnegchr2p22.3 · 31800001–36300000 · gpos75chr2p22.2 · 36300001–38300000 · gnegchr2p22.1 · 38300001–41500000 · gpos50chr2p21 · 41500001–47500000 · gnegchr2p16.3 · 47500001–52600000 · gpos100chr2p16.2 · 52600001–54700000 · gnegchr2p16.1 · 54700001–61000000 · gpos100chr2p15 · 61000001–63900000 · gnegchr2p14 · 63900001–68400000 · gpos50chr2p13.3 · 68400001–71300000 · gnegchr2p13.2 · 71300001–73300000 · gpos50chr2p13.1 · 73300001–74800000 · gnegchr2p12 · 74800001–83100000 · gpos100chr2p11.2 · 83100001–91800000 · gnegchr2p11.1 · 91800001–93900000 · acenchr2q11.1 · 93900001–96000000 · acenchr2q11.2 · 96000001–102100000 · gnegchr2q12.1 · 102100001–105300000 · gpos50chr2q12.2 · 105300001–106700000 · gnegchr2q12.3 · 106700001–108700000 · gpos25chr2q13 · 108700001–112200000 · gnegchr2q14.1 · 112200001–118100000 · gpos50chr2q14.2 · 118100001–121600000 · gnegchr2q14.3 · 121600001–129100000 · gpos50chr2q21.1 · 129100001–131700000 · gnegchr2q21.2 · 131700001–134300000 · gpos25chr2q21.3 · 134300001–136100000 · gnegchr2q22.1 · 136100001–141500000 · gpos100chr2q22.2 · 141500001–143400000 · gnegchr2q22.3 · 143400001–147900000 · gpos100chr2q23.1 · 147900001–149000000 · gnegchr2q23.2 · 149000001–149600000 · gpos25chr2q23.3 · 149600001–154000000 · gnegchr2q24.1 · 154000001–158900000 · gpos75chr2q24.2 · 158900001–162900000 · gnegchr2q24.3 · 162900001–168900000 · gpos75chr2q31.1 · 168900001–177100000 · gnegchr2q31.2 · 177100001–179700000 · gpos50chr2q31.3 · 179700001–182100000 · gnegchr2q32.1 · 182100001–188500000 · gpos75chr2q32.2 · 188500001–191100000 · gnegchr2q32.3 · 191100001–196600000 · gpos75chr2q33.1 · 196600001–202500000 · gnegchr2q33.2 · 202500001–204100000 · gpos50chr2q33.3 · 204100001–208200000 · gnegchr2q34 · 208200001–214500000 · gpos100chr2q35 · 214500001–220700000 · gnegchr2q36.1 · 220700001–224300000 · gpos75chr2q36.2 · 224300001–225200000 · gnegchr2q36.3 · 225200001–230100000 · gpos100chr2q37.1 · 230100001–234700000 · gnegchr2q37.2 · 234700001–236400000 · gpos50chr2q37.3 · 236400001–242193529 · gnegSTK25pq1 bp242,193,529 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr2:241,482,075–241,509,730
Gene span
27,656 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000316586 ★241,492,670–241,508,58412
ENST00001116579241,482,075–241,508,61411
ENST00001141732241,492,670–241,508,69512
ENST00001008491241,493,777–241,508,69511
ENST00000535007241,494,707–241,508,69511
ENST00000543554241,494,707–241,509,57211
ENST00000903350241,494,712–241,508,69512
ENST00001017641241,494,712–241,508,61410
ENST00001017640241,494,714–241,508,61410
ENST00000930802241,494,933–241,508,69511
ENST00000930803241,495,015–241,508,61410
ENST00000403346241,495,017–241,508,69512

顯示 12/39 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

STK25 是受氧化壓力活化的絲胺酸/蘇胺酸激酶,能以 ATP 為磷酸基來源,催化蛋白質中絲胺酸或蘇胺酸殘基的磷酸化。來源指出它與代謝恆定、神經元極化、細胞移動、高基氏體組織、細胞凋亡及先天免疫等生物過程有關,並在不同訊號脈絡中調節下游事件。

STK25 定位至高基氏體,並被認為可調節蛋白質運輸、細胞黏附,以及參與細胞移動的極性複合體。它也是 STRIPAK(striatin-interacting phosphatase and kinase)複合體的一部分;STRIPAK 複合體參與蛋白質去磷酸化與磷酸化,並調節 Hippo、MAPK、核受體及細胞骨架重塑等訊號路徑。不同類型的 STRIPAK 複合體與細胞生長、分化、凋亡、代謝及免疫調節等過程相關。

在 PKA 路徑中,STK25 透過影響調節次單元 PRKAR1A 的磷酸化,抑制催化次單元的激酶活性,因而具有抑制 PKA 路徑的作用。另一方面,STK25 可直接磷酸化轉錄因子 IRF5,正向調節 TLR 訊號傳遞。這些作用顯示,STK25 可透過不同底物與複合體參與訊號調節;其影響依所涉及的路徑與生物過程而異。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 241508584 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>STK25 ENST00000316586 GRCh38 chr2:241508484-241509584 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AACCCTCTCGAAGAAGGAGGGATGTGAGGAGGTCAGGATAGTCACCTGTGCTGAGCCATCATGGAGAGTG
AGGGCCTGTAAGGGTGGACACAGTATGCAGGAGGGACAAATCTTCCTCACCGGACAGGTGGGGATCCCTG
CGGTGCACTAGGGGAATGCACACAGGGGGCACTATGACCTGGCGGCCCACGGGGCACGGGGACGCACCAG
GTAGCCTTGGGATCTGCAAGTCCCTCCCGGACCCTGGGGAGTGCCATGACGGCTTCCAGCAGCAGTCACT
GTCCTGGGCGCGTCCCGCGCTCTAGCCCAGGTGGGTCCCACAACGGTGTGACCAAGGACGTCCTATGACC
ACCCCTTGACAGGTAAGGAAACTGAGGCAGGAGAGGCGAAGCAACTCGCCCAAGGAATGGGCTGTGCCGG
TAGCTTCTCCAAGGCCTGGTGCGCCCTGGCCTGTGCGCGTGATCCCGGGCGGGGTCTCAGTACGAACAGG
GGCTTCGCGATGTGGCCAGCGCGGGCTTATCTCCGTGCCGTGACGACAAGGCTAGAAGCCTGGGCGGCCG
CGGTGGATCCTCGTGGCGAGGCGGGGAGGGCGCCGGGCCTCACTGGCCCGCTCGAACCAGGGCTGCGCAG
GGCAGAGCCCAAGGGAGAGGGCCGCGCGGCCGCCGTAACGTCGGAGACGACGCCTGGCAGGCGCCAGCAA
ACGCAGAAGACCCGCGAGGGCGAGGCAGGGAGGGCGCGACGCGACAACGACCACGTGCCCCGCCCGCCCA
GGCGCGCGGCCTGCCGGGAGACGCAGTCCAAACCTTTCGGGAGCAGGACTAGGGGTCCCAGAGAGCCTCG
CGGCGCGCATGCGAGCCCCGGCCCCCTCTCGCGCAGCCTGCCGGGACTTGTAGTCCAACGCCAGCAGGCT
TCCGGGCCCGGAGTGGGCGGTGGGACTCGGGGTCCCAGAGAGCCGTGCGCGGGCCGCGACGCCGAGCACC
GCCCTCGCCGTCGCCTCCGGGCTTTCTCCGGTCGCTGCCGCCACCACCGTTGCTTCGCGGGCTGGGAGGC
CCGGGGTCCCCGGGCGAACAGAGGCTGCGGGTGGGAGCCTTCGCGGGCGCT
STK25 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
STK25_2 ↗2:241,508,343負股241,508,333–241,508,392
STK25_1 ↗2:241,508,584負股241,508,574–241,508,633
STK25_3 ↗2:241,508,787負股241,508,777–241,508,836

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR2_95JT66 · enhancer · 241505733–241506081 · regulatory

ENSR2_CTZ36 · enhancer · 241506882–241508351 · regulatory

ENSR2_B3QX4H · promoter · 241508352–241508883 · regulatory

ENSR2_B3QX4K · enhancer · 241508884–241509561 · regulatory

ENSR2_894PDJ · promoter · 241509562–241509813 · regulatory

· motif · 241507491–241507500 · motif

· motif · 241507491–241507500 · motif

· motif · 241507929–241507942 · motif

· motif · 241508669–241508678 · motif

· motif · 241508730–241508741 · motif

· motif · 241508732–241508748 · motif

· motif · 241508732–241508748 · motif

· motif · 241508826–241508835 · motif

· motif · 241508826–241508835 · motif

· motif · 241508826–241508835 · motif

· motif · 241508826–241508835 · motif

· motif · 241509063–241509069 · motif

· motif · 241509068–241509085 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:426 aa

1 aa426 aa結構域功能區域
依 O00506 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

serine/threonine kinase 25 長 426 個胺基酸,屬於蛋白激酶超家族中的 STE Ser/Thr protein kinase family,並位於 STE20 次家族。其蛋白激酶結構域位於第 20 至 270 個胺基酸;第 291 至 355 個胺基酸則註記為無序區域。

結構域Protein kinase20–270 aa
功能區域Disordered291–355 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7Z4V…

PDB · 7Z4V

X-ray · 1.64 A · A=1-294

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Golgi apparatus

STK25 位於細胞質,並定位至高基氏體;來源未提供定位改變的條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 11 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SOK1STK25CAB39CCNDBP1CEP70GOLGA2GOLGA6L9IHO1PDCD10STRNTRIM27YWHAZGolga2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 11 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

STK25 可形成同源二聚體,並與 CTTNBP2NL 互作;它也是 STRIPAK 複合體核心的一員,該複合體包含 PP2A 催化與支架次單元、striatins、MOB4、STRIP1、STRIP2、PDCD10,以及包括 STK24 和 STK26 在內的 STE20 激酶。STK25 也透過 N 端與 TAOK3 互作;此互作可促進 STK25 的蛋白質表現量和/或穩定性。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能STK25 是受氧化壓力活化的絲胺酸/蘇胺酸激酶,與代謝恆定、神經元極化、細胞移動、高基氏體組織、凋亡及先天免疫相關。它定位於高基氏體,可能調節蛋白質運輸、細胞黏附和細胞移動相關極性複合體;亦屬於參與蛋白質磷酸化調節及多條訊號路徑的 STRIPAK 複合體。STK25 可抑制 PKA 路徑,並藉由磷酸化 IRF5 正向調節 TLR 訊號。含實驗來源
證據與來源

Oxidant stress-activated serine/threonine kinase that plays a role in metabolic homeostasis, neuronal polarization, cell migration, Golgi organization, apoptosis or innate immunity. Targets to the Golgi apparatus where it appears to regulate protein transport events, cell adhesion, and polarity complexes important for cell migration. Part of the striatin-interacting phosphatase and kinase (STRIPAK) complexes. STRIPAK complexes have critical roles in protein (de)phosphorylation and are regulators of multiple signaling pathways including Hippo, MAPK, nuclear receptor and cytoskeleton remodeling. Different types of STRIPAK complexes are involved in a variety of biological processes such as cell growth, differentiation, apoptosis, metabolism and immune regulation. Functions as an inhibitor of the PKA pathway by affecting phosphorylation of the PRKAR1A regulatory subunit, which in turn suppresses the kinase activity of the catalytic subunit. Positively regulates the TLR signaling by directly phosphorylating the transcription factor IRF5

PMID 15037601 ↗ · PMID 18782753 ↗ · PMID 35977512 ↗ · PMID 40639948 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+)含實驗來源
證據與來源

L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+)

PMID 35977512 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+)含實驗來源
證據與來源

L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+)

PMID 40639948 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用STK25 可形成同源二聚體,並與 CTTNBP2NL 互作;它也是 STRIPAK 複合體核心的一員,該複合體含 PP2A 催化與支架次單元、striatins、MOB4、STRIP1、STRIP2、PDCD10 及 STE20 激酶成員 STK24、STK26。STK25 另透過 N 端與 TAOK3 互作,此互作會促進 STK25 的蛋白質表現量和/或穩定性。含實驗來源
證據與來源

Homodimer. Interacts with CTTNBP2NL. Part of the core of STRIPAK complexes composed of PP2A catalytic and scaffolding subunits, the striatins (PP2A regulatory subunits), the striatin-associated proteins MOB4, STRIP1 and STRIP2, PDCD10 and members of the STE20 kinases, such as STK24 and STK26. Interacts with TAOK3 (via N-terminus); the interaction promotes STK25 abundance at the level of protein expression and/or stability

PMID 18782753 ↗ · PMID 34634521 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位STK25 位於細胞質及高基氏體,並定位於高基氏體;來源未提供定位改變條件或異構型差異。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Golgi apparatus; Localizes to the Golgi apparatus

PMID 15037601 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000316586 · 4,515 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCTTTCTCCGGTCGCTGCCGCCACCACCGTTGCTTCGCGG40
41GCTGGGAGGCCCGGGGTCCCCGGGCGAACAGAGGCTGCGG80
81GTGGGAGCCTTCGCGGGCGCTGCAGAGCGGGCCGGGGGAG120
121GCCGGGATGGAGCCCCGCGGAGTGGACTGACGCCGCAGGG160
161GCGAGCTAGCCGGCTCCGCGCCTCTCCGCGGGATCCAGAC200
201GCCTCCTGGGGCTGCTGGCGGAGGGTCTGAGGCGGCGCGG240
241CCATGGCTCACCTCCGGGGATTTGCCAACCAGCACTCTCG280
281AGTGGACCCTGAGGAGCTCTTCACCAAGCTCGACCGCATT320
321GGCAAGGGCTCGTTTGGGGAGGTCTACAAGGGCATCGATA360
361ACCACACAAAGGAGGTGGTGGCCATCAAGATCATCGACCT400
401GGAGGAGGCCGAGGATGAGATCGAGGACATCCAGCAGGAG440
441ATCACTGTCCTCAGTCAGTGCGACAGCCCCTACATCACCC480
481GCTACTTTGGCTCCTACCTAAAGAGCACCAAGCTATGGAT520
521CATCATGGAGTACCTGGGCGGCGGCTCAGCACTGGACTTG560
561CTTAAACCAGGTCCCCTGGAGGAGACATACATTGCCACGA600
601TCCTGCGGGAGATTCTGAAGGGCCTGGATTATCTGCACTC640
641CGAACGCAAGATCCACCGAGACATCAAAGCTGCCAACGTG680
681CTACTCTCGGAGCAGGGTGACGTGAAGCTGGCGGACTTTG720
721GGGTAGCAGGGCAGCTCACAGACACGCAGATTAAGAGGAA760
761CACATTCGTGGGCACCCCCTTCTGGATGGCACCTGAGGTC800
801ATCAAGCAGTCGGCCTACGACTTCAAGGCTGACATCTGGT840
841CCCTGGGGATCACAGCCATCGAGCTGGCCAAGGGGGAGCC880
881TCCAAACTCTGACCTCCACCCCATGCGCGTCCTGTTCCTG920
921ATTCCCAAGAACAGCCCACCCACACTGGAGGGCCAGCACA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。