基因總覽
STK25 是蛋白質編碼基因,產物為 serine/threonine kinase 25,屬於蛋白激酶超家族中的 STE Ser/Thr protein kinase family,並歸於 STE20 次家族。作為一種氧化壓力活化的激酶,STK25 參與細胞內訊號調節,並與代謝恆定、神經元極化、細胞移動、高基氏體組織、細胞凋亡及先天免疫等過程相關。其蛋白質具有蛋白激酶結構域,提供催化功能的結構基礎;此外,序列中也有一段被註記為無序區域。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000316586 ★ | 241,492,670–241,508,584 | 12 |
| ENST00001116579 | 241,482,075–241,508,614 | 11 |
| ENST00001141732 | 241,492,670–241,508,695 | 12 |
| ENST00001008491 | 241,493,777–241,508,695 | 11 |
| ENST00000535007 | 241,494,707–241,508,695 | 11 |
| ENST00000543554 | 241,494,707–241,509,572 | 11 |
| ENST00000903350 | 241,494,712–241,508,695 | 12 |
| ENST00001017641 | 241,494,712–241,508,614 | 10 |
| ENST00001017640 | 241,494,714–241,508,614 | 10 |
| ENST00000930802 | 241,494,933–241,508,695 | 11 |
| ENST00000930803 | 241,495,015–241,508,614 | 10 |
| ENST00000403346 | 241,495,017–241,508,695 | 12 |
顯示 12/39 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
STK25 是受氧化壓力活化的絲胺酸/蘇胺酸激酶,能以 ATP 為磷酸基來源,催化蛋白質中絲胺酸或蘇胺酸殘基的磷酸化。來源指出它與代謝恆定、神經元極化、細胞移動、高基氏體組織、細胞凋亡及先天免疫等生物過程有關,並在不同訊號脈絡中調節下游事件。
STK25 定位至高基氏體,並被認為可調節蛋白質運輸、細胞黏附,以及參與細胞移動的極性複合體。它也是 STRIPAK(striatin-interacting phosphatase and kinase)複合體的一部分;STRIPAK 複合體參與蛋白質去磷酸化與磷酸化,並調節 Hippo、MAPK、核受體及細胞骨架重塑等訊號路徑。不同類型的 STRIPAK 複合體與細胞生長、分化、凋亡、代謝及免疫調節等過程相關。
在 PKA 路徑中,STK25 透過影響調節次單元 PRKAR1A 的磷酸化,抑制催化次單元的激酶活性,因而具有抑制 PKA 路徑的作用。另一方面,STK25 可直接磷酸化轉錄因子 IRF5,正向調節 TLR 訊號傳遞。這些作用顯示,STK25 可透過不同底物與複合體參與訊號調節;其影響依所涉及的路徑與生物過程而異。
Promoter 與基因調控
>STK25 ENST00000316586 GRCh38 chr2:241508484-241509584 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AACCCTCTCGAAGAAGGAGGGATGTGAGGAGGTCAGGATAGTCACCTGTGCTGAGCCATCATGGAGAGTG AGGGCCTGTAAGGGTGGACACAGTATGCAGGAGGGACAAATCTTCCTCACCGGACAGGTGGGGATCCCTG CGGTGCACTAGGGGAATGCACACAGGGGGCACTATGACCTGGCGGCCCACGGGGCACGGGGACGCACCAG GTAGCCTTGGGATCTGCAAGTCCCTCCCGGACCCTGGGGAGTGCCATGACGGCTTCCAGCAGCAGTCACT GTCCTGGGCGCGTCCCGCGCTCTAGCCCAGGTGGGTCCCACAACGGTGTGACCAAGGACGTCCTATGACC ACCCCTTGACAGGTAAGGAAACTGAGGCAGGAGAGGCGAAGCAACTCGCCCAAGGAATGGGCTGTGCCGG TAGCTTCTCCAAGGCCTGGTGCGCCCTGGCCTGTGCGCGTGATCCCGGGCGGGGTCTCAGTACGAACAGG GGCTTCGCGATGTGGCCAGCGCGGGCTTATCTCCGTGCCGTGACGACAAGGCTAGAAGCCTGGGCGGCCG CGGTGGATCCTCGTGGCGAGGCGGGGAGGGCGCCGGGCCTCACTGGCCCGCTCGAACCAGGGCTGCGCAG GGCAGAGCCCAAGGGAGAGGGCCGCGCGGCCGCCGTAACGTCGGAGACGACGCCTGGCAGGCGCCAGCAA ACGCAGAAGACCCGCGAGGGCGAGGCAGGGAGGGCGCGACGCGACAACGACCACGTGCCCCGCCCGCCCA GGCGCGCGGCCTGCCGGGAGACGCAGTCCAAACCTTTCGGGAGCAGGACTAGGGGTCCCAGAGAGCCTCG CGGCGCGCATGCGAGCCCCGGCCCCCTCTCGCGCAGCCTGCCGGGACTTGTAGTCCAACGCCAGCAGGCT TCCGGGCCCGGAGTGGGCGGTGGGACTCGGGGTCCCAGAGAGCCGTGCGCGGGCCGCGACGCCGAGCACC GCCCTCGCCGTCGCCTCCGGGCTTTCTCCGGTCGCTGCCGCCACCACCGTTGCTTCGCGGGCTGGGAGGC CCGGGGTCCCCGGGCGAACAGAGGCTGCGGGTGGGAGCCTTCGCGGGCGCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| STK25_2 ↗ | 2:241,508,343 | 負股 | 241,508,333–241,508,392 |
| STK25_1 ↗ | 2:241,508,584 | 負股 | 241,508,574–241,508,633 |
| STK25_3 ↗ | 2:241,508,787 | 負股 | 241,508,777–241,508,836 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR2_95JT66 · enhancer · 241505733–241506081 · regulatory
ENSR2_CTZ36 · enhancer · 241506882–241508351 · regulatory
ENSR2_B3QX4H · promoter · 241508352–241508883 · regulatory
ENSR2_B3QX4K · enhancer · 241508884–241509561 · regulatory
ENSR2_894PDJ · promoter · 241509562–241509813 · regulatory
· motif · 241507491–241507500 · motif
· motif · 241507491–241507500 · motif
· motif · 241507929–241507942 · motif
· motif · 241508669–241508678 · motif
· motif · 241508730–241508741 · motif
· motif · 241508732–241508748 · motif
· motif · 241508732–241508748 · motif
· motif · 241508826–241508835 · motif
· motif · 241508826–241508835 · motif
· motif · 241508826–241508835 · motif
· motif · 241508826–241508835 · motif
· motif · 241509063–241509069 · motif
· motif · 241509068–241509085 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:426 aa
serine/threonine kinase 25 長 426 個胺基酸,屬於蛋白激酶超家族中的 STE Ser/Thr protein kinase family,並位於 STE20 次家族。其蛋白激酶結構域位於第 20 至 270 個胺基酸;第 291 至 355 個胺基酸則註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
STK25 位於細胞質,並定位至高基氏體;來源未提供定位改變的條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 11 個夥伴
- CAB39Q9Y376 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- CCNDBP1O95273 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CEP70Q8NHQ1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GOLGA2Q08379 · UniProt INTERACTION · 18 experiments
- GOLGA6L9A6NEM1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IHO1Q8IYA8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PDCD10Q9BUL8 · UniProt INTERACTION · 34 experiments
- STRNO43815 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- TRIM27P14373 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- YWHAZP63104 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- Golga2Q62839 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
STK25 可形成同源二聚體,並與 CTTNBP2NL 互作;它也是 STRIPAK 複合體核心的一員,該複合體包含 PP2A 催化與支架次單元、striatins、MOB4、STRIP1、STRIP2、PDCD10,以及包括 STK24 和 STK26 在內的 STE20 激酶。STK25 也透過 N 端與 TAOK3 互作;此互作可促進 STK25 的蛋白質表現量和/或穩定性。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | STK25 是受氧化壓力活化的絲胺酸/蘇胺酸激酶,與代謝恆定、神經元極化、細胞移動、高基氏體組織、凋亡及先天免疫相關。它定位於高基氏體,可能調節蛋白質運輸、細胞黏附和細胞移動相關極性複合體;亦屬於參與蛋白質磷酸化調節及多條訊號路徑的 STRIPAK 複合體。STK25 可抑制 PKA 路徑,並藉由磷酸化 IRF5 正向調節 TLR 訊號。 | 含實驗來源 | 證據與來源Oxidant stress-activated serine/threonine kinase that plays a role in metabolic homeostasis, neuronal polarization, cell migration, Golgi organization, apoptosis or innate immunity. Targets to the Golgi apparatus where it appears to regulate protein transport events, cell adhesion, and polarity complexes important for cell migration. Part of the striatin-interacting phosphatase and kinase (STRIPAK) complexes. STRIPAK complexes have critical roles in protein (de)phosphorylation and are regulators of multiple signaling pathways including Hippo, MAPK, nuclear receptor and cytoskeleton remodeling. Different types of STRIPAK complexes are involved in a variety of biological processes such as cell growth, differentiation, apoptosis, metabolism and immune regulation. Functions as an inhibitor of the PKA pathway by affecting phosphorylation of the PRKAR1A regulatory subunit, which in turn suppresses the kinase activity of the catalytic subunit. Positively regulates the TLR signaling by directly phosphorylating the transcription factor IRF5 PMID 15037601 ↗ · PMID 18782753 ↗ · PMID 35977512 ↗ · PMID 40639948 ↗ |
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | STK25 可形成同源二聚體,並與 CTTNBP2NL 互作;它也是 STRIPAK 複合體核心的一員,該複合體含 PP2A 催化與支架次單元、striatins、MOB4、STRIP1、STRIP2、PDCD10 及 STE20 激酶成員 STK24、STK26。STK25 另透過 N 端與 TAOK3 互作,此互作會促進 STK25 的蛋白質表現量和/或穩定性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. Interacts with CTTNBP2NL. Part of the core of STRIPAK complexes composed of PP2A catalytic and scaffolding subunits, the striatins (PP2A regulatory subunits), the striatin-associated proteins MOB4, STRIP1 and STRIP2, PDCD10 and members of the STE20 kinases, such as STK24 and STK26. Interacts with TAOK3 (via N-terminus); the interaction promotes STK25 abundance at the level of protein expression and/or stability PMID 18782753 ↗ · PMID 34634521 ↗ |
| 細胞定位 | STK25 位於細胞質及高基氏體,並定位於高基氏體;來源未提供定位改變條件或異構型差異。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCTTTCTCCGGTCGCTGCCGCCACCACCGTTGCTTCGCGG40GCTGGGAGGCCCGGGGTCCCCGGGCGAACAGAGGCTGCGG80GTGGGAGCCTTCGCGGGCGCTGCAGAGCGGGCCGGGGGAG120GCCGGGATGGAGCCCCGCGGAGTGGACTGACGCCGCAGGG160GCGAGCTAGCCGGCTCCGCGCCTCTCCGCGGGATCCAGAC200GCCTCCTGGGGCTGCTGGCGGAGGGTCTGAGGCGGCGCGG240CCATGGCTCACCTCCGGGGATTTGCCAACCAGCACTCTCG280AGTGGACCCTGAGGAGCTCTTCACCAAGCTCGACCGCATT320GGCAAGGGCTCGTTTGGGGAGGTCTACAAGGGCATCGATA360ACCACACAAAGGAGGTGGTGGCCATCAAGATCATCGACCT400GGAGGAGGCCGAGGATGAGATCGAGGACATCCAGCAGGAG440ATCACTGTCCTCAGTCAGTGCGACAGCCCCTACATCACCC480GCTACTTTGGCTCCTACCTAAAGAGCACCAAGCTATGGAT520CATCATGGAGTACCTGGGCGGCGGCTCAGCACTGGACTTG560CTTAAACCAGGTCCCCTGGAGGAGACATACATTGCCACGA600TCCTGCGGGAGATTCTGAAGGGCCTGGATTATCTGCACTC640CGAACGCAAGATCCACCGAGACATCAAAGCTGCCAACGTG680CTACTCTCGGAGCAGGGTGACGTGAAGCTGGCGGACTTTG720GGGTAGCAGGGCAGCTCACAGACACGCAGATTAAGAGGAA760CACATTCGTGGGCACCCCCTTCTGGATGGCACCTGAGGTC800ATCAAGCAGTCGGCCTACGACTTCAAGGCTGACATCTGGT840CCCTGGGGATCACAGCCATCGAGCTGGCCAAGGGGGAGCC880TCCAAACTCTGACCTCCACCCCATGCGCGTCCTGTTCCTG920ATTCCCAAGAACAGCCCACCCACACTGGAGGGCCAGCACA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。