演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

STK24MST-3

serine/threonine kinase 24

STK24 編碼一種 STE20 家族的絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶,參與壓力相關細胞反應、細胞移動調控,並是 STRIPAK 複合體的組成成員。

Homo sapiens13q32.2UniProt Q9Y6E0
OFFICIAL SYMBOL
STK24
CHROMOSOME
13
UNIPROT
Q9Y6E0
PDB / ALPHAFOLD
3A7F
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

STK24(serine/threonine kinase 24)是蛋白質編碼基因,其產物屬於蛋白激酶超家族中的 STE Ser/Thr protein kinase family,並歸入 STE20 subfamily。這類蛋白質的基本特性是可在蛋白質受質的絲胺酸或蘇胺酸殘基上催化磷酸化。STK24 的蛋白質長度為 443 個胺基酸,含有蛋白激酶結構域;其序列另有無序區,以及核定位與核輸出訊號。這些特徵提供理解其分子性質與細胞內活動的背景;其參與的細胞過程及具體作用方式如下方功能所述。

Official symbol
STK24
Gene name
serine/threonine kinase 24
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11403
UniProt
Q9Y6E0
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
MST-3MST3MST3BSTK3STE20

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1313q32.2
chr13 · 114,364,328 bp · GRCh38chr13p13 · 1–4600000 · gvarchr13p12 · 4600001–10100000 · stalkchr13p11.2 · 10100001–16500000 · gvarchr13p11.1 · 16500001–17700000 · acenchr13q11 · 17700001–18900000 · acenchr13q12.11 · 18900001–22600000 · gnegchr13q12.12 · 22600001–24900000 · gpos25chr13q12.13 · 24900001–27200000 · gnegchr13q12.2 · 27200001–28300000 · gpos25chr13q12.3 · 28300001–31600000 · gnegchr13q13.1 · 31600001–33400000 · gpos50chr13q13.2 · 33400001–34900000 · gnegchr13q13.3 · 34900001–39500000 · gpos75chr13q14.11 · 39500001–44600000 · gnegchr13q14.12 · 44600001–45200000 · gpos25chr13q14.13 · 45200001–46700000 · gnegchr13q14.2 · 46700001–50300000 · gpos50chr13q14.3 · 50300001–54700000 · gnegchr13q21.1 · 54700001–59000000 · gpos100chr13q21.2 · 59000001–61800000 · gnegchr13q21.31 · 61800001–65200000 · gpos75chr13q21.32 · 65200001–68100000 · gnegchr13q21.33 · 68100001–72800000 · gpos100chr13q22.1 · 72800001–74900000 · gnegchr13q22.2 · 74900001–76700000 · gpos50chr13q22.3 · 76700001–78500000 · gnegchr13q31.1 · 78500001–87100000 · gpos100chr13q31.2 · 87100001–89400000 · gnegchr13q31.3 · 89400001–94400000 · gpos100chr13q32.1 · 94400001–97500000 · gnegchr13q32.2 · 97500001–98700000 · gpos25chr13q32.3 · 98700001–101100000 · gnegchr13q33.1 · 101100001–104200000 · gpos100chr13q33.2 · 104200001–106400000 · gnegchr13q33.3 · 106400001–109600000 · gpos100chr13q34 · 109600001–114364328 · gnegSTK24pq1 bp114,364,328 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr13:98,445,185–98,577,940
Gene span
132,756 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000539966 ★98,445,185–98,577,10711
ENST0000037654798,445,185–98,521,99811
ENST0000039751798,445,185–98,577,47710
ENST0000087179998,445,185–98,577,47710
ENST0000093732398,445,185–98,577,47711
ENST0000093732498,445,185–98,577,4778
ENST0000093732598,445,185–98,577,4779
ENST0000108357898,445,185–98,577,47710
ENST0000113201798,445,185–98,577,47711
ENST0000037655498,450,201–98,466,5615
ENST0000104195598,452,160–98,577,47712
ENST0000041803898,455,421–98,463,7854

顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

STK24 可將磷酸基轉移至蛋白質的絲胺酸或蘇胺酸殘基,並參與壓力刺激及 caspase 活化相關的細胞凋亡反應。在氧化壓力下,它會調節 JNK1-JNK2(MAPK8、MAPK9)及 p38(MAPK11、MAPK12、MAPK13、MAPK14)的磷酸化,介入氧化壓力誘發的細胞死亡。另在 staurosporine 誘發、非依賴 caspase 的凋亡路徑中,STK24 參與調控 AIFM1 與 ENDOG 移入細胞核,以及 ENDOG 相關的 DNase 活性。

STK24 也能磷酸化 STK38L 的 Thr-442,並刺激 STK38L 的激酶活性。在極化細胞移動期間,RHO 活化時,STK24 與 STK26 協同負向調控 Golgi 的重新定向。此外,STK24 可磷酸化 PTPN12 並抑制其活性;它也可能透過 PTPN12 調節 PXN 磷酸化,因而與細胞移動調控相關。

STK24 是 STRIPAK(striatin-interacting phosphatase and kinase)複合體的成員。STRIPAK 複合體參與蛋白質去磷酸化與磷酸化,並調節包括 Hippo、MAPK、核受體及細胞骨架重塑在內的多種訊號路徑。不同類型的 STRIPAK 複合體涉及細胞生長、分化、凋亡、代謝及免疫調節等過程。STK24 另被指出可能是視神經與橈神經軸突再生的關鍵調節因子;此處保留來源所述的可能性。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 98577107 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>STK24 ENST00000539966 GRCh38 chr13:98577007-98578107 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGTGCCAGCGTCCCTACAATCTAAGGAGCAGGGAGTCATCACTGGGGTGGCTGCCGCTCTACCTGTTTGC
GACTGTAATAAAACACCTTCTGGAGGCCGAGGGACCCGCTTCATCCTGACTTTTCCCCTCAGTAGCTAGA
GAGAAGGCGGCTGAAAAGAGGAGACAGAACTGGTGCTGAGTGGGCCTGGAGCTTCCGAGGCAAGGGAAAG
AGGGAGAGGGCTGCAGTTCAAAGTCCAGACGCGCTTTCCTTCCATTCTCTTCCCTTCCTCCCTGCCCTCT
GCGCCCCATTTTCCCCTTATCGTGGGTGGGGGCTTCTGATTTGCTGCGGATCCCAGAGATGGTGGGGTTC
AGCCTCCGCACTGCTTAGCTAAGTTCCCAGCCCAGCAGTCCCAGCCGGGCTGTTTTCGGTAACCAAAGCA
CTAGGAATTAACCTCTCTCTCGGCCTCTTCCCTTTCGGTTTCCTTCTTGGGTTGGCTGGAAACTTCACCC
AGACACCGAAGCAGCTCTGCCCGGCCTTTTGGCACAGGCCACCGGCCGAGGCCCCACGGGGCGCTCTCCT
TCCCCAGGTGCCCCCGACTCCGATCCTGCCCTCAGGGGCTCGCCCGGGACGCGTTTTCCCAGAGGCCGCC
GGGGCGGGGTGGGCTGGCTGGCGGGAAGAGGGGGCCGCGGCCCAGGCTCGCCCCGGCGCCGGCCCGGTGG
GCACGCGGCCAGCCTCCGGCCCCGACTCGGTCCCTCCCGGCGCCCGCCCCAGCCGAGGCCCCCTCCCGGC
CCCGCCGCCCGCCCGCGGGGGCGTGGGAGCGCCGCAGGAGCAGCTGGGACCCGGGCCGGGCCGACAGGCG
GCGGCTGCGGCCTAGGGCTCCCGCGCGGCCACCGGCCTCTCCCCTCCCCCTCCCGGAAGCGCGGGGCGGG
GTCCCCGGCCGGGCCGTGGGGGCGGGCGCGGGGGCCGGGCCGGGGCGGGACGCGCTCGGCGCTCGCGGGC
TCGGCGGGCTGTGCGCGCCCACTCCGGCTCCAGCGGCCAGCGCGCGCGGGCCCAGGCCGCCCGGCTCCAG
CCCAGCAGTAGCGGCAGCAGCGGCGGCGGCGGCAGTGCGCGCGAGGCCCTG
STK24 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
STK24_3 ↗13:98,519,264負股98,519,254–98,519,313
STK24_2 ↗13:98,522,092負股98,522,082–98,522,141
STK24_1 ↗13:98,576,771負股98,576,761–98,576,820

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR13_D6W38 · enhancer · 98570487–98572833 · regulatory

ENSR13_BPK7C · enhancer · 98574256–98574772 · regulatory

ENSR13_D6W3D · enhancer · 98574921–98577096 · regulatory

ENSR13_5T72PD · CTCF_binding_site · 98576638–98576659 · regulatory

ENSR13_93G5FJ · promoter · 98577097–98577536 · regulatory

ENSR13_5T72S8 · CTCF_binding_site · 98577261–98577282 · regulatory

ENSR13_BPK7T · enhancer · 98577537–98578397 · regulatory

ENSR13_5T72XP · CTCF_binding_site · 98578008–98578029 · regulatory

ENSR13_BPK8G · enhancer · 98581913–98582477 · regulatory

· motif · 98572550–98572563 · motif

· motif · 98572550–98572563 · motif

· motif · 98573804–98573816 · motif

· motif · 98574156–98574171 · motif

· motif · 98574875–98574887 · motif

· motif · 98576186–98576203 · motif

· motif · 98576500–98576509 · motif

· motif · 98576516–98576533 · motif

· motif · 98576640–98576656 · motif

· motif · 98576802–98576811 · motif

· motif · 98576802–98576813 · motif

· motif · 98576923–98576939 · motif

· motif · 98577025–98577038 · motif

· motif · 98577028–98577041 · motif

· motif · 98577089–98577106 · motif

· motif · 98577101–98577114 · motif

· motif · 98577118–98577135 · motif

· motif · 98577160–98577173 · motif

· motif · 98577172–98577185 · motif

· motif · 98577207–98577216 · motif

· motif · 98577207–98577218 · motif

· motif · 98577255–98577272 · motif

· motif · 98577263–98577279 · motif

· motif · 98577307–98577320 · motif

· motif · 98577313–98577326 · motif

· motif · 98577330–98577343 · motif

· motif · 98577869–98577884 · motif

· motif · 98577869–98577884 · motif

· motif · 98577870–98577884 · motif

· motif · 98577871–98577884 · motif

· motif · 98577978–98577991 · motif

· motif · 98578010–98578026 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:443 aa

1 aa443 aa結構域功能區域基序
依 Q9Y6E0 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

STK24 蛋白質長 443 個胺基酸,屬於蛋白激酶超家族的 STE Ser/Thr protein kinase family,並歸入 STE20 subfamily。蛋白激酶結構域位於第 36–286 位;第 309–337 位註解為無序區。序列另含第 278–292 位的雙分段核定位訊號,以及第 335–386 位的核輸出訊號。

結構域Protein kinase36–286 aa
功能區域Disordered309–337 aa
基序Bipartite nuclear localization signal278–292 aa
基序Nuclear export signal (NES)335–386 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 3A7F…

PDB · 3A7F

X-ray · 1.55 A · A=10-315

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Nucleus;Membrane

STK24 註解於細胞質、細胞核及膜。 截短形式 MST3/N 會移入細胞核;STK24 也與 STK38L 在膜上共定位。 這些描述指出截短形式與全長蛋白質的定位動態有所不同。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 6 個夥伴 · 最多顯示 50 個
MST-3STK24CTTNBP2NLPDCD10STRIP1STRNTRAF3IP3CAB39
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

STK24 可呈單體形式,並與 CTTNBP2NL 及 PDCD10 互作。它透過 C 端與 RIPOR1 互作;此關係依賴 PDCD10,但不依賴 Rho,而 STK24 與 RIPOR1 的結合亦需要 PDCD10。STK24 也是 STRIPAK 核心複合體成員;該複合體包含 PP2A 催化與支架次單元、striatins、MOB4、STRIP1、STRIP2、PDCD10,以及包括 STK24 和 STK26 在內的 STE20 激酶。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能STK24 可磷酸化絲胺酸與蘇胺酸,並參與壓力及 caspase 活化相關的凋亡;氧化壓力下會調節 JNK 與 p38 磷酸化。它也參與 staurosporine 誘發的非依賴 caspase 凋亡,調控 AIFM1、ENDOG 核移位及 ENDOG 相關 DNase 活性;可活化 STK38L,與 STK26 共同調控 Golgi 定向,並透過 PTPN12 影響細胞移動。它是 STRIPAK 成員,且可能調節軸突再生。含實驗來源
證據與來源

Serine/threonine-protein kinase that acts on both serine and threonine residues and promotes apoptosis in response to stress stimuli and caspase activation. Mediates oxidative-stress-induced cell death by modulating phosphorylation of JNK1-JNK2 (MAPK8 and MAPK9), p38 (MAPK11, MAPK12, MAPK13 and MAPK14) during oxidative stress. Plays a role in a staurosporine-induced caspase-independent apoptotic pathway by regulating the nuclear translocation of AIFM1 and ENDOG and the DNase activity associated with ENDOG. Phosphorylates STK38L on 'Thr-442' and stimulates its kinase activity. In association with STK26 negatively regulates Golgi reorientation in polarized cell migration upon RHO activation. Also regulates cellular migration with alteration of PTPN12 activity and PXN phosphorylation: phosphorylates PTPN12 and inhibits its activity and may regulate PXN phosphorylation through PTPN12. May act as a key regulator of axon regeneration in the optic nerve and radial nerve. Part of the striatin-interacting phosphatase and kinase (STRIPAK) complexes. STRIPAK complexes have critical roles in protein (de)phosphorylation and are regulators of multiple signaling pathways including Hippo, MAPK, nuclear receptor and cytoskeleton remodeling. Different types of STRIPAK complexes are involved in a variety of biological processes such as cell growth, differentiation, apoptosis, metabolism and immune regulation

PMID 16314523 ↗ · PMID 17046825 ↗ · PMID 18782753 ↗ · PMID 19604147 ↗ · PMID 19782762 ↗ · PMID 19855390 ↗ · PMID 27807006 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+)資料庫紀錄
證據與來源

L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+)資料庫紀錄
證據與來源

L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+)

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交互作用STK24 可呈單體,並與 CTTNBP2NL、PDCD10 互作;它透過 C 端與 RIPOR1 結合,此互作依賴 PDCD10 而不依賴 Rho,且 PDCD10 是 STK24 與 RIPOR1 結合所必需。STK24 也屬於 STRIPAK 核心複合體,該複合體含 PP2A 次單元、striatins、MOB4、STRIP1、STRIP2、PDCD10 及 STK24、STK26 等 STE20 激酶。含實驗來源
證據與來源

Monomer. Interacts with CTTNBP2NL. Interacts with RIPOR1 (via C-terminus); this interaction occurs in a PDCD10-dependent and Rho-independent manner. Interacts with PDCD10; this interaction is required for the association of STK24 with RIPOR1. Part of the core of STRIPAK complexes composed of PP2A catalytic and scaffolding subunits, the striatins (PP2A regulatory subunits), the striatin-associated proteins MOB4, STRIP1 and STRIP2, PDCD10 and members of the STE20 kinases, such as STK24 and STK26

PMID 18782753 ↗ · PMID 20124694 ↗ · PMID 27807006 ↗

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細胞定位STK24 位於細胞質、細胞核及膜。截短形式 MST3/N 會移入細胞核;此外,STK24 與 STK38L 在膜上共定位。來源描述了截短形式的核移位及與 STK38L 的膜上共定位。資料庫紀錄
證據與來源

Cytoplasm; Nucleus; Membrane; The truncated form (MST3/N) translocates to the nucleus. Colocalizes with STK38L in the membrane

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情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000539966 · 9,605 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACTCCGGCTCCAGCGGCCAGCGCGCGCGGGCCCAGGCCGC40
41CCGGCTCCAGCCCAGCAGTAGCGGCAGCAGCGGCGGCGGC80
81GGCAGTGCGCGCGAGGCCCTGCGCCCCCAGCAGCTCCTCC120
121CTGGCGCCGTGCATGGAGACGCGGCCCGCCACCCGCCGCT160
161GAGCCCCCGCCGCCCGGCCGGGACCCGCCAGGGCTGGGGT200
201GGCCTCGGGCTCCGGCCGGCCCCGCCGCCCGAGGGCTGCG240
241CGCGGCCCGCGGGCCTCGCCGCCCCGCGCGGATCGTCGCG280
281GCCCGGCCGTCCCGTCCCAGGAAGTGGCCGTCCTGAGCGC320
321CATGGCTCACTCCCCGGTGCAGTCGGGCCTGCCCGGCATG360
361CAGAACCTAAAGGCAGACCCAGAAGAGCTTTTTACAAAAC400
401TAGAGAAAATTGGGAAGGGCTCCTTTGGAGAGGTGTTCAA440
441AGGCATTGACAATCGGACTCAGAAAGTGGTTGCCATAAAG480
481ATCATTGATCTGGAAGAAGCTGAAGATGAGATAGAGGACA520
521TTCAACAAGAAATCACAGTGCTGAGTCAGTGTGACAGTCC560
561ATATGTAACCAAATATTATGGATCCTATCTGAAGGATACA600
601AAATTATGGATAATAATGGAATATCTTGGTGGAGGCTCCG640
641CACTAGATCTATTAGAACCTGGCCCATTAGATGAAACCCA680
681GATCGCTACTATATTAAGAGAAATACTGAAAGGACTCGAT720
721TATCTCCATTCGGAGAAGAAAATCCACAGAGACATTAAAG760
761CGGCCAACGTCCTGCTGTCTGAGCATGGCGAGGTGAAGCT800
801GGCGGACTTTGGCGTGGCTGGCCAGCTGACAGACACCCAG840
841ATCAAAAGGAACACCTTCGTGGGCACCCCATTCTGGATGG880
881CACCCGAGGTCATCAAACAGTCGGCCTATGACTCGAAGGC920
921AGACATCTGGTCCCTGGGCATAACAGCTATTGAACTTGCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。