基因總覽
STK24(serine/threonine kinase 24)是蛋白質編碼基因,其產物屬於蛋白激酶超家族中的 STE Ser/Thr protein kinase family,並歸入 STE20 subfamily。這類蛋白質的基本特性是可在蛋白質受質的絲胺酸或蘇胺酸殘基上催化磷酸化。STK24 的蛋白質長度為 443 個胺基酸,含有蛋白激酶結構域;其序列另有無序區,以及核定位與核輸出訊號。這些特徵提供理解其分子性質與細胞內活動的背景;其參與的細胞過程及具體作用方式如下方功能所述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000539966 ★ | 98,445,185–98,577,107 | 11 |
| ENST00000376547 | 98,445,185–98,521,998 | 11 |
| ENST00000397517 | 98,445,185–98,577,477 | 10 |
| ENST00000871799 | 98,445,185–98,577,477 | 10 |
| ENST00000937323 | 98,445,185–98,577,477 | 11 |
| ENST00000937324 | 98,445,185–98,577,477 | 8 |
| ENST00000937325 | 98,445,185–98,577,477 | 9 |
| ENST00001083578 | 98,445,185–98,577,477 | 10 |
| ENST00001132017 | 98,445,185–98,577,477 | 11 |
| ENST00000376554 | 98,450,201–98,466,561 | 5 |
| ENST00001041955 | 98,452,160–98,577,477 | 12 |
| ENST00000418038 | 98,455,421–98,463,785 | 4 |
顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
STK24 可將磷酸基轉移至蛋白質的絲胺酸或蘇胺酸殘基,並參與壓力刺激及 caspase 活化相關的細胞凋亡反應。在氧化壓力下,它會調節 JNK1-JNK2(MAPK8、MAPK9)及 p38(MAPK11、MAPK12、MAPK13、MAPK14)的磷酸化,介入氧化壓力誘發的細胞死亡。另在 staurosporine 誘發、非依賴 caspase 的凋亡路徑中,STK24 參與調控 AIFM1 與 ENDOG 移入細胞核,以及 ENDOG 相關的 DNase 活性。
STK24 也能磷酸化 STK38L 的 Thr-442,並刺激 STK38L 的激酶活性。在極化細胞移動期間,RHO 活化時,STK24 與 STK26 協同負向調控 Golgi 的重新定向。此外,STK24 可磷酸化 PTPN12 並抑制其活性;它也可能透過 PTPN12 調節 PXN 磷酸化,因而與細胞移動調控相關。
STK24 是 STRIPAK(striatin-interacting phosphatase and kinase)複合體的成員。STRIPAK 複合體參與蛋白質去磷酸化與磷酸化,並調節包括 Hippo、MAPK、核受體及細胞骨架重塑在內的多種訊號路徑。不同類型的 STRIPAK 複合體涉及細胞生長、分化、凋亡、代謝及免疫調節等過程。STK24 另被指出可能是視神經與橈神經軸突再生的關鍵調節因子;此處保留來源所述的可能性。
Promoter 與基因調控
>STK24 ENST00000539966 GRCh38 chr13:98577007-98578107 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGTGCCAGCGTCCCTACAATCTAAGGAGCAGGGAGTCATCACTGGGGTGGCTGCCGCTCTACCTGTTTGC GACTGTAATAAAACACCTTCTGGAGGCCGAGGGACCCGCTTCATCCTGACTTTTCCCCTCAGTAGCTAGA GAGAAGGCGGCTGAAAAGAGGAGACAGAACTGGTGCTGAGTGGGCCTGGAGCTTCCGAGGCAAGGGAAAG AGGGAGAGGGCTGCAGTTCAAAGTCCAGACGCGCTTTCCTTCCATTCTCTTCCCTTCCTCCCTGCCCTCT GCGCCCCATTTTCCCCTTATCGTGGGTGGGGGCTTCTGATTTGCTGCGGATCCCAGAGATGGTGGGGTTC AGCCTCCGCACTGCTTAGCTAAGTTCCCAGCCCAGCAGTCCCAGCCGGGCTGTTTTCGGTAACCAAAGCA CTAGGAATTAACCTCTCTCTCGGCCTCTTCCCTTTCGGTTTCCTTCTTGGGTTGGCTGGAAACTTCACCC AGACACCGAAGCAGCTCTGCCCGGCCTTTTGGCACAGGCCACCGGCCGAGGCCCCACGGGGCGCTCTCCT TCCCCAGGTGCCCCCGACTCCGATCCTGCCCTCAGGGGCTCGCCCGGGACGCGTTTTCCCAGAGGCCGCC GGGGCGGGGTGGGCTGGCTGGCGGGAAGAGGGGGCCGCGGCCCAGGCTCGCCCCGGCGCCGGCCCGGTGG GCACGCGGCCAGCCTCCGGCCCCGACTCGGTCCCTCCCGGCGCCCGCCCCAGCCGAGGCCCCCTCCCGGC CCCGCCGCCCGCCCGCGGGGGCGTGGGAGCGCCGCAGGAGCAGCTGGGACCCGGGCCGGGCCGACAGGCG GCGGCTGCGGCCTAGGGCTCCCGCGCGGCCACCGGCCTCTCCCCTCCCCCTCCCGGAAGCGCGGGGCGGG GTCCCCGGCCGGGCCGTGGGGGCGGGCGCGGGGGCCGGGCCGGGGCGGGACGCGCTCGGCGCTCGCGGGC TCGGCGGGCTGTGCGCGCCCACTCCGGCTCCAGCGGCCAGCGCGCGCGGGCCCAGGCCGCCCGGCTCCAG CCCAGCAGTAGCGGCAGCAGCGGCGGCGGCGGCAGTGCGCGCGAGGCCCTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| STK24_3 ↗ | 13:98,519,264 | 負股 | 98,519,254–98,519,313 |
| STK24_2 ↗ | 13:98,522,092 | 負股 | 98,522,082–98,522,141 |
| STK24_1 ↗ | 13:98,576,771 | 負股 | 98,576,761–98,576,820 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR13_D6W38 · enhancer · 98570487–98572833 · regulatory
ENSR13_BPK7C · enhancer · 98574256–98574772 · regulatory
ENSR13_D6W3D · enhancer · 98574921–98577096 · regulatory
ENSR13_5T72PD · CTCF_binding_site · 98576638–98576659 · regulatory
ENSR13_93G5FJ · promoter · 98577097–98577536 · regulatory
ENSR13_5T72S8 · CTCF_binding_site · 98577261–98577282 · regulatory
ENSR13_BPK7T · enhancer · 98577537–98578397 · regulatory
ENSR13_5T72XP · CTCF_binding_site · 98578008–98578029 · regulatory
ENSR13_BPK8G · enhancer · 98581913–98582477 · regulatory
· motif · 98572550–98572563 · motif
· motif · 98572550–98572563 · motif
· motif · 98573804–98573816 · motif
· motif · 98574156–98574171 · motif
· motif · 98574875–98574887 · motif
· motif · 98576186–98576203 · motif
· motif · 98576500–98576509 · motif
· motif · 98576516–98576533 · motif
· motif · 98576640–98576656 · motif
· motif · 98576802–98576811 · motif
· motif · 98576802–98576813 · motif
· motif · 98576923–98576939 · motif
· motif · 98577025–98577038 · motif
· motif · 98577028–98577041 · motif
· motif · 98577089–98577106 · motif
· motif · 98577101–98577114 · motif
· motif · 98577118–98577135 · motif
· motif · 98577160–98577173 · motif
· motif · 98577172–98577185 · motif
· motif · 98577207–98577216 · motif
· motif · 98577207–98577218 · motif
· motif · 98577255–98577272 · motif
· motif · 98577263–98577279 · motif
· motif · 98577307–98577320 · motif
· motif · 98577313–98577326 · motif
· motif · 98577330–98577343 · motif
· motif · 98577869–98577884 · motif
· motif · 98577869–98577884 · motif
· motif · 98577870–98577884 · motif
· motif · 98577871–98577884 · motif
· motif · 98577978–98577991 · motif
· motif · 98578010–98578026 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:443 aa
STK24 蛋白質長 443 個胺基酸,屬於蛋白激酶超家族的 STE Ser/Thr protein kinase family,並歸入 STE20 subfamily。蛋白激酶結構域位於第 36–286 位;第 309–337 位註解為無序區。序列另含第 278–292 位的雙分段核定位訊號,以及第 335–386 位的核輸出訊號。
蛋白質三維結構
細胞內定位
STK24 註解於細胞質、細胞核及膜。 截短形式 MST3/N 會移入細胞核;STK24 也與 STK38L 在膜上共定位。 這些描述指出截短形式與全長蛋白質的定位動態有所不同。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- CTTNBP2NLQ9P2B4 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- PDCD10Q9BUL8 · UniProt INTERACTION · 14 experiments · 2 筆來源紀錄
- STRIP1Q5VSL9 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- STRNO43815 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- TRAF3IP3Q9Y228 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CAB39Q9Y376 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
STK24 可呈單體形式,並與 CTTNBP2NL 及 PDCD10 互作。它透過 C 端與 RIPOR1 互作;此關係依賴 PDCD10,但不依賴 Rho,而 STK24 與 RIPOR1 的結合亦需要 PDCD10。STK24 也是 STRIPAK 核心複合體成員;該複合體包含 PP2A 催化與支架次單元、striatins、MOB4、STRIP1、STRIP2、PDCD10,以及包括 STK24 和 STK26 在內的 STE20 激酶。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | STK24 可磷酸化絲胺酸與蘇胺酸,並參與壓力及 caspase 活化相關的凋亡;氧化壓力下會調節 JNK 與 p38 磷酸化。它也參與 staurosporine 誘發的非依賴 caspase 凋亡,調控 AIFM1、ENDOG 核移位及 ENDOG 相關 DNase 活性;可活化 STK38L,與 STK26 共同調控 Golgi 定向,並透過 PTPN12 影響細胞移動。它是 STRIPAK 成員,且可能調節軸突再生。 | 含實驗來源 | 證據與來源Serine/threonine-protein kinase that acts on both serine and threonine residues and promotes apoptosis in response to stress stimuli and caspase activation. Mediates oxidative-stress-induced cell death by modulating phosphorylation of JNK1-JNK2 (MAPK8 and MAPK9), p38 (MAPK11, MAPK12, MAPK13 and MAPK14) during oxidative stress. Plays a role in a staurosporine-induced caspase-independent apoptotic pathway by regulating the nuclear translocation of AIFM1 and ENDOG and the DNase activity associated with ENDOG. Phosphorylates STK38L on 'Thr-442' and stimulates its kinase activity. In association with STK26 negatively regulates Golgi reorientation in polarized cell migration upon RHO activation. Also regulates cellular migration with alteration of PTPN12 activity and PXN phosphorylation: phosphorylates PTPN12 and inhibits its activity and may regulate PXN phosphorylation through PTPN12. May act as a key regulator of axon regeneration in the optic nerve and radial nerve. Part of the striatin-interacting phosphatase and kinase (STRIPAK) complexes. STRIPAK complexes have critical roles in protein (de)phosphorylation and are regulators of multiple signaling pathways including Hippo, MAPK, nuclear receptor and cytoskeleton remodeling. Different types of STRIPAK complexes are involved in a variety of biological processes such as cell growth, differentiation, apoptosis, metabolism and immune regulation PMID 16314523 ↗ · PMID 17046825 ↗ · PMID 18782753 ↗ · PMID 19604147 ↗ · PMID 19782762 ↗ · PMID 19855390 ↗ · PMID 27807006 ↗ |
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | STK24 可呈單體,並與 CTTNBP2NL、PDCD10 互作;它透過 C 端與 RIPOR1 結合,此互作依賴 PDCD10 而不依賴 Rho,且 PDCD10 是 STK24 與 RIPOR1 結合所必需。STK24 也屬於 STRIPAK 核心複合體,該複合體含 PP2A 次單元、striatins、MOB4、STRIP1、STRIP2、PDCD10 及 STK24、STK26 等 STE20 激酶。 | 含實驗來源 | 證據與來源Monomer. Interacts with CTTNBP2NL. Interacts with RIPOR1 (via C-terminus); this interaction occurs in a PDCD10-dependent and Rho-independent manner. Interacts with PDCD10; this interaction is required for the association of STK24 with RIPOR1. Part of the core of STRIPAK complexes composed of PP2A catalytic and scaffolding subunits, the striatins (PP2A regulatory subunits), the striatin-associated proteins MOB4, STRIP1 and STRIP2, PDCD10 and members of the STE20 kinases, such as STK24 and STK26 PMID 18782753 ↗ · PMID 20124694 ↗ · PMID 27807006 ↗ |
| 細胞定位 | STK24 位於細胞質、細胞核及膜。截短形式 MST3/N 會移入細胞核;此外,STK24 與 STK38L 在膜上共定位。來源描述了截短形式的核移位及與 STK38L 的膜上共定位。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Cytoplasm; Nucleus; Membrane; The truncated form (MST3/N) translocates to the nucleus. Colocalizes with STK38L in the membrane |
核酸與蛋白質序列
ACTCCGGCTCCAGCGGCCAGCGCGCGCGGGCCCAGGCCGC40CCGGCTCCAGCCCAGCAGTAGCGGCAGCAGCGGCGGCGGC80GGCAGTGCGCGCGAGGCCCTGCGCCCCCAGCAGCTCCTCC120CTGGCGCCGTGCATGGAGACGCGGCCCGCCACCCGCCGCT160GAGCCCCCGCCGCCCGGCCGGGACCCGCCAGGGCTGGGGT200GGCCTCGGGCTCCGGCCGGCCCCGCCGCCCGAGGGCTGCG240CGCGGCCCGCGGGCCTCGCCGCCCCGCGCGGATCGTCGCG280GCCCGGCCGTCCCGTCCCAGGAAGTGGCCGTCCTGAGCGC320CATGGCTCACTCCCCGGTGCAGTCGGGCCTGCCCGGCATG360CAGAACCTAAAGGCAGACCCAGAAGAGCTTTTTACAAAAC400TAGAGAAAATTGGGAAGGGCTCCTTTGGAGAGGTGTTCAA440AGGCATTGACAATCGGACTCAGAAAGTGGTTGCCATAAAG480ATCATTGATCTGGAAGAAGCTGAAGATGAGATAGAGGACA520TTCAACAAGAAATCACAGTGCTGAGTCAGTGTGACAGTCC560ATATGTAACCAAATATTATGGATCCTATCTGAAGGATACA600AAATTATGGATAATAATGGAATATCTTGGTGGAGGCTCCG640CACTAGATCTATTAGAACCTGGCCCATTAGATGAAACCCA680GATCGCTACTATATTAAGAGAAATACTGAAAGGACTCGAT720TATCTCCATTCGGAGAAGAAAATCCACAGAGACATTAAAG760CGGCCAACGTCCTGCTGTCTGAGCATGGCGAGGTGAAGCT800GGCGGACTTTGGCGTGGCTGGCCAGCTGACAGACACCCAG840ATCAAAAGGAACACCTTCGTGGGCACCCCATTCTGGATGG880CACCCGAGGTCATCAAACAGTCGGCCTATGACTCGAAGGC920AGACATCTGGTCCCTGGGCATAACAGCTATTGAACTTGCA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。