演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

STK17BDRAK2

serine/threonine kinase 17b

STK17B(serine/threonine kinase 17b)是蛋白質激酶超家族成員,屬於 CAMK Ser/Thr protein kinase family 的 DAP kinase subfamily,並與細胞凋亡正向調控有關。

Homo sapiens2q32.3UniProt O94768
OFFICIAL SYMBOL
STK17B
CHROMOSOME
2
UNIPROT
O94768
PDB / ALPHAFOLD
6QF4
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

STK17B(serine/threonine kinase 17b)是蛋白質編碼基因,其產物屬於蛋白質激酶超家族,並歸入 CAMK Ser/Thr protein kinase family 的 DAP kinase subfamily。這項家族分類指出其為絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶類成員;來源所列蛋白質全長為 372 個胺基酸,並具有蛋白質激酶結構域。其已知角色包括正向調控細胞凋亡;另有與 myosin light chains 磷酸化相關的註記,但該功能標示為依相似性推定。

Official symbol
STK17B
Gene name
serine/threonine kinase 17b
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11396
UniProt
O94768
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
DRAK2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 22q32.3
chr2 · 242,193,529 bp · GRCh38chr2p25.3 · 1–4400000 · gnegchr2p25.2 · 4400001–6900000 · gpos50chr2p25.1 · 6900001–12000000 · gnegchr2p24.3 · 12000001–16500000 · gpos75chr2p24.2 · 16500001–19000000 · gnegchr2p24.1 · 19000001–23800000 · gpos75chr2p23.3 · 23800001–27700000 · gnegchr2p23.2 · 27700001–29800000 · gpos25chr2p23.1 · 29800001–31800000 · gnegchr2p22.3 · 31800001–36300000 · gpos75chr2p22.2 · 36300001–38300000 · gnegchr2p22.1 · 38300001–41500000 · gpos50chr2p21 · 41500001–47500000 · gnegchr2p16.3 · 47500001–52600000 · gpos100chr2p16.2 · 52600001–54700000 · gnegchr2p16.1 · 54700001–61000000 · gpos100chr2p15 · 61000001–63900000 · gnegchr2p14 · 63900001–68400000 · gpos50chr2p13.3 · 68400001–71300000 · gnegchr2p13.2 · 71300001–73300000 · gpos50chr2p13.1 · 73300001–74800000 · gnegchr2p12 · 74800001–83100000 · gpos100chr2p11.2 · 83100001–91800000 · gnegchr2p11.1 · 91800001–93900000 · acenchr2q11.1 · 93900001–96000000 · acenchr2q11.2 · 96000001–102100000 · gnegchr2q12.1 · 102100001–105300000 · gpos50chr2q12.2 · 105300001–106700000 · gnegchr2q12.3 · 106700001–108700000 · gpos25chr2q13 · 108700001–112200000 · gnegchr2q14.1 · 112200001–118100000 · gpos50chr2q14.2 · 118100001–121600000 · gnegchr2q14.3 · 121600001–129100000 · gpos50chr2q21.1 · 129100001–131700000 · gnegchr2q21.2 · 131700001–134300000 · gpos25chr2q21.3 · 134300001–136100000 · gnegchr2q22.1 · 136100001–141500000 · gpos100chr2q22.2 · 141500001–143400000 · gnegchr2q22.3 · 143400001–147900000 · gpos100chr2q23.1 · 147900001–149000000 · gnegchr2q23.2 · 149000001–149600000 · gpos25chr2q23.3 · 149600001–154000000 · gnegchr2q24.1 · 154000001–158900000 · gpos75chr2q24.2 · 158900001–162900000 · gnegchr2q24.3 · 162900001–168900000 · gpos75chr2q31.1 · 168900001–177100000 · gnegchr2q31.2 · 177100001–179700000 · gpos50chr2q31.3 · 179700001–182100000 · gnegchr2q32.1 · 182100001–188500000 · gpos75chr2q32.2 · 188500001–191100000 · gnegchr2q32.3 · 191100001–196600000 · gpos75chr2q33.1 · 196600001–202500000 · gnegchr2q33.2 · 202500001–204100000 · gpos50chr2q33.3 · 204100001–208200000 · gnegchr2q34 · 208200001–214500000 · gpos100chr2q35 · 214500001–220700000 · gnegchr2q36.1 · 220700001–224300000 · gpos75chr2q36.2 · 224300001–225200000 · gnegchr2q36.3 · 225200001–230100000 · gpos100chr2q37.1 · 230100001–234700000 · gnegchr2q37.2 · 234700001–236400000 · gpos50chr2q37.3 · 236400001–242193529 · gnegSTK17Bpq1 bp242,193,529 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr2:196,133,559–196,176,503
Gene span
42,945 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000263955 ★196,133,583–196,171,5788
ENST00000449152196,133,583–196,171,00010
ENST00000420683196,133,583–196,176,3349
ENST00000714417196,133,583–196,171,3198
ENST00000879796196,133,583–196,171,6479
ENST00000879797196,133,583–196,170,3089
ENST00000879798196,133,583–196,166,1168
ENST00000879799196,133,583–196,163,9427
ENST00000915456196,133,583–196,171,3418
ENST00001137701196,133,583–196,171,6478
ENST00000409228196,137,447–196,176,5038
ENST00000606789196,155,267–196,171,6473

顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

STK17B 的功能資料指出,它是細胞凋亡的正向調節因子,亦即與促進凋亡的調控方向相關。來源未進一步說明此作用發生於哪些細胞、由何種刺激引發,或經由哪些下游步驟完成,因此不能據此延伸出特定的凋亡路徑或生理情境。

此外,STK17B 被註記為可磷酸化 myosin light chains,但此項資訊標示為「依相似性」推定,應視為推論性功能,而非在此來源中直接確立的作用。磷酸化反應涉及將磷酸基團加到蛋白質上;資料列出的酵素反應式則分別描述以 ATP 為磷酸基供體,將絲胺酸或蘇胺酸殘基磷酸化,並產生 ADP 與 H⁺。這些反應式說明該類激酶反應的化學形式,並未指定 myosin light chains 上的磷酸化位點或反應條件。

因此,現有資料支持的功能重點是 STK17B 與凋亡正向調控的關聯,以及依相似性提出的 myosin light chains 磷酸化功能;但不足以確定兩者是否存在直接的因果連結,也未提供其對細胞或組織層級結果的描述。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 196171578 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>STK17B ENST00000263955 GRCh38 chr2:196171478-196172578 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TACTGGGATAGAACAAGAAAACCTGTCCTTTATATGCTAACTGAACATTAAGTCTTTTGAAAGCAAGAGG
ACGACTCCACTCCCAGTATCCTTTCCCACGGAAGGGTTTTCTGCAATTATCGTAAATGTCCTCTGAAAGC
AATCCTAGATTACATAACTAATCCCATATATGTATGAGTATGTGTGTATCCTATACATATAAACTAGGAT
TATATATCTATGTAAAACATTTGTGTCTTGCACAGAACTTTGAAAATTTCCACTGTCTTCAAAGGATAAC
AGATCTTGAGTAGGTTGCTGAGGGCTTTCATCTTTTTCCTTAGCACTATAAATGCAAAATCGGCTATTCA
GCCTATTGGGACCCTCCCTACACTGCCTTCAGTCAGTGCCTCAGAAGGGACACCATTCGCGACAGCGGAC
GTTAGCAGTGGGGTCTAGGTTCCATAAATCCCCAACTGATGTTGACACTCCGAGGAACCTCTGCCAAGTT
GTAGCAAACTGGGTTCTCCACTTACAGGGTACGTTCCGGTCCTAAGGAAGACTCTCAAGAAGAGTCAGAA
AATAGGTCTTTGGTAGGCACTGAAGTTTGGTAACTAGTCGCAGGCAGCTGGGACGAATTTTGCGGCTTCC
TTCTCCCCGGTCTCCGGATATTCACACCTCTCGAACTGACCTCTCTGAAGGTGGGAAGGAGTACACAGAG
CAGTAGTTCCAGCCCCGCGCGCCCCCTCTGCAGCGCCGCCCCCTCCGCCCCTCCCTCGCGGCAGCCCGAG
TGCGCCCCACCTGCGCCGCCACGCCGCCGCGCCTCCCCGCCCCGCCTCGGGCCAGCCAGGCGCCGCACCC
TCTCACCGCCGGGCCCCGCCCCGCACACGCGCCCCCGGCCGGTGCCCCGCCCCTCCCGTCACGTGACAGA
CCCACCCTCCGCACCCGTTCCGATTGGCTCTCCCGACCTAGGGGGAGGGATCTGGCGAACGGCGATGCCC
CAGACGCGGCTGCAGTTTTCAAACCGCGACTGCAAGCTTCGGTAGTCCTCTCCGCTGCTGTCGCCAGGAG
TCACTTCACGAGAAGCCAGGTCACAACCGTCGGCCCTTGTCTGGAAAAGTA
STK17B 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
STK17B_1 ↗2:196,171,578負股196,171,568–196,171,627

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR2_CPGKD · enhancer · 196166760–196168669 · regulatory

ENSR2_53P5RKT · CTCF_binding_site · 196168573–196168594 · regulatory

ENSR2_94TT9W · enhancer · 196168942–196169414 · regulatory

ENSR2_CPGKK · enhancer · 196169602–196170989 · regulatory

ENSR2_B3FX69 · promoter · 196170990–196171895 · regulatory

ENSR2_53P5S4J · CTCF_binding_site · 196171522–196171543 · regulatory

ENSR2_53P5S5B · CTCF_binding_site · 196171693–196171714 · regulatory

ENSR2_B3FX6W · enhancer · 196175311–196176316 · regulatory

ENSR2_B3FX73 · promoter · 196176317–196176993 · regulatory

· motif · 196167173–196167181 · motif

· motif · 196168282–196168297 · motif

· motif · 196168575–196168591 · motif

· motif · 196169163–196169174 · motif

· motif · 196169290–196169302 · motif

· motif · 196169293–196169308 · motif

· motif · 196169677–196169691 · motif

· motif · 196169677–196169691 · motif

· motif · 196169841–196169855 · motif

· motif · 196169848–196169859 · motif

· motif · 196171142–196171157 · motif

· motif · 196171306–196171323 · motif

· motif · 196171329–196171346 · motif

· motif · 196171350–196171363 · motif

· motif · 196171350–196171363 · motif

· motif · 196171524–196171540 · motif

· motif · 196171570–196171578 · motif

· motif · 196171672–196171681 · motif

· motif · 196171672–196171681 · motif

· motif · 196171695–196171711 · motif

· motif · 196171706–196171719 · motif

· motif · 196171776–196171789 · motif

· motif · 196171794–196171803 · motif

· motif · 196171831–196171844 · motif

· motif · 196171906–196171913 · motif

· motif · 196171917–196171926 · motif

· motif · 196171919–196171931 · motif

· motif · 196172974–196172987 · motif

· motif · 196172974–196172987 · motif

· motif · 196173112–196173124 · motif

· motif · 196176189–196176206 · motif

· motif · 196176198–196176206 · motif

· motif · 196176308–196176323 · motif

· motif · 196176524–196176539 · motif

· motif · 196176524–196176539 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:372 aa

1 aa372 aa結構域功能區域
依 O94768 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

STK17B 蛋白長 372 個胺基酸,屬於 CAMK Ser/Thr protein kinase family 的 DAP kinase subfamily。其蛋白質激酶結構域位於第 33 至 293 個胺基酸;第 305 至 362 個胺基酸則註記為無序區域。

結構域Protein kinase33–293 aa
功能區域Disordered305–362 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 6QF4…

PDB · 6QF4

X-ray · 2.50 A · A=18-329

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus;Cell membrane;Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment

STK17B 曾被定位於細胞核、細胞膜及內質網—高基氏體中間區室。 資料亦指出它與自身在質膜共定位;此項描述是 STK17B 的定位資訊,並非其他分子定位的轉移。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
DRAK2STK17B
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

STK17B 與 CHP1 有交互作用。此交互作用與 CHP1 從高基氏體轉位至細胞核有關;資料描述的是 CHP1 的定位變化,未指出 STK17B 與 CHP1 是否構成特定複合體,也未說明兩者是否直接結合。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能STK17B 被註記為可磷酸化 myosin light chains,但此作用是依相似性推定,並非此處直接確立的結果。此外,STK17B 被描述為細胞凋亡的正向調節因子;來源未提供相關細胞、刺激條件或具體調控步驟。含實驗來源
證據與來源

Phosphorylates myosin light chains (By similarity). Acts as a positive regulator of apoptosis

PMID 9786912 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+)資料庫紀錄
證據與來源

L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+)資料庫紀錄
證據與來源

L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用STK17B 與 CHP1 有交互作用;此交互作用會誘導 CHP1 從高基氏體轉位至細胞核。來源未進一步說明此轉位所需條件或兩者是否形成特定複合體。推論支持
證據與來源

Interacts with CHP1; the interaction induces CHP1 to translocate from the Golgi to the nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位STK17B 的定位資料包括細胞核、細胞膜及內質網—高基氏體中間區室;另有資料指出 STK17B 與自身在質膜共定位。來源未說明這些定位是否隨條件或細胞狀態改變。含實驗來源
證據與來源

Nucleus; Cell membrane; Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment; Colocalizes with STK17B at the plasma membrane

PMID 9786912 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000263955 · 5,273 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AAACCGCGACTGCAAGCTTCGGTAGTCCTCTCCGCTGCTG40
41TCGCCAGGAGTCACTTCACGAGAAGCCAGGTCACAACCGT80
81CGGCCCTTGTCTGGAAAAGTAAAAGTGGATCCTGCCACGT120
121TCGGAGCTCCCTGGCGCCTCGCCCGGCTGGAGCTAGAGAA160
161CTCGTCCTGTGGCGGCCCCCGGCGTGGGGCGGGACAGCGG200
201CCCCCTGGAGGGGGCAGTCCCGGGAGAACCTGCGGCGGCC240
241GGAGCGGTAAAAATAAGTGACTAAAGAAGCAGACCTGGGA280
281ATCACCTAACATGTCGAGGAGGAGATTTGATTGCCGAAGT320
321ATTTCAGGCCTACTAACTACAACTCCTCAAATTCCAATAA360
361AAATGGAAAACTTTAATAATTTCTATATACTTACATCTAA400
401AGAGCTAGGGAGAGGAAAATTTGCTGTGGTTAGACAATGT440
441ATATCAAAATCTACTGGCCAAGAATATGCTGCAAAATTTC480
481TAAAAAAGAGAAGAAGAGGACAGGATTGTCGAGCAGAAAT520
521TTTACACGAGATTGCTGTGCTTGAATTGGCAAAGTCTTGT560
561CCCCGTGTTATTAATCTTCATGAGGTCTATGAAAATACAA600
601GTGAAATCATTTTGATATTGGAATATGCTGCAGGTGGAGA640
641AATTTTCAGCCTGTGTTTACCTGAGTTGGCTGAAATGGTT680
681TCTGAAAATGATGTTATCAGACTCATTAAACAAATACTTG720
721AAGGAGTTTATTATCTACATCAGAATAACATTGTACACCT760
761TGATTTAAAGCCACAGAATATATTACTGAGCAGCATATAC800
801CCTCTCGGGGACATTAAAATAGTAGATTTTGGAATGTCTC840
841GAAAAATAGGGCATGCGTGTGAACTTCGGGAAATCATGGG880
881AACACCAGAATATTTAGCTCCAGAAATCCTGAACTATGAT920
921CCCATTACCACAGCAACAGATATGTGGAATATTGGTATAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。