基因總覽
STK17B(serine/threonine kinase 17b)是蛋白質編碼基因,其產物屬於蛋白質激酶超家族,並歸入 CAMK Ser/Thr protein kinase family 的 DAP kinase subfamily。這項家族分類指出其為絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶類成員;來源所列蛋白質全長為 372 個胺基酸,並具有蛋白質激酶結構域。其已知角色包括正向調控細胞凋亡;另有與 myosin light chains 磷酸化相關的註記,但該功能標示為依相似性推定。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000263955 ★ | 196,133,583–196,171,578 | 8 |
| ENST00000449152 | 196,133,583–196,171,000 | 10 |
| ENST00000420683 | 196,133,583–196,176,334 | 9 |
| ENST00000714417 | 196,133,583–196,171,319 | 8 |
| ENST00000879796 | 196,133,583–196,171,647 | 9 |
| ENST00000879797 | 196,133,583–196,170,308 | 9 |
| ENST00000879798 | 196,133,583–196,166,116 | 8 |
| ENST00000879799 | 196,133,583–196,163,942 | 7 |
| ENST00000915456 | 196,133,583–196,171,341 | 8 |
| ENST00001137701 | 196,133,583–196,171,647 | 8 |
| ENST00000409228 | 196,137,447–196,176,503 | 8 |
| ENST00000606789 | 196,155,267–196,171,647 | 3 |
顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
STK17B 的功能資料指出,它是細胞凋亡的正向調節因子,亦即與促進凋亡的調控方向相關。來源未進一步說明此作用發生於哪些細胞、由何種刺激引發,或經由哪些下游步驟完成,因此不能據此延伸出特定的凋亡路徑或生理情境。
此外,STK17B 被註記為可磷酸化 myosin light chains,但此項資訊標示為「依相似性」推定,應視為推論性功能,而非在此來源中直接確立的作用。磷酸化反應涉及將磷酸基團加到蛋白質上;資料列出的酵素反應式則分別描述以 ATP 為磷酸基供體,將絲胺酸或蘇胺酸殘基磷酸化,並產生 ADP 與 H⁺。這些反應式說明該類激酶反應的化學形式,並未指定 myosin light chains 上的磷酸化位點或反應條件。
因此,現有資料支持的功能重點是 STK17B 與凋亡正向調控的關聯,以及依相似性提出的 myosin light chains 磷酸化功能;但不足以確定兩者是否存在直接的因果連結,也未提供其對細胞或組織層級結果的描述。
Promoter 與基因調控
>STK17B ENST00000263955 GRCh38 chr2:196171478-196172578 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TACTGGGATAGAACAAGAAAACCTGTCCTTTATATGCTAACTGAACATTAAGTCTTTTGAAAGCAAGAGG ACGACTCCACTCCCAGTATCCTTTCCCACGGAAGGGTTTTCTGCAATTATCGTAAATGTCCTCTGAAAGC AATCCTAGATTACATAACTAATCCCATATATGTATGAGTATGTGTGTATCCTATACATATAAACTAGGAT TATATATCTATGTAAAACATTTGTGTCTTGCACAGAACTTTGAAAATTTCCACTGTCTTCAAAGGATAAC AGATCTTGAGTAGGTTGCTGAGGGCTTTCATCTTTTTCCTTAGCACTATAAATGCAAAATCGGCTATTCA GCCTATTGGGACCCTCCCTACACTGCCTTCAGTCAGTGCCTCAGAAGGGACACCATTCGCGACAGCGGAC GTTAGCAGTGGGGTCTAGGTTCCATAAATCCCCAACTGATGTTGACACTCCGAGGAACCTCTGCCAAGTT GTAGCAAACTGGGTTCTCCACTTACAGGGTACGTTCCGGTCCTAAGGAAGACTCTCAAGAAGAGTCAGAA AATAGGTCTTTGGTAGGCACTGAAGTTTGGTAACTAGTCGCAGGCAGCTGGGACGAATTTTGCGGCTTCC TTCTCCCCGGTCTCCGGATATTCACACCTCTCGAACTGACCTCTCTGAAGGTGGGAAGGAGTACACAGAG CAGTAGTTCCAGCCCCGCGCGCCCCCTCTGCAGCGCCGCCCCCTCCGCCCCTCCCTCGCGGCAGCCCGAG TGCGCCCCACCTGCGCCGCCACGCCGCCGCGCCTCCCCGCCCCGCCTCGGGCCAGCCAGGCGCCGCACCC TCTCACCGCCGGGCCCCGCCCCGCACACGCGCCCCCGGCCGGTGCCCCGCCCCTCCCGTCACGTGACAGA CCCACCCTCCGCACCCGTTCCGATTGGCTCTCCCGACCTAGGGGGAGGGATCTGGCGAACGGCGATGCCC CAGACGCGGCTGCAGTTTTCAAACCGCGACTGCAAGCTTCGGTAGTCCTCTCCGCTGCTGTCGCCAGGAG TCACTTCACGAGAAGCCAGGTCACAACCGTCGGCCCTTGTCTGGAAAAGTA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| STK17B_1 ↗ | 2:196,171,578 | 負股 | 196,171,568–196,171,627 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR2_CPGKD · enhancer · 196166760–196168669 · regulatory
ENSR2_53P5RKT · CTCF_binding_site · 196168573–196168594 · regulatory
ENSR2_94TT9W · enhancer · 196168942–196169414 · regulatory
ENSR2_CPGKK · enhancer · 196169602–196170989 · regulatory
ENSR2_B3FX69 · promoter · 196170990–196171895 · regulatory
ENSR2_53P5S4J · CTCF_binding_site · 196171522–196171543 · regulatory
ENSR2_53P5S5B · CTCF_binding_site · 196171693–196171714 · regulatory
ENSR2_B3FX6W · enhancer · 196175311–196176316 · regulatory
ENSR2_B3FX73 · promoter · 196176317–196176993 · regulatory
· motif · 196167173–196167181 · motif
· motif · 196168282–196168297 · motif
· motif · 196168575–196168591 · motif
· motif · 196169163–196169174 · motif
· motif · 196169290–196169302 · motif
· motif · 196169293–196169308 · motif
· motif · 196169677–196169691 · motif
· motif · 196169677–196169691 · motif
· motif · 196169841–196169855 · motif
· motif · 196169848–196169859 · motif
· motif · 196171142–196171157 · motif
· motif · 196171306–196171323 · motif
· motif · 196171329–196171346 · motif
· motif · 196171350–196171363 · motif
· motif · 196171350–196171363 · motif
· motif · 196171524–196171540 · motif
· motif · 196171570–196171578 · motif
· motif · 196171672–196171681 · motif
· motif · 196171672–196171681 · motif
· motif · 196171695–196171711 · motif
· motif · 196171706–196171719 · motif
· motif · 196171776–196171789 · motif
· motif · 196171794–196171803 · motif
· motif · 196171831–196171844 · motif
· motif · 196171906–196171913 · motif
· motif · 196171917–196171926 · motif
· motif · 196171919–196171931 · motif
· motif · 196172974–196172987 · motif
· motif · 196172974–196172987 · motif
· motif · 196173112–196173124 · motif
· motif · 196176189–196176206 · motif
· motif · 196176198–196176206 · motif
· motif · 196176308–196176323 · motif
· motif · 196176524–196176539 · motif
· motif · 196176524–196176539 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:372 aa
STK17B 蛋白長 372 個胺基酸,屬於 CAMK Ser/Thr protein kinase family 的 DAP kinase subfamily。其蛋白質激酶結構域位於第 33 至 293 個胺基酸;第 305 至 362 個胺基酸則註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
STK17B 曾被定位於細胞核、細胞膜及內質網—高基氏體中間區室。 資料亦指出它與自身在質膜共定位;此項描述是 STK17B 的定位資訊,並非其他分子定位的轉移。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
STK17B 與 CHP1 有交互作用。此交互作用與 CHP1 從高基氏體轉位至細胞核有關;資料描述的是 CHP1 的定位變化,未指出 STK17B 與 CHP1 是否構成特定複合體,也未說明兩者是否直接結合。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | STK17B 被註記為可磷酸化 myosin light chains,但此作用是依相似性推定,並非此處直接確立的結果。此外,STK17B 被描述為細胞凋亡的正向調節因子;來源未提供相關細胞、刺激條件或具體調控步驟。 | 含實驗來源 | 證據與來源Phosphorylates myosin light chains (By similarity). Acts as a positive regulator of apoptosis PMID 9786912 ↗ |
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | STK17B 與 CHP1 有交互作用;此交互作用會誘導 CHP1 從高基氏體轉位至細胞核。來源未進一步說明此轉位所需條件或兩者是否形成特定複合體。 | 推論支持 | 證據與來源Interacts with CHP1; the interaction induces CHP1 to translocate from the Golgi to the nucleus |
| 細胞定位 | STK17B 的定位資料包括細胞核、細胞膜及內質網—高基氏體中間區室;另有資料指出 STK17B 與自身在質膜共定位。來源未說明這些定位是否隨條件或細胞狀態改變。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus; Cell membrane; Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment; Colocalizes with STK17B at the plasma membrane PMID 9786912 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AAACCGCGACTGCAAGCTTCGGTAGTCCTCTCCGCTGCTG40TCGCCAGGAGTCACTTCACGAGAAGCCAGGTCACAACCGT80CGGCCCTTGTCTGGAAAAGTAAAAGTGGATCCTGCCACGT120TCGGAGCTCCCTGGCGCCTCGCCCGGCTGGAGCTAGAGAA160CTCGTCCTGTGGCGGCCCCCGGCGTGGGGCGGGACAGCGG200CCCCCTGGAGGGGGCAGTCCCGGGAGAACCTGCGGCGGCC240GGAGCGGTAAAAATAAGTGACTAAAGAAGCAGACCTGGGA280ATCACCTAACATGTCGAGGAGGAGATTTGATTGCCGAAGT320ATTTCAGGCCTACTAACTACAACTCCTCAAATTCCAATAA360AAATGGAAAACTTTAATAATTTCTATATACTTACATCTAA400AGAGCTAGGGAGAGGAAAATTTGCTGTGGTTAGACAATGT440ATATCAAAATCTACTGGCCAAGAATATGCTGCAAAATTTC480TAAAAAAGAGAAGAAGAGGACAGGATTGTCGAGCAGAAAT520TTTACACGAGATTGCTGTGCTTGAATTGGCAAAGTCTTGT560CCCCGTGTTATTAATCTTCATGAGGTCTATGAAAATACAA600GTGAAATCATTTTGATATTGGAATATGCTGCAGGTGGAGA640AATTTTCAGCCTGTGTTTACCTGAGTTGGCTGAAATGGTT680TCTGAAAATGATGTTATCAGACTCATTAAACAAATACTTG720AAGGAGTTTATTATCTACATCAGAATAACATTGTACACCT760TGATTTAAAGCCACAGAATATATTACTGAGCAGCATATAC800CCTCTCGGGGACATTAAAATAGTAGATTTTGGAATGTCTC840GAAAAATAGGGCATGCGTGTGAACTTCGGGAAATCATGGG880AACACCAGAATATTTAGCTCCAGAAATCCTGAACTATGAT920CCCATTACCACAGCAACAGATATGTGGAATATTGGTATAA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。