基因總覽
STK17A 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 serine/threonine kinase 17a。其產物 Serine/threonine-protein kinase 17A 屬於 protein kinase superfamily,並歸入 CAMK Ser/Thr protein kinase family 的 DAP kinase subfamily。蛋白質長 414 個胺基酸,具有蛋白質激酶結構域;來源所列的兩段無序區位於 N 端及激酶結構域之後。這些家族與結構資訊界定了它作為蛋白質激酶的基本性質;來源另指出其與細胞凋亡及細胞內活性氧調節相關,具體功能見下文。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000319357 ★ | 43,583,108–43,627,379 | 7 |
| ENST00000869874 | 43,582,991–43,635,964 | 6 |
| ENST00000938960 | 43,582,991–43,635,964 | 5 |
| ENST00000950254 | 43,582,991–43,635,964 | 6 |
| ENST00001127656 | 43,582,991–43,625,184 | 7 |
| ENST00001141896 | 43,582,991–43,635,964 | 7 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
STK17A 的產物被註明可正向調節細胞凋亡,也參與調節細胞內活性氧(reactive oxygen species)。來源未進一步說明這兩項作用的分子步驟或彼此關係,因此不能據此推定特定的下游途徑。
其酵素活性反應描述顯示,該蛋白可利用 ATP,將磷酸基轉移至蛋白質中的 serine 或 threonine 殘基,分別形成磷酸化的 serine 或 threonine,並產生 ADP 與 H⁺。這與其 serine/threonine protein kinase 的分類相符;不過,來源沒有提供受質身分或特定反應發生時的細胞條件。
因此,現有資料支持 STK17A 具有蛋白質磷酸化相關的酵素活性,並將其與細胞凋亡正向調節及活性氧調控相連。來源未交代其如何透過磷酸化影響這些細胞功能,故不宜延伸為更具體的機制或因果描述。
Promoter 與基因調控
>STK17A ENST00000319357 GRCh38 chr7:43582108-43583208 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GAGAGAAGTGATCAAACGCCGCATCTAGTTTGAAGGAAAAGACAAGAGGGTTTACTGACAAACTGGAGAT GAGCATGAGAGAGGAATCAATGCTCATCCCAAGATTTTTGGCCTGAACAGCTAGAAGGAAGGAGATGAAG AAAACTGAGACGGGGAAAGCTGGGTAGGAGTGCATTCATGAAGACCAATCAGCAACTTACTTTTGTGTAT GTTAAGTCTGAGATGCTAATTTGACATGTAAGTGGAGATGCCAAATGCATAGTCAAATACACCAGTCTGA AGTTCAGGGAATATTTGGAAGCTAGAGATACAAATTCTGTAGTCATGAGCATATAGATGGTAATTAAAGT CGTAAGACCGGATGAGAGGACCTCGAAAGTAAATATAGAGACGACTACAGACAATATAATAGTGTCTATT TCATAGGGCCGGTGTGCAGGGTTAATAATATTTATACAACTCTGCCTCCAGACCCCTCTCCCAGTGTACG GAGATCAGGATCTCATCACCCCTCCCCACCACGTGAAGTCCTGCTTACAGCTCAAATGCCTTTTATTAAC CGAAGTGCCTCCAGACCCCTCCCCTCCTCACCACGTGAAGTCCCGCTTACAGCTCAAATGCCTTTTATTA ACCGAAGGTCAGCTTTTGTGACTCTCAGACGCTCAACAGGTGCGCAACTCTGCTAACGCAGTAGGCTGTC CTGGCCAAAGGGTGGTGCTGTGAGTCGCCTCCAGCCTCCGGGCCGTCCCGAAAGCTGCACCTTCTCCCCC TGAGCTGCAGAGGGCGCGCGTGAGGCATCGGGCGCTCAGGACCCCGCGGGAGCTCAGCGAGGGGGCGGGC GGCCACGGAGTGAGGCCGGGGCGGGGTCGGGCGCGGGGCGGACGTGGGGAGGGGTTGGCCGGGGCCAGAA GCAGGGTGCAGGGCAGGCGCGGGGCGGTCACGGGGGCGGGGCCGGTCGCGGGGCGCGGGGCGGGCCCGAG CTACCGGTAGTCTGCCTGCCGCAGTCCGAGCGCCGCGCTGGGGAGAGCGGGTGTTTGAAGGCTCCGCGGA CCGGCACTAGGAGCCGGGGGCGGGTCCGTGACCCTCCGGCTGCTCGGAGTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| STK17A_1 ↗ | 7:43,583,108 | 正股 | 43,583,059–43,583,118 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_9MB3R · promoter · 43582618–43583118 · regulatory
ENSR7_5D8R3B · CTCF_binding_site · 43582808–43582829 · regulatory
ENSR7_5D8R3L · CTCF_binding_site · 43582877–43582898 · regulatory
ENSR7_5D8R3T · CTCF_binding_site · 43582928–43582949 · regulatory
· motif · 43581942–43581962 · motif
· motif · 43582682–43582692 · motif
· motif · 43582772–43582781 · motif
· motif · 43582810–43582826 · motif
· motif · 43582879–43582895 · motif
· motif · 43582930–43582946 · motif
· motif · 43582933–43582946 · motif
· motif · 43582938–43582948 · motif
· motif · 43582964–43582974 · motif
· motif · 43582976–43582986 · motif
· motif · 43583044–43583057 · motif
· motif · 43583049–43583059 · motif
· motif · 43583050–43583063 · motif
· motif · 43583068–43583078 · motif
· motif · 43583168–43583181 · motif
· motif · 43583173–43583183 · motif
· motif · 43583868–43583876 · motif
· motif · 43584127–43584138 · motif
· motif · 43584444–43584459 · motif
· motif · 43584514–43584529 · motif
· motif · 43585738–43585749 · motif
· motif · 43586228–43586240 · motif
· motif · 43586535–43586543 · motif
· motif · 43587005–43587020 · motif
· motif · 43587227–43587235 · motif
· motif · 43587227–43587244 · motif
在順鉑處理後,STK17A 的表現會以 p53/TP53 依賴的方式受到誘導。p53/TP53 可直接結合 STK17A 的調控區域並活化其表現;來源未提供其他調控條件。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:414 aa
Serine/threonine-protein kinase 17A 長 414 個胺基酸,屬於 protein kinase superfamily、CAMK Ser/Thr protein kinase family,並位於 DAP kinase subfamily。其 protein kinase 結構域涵蓋第 61 至 321 個胺基酸。來源另將第 1 至 40 位及第 342 至 363 位註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源將 STK17A 蛋白質定位於細胞核;未提供定位變化的條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | STK17A 的產物可正向調節細胞凋亡,並參與調節細胞內活性氧。來源未進一步說明調節的分子機制、作用條件,或這兩項功能之間的關係。 | 含實驗來源 | 證據與來源Acts as a positive regulator of apoptosis. Also acts as a regulator of cellular reactive oxygen species PMID 21489989 ↗ · PMID 9786912 ↗ |
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | STK17A 蛋白質定位於細胞核。此項敘述未指出定位所依據的特定處理條件、異構型差異或細胞內動態。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | 順鉑處理後,STK17A 表現以 p53/TP53 依賴的方式受到誘導;p53/TP53 可直接結合其調控區域並活化表現。來源未描述其他誘導條件或額外調控因子。 | 含實驗來源 | 證據與來源Directly regulated by p53/TP53: induced following cisplatin treatment in a p53/TP53-dependent manner. p53/TP53 activates expression by directly binding to its regulatory regions PMID 15940259 ↗ · PMID 21489989 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCAGTCCGAGCGCCGCGCTGGGGAGAGCGGGTGTTTGAAG40GCTCCGCGGACCGGCACTAGGAGCCGGGGGCGGGTCCGTG80ACCCTCCGGCTGCTCGGAGTGAACAGGCGGCCAGGAAAGA120AGCGGGCCTGAACACCATGATCCCTTTGGAGAAGCCAGGC160AGCGGCGGCTCCTCCCCAGGCGCCACCTCAGGCTCGGGCC200GGGCAGGCCGGGGTCTGAGCGGGCCGTGCCGGCCGCCGCC240GCCGCCCCAGGCCCGCGGGCTGCTGACAGAGATACGCGCC280GTGGTGCGCACCGAGCCCTTCCAGGACGGCTACAGCCTGT320GCCCGGGCCGGGAGCTGGGCAGGGGGAAATTTGCAGTGGT360GAGAAAATGTATAAAGAAAGATTCTGGGAAAGAATTTGCT400GCAAAGTTCATGAGAAAAAGAAGAAAAGGCCAAGATTGTC440GGATGGAAATAATTCATGAGATTGCTGTACTTGAACTAGC480ACAAGACAATCCTTGGGTCATTAATTTACATGAAGTTTAT520GAGACTGCATCAGAAATGATCTTAGTTCTGGAATATGCTG560CTGGGGGTGAAATCTTTGACCAGTGTGTTGCAGACAGAGA600AGAAGCCTTTAAAGAAAAAGATGTTCAAAGACTTATGCGA640CAGATTTTAGAAGGTGTTCACTTTTTACACACTCGTGATG680TAGTTCATCTTGATTTGAAGCCTCAGAATATTCTGTTGAC720AAGTGAATCTCCATTGGGTGACATTAAGATTGTTGATTTT760GGCCTTTCAAGAATATTGAAGAACAGTGAAGAGCTCCGAG800AAATTATGGGTACCCCTGAATATGTGGCTCCTGAAATTCT840TAGTTATGATCCTATAAGCATGGCAACAGATATGTGGAGC880ATTGGAGTGTTAACATATGTCATGCTTACAGGAATATCAC920CTTTCTTAGGCAATGATAAACAAGAAACATTCTTAAACAT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。