基因總覽
STK16 是蛋白質編碼基因，其產物 serine/threonine kinase 16 屬於 protein kinase superfamily 中的 Ser/Thr protein kinase family。這是一種膜相關激酶，蛋白質全長 305 個胺基酸；其主要結構特色為涵蓋第 20 至 293 個胺基酸的 protein kinase 結構域，以及位於第 166 至 202 個胺基酸的 activation loop。這些特徵符合其作為蛋白質激酶的基本性質。其可能參與細胞內訊號傳遞與分泌囊泡運輸，並可能涉及乳腺導管形態形成期間的基質與上皮細胞互作調節。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000396738 ★ | 219,245,479–219,250,337 | 8 |
| ENST00000409638 | 219,245,455–219,250,339 | 8 |
| ENST00000409516 | 219,245,455–219,250,339 | 6 |
| ENST00000875263 | 219,245,455–219,250,335 | 8 |
| ENST00000875264 | 219,245,455–219,250,339 | 8 |
| ENST00000913739 | 219,245,455–219,250,339 | 8 |
| ENST00000913740 | 219,245,479–219,250,339 | 6 |
| ENST00000913741 | 219,245,479–219,250,339 | 8 |
| ENST00001144846 | 219,245,479–219,250,339 | 8 |
| ENST00000409260 | 219,245,482–219,250,339 | 7 |
| ENST00000409743 | 219,245,482–219,250,339 | 6 |
| ENST00000875262 | 219,245,482–219,250,339 | 7 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
STK16 的產物是膜相關蛋白激酶，可將磷酸基轉移至蛋白質的 serine 或 threonine 殘基。相應反應以 ATP 為磷酸基來源，產生磷酸化蛋白質、ADP 與 H⁺。此外，STK16 也能進行自身磷酸化；來源指出其可在 tyrosine 殘基上自體磷酸化，但是否能將其他蛋白質的 tyrosine 殘基磷酸化，目前仍不清楚，因此不能據此確定其具有對其他蛋白質的 tyrosine kinase 活性。
體外實驗所列的底物包括 DRG1、ENO1 與 EIF4EBP1。另有資料指出，STK16 透過自身 N 端與 DRG1 互作，並磷酸化 DRG1。這些資訊支持其可作用於特定蛋白質底物，但來源未進一步說明這些磷酸化事件如何改變底物活性或細胞反應。
STK16 可能參與分泌囊泡運輸，也可能參與細胞內訊號傳遞；這些作用在來源中以可能性描述，未提供可確定的詳細機制。它也可能參與 TGF-beta 訊號。至於乳腺導管形態形成，STK16 被提出可能調節其中的基質與上皮細胞互作；來源未將此描述為已確立的因果機制。整體而言，現有資料指出 STK16 具有蛋白質磷酸化活性，並提出數項可能的細胞過程，但對其生物學作用的具體途徑仍有限定。
Promoter 與基因調控
>STK16 ENST00000396738 GRCh38 chr2:219244479-219245579 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAGGACCTCTTTCCTGGAGAGTCCTGTTTCAGCAAAACAGCCATTCCCTCCTGGCCATTCCACCTTCTTT GGAAGTGCACCCCTCTCCAGCTTACCCCTGCCTGCCTCCGCAACAGATATTAAGGACAACTGCTTTGTGC CAAAGCTCGAAAATCTGTGAATTTCCGTTCCTTTTGCCTTTACAGTCTCAAGAATGGGATGTGAAGATCA GGGTAATAATAATTACGGTTTATTGACACGTACTGAAGGCTATGTGTCAGATATTGTATTAAACACTGTA CATCTCATTTAATCTTCAACTCCATGAGGTAGATAATTATTTCCATTTTACAGAGGAGGAGAGGAAAGGA CAGAAACATTAAGTAGCCTGTCCAAGGTCACACAACTACGTTAACGGAGCTGTCATTTGAACTAGTCAGT CTGGCCTCACAGTTAAGCTACTTAACCTTATGTACTATTATACCTATTTTACAGCTACCAAAAGTAAGGA TCCGAGAGGTTAAGTAACTTGCCCGAGGTTACACAGCTAGCATGCTATTAACACTCAATTTAGAAACTGG AAGTCTGGTTCACAAGCCTGAGCTCTTAACCACTGAGACTAGGGGTAGTGGGATACAGGCCAGAGCCCAG AAGGTTGTACGGGATCAGGAGACCAGGCCACCAGACCCGCCCCTCACTGGATCCCCCTCCAGGCTGCAGT GTAGTTGGCCGCTTTCTGCCCCAGAGCGCCAGAGGTATGAAGCCTCCTACCTCCAACATTGGGAGATGGA GGTCCTGGGGGCCTCGGGCCGAGCCCGGCTTTGCTCCCCTTTGGCGTAGGTGCCTGCGTCTTGACCCCCA CCGAAGGCCAAGTAGAGAACCCTCACCAGGGTCCTGGGACCCGTCCACCCCTACACCTAGCTAGCCCGGA GCCTCTCAGCTCCGCGTCCCCACATCCTCCGGATGCCCAGCGGTTGCTGAGATACCGCGGGCCGTTACGC CGGCGCGGACTGATGATGTCAGCACTGCTTCCGGTCGGTGGCGCTTCTCTCTGGCCCGAGCCAGGTCAGT CCGGCAGTGCAGATGGCCCATCCCGGGCTCTGGGCTCCTAGACCGGGGTGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| STK16_1 ↗ | 2:219,245,498 | 正股 | 219,245,449–219,245,508 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR2_88G365 · promoter · 219243604–219243777 · regulatory
ENSR2_B3LHRH · enhancer · 219244837–219245433 · regulatory
ENSR2_6XR6QL · promoter · 219245434–219245465 · regulatory
ENSR2_9582L5 · promoter · 219245468–219245906 · regulatory
ENSR2_53WKCJF · CTCF_binding_site · 219245485–219245506 · regulatory
ENSR2_53WKD2S · CTCF_binding_site · 219248374–219248395 · regulatory
· motif · 219243616–219243625 · motif
· motif · 219243616–219243625 · motif
· motif · 219245469–219245482 · motif
· motif · 219245484–219245493 · motif
· motif · 219245487–219245503 · motif
· motif · 219245670–219245685 · motif
· motif · 219245737–219245749 · motif
· motif · 219245740–219245747 · motif
· motif · 219247556–219247568 · motif
· motif · 219247928–219247937 · motif
· motif · 219248086–219248097 · motif
· motif · 219248376–219248392 · motif
· motif · 219249298–219249308 · motif
· motif · 219249410–219249419 · motif
· motif · 219249469–219249482 · motif
· motif · 219249469–219249482 · motif
· motif · 219249557–219249567 · motif
· motif · 219249635–219249648 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：305 aa
serine/threonine kinase 16 長 305 個胺基酸，屬於 Ser/Thr protein kinase family。其 protein kinase 結構域位於第 20 至 293 個胺基酸，activation loop 位於第 166 至 202 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
STK16 位於細胞質的核周區域，並與膜脂質錨定相關；資料亦指出它與 Golgi 及源自 Golgi 的囊泡相關。 來源未提供定位變化的條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 95 個夥伴
- ADAMTSL4Q6UY14 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- AGR2O95994 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- APBA1Q02410 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APBA2Q99767 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ARNT2Q9HBZ2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ATP23Q9Y6H3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BHLHA9Q7RTU4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CALCOCO2Q13137 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CBX3Q13185 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CFPP27918 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CRXO43186 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CSKMTA8MUP2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CYSRT1A8MQ03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DDIT4LQ96D03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG3Q92796 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG4P78352 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DNAJA3Q96EY1-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DRG1Q9Y295 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EFEMP2O95967 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- EFHC2Q5JST6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FLACC1Q96Q35 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FRMPD2Q68DX3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- FRS3O43559 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FXR1P51114-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GABPAQ06546 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
STK16 以單體形式存在，並透過 N 端與 DRG1 互作；此互作伴隨 DRG1 磷酸化。來源未指出 STK16 與其他蛋白質形成複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | STK16 是膜相關激酶，可磷酸化 serine 與 threonine，並能自體磷酸化；體外底物包括 DRG1、ENO1 與 EIF4EBP1。它可能參與分泌囊泡運輸、細胞內訊號傳遞及 TGF-beta 訊號，也可能調節乳腺導管形態形成時的基質與上皮細胞互作。雖可在 tyrosine 上自體磷酸化，但是否磷酸化其他蛋白質的 tyrosine 尚不清楚。 | 含實驗來源 | 證據與來源Membrane-associated protein kinase that phosphorylates on serine and threonine residues. In vitro substrates include DRG1, ENO1 and EIF4EBP1. Also autophosphorylates. May be involved in secretory vesicle trafficking or intracellular signaling. May have a role in regulating stromal-epithelial interactions that occur during ductal morphogenesis in the mammary gland. May be involved in TGF-beta signaling. Able to autophosphorylate on Tyr residue; it is however unclear whether it has tyrosine-protein kinase toward other proteins PMID 10364453 ↗ |
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | L-tyrosyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + ADP + H(+) | 推論支持 | |
| 交互作用 | STK16 以單體形式存在，並透過自身 N 端與 DRG1 互作；該互作伴隨 DRG1 磷酸化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Monomer. Interacts with DRG1 (via its N-terminal); the interaction phosphorylates DRG1 PMID 18184589 ↗ |
| 細胞定位 | STK16 位於細胞質核周區域，與膜脂質錨定相關，並與 Golgi 及源自 Golgi 的囊泡相關。 | 推論支持 | 證據與來源Cytoplasm, perinuclear region; Membrane / Lipid-anchor; Associates with Golgi and Golgi-derived vesicles |
核酸與蛋白質序列
AGCACTGCTTCCGGTCGGTGGCGCTTCTCTCTGGCCCGAG40CCAGGTCAGTCCGGCAGTGCAGATGGCCCATCCCGGGCTC80TGGGCTCCTAGACCGGGGTGGGCCCTGCCAGGAGTGGGCC120TGAGCCTCGCACGTCCTCTGAAACTACGCTATGCTCTGCT160TTTGCGGCGCGATGGGCGTGGGAGCGGGGGCTGCCCAAAG200ATGGGCTGGGGTTGGAGGAAGTGGCCCGGTAGCCGCTGTG240TGTCCTGAGGCCGTAAGGCGCCTGACCCCACCCCTGAAGC280TGGCGACGGAGCAGGGCCTGTTTTCTCTACACTATAGTCA320TGATCCGCTGGGCCCCCAGCGCATCTCCTGGAAGAGCCCA360CTCACCCTGGACGAGCTCTTCGGTAGCCTCAGACCGTCCT400TGAAGAGGATGACTGAGACATTATGGGCCACGCGCTGTGT440GTCTGCTCTCGGGGAACTGTCATCATTGACAATAAGCGCT480ACCTCTTCATCCAGAAACTGGGGGAGGGTGGGTTCAGCTA520TGTGGACCTAGTGGAAGGGTTACATGATGGACACTTCTAC560GCCCTGAAGCGAATCCTGTGTCACGAGCAGCAGGACCGGG600AGGAGGCCCAGCGAGAAGCCGACATGCATCGCCTCTTCAA640TCACCCCAACATCCTTCGCCTCGTGGCTTACTGTCTGAGG680GAACGGGGTGCTAAGCATGAGGCCTGGCTGCTGCTACCAT720TCTTCAAGAGAGGTACGCTGTGGAATGAGATAGAAAGGCT760GAAGGACAAAGGCAACTTCCTGACCGAGGATCAAATCCTT800TGGCTGCTGCTGGGGATCTGCAGAGGCCTTGAGGCCATTC840ATGCCAAGGGTTATGCCCACAGAGACTTGAAGCCCACCAA880TATATTGCTTGGAGATGAGGGGCAGCCAGTTTTAATGGAC920TTGGGTTCCATGAATCAAGCATGCATCCATGTGGAGGGCT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。