演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

STK10LOK

serine/threonine kinase 10

STK10 編碼一種絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶,參與調控淋巴球移動,並可磷酸化 ERM 蛋白 MSN;其對 PLK1 的作用仍待體內證據確認。

Homo sapiens5q35.1UniProt O94804
OFFICIAL SYMBOL
STK10
CHROMOSOME
5
UNIPROT
O94804
PDB / ALPHAFOLD
2J7T
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

STK10(serine/threonine kinase 10)是蛋白質編碼基因,產物屬於 protein kinase 超家族中的 STE Ser/Thr protein kinase 家族,並歸於 STE20 亞家族。其蛋白質長 968 個胺基酸,具有蛋白激酶結構域;序列中另有多段預測為無序的區域。這些基本特徵界定了 STK10 作為激酶的分子身分,而其受質磷酸化及相關細胞功能則另見下方說明。

Official symbol
STK10
Gene name
serine/threonine kinase 10
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11388
UniProt
O94804
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
LOKPRO2729

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 55q35.1
chr5 · 181,538,259 bp · GRCh38chr5p15.33 · 1–4400000 · gnegchr5p15.32 · 4400001–6300000 · gpos25chr5p15.31 · 6300001–9900000 · gnegchr5p15.2 · 9900001–15000000 · gpos50chr5p15.1 · 15000001–18400000 · gnegchr5p14.3 · 18400001–23300000 · gpos100chr5p14.2 · 23300001–24600000 · gnegchr5p14.1 · 24600001–28900000 · gpos100chr5p13.3 · 28900001–33800000 · gnegchr5p13.2 · 33800001–38400000 · gpos25chr5p13.1 · 38400001–42500000 · gnegchr5p12 · 42500001–46100000 · gpos50chr5p11 · 46100001–48800000 · acenchr5q11.1 · 48800001–51400000 · acenchr5q11.2 · 51400001–59600000 · gnegchr5q12.1 · 59600001–63600000 · gpos75chr5q12.2 · 63600001–63900000 · gnegchr5q12.3 · 63900001–67400000 · gpos75chr5q13.1 · 67400001–69100000 · gnegchr5q13.2 · 69100001–74000000 · gpos50chr5q13.3 · 74000001–77600000 · gnegchr5q14.1 · 77600001–82100000 · gpos50chr5q14.2 · 82100001–83500000 · gnegchr5q14.3 · 83500001–93000000 · gpos100chr5q15 · 93000001–98900000 · gnegchr5q21.1 · 98900001–103400000 · gpos100chr5q21.2 · 103400001–105100000 · gnegchr5q21.3 · 105100001–110200000 · gpos100chr5q22.1 · 110200001–112200000 · gnegchr5q22.2 · 112200001–113800000 · gpos50chr5q22.3 · 113800001–115900000 · gnegchr5q23.1 · 115900001–122100000 · gpos100chr5q23.2 · 122100001–127900000 · gnegchr5q23.3 · 127900001–131200000 · gpos100chr5q31.1 · 131200001–136900000 · gnegchr5q31.2 · 136900001–140100000 · gpos25chr5q31.3 · 140100001–145100000 · gnegchr5q32 · 145100001–150400000 · gpos75chr5q33.1 · 150400001–153300000 · gnegchr5q33.2 · 153300001–156300000 · gpos50chr5q33.3 · 156300001–160500000 · gnegchr5q34 · 160500001–169000000 · gpos100chr5q35.1 · 169000001–173300000 · gnegchr5q35.2 · 173300001–177100000 · gpos25chr5q35.3 · 177100001–181538259 · gnegSTK10pq1 bp181,538,259 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr5:172,042,079–172,188,411
Gene span
146,333 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000176763 ★172,042,079–172,188,22419
ENST00000877786172,042,079–172,188,41119
ENST00000877787172,042,079–172,188,41118
ENST00000877788172,042,079–172,188,41118
ENST00000877789172,042,079–172,188,41119
ENST00000877790172,042,079–172,188,41120
ENST00000916144172,042,079–172,188,41118
ENST00000916145172,042,079–172,188,41118
ENST00000916146172,042,079–172,188,41119
ENST00001132032172,042,079–172,188,41119
ENST00000520476172,044,668–172,061,1687
ENST00001113273172,111,860–172,188,4115

顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

STK10 是絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶,參與淋巴球移動的調控。它可磷酸化 ERM 蛋白,例如 MSN;此磷酸化作用與 STK10 調節淋巴球移動的功能相關。酵素反應中,STK10 利用 ATP 將蛋白質上的絲胺酸或蘇胺酸磷酸化,並產生 ADP 與 H⁺。

除了與淋巴球移動相關的作用,STK10 也被描述為 MAP3K1/MEKK1 的負向調節因子。這項功能關係指出 STK10 對 MAP3K1/MEKK1 活性具有抑制方向的調控,但來源未進一步提供其作用機制或細胞情境,因此不宜延伸解讀。

STK10 可能也參與細胞週期調控,方式是作為 polo kinase kinase,促進 PLK1 磷酸化。相關磷酸化已在體外觀察到,但其是否在體內發生仍需更多證據;因此,STK10 對 PLK1 的作用及其細胞週期意義目前仍帶有不確定性,不能視為已在生理情境中確立的功能。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 172188224 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>STK10 ENST00000176763 GRCh38 chr5:172188124-172189224 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTCCTTAGATTCAGGTAAAAGCATGTTATAACCGTCTATAGGACAAACAGGCAACAGTAGCAGTGAAGTG
ACTCAAGTAGCCAGGATCGAGAATGAAGGTGCTCAAAGAAGACTTTAGTTTGATCTGTATGTAGTGCGCT
CATCTTTTTTGAAACTAGGAAATTAAAAATTAGAATAAAGTTTTTATTTAATATGCAAATACATCCGCAA
ACCCATCAGGAAACATAAGAGAAATCAGTGCCAAAGGAGCTCTTTCTCCCAGCCCTCTAATCCTGGCAGG
TTTGTGGATCGTGGACGGGGAGCCCCTGGAAAGGACCGCGCCGGGAAGCCGGGCCCTGCAGGGACTGGCC
GCGGCTGCACCGGCGTTGCCCGTCGCACACTAGGAGGCAGCACCGCGCCGAGGAACCCGCAGCAGACGGG
CAGCCAGCGTGTGTGCCTGGGGCGAGTGCCCTCGCCTGCCGGCGTCCCCATCGGAAAAGTGGGGGCGAGG
GCAGCCTAGCGGAATAGCTGCGGGAGGATTAAATGAACGAGTGCAGGTTCACCTTCTGGGCGCTGACAAC
GATCCGTGGGCTCTCGCGAAATGCCAAGTCGCCGTCCCGCTTGCTCCCATAAAAGTTTTGGGAGCCACGC
GGCGCGGCGGGCGGGCTCCTGAGTCCATGAGCGGTCCCACCGAGCGGTCCCCGAAGCTTCCCCAAAGCCC
AGCCCGCGGCTCGCGGAGCGTGGTGTGGGGGGACTACAGTTTCCAGAGTGCCCTGCGGCGACGGGCGGAG
CCGGGGAGCGCCCGCAGCCAATTAGGGGGTCCCGGGGCTCTGCCGGGGAGCGGCGGGTGGAGCCGGGCCG
GTGGGCGGGCGCGGGGACGGTCCCCTGGAACGGGTCCGAGGCTCTCGCAGGCAGGGCTGGGCCGGGCAGG
AGCTGCGAGGCCGGCACAAGGGAGGCGGCCCTGGGGACCTGACAGGGCGGGGGCGGGGGCGGGCACGCCG
CCGCCTGCGCGGTTCCGGGTGCTCCCGGCGCGGCGCTGCCCAGGGCACACTTGACCGAGGTCGGGCTGCG
GGGAAAGGCGGGTCTGGGGAGAACCCCGAGAGACGCGGCGTCCTCCAACTC
STK10 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
STK10_1 ↗5:172,188,196負股172,188,186–172,188,245
STK10_2 ↗5:172,188,336負股172,188,326–172,188,385

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR5_94JC94 · enhancer · 172184927–172185284 · regulatory

ENSR5_B396M5 · enhancer · 172185492–172186057 · regulatory

ENSR5_CM4BN · enhancer · 172186532–172188213 · regulatory

ENSR5_53HHHN5 · CTCF_binding_site · 172187874–172187895 · regulatory

ENSR5_94JCB3 · promoter · 172188214–172188714 · regulatory

ENSR5_53HHHSK · CTCF_binding_site · 172188832–172188853 · regulatory

· motif · 172184611–172184624 · motif

· motif · 172184909–172184931 · motif

· motif · 172184909–172184931 · motif

· motif · 172185076–172185089 · motif

· motif · 172185076–172185089 · motif

· motif · 172185515–172185537 · motif

· motif · 172185515–172185537 · motif

· motif · 172185622–172185639 · motif

· motif · 172185771–172185782 · motif

· motif · 172185840–172185855 · motif

· motif · 172185936–172185949 · motif

· motif · 172185938–172185949 · motif

· motif · 172185940–172185949 · motif

· motif · 172186195–172186206 · motif

· motif · 172186197–172186206 · motif

· motif · 172187630–172187639 · motif

· motif · 172187655–172187668 · motif

· motif · 172187723–172187734 · motif

· motif · 172187876–172187892 · motif

· motif · 172187882–172187897 · motif

· motif · 172187920–172187933 · motif

· motif · 172187933–172187955 · motif

· motif · 172187933–172187955 · motif

· motif · 172187936–172187945 · motif

· motif · 172188090–172188107 · motif

· motif · 172188230–172188247 · motif

· motif · 172188238–172188251 · motif

· motif · 172188252–172188265 · motif

· motif · 172188258–172188271 · motif

· motif · 172188276–172188289 · motif

· motif · 172188364–172188377 · motif

· motif · 172188834–172188850 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:968 aa

1 aa968 aa結構域功能區域
依 O94804 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

STK10 蛋白長 968 個胺基酸,屬於 protein kinase 超家族的 STE Ser/Thr protein kinase 家族與 STE20 亞家族。其 protein kinase 結構域位於第 36–294 位胺基酸,activation segment 位於第 175–224 位。另有多段區域被註記為無序,包括第 337–411、425–490、668–690、827–865、910–929 及 944–968 位胺基酸。

結構域Protein kinase36–294 aa
功能區域Activation segment175–224 aa
功能區域Disordered337–411 aa
功能區域Disordered425–490 aa
功能區域Disordered668–690 aa
功能區域Disordered827–865 aa
功能區域Disordered910–929 aa
功能區域Disordered944–968 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2J7T…

PDB · 2J7T

X-ray · 2.00 A · A=18-317

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

STK10 被註記為細胞膜上的周邊膜蛋白;來源未提供其定位隨條件改變或不同異構型之間差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
LOKSTK10
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

STK10 可形成同源二聚體,且同源二聚化是其 activation segment 發生自體磷酸化所必需。這是蛋白質組裝與活化相關的證據;來源未指出其他結合夥伴或複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

來源將 STK10 與睪丸生殖細胞腫瘤(TGCT)列為疾病關聯,並指出影響該基因的變異可能造成此病,但未提供特定變異或因果機制。TGCT 約占男性睪丸腫瘤的 95%,涵蓋多種病理亞型,包括 seminoma、embryonal carcinoma、yolk sac tumor、choriocarcinoma 與 teratoma 等。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能STK10 是絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶,參與淋巴球移動調控,並可藉由磷酸化 MSN 等 ERM 蛋白發揮作用。它是 MAP3K1/MEKK1 的負向調節因子。STK10 也可能作為 polo kinase kinase 參與細胞週期調控,並在體外促進 PLK1 磷酸化;此作用是否在體內發生仍需更多證據。含實驗來源
證據與來源

Serine/threonine-protein kinase involved in regulation of lymphocyte migration. Phosphorylates MSN, and possibly PLK1. Involved in regulation of lymphocyte migration by mediating phosphorylation of ERM proteins such as MSN. Acts as a negative regulator of MAP3K1/MEKK1. May also act as a cell cycle regulator by acting as a polo kinase kinase: mediates phosphorylation of PLK1 in vitro; however such data require additional evidence in vivo

PMID 11903060 ↗ · PMID 12639966 ↗ · PMID 19255442 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+)含實驗來源
證據與來源

L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+)

PMID 18239682 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+)含實驗來源
證據與來源

L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+)

PMID 18239682 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用STK10 可形成同源二聚體,而同源二聚化是 activation segment 自體磷酸化所必需的。含實驗來源
證據與來源

Homodimer; homodimerization is required for activation segment autophosphorylation

PMID 18239682 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位STK10 位於細胞膜,並被註記為周邊膜蛋白。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Peripheral membrane protein

PMID 19255442 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯來源指出,影響 STK10 的變異可能造成睪丸生殖細胞腫瘤(TGCT),但未列出特定變異。TGCT 約占男性所有睪丸腫瘤的 95%,病理亞型包括未分類的曲細精管內生殖細胞腫瘤、seminoma(含有合體滋養層細胞者)、精母細胞型 seminoma、胚胎癌、卵黃囊瘤、絨毛膜癌及畸胎瘤。含實驗來源
證據與來源

Testicular germ cell tumor TGCT A common malignancy in males representing 95% of all testicular neoplasms. TGCTs have various pathologic subtypes including: unclassified intratubular germ cell neoplasia, seminoma (including cases with syncytiotrophoblastic cells), spermatocytic seminoma, embryonal carcinoma, yolk sac tumor, choriocarcinoma, and teratoma. The disease may be caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 273300

PMID 16175573 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000176763 · 5,892 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCTCCCGGCGCGGCGCTGCCCAGGGCACACTTGACCGAGG40
41TCGGGCTGCGGGGAAAGGCGGGTCTGGGGAGAACCCCGAG80
81AGACGCGGCGTCCTCCAACTCCTCCTCCTTCTCCTCGCGG120
121CCGCCGAAGCCACAGCCCGAGCCCGAGCCCGAGCCCGAGC160
161CGGCGCCACCGCGCCCCCGGCCATGGCTTTTGCCAATTTC200
201CGCCGCATCCTGCGCCTGTCTACCTTCGAGAAGAGAAAGT240
241CCCGCGAATATGAGCACGTCCGCCGCGACCTGGACCCCAA280
281CGAGGTGTGGGAGATCGTGGGCGAGCTGGGCGACGGCGCC320
321TTCGGCAAGGTTTACAAGGCCAAGAATAAGGAGACGGGTG360
361CTTTGGCTGCGGCCAAAGTCATTGAAACCAAGAGTGAGGA400
401GGAGCTGGAGGACTACATCGTGGAGATTGAGATCCTGGCC440
441ACCTGCGACCACCCCTACATTGTGAAGCTCCTGGGAGCCT480
481ACTATCACGACGGGAAGCTGTGGATCATGATTGAGTTCTG520
521TCCAGGGGGAGCCGTGGACGCCATCATGCTGGAGCTGGAC560
561AGAGGCCTCACGGAGCCCCAGATACAGGTGGTTTGCCGCC600
601AGATGCTAGAAGCCCTCAACTTCCTGCACAGCAAGAGGAT640
641CATCCACCGAGATCTGAAAGCTGGCAACGTGCTGATGACC680
681CTCGAGGGAGACATCAGGCTGGCTGACTTTGGTGTGTCTG720
721CCAAGAATCTGAAGACTCTACAGAAACGAGATTCCTTCAT760
761CGGCACGCCTTACTGGATGGCCCCCGAGGTGGTCATGTGT800
801GAGACCATGAAAGACACGCCCTACGACTACAAAGCCGACA840
841TCTGGTCCCTGGGCATCACGCTGATTGAGATGGCCCAGAT880
881CGAGCCGCCACACCACGAGCTCAACCCCATGCGGGTCCTG920
921CTAAAGATCGCCAAGTCGGACCCTCCCACGCTGCTCACGC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。