演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

STIP1HOP

stress induced phosphoprotein 1

STIP1 編碼 STIP1/HOP 家族的蛋白質,作為 HSP90AA1 的共同伴護蛋白,並協助 HSPA8/HSC70 與 HSP90 形成關聯。

Homo sapiens11q13.1UniProt P31948
OFFICIAL SYMBOL
STIP1
CHROMOSOME
11
UNIPROT
P31948
PDB / ALPHAFOLD
7KW7
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

STIP1(stress induced phosphoprotein 1)是蛋白質編碼基因,產物屬於 STIP1/HOP family。其蛋白質含多個 TPR 重複序列,並具有 STI1 1 與 STI1 2 結構域;這些結構特色構成其分子架構。來源將 STIP1 描述為共同伴護蛋白,並指出它與分子伴護蛋白 HSP90AA1、HSPA8/HSC70 有關。

Official symbol
STIP1
Gene name
stress induced phosphoprotein 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11387
UniProt
P31948
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HOPSTI1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111q13.1
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegSTIP1pq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr11:64,185,272–64,204,549
Gene span
19,278 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000305218 ★64,186,171–64,204,54314
ENST0000035879464,185,272–64,204,54314
ENST0000093970764,186,144–64,204,5458
ENST0000090252164,186,149–64,204,54114
ENST0000090252264,186,153–64,204,54112
ENST0000093970864,186,160–64,204,54814
ENST0000090252364,186,171–64,204,54814
ENST0000090252464,186,171–64,204,54711
ENST0000110036564,186,171–64,204,54614
ENST0000110036664,186,176–64,204,5482
ENST0000110036864,186,178–64,204,54514
ENST0000113013964,186,178–64,198,2458

顯示 12/23 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

STIP1 的來源所述角色是共同伴護蛋白(co-chaperone),與 HSP90AA1 的作用相關。共同伴護蛋白並非此處所述的分子伴護蛋白本身;資料指出 STIP1 也會介導分子伴護蛋白 HSPA8/HSC70 與 HSP90 之間的關聯,將兩者的關聯列為其功能之一。

對 HSP90AA1 的共同伴護作用有文獻支持;至於介導 HSPA8/HSC70 與 HSP90 關聯的描述,來源標示為 By similarity,因此應視為相似性推論,而非在此處作為已直接確立的結果。來源未進一步提供相關作用的實驗條件、具體分子步驟或下游生物學結果,故無法據此延伸說明其調控機制或生理效應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 64186171 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>STIP1 ENST00000305218 GRCh38 chr11:64185171-64186271 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGATTCAGTTCTTCGTCTCCTTCACTCCTTTACATCGGACTCACGAGGGCTGAGGGGCAGCTCCCTTTCG
TTAAGTGCTTCCCGCGTGCTCAACACCGCACGAATTCCCCTCGGCCCTACAGGACCAAACGACCGGCGCG
CTGAGAAAGGGTGTGCGGTTCCACTGAGGACGCCCAAGCGGGACAGCCGGGCCCGCCGCGGTGAGATCCC
CGGCCTGTCCAGCCCAAGCCCAAGCGCCCTCGCGGTCACGTGGCATTTCCGGAACATTCAGAACCTAACA
GCCAGGAGGCAGGAGGGCCGGGCCGAGGCCGGAGCGCTGGACAACGCGGGTAGCTGGCGCTCGAGGGACA
GGCAGCTCCCACCGGCTAGGACCCCCATCCCGATGCGCGGGCGAAGGGCTGGGGCCCTGTGCCGCTGGCG
ATCCCGGGGACCGCCTGGAACTCGCGGCACTCGGGAGCGAGAGGGAAAGCAACCCAGAGGCCCCGCAGCC
GCCGGCGACACAGCTACAGACCCCGACTGCAGCCGGTACTCCCATATATCAGGGGCGGGGCGAAACCCGG
CCTTTTGAAGGGCAGCGATTTAAACCAATCAGCGCAAAGAGTTGGCAACCCTCCGCCCAATTGGAATCGC
TCTCATTCTGAAGGCGGTTCCGACATGGAGTCCGGCAGCCCAATGGGAGAGGTGGAAATTTCCAGAACGA
TCAGAACCAATGGGCGCGGCCAGCGCGGCTACGATTGGCAGTGCAAAAGACCAATCCGTGTCGCAGAAGT
TCGCTCCTCCCTCCATTCGTGGAGCCTGAGATGGGTGGGTTTATAGAGGAGCGCCCAATCCTGAGGTGCG
GGGGAGGCAGGGTTGAGGGAATTACTCCCCGCTGTCCAATGAGAAGGAAGTGGAGATGATGGGCTGGACC
TCAAGCCAATAGTAGAGCAGCACAGACATTCCCCCTAGAAGAACTCGACCAGTGAGCAGGCGAGGAAGGG
GCGGGAGCCGGGGTCCCGGTAGCTTCTAGTAGGTTCCAGAAGGCGGCGCGTGCGGTTGGGAACGCGGAGC
GGACGGATTCGATTCAACGGGGTTCCGGACCGCGCTGCGCTATGGAGCAGG
STIP1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
STIP1_1 ↗11:64,186,204正股64,186,155–64,186,214

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR11_BGPWG · enhancer · 64180743–64181666 · regulatory

ENSR11_9XGS6 · promoter · 64181667–64182167 · regulatory

ENSR11_9XGT3 · promoter · 64184782–64185282 · regulatory

ENSR11_9XGT6 · enhancer · 64185283–64185660 · regulatory

ENSR11_BGPX6 · promoter · 64185661–64186235 · regulatory

ENSR11_5K4LTB · CTCF_binding_site · 64186182–64186203 · regulatory

ENSR11_BGPX9 · enhancer · 64186236–64187168 · regulatory

ENSR11_5K4LWM · CTCF_binding_site · 64186472–64186493 · regulatory

· motif · 64181717–64181726 · motif

· motif · 64181717–64181726 · motif

· motif · 64185415–64185424 · motif

· motif · 64185415–64185424 · motif

· motif · 64185424–64185433 · motif

· motif · 64185424–64185435 · motif

· motif · 64185621–64185641 · motif

· motif · 64185711–64185721 · motif

· motif · 64185880–64185890 · motif

· motif · 64185884–64185901 · motif

· motif · 64185971–64185981 · motif

· motif · 64186005–64186018 · motif

· motif · 64186105–64186115 · motif

· motif · 64186147–64186157 · motif

· motif · 64186184–64186200 · motif

· motif · 64186191–64186208 · motif

· motif · 64186276–64186286 · motif

· motif · 64186281–64186291 · motif

· motif · 64186474–64186490 · motif

· motif · 64188663–64188671 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:543 aa

1 aa543 aa結構域功能區域基序重複區
依 P31948 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

STIP1 蛋白質長 543 個胺基酸,屬於 STIP1/HOP family。序列包含九個 TPR 重複區,分布於 N 端及中、後段,另有 STI1 1 與 STI1 2 兩個結構域。第 192–233 位胺基酸區段註記為無序區;第 222–239 位則有雙部核定位訊號註記。

重複區TPR 14–37 aa
重複區TPR 238–71 aa
重複區TPR 372–105 aa
結構域STI1 1130–169 aa
重複區TPR 4225–258 aa
重複區TPR 5259–292 aa
重複區TPR 6300–333 aa
重複區TPR 7360–393 aa
重複區TPR 8394–427 aa
重複區TPR 9428–461 aa
結構域STI1 2492–531 aa
功能區域Disordered192–233 aa
基序Bipartite nuclear localization signal222–239 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7KW7…

PDB · 7KW7

EM · 3.57 A · E=1-543

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Nucleus;Dynein axonemal particle

STIP1 的定位註記包括細胞質、細胞核及 dynein axonemal particle。 來源未提供定位變化的條件、動態或異構型差異,因此不據此推定其轉位方式。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Dynein axonemal particle。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 22 個夥伴 · 最多顯示 50 個
HOPSTIP1ACDADALC3orf36CAPN5CCDC117CDC37L1CDS2EGFREML1ERBB2FAM9AFOXD4L6GABPB1HSP90AB1MYCPOLA2PPP5CRBBP4SPRY4TERF1TP53TRAF5
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 22 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

STIP1 可能參與由 HSP90、HSP70、STIP1/HOP、CDC37、PPP5C、PTGES3/p23、TSC1 與客戶蛋白 TSC2 組成的複合體;另有相似性資料記載其與 HSPA8/HSC70、HSPCA/HSP-86 及 HSPCB/HSP-84 形成複合體。它也與 PACRG、EEF1AKMT3、FLCN、FNIP1、FNIP2 及 HSPA8/HSC70 有互作記載。STIP1 與 HSP90/HSP90AA1 的互作會使 PPP5C:HSP90AA1 互作解離;與 HSP90AB1 的互作則記載於 SMYD2 依賴的 HSP90AB1 甲基化條件下。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能STIP1 作為 HSP90AA1 的共同伴護蛋白;此外,資料指出它會介導分子伴護蛋白 HSPA8/HSC70 與 HSP90 之間的關聯,但此項描述標示為相似性推論。推論支持
證據與來源

Acts as a co-chaperone for HSP90AA1. Mediates the association of the molecular chaperones HSPA8/HSC70 and HSP90 (By similarity)

PMID 27353360 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用STIP1 可能加入含 HSP90、HSP70、STIP1/HOP、CDC37、PPP5C、PTGES3/p23、TSC1 與 TSC2 的複合體;另有相似性資料記載其與 HSPA8/HSC70、HSPCA/HSP-86、HSPCB/HSP-84 形成複合體。其互作對象還包括 PACRG、EEF1AKMT3、FLCN、FNIP1、FNIP2、HSPA8/HSC70、HSP90/HSP90AA1 及 HSP90AB1。與 HSP90/HSP90AA1 的互作會使 PPP5C:HSP90AA1 解離;HSP90AB1 的互作條件則涉及 SMYD2 依賴的甲基化。含實驗來源
證據與來源

Probably forms a complex composed of chaperones HSP90 and HSP70, co-chaperones STIP1/HOP, CDC37, PPP5C, PTGES3/p23, TSC1 and client protein TSC2. Forms a complex with HSPA8/HSC70, HSPCA/HSP-86 and HSPCB/HSP-84 (By similarity). Interacts with PACRG. Interacts with EEF1AKMT3. Interacts with HSP90/HSP90AA1; the interaction dissociates the PPP5C:HSP90AA1 interaction. Interacts with FLCN, FNIP1 and FNIP2. Interacts with HSPA8/HSC70 (By similarity). Interacts with HSP90AB1; upon SMYD2-dependent HSP90AB1 methylation

PMID 14532270 ↗ · PMID 23349634 ↗ · PMID 24880080 ↗ · PMID 27353360 ↗ · PMID 29127155 ↗ · PMID 9195923 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位STIP1 的定位註記列有細胞質、細胞核,以及 dynein axonemal particle。這些是來源所列的定位資訊;該筆資料沒有交代定位發生的條件、變化方向或動態,也未區分不同異構型。推論支持
證據與來源

Cytoplasm; Nucleus; Dynein axonemal particle

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000305218 · 2,140 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGCTTCTAGTAGGTTCCAGAAGGCGGCGCGTGCGGTTGGG40
41AACGCGGAGCGGACGGATTCGATTCAACGGGGTTCCGGAC80
81CGCGCTGCGCTATGGAGCAGGTCAATGAGCTGAAGGAGAA120
121AGGCAACAAGGCCCTGAGCGTGGGTAACATCGATGATGCC160
161TTACAGTGCTACTCCGAAGCTATTAAGCTGGATCCCCACA200
201ACCACGTGCTGTACAGCAACCGTTCTGCTGCCTATGCCAA240
241GAAAGGAGACTACCAGAAGGCTTATGAGGATGGCTGCAAG280
281ACTGTCGACCTAAAGCCTGACTGGGGCAAGGGCTATTCAC320
321GAAAAGCAGCAGCTCTAGAGTTCTTAAACCGCTTTGAAGA360
361AGCCAAGCGAACCTATGAGGAGGGCTTAAAACACGAGGCA400
401AATAACCCTCAACTGAAAGAGGGTTTACAGAATATGGAGG440
441CCAGGTTGGCAGAGAGAAAATTCATGAACCCTTTCAACAT480
481GCCTAATCTGTATCAGAAGTTGGAGAGTGATCCCAGGACA520
521AGGACACTACTCAGTGATCCTACCTACCGGGAGCTGATAG560
561AGCAGCTACGAAACAAGCCTTCTGACCTGGGCACGAAACT600
601ACAAGATCCCCGGATCATGACCACTCTCAGCGTCCTCCTT640
641GGGGTCGATCTGGGCAGTATGGATGAGGAGGAAGAGATTG680
681CAACACCTCCACCACCACCCCCTCCCAAAAAGGAGACCAA720
721GCCAGAGCCAATGGAAGAAGATCTTCCAGAGAATAAGAAG760
761CAGGCACTGAAAGAAAAAGAGCTGGGGAACGATGCCTACA800
801AGAAGAAAGACTTTGACACAGCCTTGAAGCATTACGACAA840
841AGCCAAGGAGCTGGACCCCACTAACATGACTTACATTACC880
881AATCAAGCAGCGGTATACTTTGAAAAGGGCGACTACAATA920
921AGTGCCGGGAGCTTTGTGAGAAGGCCATTGAAGTGGGGAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。