基因總覽
STIP1(stress induced phosphoprotein 1)是蛋白質編碼基因,產物屬於 STIP1/HOP family。其蛋白質含多個 TPR 重複序列,並具有 STI1 1 與 STI1 2 結構域;這些結構特色構成其分子架構。來源將 STIP1 描述為共同伴護蛋白,並指出它與分子伴護蛋白 HSP90AA1、HSPA8/HSC70 有關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000305218 ★ | 64,186,171–64,204,543 | 14 |
| ENST00000358794 | 64,185,272–64,204,543 | 14 |
| ENST00000939707 | 64,186,144–64,204,545 | 8 |
| ENST00000902521 | 64,186,149–64,204,541 | 14 |
| ENST00000902522 | 64,186,153–64,204,541 | 12 |
| ENST00000939708 | 64,186,160–64,204,548 | 14 |
| ENST00000902523 | 64,186,171–64,204,548 | 14 |
| ENST00000902524 | 64,186,171–64,204,547 | 11 |
| ENST00001100365 | 64,186,171–64,204,546 | 14 |
| ENST00001100366 | 64,186,176–64,204,548 | 2 |
| ENST00001100368 | 64,186,178–64,204,545 | 14 |
| ENST00001130139 | 64,186,178–64,198,245 | 8 |
顯示 12/23 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
STIP1 的來源所述角色是共同伴護蛋白(co-chaperone),與 HSP90AA1 的作用相關。共同伴護蛋白並非此處所述的分子伴護蛋白本身;資料指出 STIP1 也會介導分子伴護蛋白 HSPA8/HSC70 與 HSP90 之間的關聯,將兩者的關聯列為其功能之一。
對 HSP90AA1 的共同伴護作用有文獻支持;至於介導 HSPA8/HSC70 與 HSP90 關聯的描述,來源標示為 By similarity,因此應視為相似性推論,而非在此處作為已直接確立的結果。來源未進一步提供相關作用的實驗條件、具體分子步驟或下游生物學結果,故無法據此延伸說明其調控機制或生理效應。
Promoter 與基因調控
>STIP1 ENST00000305218 GRCh38 chr11:64185171-64186271 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGATTCAGTTCTTCGTCTCCTTCACTCCTTTACATCGGACTCACGAGGGCTGAGGGGCAGCTCCCTTTCG TTAAGTGCTTCCCGCGTGCTCAACACCGCACGAATTCCCCTCGGCCCTACAGGACCAAACGACCGGCGCG CTGAGAAAGGGTGTGCGGTTCCACTGAGGACGCCCAAGCGGGACAGCCGGGCCCGCCGCGGTGAGATCCC CGGCCTGTCCAGCCCAAGCCCAAGCGCCCTCGCGGTCACGTGGCATTTCCGGAACATTCAGAACCTAACA GCCAGGAGGCAGGAGGGCCGGGCCGAGGCCGGAGCGCTGGACAACGCGGGTAGCTGGCGCTCGAGGGACA GGCAGCTCCCACCGGCTAGGACCCCCATCCCGATGCGCGGGCGAAGGGCTGGGGCCCTGTGCCGCTGGCG ATCCCGGGGACCGCCTGGAACTCGCGGCACTCGGGAGCGAGAGGGAAAGCAACCCAGAGGCCCCGCAGCC GCCGGCGACACAGCTACAGACCCCGACTGCAGCCGGTACTCCCATATATCAGGGGCGGGGCGAAACCCGG CCTTTTGAAGGGCAGCGATTTAAACCAATCAGCGCAAAGAGTTGGCAACCCTCCGCCCAATTGGAATCGC TCTCATTCTGAAGGCGGTTCCGACATGGAGTCCGGCAGCCCAATGGGAGAGGTGGAAATTTCCAGAACGA TCAGAACCAATGGGCGCGGCCAGCGCGGCTACGATTGGCAGTGCAAAAGACCAATCCGTGTCGCAGAAGT TCGCTCCTCCCTCCATTCGTGGAGCCTGAGATGGGTGGGTTTATAGAGGAGCGCCCAATCCTGAGGTGCG GGGGAGGCAGGGTTGAGGGAATTACTCCCCGCTGTCCAATGAGAAGGAAGTGGAGATGATGGGCTGGACC TCAAGCCAATAGTAGAGCAGCACAGACATTCCCCCTAGAAGAACTCGACCAGTGAGCAGGCGAGGAAGGG GCGGGAGCCGGGGTCCCGGTAGCTTCTAGTAGGTTCCAGAAGGCGGCGCGTGCGGTTGGGAACGCGGAGC GGACGGATTCGATTCAACGGGGTTCCGGACCGCGCTGCGCTATGGAGCAGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| STIP1_1 ↗ | 11:64,186,204 | 正股 | 64,186,155–64,186,214 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR11_BGPWG · enhancer · 64180743–64181666 · regulatory
ENSR11_9XGS6 · promoter · 64181667–64182167 · regulatory
ENSR11_9XGT3 · promoter · 64184782–64185282 · regulatory
ENSR11_9XGT6 · enhancer · 64185283–64185660 · regulatory
ENSR11_BGPX6 · promoter · 64185661–64186235 · regulatory
ENSR11_5K4LTB · CTCF_binding_site · 64186182–64186203 · regulatory
ENSR11_BGPX9 · enhancer · 64186236–64187168 · regulatory
ENSR11_5K4LWM · CTCF_binding_site · 64186472–64186493 · regulatory
· motif · 64181717–64181726 · motif
· motif · 64181717–64181726 · motif
· motif · 64185415–64185424 · motif
· motif · 64185415–64185424 · motif
· motif · 64185424–64185433 · motif
· motif · 64185424–64185435 · motif
· motif · 64185621–64185641 · motif
· motif · 64185711–64185721 · motif
· motif · 64185880–64185890 · motif
· motif · 64185884–64185901 · motif
· motif · 64185971–64185981 · motif
· motif · 64186005–64186018 · motif
· motif · 64186105–64186115 · motif
· motif · 64186147–64186157 · motif
· motif · 64186184–64186200 · motif
· motif · 64186191–64186208 · motif
· motif · 64186276–64186286 · motif
· motif · 64186281–64186291 · motif
· motif · 64186474–64186490 · motif
· motif · 64188663–64188671 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:543 aa
STIP1 蛋白質長 543 個胺基酸,屬於 STIP1/HOP family。序列包含九個 TPR 重複區,分布於 N 端及中、後段,另有 STI1 1 與 STI1 2 兩個結構域。第 192–233 位胺基酸區段註記為無序區;第 222–239 位則有雙部核定位訊號註記。
蛋白質三維結構
細胞內定位
STIP1 的定位註記包括細胞質、細胞核及 dynein axonemal particle。 來源未提供定位變化的條件、動態或異構型差異,因此不據此推定其轉位方式。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Dynein axonemal particle。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 22 個夥伴
- ACDQ96AP0 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ADALQ6DHV7-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- C3orf36Q3SXR2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CAPN5O15484 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCDC117Q8IWD4 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- CDC37L1Q7L3B6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CDS2O95674 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EGFRP00533 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EML1O00423 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ERBB2P04626 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- FAM9AQ8IZU1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FOXD4L6Q3SYB3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GABPB1Q06547-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSP90AB1P08238 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- MYCP01106 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- POLA2Q14181 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PPP5CP53041 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- RBBP4Q09028 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SPRY4Q9C004 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TERF1P54274-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TP53P04637 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- TRAF5O00463 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
STIP1 可能參與由 HSP90、HSP70、STIP1/HOP、CDC37、PPP5C、PTGES3/p23、TSC1 與客戶蛋白 TSC2 組成的複合體;另有相似性資料記載其與 HSPA8/HSC70、HSPCA/HSP-86 及 HSPCB/HSP-84 形成複合體。它也與 PACRG、EEF1AKMT3、FLCN、FNIP1、FNIP2 及 HSPA8/HSC70 有互作記載。STIP1 與 HSP90/HSP90AA1 的互作會使 PPP5C:HSP90AA1 互作解離;與 HSP90AB1 的互作則記載於 SMYD2 依賴的 HSP90AB1 甲基化條件下。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | STIP1 作為 HSP90AA1 的共同伴護蛋白;此外,資料指出它會介導分子伴護蛋白 HSPA8/HSC70 與 HSP90 之間的關聯,但此項描述標示為相似性推論。 | 推論支持 | 證據與來源Acts as a co-chaperone for HSP90AA1. Mediates the association of the molecular chaperones HSPA8/HSC70 and HSP90 (By similarity) PMID 27353360 ↗ |
| 交互作用 | STIP1 可能加入含 HSP90、HSP70、STIP1/HOP、CDC37、PPP5C、PTGES3/p23、TSC1 與 TSC2 的複合體;另有相似性資料記載其與 HSPA8/HSC70、HSPCA/HSP-86、HSPCB/HSP-84 形成複合體。其互作對象還包括 PACRG、EEF1AKMT3、FLCN、FNIP1、FNIP2、HSPA8/HSC70、HSP90/HSP90AA1 及 HSP90AB1。與 HSP90/HSP90AA1 的互作會使 PPP5C:HSP90AA1 解離;HSP90AB1 的互作條件則涉及 SMYD2 依賴的甲基化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Probably forms a complex composed of chaperones HSP90 and HSP70, co-chaperones STIP1/HOP, CDC37, PPP5C, PTGES3/p23, TSC1 and client protein TSC2. Forms a complex with HSPA8/HSC70, HSPCA/HSP-86 and HSPCB/HSP-84 (By similarity). Interacts with PACRG. Interacts with EEF1AKMT3. Interacts with HSP90/HSP90AA1; the interaction dissociates the PPP5C:HSP90AA1 interaction. Interacts with FLCN, FNIP1 and FNIP2. Interacts with HSPA8/HSC70 (By similarity). Interacts with HSP90AB1; upon SMYD2-dependent HSP90AB1 methylation PMID 14532270 ↗ · PMID 23349634 ↗ · PMID 24880080 ↗ · PMID 27353360 ↗ · PMID 29127155 ↗ · PMID 9195923 ↗ |
| 細胞定位 | STIP1 的定位註記列有細胞質、細胞核,以及 dynein axonemal particle。這些是來源所列的定位資訊;該筆資料沒有交代定位發生的條件、變化方向或動態,也未區分不同異構型。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGCTTCTAGTAGGTTCCAGAAGGCGGCGCGTGCGGTTGGG40AACGCGGAGCGGACGGATTCGATTCAACGGGGTTCCGGAC80CGCGCTGCGCTATGGAGCAGGTCAATGAGCTGAAGGAGAA120AGGCAACAAGGCCCTGAGCGTGGGTAACATCGATGATGCC160TTACAGTGCTACTCCGAAGCTATTAAGCTGGATCCCCACA200ACCACGTGCTGTACAGCAACCGTTCTGCTGCCTATGCCAA240GAAAGGAGACTACCAGAAGGCTTATGAGGATGGCTGCAAG280ACTGTCGACCTAAAGCCTGACTGGGGCAAGGGCTATTCAC320GAAAAGCAGCAGCTCTAGAGTTCTTAAACCGCTTTGAAGA360AGCCAAGCGAACCTATGAGGAGGGCTTAAAACACGAGGCA400AATAACCCTCAACTGAAAGAGGGTTTACAGAATATGGAGG440CCAGGTTGGCAGAGAGAAAATTCATGAACCCTTTCAACAT480GCCTAATCTGTATCAGAAGTTGGAGAGTGATCCCAGGACA520AGGACACTACTCAGTGATCCTACCTACCGGGAGCTGATAG560AGCAGCTACGAAACAAGCCTTCTGACCTGGGCACGAAACT600ACAAGATCCCCGGATCATGACCACTCTCAGCGTCCTCCTT640GGGGTCGATCTGGGCAGTATGGATGAGGAGGAAGAGATTG680CAACACCTCCACCACCACCCCCTCCCAAAAAGGAGACCAA720GCCAGAGCCAATGGAAGAAGATCTTCCAGAGAATAAGAAG760CAGGCACTGAAAGAAAAAGAGCTGGGGAACGATGCCTACA800AGAAGAAAGACTTTGACACAGCCTTGAAGCATTACGACAA840AGCCAAGGAGCTGGACCCCACTAACATGACTTACATTACC880AATCAAGCAGCGGTATACTTTGAAAAGGGCGACTACAATA920AGTGCCGGGAGCTTTGTGAGAAGGCCATTGAAGTGGGGAG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。