基因總覽
STIL 是蛋白質編碼基因，產物為 STIL centriolar assembly protein。此蛋白質參與胚胎發育及細胞生長、增殖，並與中心粒複製和有絲分裂進程相關。其功能也涉及 sonic hedgehog pathway，以及 PLK4 驅動的細胞骨架重組與定向細胞移動。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000371877 ★ | 47,250,139–47,314,147 | 17 |
| ENST00000360380 | 47,250,139–47,314,211 | 18 |
| ENST00000337817 | 47,250,139–47,314,892 | 19 |
| ENST00000682977 | 47,250,139–47,314,176 | 18 |
| ENST00000396221 | 47,250,139–47,314,176 | 17 |
| ENST00000893432 | 47,250,139–47,314,892 | 16 |
| ENST00000893433 | 47,250,139–47,314,211 | 17 |
| ENST00000893434 | 47,250,139–47,314,211 | 18 |
| ENST00000936918 | 47,250,139–47,314,211 | 17 |
| ENST00000936919 | 47,250,139–47,314,211 | 18 |
| ENST00000936920 | 47,250,139–47,314,211 | 18 |
| ENST00000936921 | 47,250,139–47,314,211 | 18 |
顯示 12/23 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
STIL 參與胚胎發育、細胞生長與增殖。長期抑制 STIL 會影響細胞存活及細胞週期分布，並伴隨 CDK1 活性下降與 CDK1 磷酸化減少。這些觀察顯示 STIL 與細胞週期調控及細胞增殖狀態有關，但來源未進一步說明這些變化之間的因果次序。
在中心粒複製中，STIL 對前中心粒形成的啟動及正常有絲分裂進程十分重要。前中心粒組裝開始時，STIL 必須協助 SASS6 與 CPAP 正確載入前中心粒基部，進而啟動組裝。這項作用將中心粒複製的早期形成步驟與有絲分裂期間的細胞分裂進程連結起來。
STIL 也正向調節 sonic hedgehog pathway，作用位置在 PTCH1 下游。除此之外，STIL 與 PLK4 共同參與調節 PLK4 驅動的細胞骨架重組及定向細胞移動。來源指出這些生物學角色，但未提供足以延伸描述其分子步驟或在不同細胞情境中作用差異的資訊。
Promoter 與基因調控
>STIL ENST00000371877 GRCh38 chr1:47314047-47315147 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGGCCGAGGTGGACGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCT CTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGGCGCCTGTAGTTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGG CAGGAGACTGGCATGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCT GGGCGACAGAGCGAGACTCCGTTTCAAAAAAAAAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGGGTGGTGGACGC CTGTAATACCAGCTAATTGGGAAGCTGAGACAGGAGAATCGCTTGAACTCGGGAGGCGAGGTTGCGGTGA GCCGATATCGCGTCATCGCACTCCAGCTTGGGCGACGGAGTGAGATTCCACCTCAAAAAAAAAAAAAATT ATGTCACTAAAACAGATGGCTTCCTAGGAAAGAAACTGGAAGAAATCTAGAAGTTGAGGATAAGTGATCA CAAAAAGGAAAAATTAAAAATGTACATTTTAGAATAAAAATTAAAAAGTAAGAAACTGGAATAACTCTAA CTTTCTTGTCTTTTGTGCTTTCAGGTAAAGAGTTTGGAAACTGTTCTTCGGGTGTCCGCTTCCAGTCGCC GACCAATGATCATCTTATAGAGCACTTCCGGCTTCATCTGCCACTCGCTCCTCCGTCTACCTAGCTGGGC TTTCCATTGCGCTTGCGGAAAGCCTACCCCGCCCCGGAACTTAACCGTTGACGAAATGAAAGGTTTAAAT CCTCGGATCCTTGATCCTGGAGCGCCGGTGGCGCCCGCAGTTCTCCAAGAAGACTTGGGATTGGTCGAGC GCGGAACCAGTGCGGGGCGCTGATTGGTCGGCACACCAATACGTAACGGCGACCGTGCGCGGCTCTCTAG CACCACCCCCGCTCCCTGACTGGCGAGGTTTCTGACCAGTCAGCAGGCGTGGCGCGGCCTTCAGTTTCGC GAGCTTGTGTTTGCCGCCTCAGTTCCCGCGACCCCAACGTCCCAGAGGCGGGGCCGGAGTCGGCGGTGGC GCTCCTTGGAGCCGGCTCCCGCTCCTACCCTGCAAACAGACCTCAGCTCCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| STIL_1 ↗ | 1:47,314,147 | 負股 | 47,314,137–47,314,196 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_9NR37 · promoter · 47313125–47313625 · regulatory
ENSR1_9NR3H · promoter · 47314137–47314637 · regulatory
ENSR1_9NR3N · promoter · 47314882–47315207 · regulatory
ENSR1_BCDJR · enhancer · 47317779–47318294 · regulatory
· motif · 47309626–47309637 · motif
· motif · 47314032–47314040 · motif
· motif · 47314032–47314049 · motif
· motif · 47314039–47314050 · motif
· motif · 47314039–47314050 · motif
· motif · 47314114–47314124 · motif
· motif · 47314228–47314238 · motif
· motif · 47314412–47314422 · motif
· motif · 47314429–47314440 · motif
· motif · 47314429–47314440 · motif
· motif · 47314482–47314495 · motif
· motif · 47314484–47314495 · motif
· motif · 47314484–47314495 · motif
· motif · 47314486–47314495 · motif
· motif · 47314746–47314761 · motif
STIL 的表現量與細胞增殖及細胞週期階段有關：細胞停止增殖時，其表現下調；在 G2 期累積，並於細胞週期完成時下降。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1287 aa
STIL centriolar assembly protein 長 1,287 個胺基酸。註解指出，胺基酸 1–1,018 區段與 RBM14 互作，231–781 區段與 CPAP 互作；584–779 區段為 PIN1 結合區。另有兩段被註記為無序區，分別位於胺基酸 378–417 與 508–533。
蛋白質三維結構
細胞內定位
STIL 位於細胞質溶膠、中心體與中心粒，也可見於細胞皮質及細胞前緣。 來源未提供這些位置隨條件或異構型改變的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- CPAPQ9HC77 · UniProt INTERACTION · 15 experiments
- PLK4O00444 · UniProt INTERACTION · 11 experiments
- SASS6Q6UVJ0 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
STIL 可形成同源二聚體，並與 CPAP、RBM14、PIN1 及 CEP85 互作；與 CPAP 和 SASS6 共同形成複合體。RBM14 與 STIL 的互作會干擾 STIL–CPAP 互作。STIL 經由 N 端與 CEP85 互作，這對 STIL 有效定位至中心粒及後續 PLK4 活化是必要的。STIL 與 PIN1 的互作涉及 PIN1 的 WW domain，且依賴 STIL 的有絲分裂期磷酸化；此項描述標示為相似性推論。
疾病與遺傳關聯
STIL 相關變異可造成初級常染色體隱性小頭症 7（MCPH7）；此病的特徵包括頭圍低於同齡平均值三個標準差以上、腦重量明顯減少及大腦皮質比例偏小，患者可有輕至重度智能障礙。另有報告指出，涉及 STIL 的染色體異常可能是部分 T 細胞急性淋巴性白血病（T-ALL）的原因之一。1p32 區域 STIL 與 TAL1 之間的缺失可形成 STIL/TAL1 融合 mRNA，預測使全長 TAL1 受 STIL 啟動子控制而不適當表現；兒童 T-ALL 中此類融合與良好預後相關。健康成人培養淋巴球在培養 7 天後也可能檢出該融合 mRNA。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | STIL 是即早反應基因，參與胚胎發育、細胞生長與增殖；長期抑制會影響細胞存活和細胞週期分布，並伴隨 CDK1 活性及磷酸化下降。它在 PTCH1 下游正向調節 sonic hedgehog pathway，也參與中心粒複製、前中心粒形成啟動及正常有絲分裂。前中心粒形成期間，STIL 對 SASS6 和 CPAP 正確載入前中心粒基部、啟動組裝是必要的；它並與 STIL 複合體調節 PLK4 驅動的細胞骨架重組及定向細胞移動。 | 含實驗來源 | 證據與來源Immediate-early gene. Plays an important role in embryonic development as well as in cellular growth and proliferation; its long-term silencing affects cell survival and cell cycle distribution as well as decreases CDK1 activity correlated with reduced phosphorylation of CDK1. Plays a role as a positive regulator of the sonic hedgehog pathway, acting downstream of PTCH1. Plays an important role in the regulation of centriole duplication. Required for the onset of procentriole formation and proper mitotic progression. During procentriole formation, is essential for the correct loading of SASS6 and CPAP to the base of the procentriole to initiate procentriole assembly. In complex with STIL acts as a modulator of PLK4-driven cytoskeletal rearrangements and directional cell motility PMID 16024801 ↗ · PMID 22020124 ↗ · PMID 29712910 ↗ · PMID 32107292 ↗ · PMID 9372240 ↗ |
| 交互作用 | STIL 可形成同源二聚體，並與 PIN1、CPAP、RBM14 及 CEP85 互作，也與 CPAP、SASS6 形成複合體。PIN1 經 WW domain 與 STIL 互作，此關係依賴 STIL 有絲分裂期磷酸化，屬相似性推論。RBM14 互作會干擾 STIL 與 CPAP 的互作；STIL N 端與 CEP85 的互作則是其有效定位至中心粒及後續 PLK4 活化所必要。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. Interacts with PIN1 via its WW domain. This interaction is dependent on STIL mitotic phosphorylation (By similarity). Interacts with CPAP. Interacts with RBM14 and this interaction interferes with the interaction of STIL with CPAP. Forms a complex with CPAP and SASS6. Interacts (via N-terminus) with CEP85; this interaction is essential for efficient centriolar targeting of STIL and subsequent PLK4 activation PMID 22020124 ↗ · PMID 25385835 ↗ · PMID 29712910 ↗ |
| 細胞定位 | STIL 定位於細胞質溶膠、細胞骨架中的微管組織中心、中心體及中心粒，也可位於細胞皮質與細胞前緣。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm, cytosol; Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome, centriole; Cytoplasm, cell cortex; Localizes at the leading edge PMID 22020124 ↗ · PMID 25385835 ↗ · PMID 29712910 ↗ · PMID 32107292 ↗ |
| 調控 | 細胞停止增殖時，STIL 表現下調；其蛋白質在 G2 期累積，並於細胞週期完成時下降。 | 含實驗來源 | 證據與來源Down-regulated when cell proliferation ceased. Accumulates during G2 phase and falls at completion of the cell cycle PMID 9372240 ↗ |
| 疾病關聯 | 涉及 STIL 的染色體異常可能造成部分 T 細胞急性淋巴性白血病。1p32 區域 STIL 與 TAL1 間缺失可產生 STIL/TAL1 融合 mRNA，其中 STIL exon 1 接合 TAL1 exon 3；兩者皆為 5′ 非翻譯外顯子，因此預測可產生受 STIL 啟動子控制的全長 TAL1，造成不適當表現。兒童 T-ALL 中此類融合與良好預後相關；健康成人培養淋巴球培養 7 天後也可能檢出融合 mRNA。 | 含實驗來源 | 證據與來源A chromosomal aberration involving STIL may be a cause of some T-cell acute lymphoblastic leukemias (T-ALL). A deletion at 1p32 between STIL and TAL1 genes leads to STIL/TAL1 fusion mRNA with STIL exon 1 splicing to TAL1 exon 3. As both STIL exon 1 and TAL1 exon 3 are 5'-untranslated exons, STIL/TAL1 fusion mRNA predicts a full-length TAL1 protein under the control of the STIL promoter, leading to inappropriate TAL1 expression. In childhood T-cell malignancies (T-ALL), a type of defect such as STIL/TAL1 fusion is associated with a good prognosis. In cultured lymphocytes from healthy adults, STIL/TAL1 fusion mRNA may be detected after 7 days of culture PMID 11390401 ↗ · PMID 12681356 ↗ · PMID 1311214 ↗ · PMID 14504110 ↗ · PMID 1922059 ↗ · PMID 2209547 ↗ · PMID 2255914 ↗ |
| 疾病關聯 | 初級常染色體隱性小頭症 7（MCPH7）由影響此基因的變異造成，特徵為頭圍低於同齡平均值三個標準差以上、腦重量明顯減少及大腦皮質比例偏小，但腦回模式相對保留，皮質結構沒有重大異常。患者可有輕至重度智能障礙；此初級小頭症不伴隨其他症候群特徵，也沒有退化性腦病造成的顯著神經缺損。 | 含實驗來源 | 證據與來源Microcephaly 7, primary, autosomal recessive MCPH7 A disease defined as a head circumference more than 3 standard deviations below the age-related mean. Brain weight is markedly reduced and the cerebral cortex is disproportionately small. Despite this marked reduction in size, the gyral pattern is relatively well preserved, with no major abnormality in cortical architecture. Affected individuals have mild to severe intellectual disability. Primary microcephaly is further defined by the absence of other syndromic features or significant neurological deficits due to degenerative brain disorder. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 612703 PMID 19215732 ↗ · PMID 22989186 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTTCCCGCGACCCCAACGTCCCAGAGGCGGGGCCGGAGT40CGGCGGTGGCGCTCCTTGGAGCCGGCTCCCGCTCCTACCC80TGCAAACAGACCTCAGCTCCGCGGAAGTTGCGGATACTGA120GGATTTGGAATTAAAGAAATCATTCACCAGACATCATGGA160GCCTATATATCCTTTTGCACGGCCCCAGATGAATACCAGG200TTTCCTTCAAGCAGGATGGTACCTTTCCACTTTCCTCCAT240CAAAATGTGCACTTTGGAACCCAACGCCAACTGGAGATTT280CATCTACTTACATCTCAGTTACTACAGAAATCCAAAGCTT320GTGGTGACTGAGAAGACCATCCGACTTGCTTATCGTCATG360CTAAGCAGAATAAAAAAAATTCGTCATGCTTTTTACTTGG400TTCTCTGACAGCAGACGAAGATGAAGAAGGTGTAACATTG440ACAGTAGATCGCTTTGATCCTGGTCGAGAAGTACCTGAAT480GCCTAGAAATAACCCCTACTGCTTCTCTTCCTGGGGACTT520TTTGATTCCATGCAAAGTTCATACTCAAGAACTTTGTTCA560AGAGAAATGATAGTTCACAGTGTAGATGACTTCAGTTCAG600CTTTAAAGGCTCTACAGTGCCATATATGTAGCAAAGATTC640CTTGGACTGTGGTAAGCTGCTTTCCCTAAGAGTTCATATC680ACTTCCAGGGAGAGTTTGGACAGTGTGGAATTTGACTTGC720ATTGGGCAGCAGTAACTCTAGCAAATAACTTTAAATGCAC760ACCTGTGAAGCCCATCCCCATTATTCCAACAGCTCTGGCA800AGAAACTTGAGCAGTAATCTGAATATTTCTCAAGTTCAAG840GGACTTATAAATATGGATATCTTACCATGGATGAAACACG880CAAATTGTTACTTTTGTTGGAATCTGATCCCAAGGTTTAT920TCTCTACCATTGGTGGGAATTTGGCTGTCTGGAATTACAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。