基因總覽
STEAP1 的正式名稱為 STEAP family member 1,屬於蛋白質編碼基因,產物屬於 STEAP family。其蛋白質長 339 個胺基酸,具有六段螺旋型跨膜區域,並標註有 Ferric oxidoreductase 結構域。來源指出 STEAP1 缺少結合電子供體 NADPH 的位點;因此,理解其基本性質時,需區分其家族與結構特徵,以及來源所述的實際酵素功能限制。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000297205 ★ | 90,154,469–90,164,827 | 5 |
| ENST00000892309 | 90,154,180–90,164,828 | 6 |
| ENST00000927745 | 90,154,180–90,164,828 | 5 |
| ENST00000927746 | 90,154,180–90,164,828 | 6 |
| ENST00000955230 | 90,154,180–90,164,828 | 5 |
| ENST00001127087 | 90,154,180–90,164,828 | 5 |
| ENST00001129814 | 90,154,180–90,160,215 | 2 |
| ENST00001140902 | 90,154,180–90,164,828 | 5 |
| ENST00000955229 | 90,154,427–90,164,828 | 5 |
| ENST00000955231 | 90,154,427–90,164,828 | 5 |
顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
STEAP1 本身不具金屬還原酶功能。來源將此限制歸因於它缺少可結合電子供體 NADPH 的位點,因此不能單憑其 Ferric oxidoreductase 結構域註解,便推定它能獨立進行金屬還原反應。
在來源所述的實驗條件下,若將 STEAP1 與 STEAP4 的 NADPH 結合結構域融合,融合蛋白可促進 Fe(3+) 還原。這項結果顯示,提供 NADPH 結合能力後,該融合構築物具有促進 Fe(3+) 還原的作用;來源並未將此活性歸為未融合的 STEAP1 本身。
Promoter 與基因調控
>STEAP1 ENST00000297205 GRCh38 chr7:90153469-90154569 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGCTGCACTTAAAAGCTAAGGCAAGGAAGGGAGGGACGGAGTAAACATGGGGTTTAAGGGTTTTTTTTTC GGCTGGGGAGCAGGGTTTGTGCGATTAAAGGTACACAATTTGAACAATTCAGGGAGCAAGTCACTCTCAG AAATTCAGCTTCGGATTCCTCAAACTGTCAATCACAGCCACTTCAGGACCGGCTGTTAGGTTTTAAATAA GGTGGCTGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACGAG GTCAGGAATTCAGGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAATCCCCGTCTCTGCTGAAAATACAAAAATTAGC CGGGCACAGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCG GGGCTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACCGCACTCCAGCCTGGGCAACAGACTGAGACTCCGT CTCAAAAAAAATAAAAATAAAATAAAAATAAATAAGCTAACGTGTGGGAGGGTTTGTAAGCTCTAAACGG TCTATCTCAAAGTGTGATCTGGGAATGCTTCCATATCTCATGGGAACTTGTTACAAATGAGAATCTCAGA CCCCATCCCAGACATACTGAACCGGAAACTGTGGGCGGACAGCCCAACAATCGGTGTTTTAATAAGCCCC CGGGTAATCTTATACACGCTAAAGTCTGAGAACCACTGCTCTAGAGAAATGCACAAACGTTCCTTAGTGG AGATTAAACAAAAGGCGAGGGGTTGGAGGGCGCGAAACGGACCTCAGGTGCAGGGCAGACGGCATTTGAG AGGAAACTGGGAGAGGCCGGAGTGCGACTTGGGGAGTCTTAGCCTCCAAGGACGTTCCGGAACCCTGCGG ACGCGGGGCGCCAGCAGGTGGCGCTGGACGCGCAACGGACAAGGAGGCGGGGCCTGCAGCTGGCTTGGAG GCTCCGCGCTCTGGAGGCTCAGGCGCCGCGTGGGGCCCGCACCTCTGGGCAGCAGCGGCAGCCGAGACTC ACGGTCAAGCTAAGGCGAAGAGTGGGTGAGTCCCTTGAATCGTTCTCACTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| STEAP1_2 ↗ | 7:90,154,186 | 正股 | 90,154,137–90,154,196 |
| STEAP1_1 ↗ | 7:90,154,469 | 正股 | 90,154,420–90,154,479 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_84MK7W · enhancer · 90149537–90149726 · regulatory
ENSR7_5R7HS3 · CTCF_binding_site · 90149979–90150000 · regulatory
ENSR7_84MK9B · enhancer · 90151945–90152153 · regulatory
ENSR7_93BR5W · enhancer · 90152707–90153050 · regulatory
ENSR7_5R7JB5 · CTCF_binding_site · 90152804–90152825 · regulatory
ENSR7_84MKB7 · enhancer · 90153506–90153663 · regulatory
ENSR7_93BR69 · promoter · 90153979–90154479 · regulatory
ENSR7_5R7JKG · CTCF_binding_site · 90154385–90154406 · regulatory
ENSR7_CBXJL · enhancer · 90154480–90155503 · regulatory
ENSR7_BMW4N · enhancer · 90157371–90158286 · regulatory
· motif · 90149981–90149997 · motif
· motif · 90152069–90152083 · motif
· motif · 90152069–90152083 · motif
· motif · 90152076–90152087 · motif
· motif · 90152806–90152822 · motif
· motif · 90154387–90154403 · motif
· motif · 90154486–90154495 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:339 aa
STEAP1 protein 長 339 個胺基酸,屬於 STEAP family。序列註解列出六段螺旋型跨膜區域,分別位於第 71–91、119–139、164–184、218–238、258–278 與 291–311 個胺基酸;另標註第 118–265 個胺基酸為 Ferric oxidoreductase 結構域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
STEAP1 被標註位於細胞膜與胞內體膜,並屬於多次穿膜蛋白。 來源未提供定位變動的條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- STEAP1BQ6NZ63 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
STEAP1 被標註為同源三聚體(homotrimer)。來源未列出其他結合夥伴,也未提供可區分實體結合與功能關係的資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | STEAP1 缺少結合電子供體 NADPH 的位點,因此本身不具金屬還原酶功能。不過,當 STEAP1 與 STEAP4 的 NADPH 結合結構域融合時,融合蛋白可促進 Fe(3+) 還原。 | 含實驗來源 | 證據與來源Does not function as a metalloreductase due to the absence of binding sites for the electron-donating substrate NADPH. Promotes Fe(3+) reduction when fused to the NADPH-binding domain of STEAP4 PMID 32409586 ↗ |
| 交互作用 | Homotrimer | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | STEAP1 被標註為多次穿膜蛋白,定位於胞內體膜及細胞膜;此資料未提供定位改變的條件或異構型差異。 | 含實驗來源 | 證據與來源Endosome membrane / Multi-pass membrane protein; Cell membrane / Multi-pass membrane protein PMID 32409586 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGGCGCCGCGTGGGGCCCGCACCTCTGGGCAGCAGCGGCA40GCCGAGACTCACGGTCAAGCTAAGGCGAAGAGTGGGTGGC80TGAAGCCATACTATTTTATAGAATTAATGGAAAGCAGAAA120AGACATCACAAACCAAGAAGAACTTTGGAAAATGAAGCCT160AGGAGAAATTTAGAAGAAGACGATTATTTGCATAAGGACA200CGGGAGAGACCAGCATGCTAAAAAGACCTGTGCTTTTGCA240TTTGCACCAAACAGCCCATGCTGATGAATTTGACTGCCCT280TCAGAACTTCAGCACACACAGGAACTCTTTCCACAGTGGC320ACTTGCCAATTAAAATAGCTGCTATTATAGCATCTCTGAC360TTTTCTTTACACTCTTCTGAGGGAAGTAATTCACCCTTTA400GCAACTTCCCATCAACAATATTTTTATAAAATTCCAATCC440TGGTCATCAACAAAGTCTTGCCAATGGTTTCCATCACTCT480CTTGGCATTGGTTTACCTGCCAGGTGTGATAGCAGCAATT520GTCCAACTTCATAATGGAACCAAGTATAAGAAGTTTCCAC560ATTGGTTGGATAAGTGGATGTTAACAAGAAAGCAGTTTGG600GCTTCTCAGTTTCTTTTTTGCTGTACTGCATGCAATTTAT640AGTCTGTCTTACCCAATGAGGCGATCCTACAGATACAAGT680TGCTAAACTGGGCATATCAACAGGTCCAACAAAATAAAGA720AGATGCCTGGATTGAGCATGATGTTTGGAGAATGGAGATT760TATGTGTCTCTGGGAATTGTGGGATTGGCAATACTGGCTC800TGTTGGCTGTGACATCTATTCCATCTGTGAGTGACTCTTT840GACATGGAGAGAATTTCACTATATTCAGAGCAAGCTAGGA880ATTGTTTCCCTTCTACTGGGCACAATACACGCATTGATTT920TTGCCTGGAATAAGTGGATAGATATAAAACAATTTGTATG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。