基因總覽
STC2(stanniocalcin 2)是由蛋白質編碼基因 STC2 產生的蛋白質,屬於 stanniocalcin family。現有資料指出,它與鈣、磷恆定有關,並具有降低血鈣的作用。蛋白質全長為 302 個胺基酸;其序列包含 N 端訊號胜肽,另有兩段被註記為無序區域。資料未提供更詳細的家族成員比較或結構資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000265087 ★ | 173,314,723–173,328,414 | 4 |
| ENST00001132045 | 173,314,708–173,328,418 | 4 |
| ENST00001065441 | 173,315,439–173,328,418 | 4 |
| ENST00000520648 | 173,322,969–173,328,053 | 3 |
| ENST00000518455 | 173,323,310–173,326,797 | 3 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
STC2 具有降低血鈣的作用,並參與鈣與磷的恆定。現有資料僅概述其在這兩種礦物質平衡中的作用,未說明作用於哪些細胞或組織、如何影響鈣與磷的調節,也未提供相關生物學過程或實驗條件的細節。因此,依據目前資訊只能描述其整體功能方向,不能進一步推定具體分子機制。
Promoter 與基因調控
>STC2 ENST00000265087 GRCh38 chr5:173328314-173329414 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGAGGAGATGGAGATAACTTCCCCGGATTTAGCTTTTTTGTCTTTGTTTTTGTTCTCACCACTTCCATCG GATGACTGGAGAGTAAAAGGGAACCCGGAGCGGGGTGGCGAGCAGCGCTTTGAGAAAATGCAGGAGTGTG TTTGGAGACGCGTAAAGTTGCCTTTCAAGCTCTGGCCTCCGGGCACGCGATGCTCCGCGGCGGGCTGACT CAGGGCTGCCTTGGGCCTCCCTGCCACCCTCCTGGAAATGATGCAAGTCCTGACTGTCACCTGGATCCCT GCAGCCCAGCCTGGAATGCGTCTGGATTAGGGGAAAGACGAGAAACGACACTCCAGGTGTTGCACGGCCC ACCAAAGCGGGAAGATAGGGCAGTTGCTCAGACCAAATACTGTATCTAGTGCTTCTGCTCCTATCTTCAA TCGTGGGGTTCTTTTTAATGCAAAGTGTCACAAGGCCAGGAATTCCCATGTGTGCTCAGTTGGCCCACAG CATCATTGTGCCTAGGAAACTGCTTCAATTTATCAAGTCCTCTGGGCTGGGAATCTCACTGAATTCCAAA CGGCGGAAAGAGGAAACTTTCCCAACCCGATGTGGGTGTGACGCGAGCCAGGGGCCCCAGGGACACTGTC CCAGAGCACACCGTCCCCCTTTAACAGCAACTGGAGCTTGGATTCGCTCTTATATTGTACAGTCCTTTCG ACCATTGCCCTGGAGCACCCGCACACGCGCACGCATCTCCGGCCGCGCTCACACACACTCATACACACGC ACGCAAACGCGTGGCCGCCGCCAGGTCGGCAACTTTGTCCGGCGCTCCCAGCGGCGCTCGGCTTCCTCCT GTAGTAGTTGAGCGCAGGCCCCGCCTCCCGGCCGTGTTGTCAAAAGGGCCGGGGTCTCGGATTGGTCCAG CCGCCGGGACAACACCTGCTCGACTCCTTCATTCAAGTGACACCAGAGCTTCCAGGGATATTTGAGGCAC CATCCCTGCCATTGCCGGGCACTCGCGGCGCTGCTAACGGCCTGGTCACATGCTCTCCGGAGAGCTACGG GAGGGCGCTGGGTAACCTCTATCCGAGCCGCGGCCGCGAGGAGGAGGGAAA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| STC2_1 ↗ | 5:173,328,414 | 負股 | 173,328,404–173,328,463 |
| STC2_2 ↗ | 5:173,329,565 | 負股 | 173,329,555–173,329,614 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR5_CM7CW · enhancer · 173323508–173325040 · regulatory
ENSR5_CM7D6 · enhancer · 173326375–173328403 · regulatory
ENSR5_874L2S · promoter · 173328404–173328608 · regulatory
ENSR5_94JRJ7 · promoter · 173329228–173329728 · regulatory
ENSR5_CM7DC · enhancer · 173329729–173331110 · regulatory
ENSR5_B39DQZ · enhancer · 173331672–173332447 · regulatory
ENSR5_53HQQTT · CTCF_binding_site · 173332182–173332203 · regulatory
· motif · 173327525–173327538 · motif
· motif · 173327832–173327848 · motif
· motif · 173327832–173327848 · motif
· motif · 173327841–173327850 · motif
· motif · 173327841–173327850 · motif
· motif · 173328131–173328144 · motif
· motif · 173328157–173328169 · motif
· motif · 173328547–173328557 · motif
· motif · 173328790–173328803 · motif
· motif · 173329355–173329370 · motif
· motif · 173329562–173329575 · motif
· motif · 173329779–173329792 · motif
· motif · 173329903–173329913 · motif
· motif · 173329924–173329937 · motif
· motif · 173332037–173332051 · motif
· motif · 173332037–173332051 · motif
· motif · 173332062–173332071 · motif
· motif · 173332062–173332071 · motif
· motif · 173332062–173332071 · motif
· motif · 173332062–173332071 · motif
· motif · 173332112–173332128 · motif
· motif · 173332112–173332128 · motif
· motif · 173332121–173332130 · motif
· motif · 173332184–173332200 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:302 aa
STC2 屬於 stanniocalcin family,全長 302 個胺基酸。其 N 端第 1–24 個胺基酸為訊號胜肽;第 23–44 位與第 217–302 位則分別被註記為無序區域。這些序列特徵來自蛋白質註解,資料未提供其他結構域資訊。
蛋白質三維結構
細胞內定位
STC2 被註記為分泌型蛋白質;資料未提供定位隨條件或異構型而改變的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
STC2 形成由二硫鍵連結的同源二聚體。資料未提供其他結合夥伴或複合體資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
核酸與蛋白質序列
ACTCGCGGCGCTGCTAACGGCCTGGTCACATGCTCTCCGG40AGAGCTACGGGAGGGCGCTGGGTAACCTCTATCCGAGCCG80CGGCCGCGAGGAGGAGGGAAAAGGCGAGCAAAAAGGAAGA120GTGGGAGGAGGAGGGGAAGCGGCGAAGGAGGAAGAGGAGG160AGGAGGAAGAGGGGAGCACAAAGGATCCAGGTCTCCCGAC200GGGAGGTTAATACCAAGAACCATGTGTGCCGAGCGGCTGG240GCCAGTTCATGACCCTGGCTTTGGTGTTGGCCACCTTTGA280CCCGGCGCGGGGGACCGACGCCACCAACCCACCCGAGGGT320CCCCAAGACAGGAGCTCCCAGCAGAAAGGCCGCCTGTCCC360TGCAGAATACAGCGGAGATCCAGCACTGTTTGGTCAACGC400TGGCGATGTGGGGTGTGGCGTGTTTGAATGTTTCGAGAAC440AACTCTTGTGAGATTCGGGGCTTACATGGGATTTGCATGA480CTTTTCTGCACAACGCTGGAAAATTTGATGCCCAGGGCAA520GTCATTCATCAAAGACGCCTTGAAATGTAAGGCCCACGCT560CTGCGGCACAGGTTCGGCTGCATAAGCCGGAAGTGCCCGG600CCATCAGGGAAATGGTGTCCCAGTTGCAGCGGGAATGCTA640CCTCAAGCACGACCTGTGCGCGGCTGCCCAGGAGAACACC680CGGGTGATAGTGGAGATGATCCATTTCAAGGACTTGCTGC720TGCACGAACCCTACGTGGACCTCGTGAACTTGCTGCTGAC760CTGTGGGGAGGAGGTGAAGGAGGCCATCACCCACAGCGTG800CAGGTTCAGTGTGAGCAGAACTGGGGAAGCCTGTGCTCCA840TCTTGAGCTTCTGCACCTCGGCCATCCAGAAGCCTCCCAC880GGCGCCCCCCGAGCGCCAGCCCCAGGTGGACAGAACCAAG920CTCTCCAGGGCCCACCACGGGGAAGCAGGACATCACCTCC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。