基因總覽
STC1 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 stanniocalcin 1,位於人類第 8 號染色體的 8p21.2。其產物 Stanniocalcin-1 屬於 stanniocalcin 家族。現有資料指出,STC1 蛋白質長 247 個胺基酸,並具有位於 N 端的訊號胜肽區段。這些資訊界定了它的家族歸屬與基本序列特徵;其生物學作用則與腎臟磷酸鹽再吸收有關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000290271 ★ | 23,841,929–23,854,806 | 4 |
| ENST00000524323 | 23,841,929–23,854,311 | 4 |
| ENST00001139557 | 23,841,929–23,854,815 | 4 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
STC1 的功能資料指出,stanniocalcin 1 可促進腎臟對磷酸鹽的再吸收。這表示其作用與腎臟處理磷酸鹽的過程有關;來源沒有進一步說明作用於哪一種腎臟細胞、透過何種分子途徑,或此效應如何受到調控,因此不宜延伸推定具體機制。
資料也提出,促進磷酸鹽再吸收可能因此預防高血鈣。這項敘述以「可能」表達推論,並將潛在的預防作用連結至腎臟磷酸鹽再吸收;它並未說明適用的生理條件、作用程度或實驗情境,也不能據此將預防效果描述為已確立的結果。
因此,依目前提供的資訊,STC1 的主要功能重點是促進腎臟磷酸鹽再吸收,而可能的生物學意義是藉此有助於預防高血鈣。來源未提供其他功能、作用機制或生物過程的細節。
Promoter 與基因調控
>STC1 ENST00000290271 GRCh38 chr8:23854706-23855806 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ACTGGTTTCCATTCAGCAGGTTTAGTCTTGCTTTGGCCAGCTTATTGTTTCAAAGTGGTTATAAAGTTGC TGGGCTTGAACACAGATTATTAATTTTCAGGCATTCATGATGTCTCCCTGTTGAGTGTGGTATGTGCAGG TGTGCACATGTGTACCTGGGGTAACTAACACTCCTGGACTATGCAATTTTGCTGGTGACTGAAAAGATGA AGTCAAAGTTGATTTGATTATTGAAGAATCACATTATTTTAGAGGTATACAGAATGTCAGAGTCCAACTT TGGCGTTTTACAGATGGGAAAACGAGGTGGGGCAAGGTAAAAAGACTTAGCCAGAGTCATAGGTTGATCA GTAGGGGGACTAAGGCTTCAGCTCTGAGCTGTCATATCTCAGTCCCCCAAGGCTTTTCCACTCACATAAA TTCCCCCTCAAGGGCTCAAATGTGTGAGTGAGAACCCAGGATGTCCACATACAAACAAAAATGCATCATA GACATGTGAACATGTACACACAGAGAAGATAGGGAGTTATTGCATTTGTAGCCTACAAAACAGAACCGAG AATGTGCTGTTAAAATTAGAGTAAAACTGCTGTAAGCAGGTTAAGTTCTCATCTAAAGAGATCACATTTC CCCACCATACCCCTGCTATCCATTTCCCCCAAGTGGCTCATTAGAAAAAAAGATGGCTAGATTTCAAAAA GCAACTTGGAGAGATTTCTATAGGATTTTTCTTTAGTTCAATCAATACAGAGTTATCTCTTACTTCCACG AAAATAGCTTTTTCACACATCTCTGCACACACAGTCACACACACATATAAAACATTGGCAGCAGGTACTT TTAATTTGCTGGAAAATATTTCTAAGAAGTCAAAAAGCTCCAGCTGAATTGCATGCCCTCTTATTGGCTC ACCAGACCAGTTGAGGGACCTGATTGGTCCTTGATCCTGAGGACCGATAAGAACGGCTATAAAATCCCTG GGTGCAGCTCTTGGGCCCCCAGTTTGCAAAAGCCAGAGGTGCAAGAAGCAGCGACTGCAGCAGCAGCAGC AGCAGCGGCGGTGGCAGCAGCAGCAGCAGCGGCGGCAGCAGCAGCAGCAGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| STC1_1 ↗ | 8:23,854,806 | 負股 | 23,854,796–23,854,855 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR8_9CGL7 · enhancer · 23850417–23850778 · regulatory
ENSR8_C4CWJ · enhancer · 23853204–23854300 · regulatory
ENSR8_B6PS7 · promoter · 23854301–23855039 · regulatory
ENSR8_B6PSW · enhancer · 23859209–23859748 · regulatory
ENSR8_57LJ5K · CTCF_binding_site · 23859471–23859492 · regulatory
· motif · 23857450–23857459 · motif
· motif · 23857450–23857459 · motif
· motif · 23859473–23859489 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:247 aa
Stanniocalcin-1 屬於 stanniocalcin 家族,蛋白質長 247 個胺基酸。序列註解標示第 1 至 17 位為訊號胜肽,提供其 N 端訊號區段的範圍。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 Stanniocalcin-1 註記為分泌型蛋白質,未提供其他定位或定位改變條件。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- MEOX2Q6FHY5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
Stanniocalcin-1 形成由二硫鍵連結的同源二聚體;此資料描述的是同一蛋白質亞基組成的複合體,未提供其他結合夥伴或功能性互作資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | STC1 可促進腎臟對磷酸鹽的再吸收;來源並指出,這項作用可能因此有助於預防高血鈣,但未提供具體機制或適用條件。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | Stanniocalcin-1 以二硫鍵連結形成同源二聚體;此敘述指出其亞基組成與連結方式,未提供其他互作對象。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AGTTTGCAAAAGCCAGAGGTGCAAGAAGCAGCGACTGCAG40CAGCAGCAGCAGCAGCGGCGGTGGCAGCAGCAGCAGCAGC80GGCGGCAGCAGCAGCAGCAGCGGAGGCACCGGTGGCAGCA120GCAGCATCACCAGCAACAACAACAAAAAAAAATCCTCATC160AAATCCTCACCTAAGCTTTCAGTGTATCCAGATCCACATC200TTCACTCAAGCCAGGAGAGGGAAAGAGGAAAGGGGGGCAG240GAAAAAAAAAAAACCCAACAACTTAGCGGAAACTTCTCAG280AGAATGCTCCAAAACTCAGCAGTGCTTCTGGTGCTGGTGA320TCAGTGCTTCTGCAACCCATGAGGCGGAGCAGAATGACTC360TGTGAGCCCCAGGAAATCCCGAGTGGCGGCTCAAAACTCA400GCTGAAGTGGTTCGTTGCCTCAACAGTGCTCTACAGGTCG440GCTGCGGGGCTTTTGCATGCCTGGAAAACTCCACCTGTGA480CACAGATGGGATGTATGACATCTGTAAATCCTTCTTGTAC520AGCGCTGCTAAATTTGACACTCAGGGAAAAGCATTCGTCA560AAGAGAGCTTAAAATGCATCGCCAACGGGGTCACCTCCAA600GGTCTTCCTCGCCATTCGGAGGTGCTCCACTTTCCAAAGG640ATGATTGCTGAGGTGCAGGAAGAGTGCTACAGCAAGCTGA680ATGTGTGCAGCATCGCCAAGCGGAACCCTGAAGCCATCAC720TGAGGTCGTCCAGCTGCCCAATCACTTCTCCAACAGATAC760TATAACAGACTTGTCCGAAGCCTGCTGGAATGTGATGAAG800ACACAGTCAGCACAATCAGAGACAGCCTGATGGAGAAAAT840TGGGCCTAACATGGCCAGCCTCTTCCACATCCTGCAGACA880GACCACTGTGCCCAAACACACCCACGAGCTGACTTCAACA920GGAGACGCACCAATGAGCCGCAGAAGCTGAAAGTCCTCCT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。