基因總覽
STATH 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 statherin。其產物是唾液蛋白,屬於 histatin/statherin family。資料指出,statherin 的功能與唾液中鈣鹽維持過飽和狀態,以及牙齒表面的 hydroxyapatite 晶體形成有關。蛋白質序列長 62 個胺基酸,包含位於第 1 至 19 位的訊號區域;另有兩段註解區域,分別位於第 20 至 25 位及第 38 至 62 位。這些序列特徵提供其基本結構資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000246895 ★ | 69,995,966–70,002,570 | 6 |
| ENST00000381060 | 69,995,966–70,002,570 | 5 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
statherin 是唾液中的蛋白質,可協助穩定含鈣鹽且處於過飽和狀態的唾液。其作用之一是抑制磷酸鈣鹽沉澱,使唾液中的鈣鹽不易以沉澱形式析出。這項功能與唾液維持過飽和狀態相關,來源並未進一步描述其作用的分子步驟或具體條件。
此外,statherin 也會調節牙齒表面的 hydroxyapatite 晶體形成。來源未詳述此調節作用的方向、機制或其與抑制磷酸鈣鹽沉澱之間的關係,因此不宜將兩者延伸為更具體的因果機制。現有資料支持的主要功能,限於穩定過飽和唾液中的鈣鹽,以及調節牙齒表面的 hydroxyapatite 晶體形成。
Promoter 與基因調控
>STATH ENST00000246895 GRCh38 chr4:69994966-69996066 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ACGCCTTAGGACAACCCCAAGATTCTGACTCAGCAAGTTTGCGAAGGTGGACTAAGAATTTACATTTCCA CAGGCTCCAGCTGATGCTGTCTGTGATGTTCCCATATGGCACACTCTGAGGAACAATGCACTAGGCTGTA TAACTTACCTCAACTTTATATATAAGTTTTTGATATTCGTTTCTTAGTACATTGAGTTATCCAACCAGCA GTGAGTAGGGTAATTTTTACACAAATTTTCCTAGGAATGTAATGAAAACATTTTTTCCTTCACTCTAGTG TAATCATGTCAACACATGGCTGCTATGGAAAAATATGTAGCCTTAAAAACTCCAGGAAATTAAATTGAAT TTCCAAATACATATATTCAGTCATATGTGAGATATGTATCAGTGAGCACTTAGAGTCATTTCACCATAAA TATAATAATTTTTTATCATATAGTACCCAAAAGATTACTGAATTTGGCAAATGTTTACGTTCACTTTGTA ACTTAAAATATTCTAAAGTCAATAGAAGATGGTAAAAGTATGAGATAAATAATGATTTGAAGAAAAACTC TTGAAGTATATGAAGACTGTAATTTTATTATGCCAGTTACCACGAGTTATCAGAGAACATGTAAAATCTT GATAACATGGTAAGTATTATTTGTGTCATAGAGTTGTTCCACCTTGGACACATACTTGTGGAAACATCTT TATCACTGCAATTATTTCTATGCCTGGTTTCCTCCAGCATGCTTTTCTGTCATCTGACTCACTCAGCGCT AGACTAACAGTGGGATTAACATGCAGTGGGTACAGTTGTTTCCTGGTTACTTTGTCTTCACAATCATCTA TTGCAAAATCACTTTGTTACGGTTATTTTTATCATTTGTAGAGACAGATTTTGGGCATTACTTTTAGTTT CCATAATGTGATCTCATAATTGCCATTATTTAACAAAAACAAATGGGGGACTTCAGAGTGTTTAAATACA TTGGCCCTCTAGGGTAGCACATCATCTCTTGAAGCTTCACTTCAACTTCACTACTTCTGTAGTCTCATCT TGAGTAAAAGGTAATATGTTCATGTATAATCGAATATGTTGTCTTAATCTA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| STATH_1 ↗ | 4:69,995,966 | 正股 | 69,995,917–69,995,976 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
· motif · 69994987–69995001 · motif
· motif · 69994987–69995001 · motif
· motif · 69994994–69995005 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:62 aa
statherin 長 62 個胺基酸,屬於 histatin/statherin family。序列第 1 至 19 位標註為訊號區域;第 20 至 25 位是與 hydroxyapatite 結合並抑制晶體生長的區域;第 38 至 62 位則為疏水區域,註解其可抑制磷酸鈣鹽沉澱。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 statherin 標註為分泌型蛋白質;未提供更具體的分泌位置或細胞內定位資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 23 個夥伴
- AQP6Q13520 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DERL3Q96Q80 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ERGIC3Q9Y282 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM209AQ5JX71 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FCRL3Q96P31-6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FIMPQ96LL3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPR152Q8TDT2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPR42O15529 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KCNJ6P48051 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LEUTXA8MZ59 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MFSD5Q6N075 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MRM1Q6IN84 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MTIF3Q9H2K0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MUC7Q8TAX7 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- REEP4Q9H6H4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SGPL1O95470 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SLC10A6Q3KNW5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SLC39A2Q9NP94 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SPNS3Q6ZMD2-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TFAMQ00059 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TLCD4Q96MV1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMEM80Q96HE8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMX2Q9Y320 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | statherin 是唾液蛋白,可透過抑制磷酸鈣鹽沉澱,穩定含鈣鹽且處於過飽和狀態的唾液;此外,它也會調節牙齒表面的 hydroxyapatite 晶體形成。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Salivary protein that stabilizes saliva supersaturated with calcium salts by inhibiting the precipitation of calcium phosphate salts. It also modulates hydroxyapatite crystal formation on the tooth surface |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
ATCATCTCTTGAAGCTTCACTTCAACTTCACTACTTCTGT40AGTCTCATCTTGAGTAAAAGAGAACCCAGCCAACTATGAA80GTTCCTTGTCTTTGCCTTCATCTTGGCTCTCATGGTTTCC120ATGATTGGAGCTGATTCATCTGAAGAGAAATTTTTGCGTA160GAATTGGAAGATTCGGTTATGGGTATGGCCCTTATCAGCC200AGTTCCAGAACAACCACTATACCCACAACCATACCAACCA240CAATACCAACAATATACCTTTTAATATCATCAGTAACTGC280AGGACATGATTATTGAGGCTTGATTGGCAAATACGACTTC320TACATCCATATTCTCATCTTTCATACCATATCACACTACT360ACCACTTTTTGAAGAATCATCAAAGAGCAATGCAAATGAA400AAACACTATAATTTACTGTATACTCTTTGTTTCAGGATAC440TTGCCTTTTCAATTGTCACTTGATGATATAATTGCAATTT480AAACTGTTAAGCTGTGTTCAGTACTGTTTCTGAATAATAG520AAATCACTTCTCTAAAAGCAATAAATTTCAAGCACATTTT560TACATGTATGCTCCTTATTTTTCTCTTTTCTATTTATAGG600AATAATGATTTCTTTCATCATCTTCTTTCCCAGTTTGACT640AGCACAGATTGAAGCCCATAATGTCAGAGGTCCTTATTT679cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。