演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

STAT6D12S1644

signal transducer and activator of transcription 6

STAT6 編碼 signal transducer and activator of transcription 6,兼具訊號傳遞與轉錄活化功能,參與 IL4 與 IL3 介導的訊號傳遞。

Homo sapiens12q13.3UniProt P42226
OFFICIAL SYMBOL
STAT6
CHROMOSOME
12
UNIPROT
P42226
PDB / ALPHAFOLD
4Y5U
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

STAT6 是蛋白質編碼基因,其產物 signal transducer and activator of transcription 6 屬於 STAT 轉錄因子家族。這個名稱反映其兼具訊號傳遞與轉錄活化的功能,並參與 IL4 與 IL3 介導的訊號傳遞。現有資料未提供更詳細的基因產物基本性質或結構資訊。

Official symbol
STAT6
Gene name
signal transducer and activator of transcription 6
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11368
UniProt
P42226
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
D12S1644IL-4-STAT

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1212q13.3
chr12 · 133,275,309 bp · GRCh38chr12p13.33 · 1–3200000 · gnegchr12p13.32 · 3200001–5300000 · gpos25chr12p13.31 · 5300001–10000000 · gnegchr12p13.2 · 10000001–12600000 · gpos75chr12p13.1 · 12600001–14600000 · gnegchr12p12.3 · 14600001–19800000 · gpos100chr12p12.2 · 19800001–21100000 · gnegchr12p12.1 · 21100001–26300000 · gpos100chr12p11.23 · 26300001–27600000 · gnegchr12p11.22 · 27600001–30500000 · gpos50chr12p11.21 · 30500001–33200000 · gnegchr12p11.1 · 33200001–35500000 · acenchr12q11 · 35500001–37800000 · acenchr12q12 · 37800001–46000000 · gpos100chr12q13.11 · 46000001–48700000 · gnegchr12q13.12 · 48700001–51100000 · gpos25chr12q13.13 · 51100001–54500000 · gnegchr12q13.2 · 54500001–56200000 · gpos25chr12q13.3 · 56200001–57700000 · gnegchr12q14.1 · 57700001–62700000 · gpos75chr12q14.2 · 62700001–64700000 · gnegchr12q14.3 · 64700001–67300000 · gpos50chr12q15 · 67300001–71100000 · gnegchr12q21.1 · 71100001–75300000 · gpos75chr12q21.2 · 75300001–79900000 · gnegchr12q21.31 · 79900001–86300000 · gpos100chr12q21.32 · 86300001–88600000 · gnegchr12q21.33 · 88600001–92200000 · gpos100chr12q22 · 92200001–95800000 · gnegchr12q23.1 · 95800001–101200000 · gpos75chr12q23.2 · 101200001–103500000 · gnegchr12q23.3 · 103500001–108600000 · gpos50chr12q24.11 · 108600001–111300000 · gnegchr12q24.12 · 111300001–111900000 · gpos25chr12q24.13 · 111900001–113900000 · gnegchr12q24.21 · 113900001–116400000 · gpos50chr12q24.22 · 116400001–117700000 · gnegchr12q24.23 · 117700001–120300000 · gpos50chr12q24.31 · 120300001–125400000 · gnegchr12q24.32 · 125400001–128700000 · gpos50chr12q24.33 · 128700001–133275309 · gnegSTAT6pq1 bp133,275,309 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr12:57,095,403–57,132,139
Gene span
36,737 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000300134 ★57,095,408–57,111,36222
ENST0000055625957,095,403–57,111,83222
ENST0000071437157,095,403–57,111,80922
ENST0000055349957,095,403–57,132,13922
ENST0000055327557,095,403–57,111,83223
ENST0000071437357,095,403–57,111,83223
ENST0000055339757,095,403–57,111,83223
ENST0000055353357,095,403–57,111,83223
ENST0000055584957,095,403–57,110,54322
ENST0000071437457,095,403–57,111,83224
ENST0000055763557,095,403–57,110,34022
ENST0000053891357,095,403–57,111,34620

顯示 12/38 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

STAT6 的功能涵蓋訊號傳遞與轉錄活化。資料指出,它參與由 IL4(interleukin-4)及 IL3(interleukin-3)介導的訊號傳遞,並具有使訊號作用連結至轉錄活化的雙重功能。

現有資料未進一步說明 IL4 或 IL3 訊號如何作用於 STAT6,也未詳述其促成轉錄活化的分子步驟、調控對象或下游生物學效應。因此,這些資訊支持其參與上述兩種細胞激素介導的訊號傳遞,以及兼具訊號傳遞和轉錄活化角色;不宜據此延伸推定特定靶基因或更細緻的作用機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 57111362 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>STAT6 ENST00000300134 GRCh38 chr12:57111262-57112362 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGGCCTCTCTGGATCCCTTGGTCTCCTCCAGCTCCTCCCCCAGCAAAAACTGCAGAACCCTCCACTAGTT
ATGTTGATGACTCAGAAGTTGAGCAAGACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GGTGTTGTGATTGCAATGGGCTCTGTTTGTGAGCCTGCCTGCACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GTGTGTAGTCTTGTGGTCAGGGAAGTTGTGCATGTGTGTGTTTGTTTCTTGGCGTGTCTCAGTGTTTACC
CCAGAAACATATAGGAACTTGGCAGATAGGAACACAGCAGATTCGTATTCAAACTTGCCCCTTGTGAATC
TGCAGGCAGCAGCTCCGGCTTGTGCTGGTTCCCACCACAGTCTCAGGAGGGGTGCCCTGTGAGGAGAGAG
CAAAGACCAGCTTCAGTCCAAGGGACTCCTAGAGTCTTCCAGAATTCTGAGCTGAGGGTTCCCCTCCCCC
ACTCCCTCCCGTCAGTGGTCACGAGACCGACCTCTAAGGCGTTCCCTGCCGGAAGGGAGGGGGACCTAGG
AGTTGGCTGGCATCGAGCTCCCTGGCGGCTTTTTAGGGTCCTCCACTGGAGGGAGCGCAGAGTCCAGAGG
GATTTACTTTTCCTGAGGCCCTGGGGAGCCCAGTCCCTTGTGGGTCCAAACCCCAGCCCTTGGCAGAGTT
TGAGTTTGGGAGCCAGGCAGTTAGGGGTGGCAAATCTCTGTTTGATATTGGGTGACTTTCTGGAGAAAAG
CTGATGCTTTTGAGGGGGACAGAGTAAGTGGGGGTCAGCCTCCCCCCAAGCCTGGCTCCAAGGCCTGGAC
CCCAGTCCTGATCCCCCACGTGTTCCCCCACTCGGCACAGGAGGCACACATATTCACCCCACTTTCTTCC
TCTTCCTCCTCCAGCCCACTTTCTCTTCTCTGTGTCGTCAGAGCTCCAGGGAGGGACCTGGGTAGAAGGA
GAAGCCGGAAACAGCGGGCTGGGGCAGCCACTGCTTACACTGAAGAGGGAGGACGGGAGAGGAGTGTGTG
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATGTGTGTGCTTTATCTTATTTTT
STAT6 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
STAT6_1 ↗12:57,111,353負股57,111,343–57,111,402
STAT6_2 ↗12:57,129,037負股57,129,027–57,129,086

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR12_BFC2F · enhancer · 57109642–57110295 · regulatory

ENSR12_BFC2J · promoter · 57110296–57111033 · regulatory

ENSR12_BFC2N · promoter · 57111336–57111883 · regulatory

ENSR12_5HFNS9 · CTCF_binding_site · 57111744–57111765 · regulatory

ENSR12_C7N2D · enhancer · 57111884–57113122 · regulatory

ENSR12_5HFNXP · CTCF_binding_site · 57112490–57112511 · regulatory

ENSR12_5HFP3R · CTCF_binding_site · 57113150–57113171 · regulatory

· motif · 57110630–57110646 · motif

· motif · 57110829–57110844 · motif

· motif · 57111366–57111381 · motif

· motif · 57111370–57111379 · motif

· motif · 57111370–57111381 · motif

· motif · 57111370–57111381 · motif

· motif · 57111499–57111508 · motif

· motif · 57111499–57111508 · motif

· motif · 57111543–57111554 · motif

· motif · 57111704–57111717 · motif

· motif · 57111746–57111762 · motif

· motif · 57111816–57111825 · motif

· motif · 57112134–57112142 · motif

· motif · 57112174–57112183 · motif

· motif · 57112278–57112286 · motif

· motif · 57112492–57112508 · motif

· motif · 57112574–57112583 · motif

· motif · 57112838–57112849 · motif

· motif · 57113152–57113168 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:847 aa

1 aa847 aa結構域功能區域基序
依 P42226 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

signal transducer and activator of transcription 6 長 847 個胺基酸,屬於 STAT 轉錄因子家族。其 SH2 結構域位於第 517–632 位胺基酸;C 端第 802–806 位有 LXXLL motif,而第 809–847 位區域註記為無序區。

結構域SH2517–632 aa
功能區域Disordered809–847 aa
基序LXXLL motif802–806 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 4Y5U…

PDB · 4Y5U

X-ray · 2.71 A · A/B=113-658

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Nucleus

資料指出,STAT6 會在磷酸化後轉位至細胞核,呈現與磷酸化狀態相關的定位變化。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 5 個夥伴 · 最多顯示 50 個
D12S1644STAT6EP300IL4RNMISTING1TBK1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

STAT6 可形成同源二聚體,或與相關家族成員形成異源二聚體;此二聚化資訊標示為依相似性推定。另有資料指出,STAT6 透過其 C 端 LXXLL motif 與 NCOA1 互作。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

STAT6 的變異會造成常染色體顯性 Hyper-IgE syndrome 6(HIES6),其特徵包括嬰兒期發病的嚴重過敏性疾病。常見表現有難治性異位性皮膚炎、食物過敏、氣喘、嗜酸性胃腸疾病及嚴重過敏性休克;半數患者有反覆皮膚、呼吸道及病毒感染。檢驗可見嗜酸性球增多及血清 IgE 顯著升高。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能STAT6 具有雙重功能,既參與訊號傳遞,也能活化轉錄;此外,它參與由 IL4(interleukin-4)與 IL3(interleukin-3)介導的訊號傳遞。含實驗來源
證據與來源

Carries out a dual function: signal transduction and activation of transcription. Involved in IL4/interleukin-4- and IL3/interleukin-3-mediated signaling

PMID 17210636 ↗ · PMID 36758835 ↗ · PMID 36884218 ↗

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交互作用STAT6 可形成同源二聚體,或與相關家族成員形成異源二聚體;此項二聚化描述為依相似性推定。STAT6 也透過其 C 端 LXXLL motif 與 NCOA1 互作。含實驗來源
證據與來源

Forms a homodimer or a heterodimer with a related family member (By similarity). Interacts with NCOA1 via its C-terminal LXXLL motif

PMID 12138096 ↗ · PMID 14757047 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位STAT6 位於細胞質與細胞核,並會在磷酸化後轉位至細胞核。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Nucleus; Translocated into the nucleus in response to phosphorylation

PMID 36758835 ↗

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疾病關聯STAT6 相關變異會造成常染色體顯性 Hyper-IgE syndrome 6,患者可自嬰兒期出現嚴重過敏性疾病,包括難治性異位性皮膚炎、食物過敏、氣喘、嗜酸性胃腸疾病與嚴重過敏性休克。半數患者有反覆皮膚、呼吸道及病毒感染;檢驗可見嗜酸性球增多及血清 IgE 顯著升高。含實驗來源
證據與來源

Hyper-IgE syndrome 6, autosomal dominant, with recurrent infections HIES6 An immunologic disorder characterized by severe allergic disease with onset in infancy. Common features are treatment-resistant atopic dermatitis, food allergies, asthma, eosinophilic gastrointestinal disease, and severe episodes of anaphylaxis. Half of the patients present with recurrent skin, respiratory, and viral infections. Clinical laboratory testing is notable for eosinophilia and markedly elevated serum IgE levels. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 620532

PMID 36758835 ↗ · PMID 36884218 ↗ · PMID 37316763 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000300134 · 3,963 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGGGCAGCCACTGCTTACACTGAAGAGGGAGGACGGGAGA40
41GGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATG80
81TGTGTGCTTTATCTTATTTTTCTTTTTGGTGGTGGTGGTG120
121GAAGGGGGGAGGTGCTAGCAGGGCCAGCCTTGAACTCGCT160
161GGACAGAGCTACAGACCTATGGGGCCTGGAAGTGCCCGCT200
201GAGAAAGGGAGAAGACAGCAGAGGGGTTGCCGAGGCAACC240
241TCCAAGTCCCAGATCATGTCTCTGTGGGGTCTGGTCTCCA280
281AGATGCCCCCAGAAAAAGTGCAGCGGCTCTATGTCGACTT320
321TCCCCAACACCTGCGGCATCTTCTGGGTGACTGGCTGGAG360
361AGCCAGCCCTGGGAGTTCCTGGTCGGCTCCGACGCCTTCT400
401GCTGCAACTTGGCTAGTGCCCTACTTTCAGACACTGTCCA440
441GCACCTTCAGGCCTCGGTGGGAGAGCAGGGGGAGGGGAGC480
481ACCATCTTGCAACACATCAGCACCCTTGAGAGCATATATC520
521AGAGGGACCCCCTGAAGCTGGTGGCCACTTTCAGACAAAT560
561ACTTCAAGGAGAGAAAAAAGCTGTTATGGAACAGTTCCGC600
601CACTTGCCAATGCCTTTCCACTGGAAGCAGGAAGAACTCA640
641AGTTTAAGACAGGCTTGCGGAGGCTGCAGCACCGAGTAGG680
681GGAGATCCACCTTCTCCGAGAAGCCCTGCAGAAGGGGGCT720
721GAGGCTGGCCAAGTGTCTCTGCACAGCTTGATAGAAACTC760
761CTGCTAATGGGACTGGGCCAAGTGAGGCCCTGGCCATGCT800
801ACTGCAGGAGACCACTGGAGAGCTAGAGGCAGCCAAAGCC840
841CTAGTGCTGAAGAGGATCCAGATTTGGAAACGGCAGCAGC880
881AGCTGGCAGGGAATGGCGCACCGTTTGAGGAGAGCCTGGC920
921CCCACTCCAGGAGAGGTGTGAAAGCCTGGTGGACATTTAT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。