演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

STAT5B

signal transducer and activator of transcription 5B

STAT5B 編碼 STAT 家族轉錄因子,能傳遞細胞激素、荷爾蒙與生長因子的訊息,並參與特定基因轉錄及造血、紅血球分化調控。

Homo sapiens17q21.2UniProt P51692
OFFICIAL SYMBOL
STAT5B
CHROMOSOME
17
UNIPROT
P51692
PDB / ALPHAFOLD
6MBW
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

STAT5B(signal transducer and activator of transcription 5B)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 STAT 轉錄因子家族。STAT5B 結合特定 DNA 調控序列,並能依訊號狀態改變細胞內位置,將細胞外訊息連結至基因轉錄調控。蛋白質含有 SH2 結構域,並具有一段與 NMI 互作所需的區域;這些結構特色與其分子互作及訊息傳遞角色相符。

Official symbol
STAT5B
Gene name
signal transducer and activator of transcription 5B
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11367
UniProt
P51692
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717q21.2
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegSTAT5Bpq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr17:42,199,176–42,288,633
Gene span
89,458 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000293328 ★42,199,177–42,276,39119
ENST0000069880842,199,176–42,276,44419
ENST0000069880942,199,176–42,276,44418
ENST0000069877642,199,176–42,288,38019
ENST0000069877742,199,176–42,288,63319
ENST0000041584542,199,176–42,276,70719
ENST0000069877842,199,176–42,276,44419
ENST0000090357742,199,176–42,276,83919
ENST0000090357842,199,176–42,276,44419
ENST0000090357942,199,176–42,248,94319
ENST0000091441342,199,176–42,276,44418
ENST0000091441442,199,176–42,276,44417

顯示 12/25 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

STAT5B 是細胞訊息傳遞與轉錄活化因子,可介導細胞對細胞激素、荷爾蒙及生長因子的反應。它能結合 GAS 元件並活化 PRL 誘導的轉錄,將外部訊號轉換為特定基因表現的調控。來源指出此轉錄作用與其訊息傳遞角色相連,但未進一步說明完整的下游分子步驟。

在生物學過程方面,STAT5B 正向調節造血分化及紅血球分化,參與血球生成相關的細胞命運調控。此外,它也參與 oncostatin-M 介導的訊息傳遞;此訊號經由 type II OSM receptor complex 傳遞,而該複合體由 OSMR 與 IL6ST 組成的異源二聚體構成。這項資料說明 STAT5B 涉及該受體複合體所介導的路徑,但未提供其在路徑中的具體分子順序或所有下游效應。

因此,來源支持 STAT5B 同時具有訊息轉導與轉錄調控角色,並將其與荷爾蒙誘導的轉錄、造血及紅血球分化,以及 oncostatin-M 路徑相連。這些功能描述指出它參與多種細胞反應;至於各類訊號如何特異地調節不同細胞中的 STAT5B,所提供資料並未詳述。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 42276391 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>STAT5B ENST00000293328 GRCh38 chr17:42276291-42277391 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AACGTTTTGCATACACACAGGGGAGCTCTGTGTGTCTGAGTGGGGGCGGGAGGGGTCCTTCTCTCTCTTT
TGGCCCCTGCAGCTTGGCTTCTGGAGCTTTCCTATGTCTTGCTTTAGTGCTAGCCCTTGGAGGGTTGCCA
GGGAAACCGCTGGCCAGCTCCGGGAGATAGACGTAGCAGAGGAAAGGAGAGTGGGTGACTCAGCCTGGCT
TCCCACAACCGCAACCCCCTCCTCAGCACGTGGAAAGGATCTGGGGGACCCCCTTCCCCTGGATCCTACA
GATGACCCTGTTTATTCTTTCTTCTCTAGAGAGAGCAGTCCCTCCCGCAGCTCTGACTGGTGGGAGCCAG
CCAGATTTTCCCAGGAAGGGAACCGGCCCCAGGCGCCCCGTCCCCCGTAGGTTCACCCTGGAACTCGGAC
AGGTGAATTCGGCCTGGGCGAATGTGAATTCCTGCCGTGCCCATGCAGGCGGCAGGAGCCCTGGCTGAGA
CGCCCTCCCGGGGGCAAACCCAGGATAATTATTGATCGGGGCCCCTGTGGACTTCTGACCTCGGCCTCGG
CGGGAGAGGACCCGGAACGCGGGCCTGGGCTCCCAGGGAGAGAGGTGGGCGGGCCGCGGAGGGGGCCAAC
CAAAACGACCACGACAGTGCGCCCTAGCCCTGCTAGTGGTGGTCGACCCAACCCAAACAAAGCAGCATGT
GCTTGCGGTGCGGCGTCGGCTAGGGAGCCGAGCCGGGAAGACACCCCACCGCCGCAGAAAGGGGGTGCGC
GCGGCGCCGGCACCGGCACCGCCGAGCGCGCCGCCACCTCGGGTGTGCCGAGGGGGTCCGGGTCCTTCAA
GGGCGGTCGCGGAGGGGGCGCGAGGGACAGCGGGCTAGCGAGCGCGCGCCGGGCGGAACCAGGAAGCGGG
GCGCGCTCCGGGTTGCCAGCGGCGCGCGTCCCTGGGCCTCCGCGCGTGAGCGGCGCGCGCGCCCCCGCGG
GCCCCGGCGGGAGGAGAGTCGGCGGCCGGAGCCGTCACCCCGGGCGGGGACCCAGCGCAGGCAACTCCGC
GCGGCGGCCCGGCCGAGGGAGGGAGCGAGCGGGCGGGCGGGCAAGCCAGAC
STAT5B 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
STAT5B_3 ↗17:42,275,631負股42,275,621–42,275,680
STAT5B_1 ↗17:42,276,375負股42,276,365–42,276,424
STAT5B_2 ↗17:42,288,537負股42,288,527–42,288,586

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_838K4D · enhancer · 42274353–42274577 · regulatory

ENSR17_BBDJ7 · enhancer · 42274684–42275560 · regulatory

ENSR17_9LR3K · promoter · 42275561–42276061 · regulatory

ENSR17_9LR3S · promoter · 42276381–42276887 · regulatory

ENSR17_74H5DH · enhancer · 42279362–42279477 · regulatory

· motif · 42274067–42274089 · motif

· motif · 42274067–42274089 · motif

· motif · 42274123–42274145 · motif

· motif · 42274123–42274145 · motif

· motif · 42274135–42274147 · motif

· motif · 42274218–42274227 · motif

· motif · 42275535–42275550 · motif

· motif · 42275730–42275745 · motif

· motif · 42275730–42275745 · motif

· motif · 42276033–42276050 · motif

· motif · 42276128–42276138 · motif

· motif · 42276484–42276495 · motif

· motif · 42276838–42276850 · motif

· motif · 42276840–42276847 · motif

· motif · 42276840–42276855 · motif

· motif · 42276841–42276856 · motif

· motif · 42277101–42277113 · motif

· motif · 42277139–42277155 · motif

· motif · 42277148–42277157 · motif

· motif · 42277148–42277157 · motif

· motif · 42277161–42277176 · motif

· motif · 42277168–42277176 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:787 aa

1 aa787 aa結構域功能區域
依 P51692 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

STAT5B 蛋白長 787 個胺基酸,屬於 STAT 轉錄因子家族。其 SH2 結構域位於第 589–686 個胺基酸;另有第 232–321 個胺基酸區段,資料註明此區段為與 NMI 互作所需。

結構域SH2589–686 aa
功能區域Required for interaction with NMI232–321 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 6MBW…

PDB · 6MBW

X-ray · 3.29 A · A/B=136-703

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Nucleus

STAT5B 位於細胞質及細胞核;在磷酸化反應後會轉位至細胞核。 來源未提供不同異構型之間的定位差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 17 個夥伴 · 最多顯示 50 個
STAT5BSTAT5BABL1CDKN1ACHAF1ADNAJA3HNRNPA2B1LGALS14LMO4MED25MRPS6NMIPIK3R3RBBP4STACSUOXTSSK3USP2ZNF410
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 17 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

活化後,STAT5B 可形成同源二聚體,也能與相關家族成員形成異源二聚體。來源另記載它與 NR3C1 結合(依相似性推定),並與 NCOA1、NMI、SOCS7 及 INSR 互作;與 INSR 的互作涉及 SH2 結構域。STAT5B 也與 CPEB3 互作,而此互作會抑制 STAT5B 介導的轉錄活化。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

STAT5B 基因變異與生長激素不敏感症合併免疫失調相關,來源分列常染色體隱性遺傳的 GHISID1 與常染色體顯性遺傳的 GHISID2。兩型皆為先天性疾病,特徵包括身材矮小、在生長激素濃度正常至偏高時仍有生長激素缺乏、對外源性生長激素治療有抗性及反覆感染。GHISID1 多數但非全部患者有免疫失調表現;GHISID2 患者通常有骨齡延遲、青春期延遲及血清 IGF1 降低,部分患者可能有輕度免疫失調,例如濕疹、血清 IgE 升高、氣喘或乳糜瀉。來源將疾病歸因於影響此基因的變異。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能STAT5B 是訊息傳遞與轉錄活化因子,介導細胞對細胞激素、荷爾蒙及生長因子的反應;它可結合 GAS 元件並活化 PRL 誘導的轉錄,正向調節造血及紅血球分化,並參與由 OSMR 與 IL6ST 異源二聚體組成的 type II OSM receptor complex 所介導的 oncostatin-M 訊息傳遞。含實驗來源
證據與來源

Signal transducer and transcription activator that mediates cellular responses to cytokines, hormones and growth factors. Binds to the GAS element and activates PRL-induced transcription. Positively regulates hematopoietic/erythroid differentiation. Involved in the oncostatin-M-mediated signaling pathway through type II OSM receptor complex (heterodimers composed of OSMR and IL6ST)

PMID 20702587 ↗ · PMID 29844444 ↗ · PMID 8732682 ↗ · PMID 9188471 ↗

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交互作用STAT5B 活化後形成同源二聚體,也可與相關家族成員形成異源二聚體;它與 NR3C1 的結合為依相似性推定,並與 NCOA1、NMI、SOCS7 及 INSR 互作,其中 INSR 互作涉及 SH2 結構域。STAT5B 亦與 CPEB3 互作,此互作會抑制 STAT5B 介導的轉錄活化。含實驗來源
證據與來源

Upon activation, forms homodimers. Forms also heterodimers with related family members. Binds NR3C1 (By similarity). Interacts with NCOA1. Interacts with NMI. Interacts with SOCS7. Interacts (via SH2 domain) with INSR. Interacts with CPEB3; this inhibits STAT5B-mediated transcriptional activation

PMID 12954634 ↗ · PMID 15677474 ↗ · PMID 20639532 ↗ · PMID 29844444 ↗ · PMID 9428692 ↗ · PMID 9989503 ↗

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細胞定位STAT5B 位於細胞質與細胞核,並會在磷酸化反應後轉位至細胞核。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Nucleus; Translocated into the nucleus in response to phosphorylation

PMID 29844444 ↗

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疾病關聯常染色體隱性遺傳的 GHISID1 是先天性生長激素不敏感症合併免疫失調,特徵包括身材矮小、生長激素濃度正常至偏高時仍有生長激素缺乏、對外源性生長激素治療有抗性及反覆感染;多數但非全部患者有免疫失調表現。此病由影響 STAT5B 基因的變異所致。含實驗來源
證據與來源

Growth hormone insensitivity syndrome with immune dysregulation 1, autosomal recessive GHISID1 An autosomal recessive form of growth hormone insensitivity syndrome, a congenital disease characterized by short stature, growth hormone deficiency in the presence of normal to elevated circulating concentrations of growth hormone, resistance to exogenous growth hormone therapy, and recurrent infections. Most, but not all, patients have features of immune dysregulation. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 245590

PMID 13679528 ↗ · PMID 15827093 ↗ · PMID 22419735 ↗

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疾病關聯常染色體顯性遺傳的 GHISID2 是先天性生長激素不敏感症合併免疫失調,具身材矮小、生長激素濃度正常至偏高時仍有生長激素缺乏、對外源性生長激素治療有抗性及反覆感染等特徵。患者通常有骨齡與青春期延遲及血清 IGF1 降低;部分患者可能有濕疹、血清 IgE 升高、氣喘或乳糜瀉等輕度免疫失調表現。此病由影響 STAT5B 基因的變異所致。含實驗來源
證據與來源

Growth hormone insensitivity syndrome with immune dysregulation 2, autosomal dominant GHISID2 An autosomal dominant form of growth hormone insensitivity syndrome, a congenital disease characterized by short stature, growth hormone deficiency in the presence of normal to elevated circulating concentrations of growth hormone, resistance to exogenous growth hormone therapy, and recurrent infections. GHISID2 patients usually have delayed bone age, delayed puberty, and decreased serum IGF1. Some patients may have features of mild immune dysregulation, such as eczema, increased serum IgE, asthma, or celiac disease. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 618985

PMID 29844444 ↗

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情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000293328 · 5,079 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGCGGCCGGAGCCGTCACCCCGGGCGGGGACCCAGCGCAG40
41GCAACTCCGCGCGGCGGCCCGGCCGAGGGAGGGAGCGAGC80
81GGGCGGGCGGGCAAGCCAGACAGCTGGGCCGGAGCAGCCG120
121CGGGCGCCCGAGGGGCCGAGCGAGATTGTAAACCATGGCT160
161GTGTGGATACAAGCTCAGCAGCTCCAAGGAGAAGCCCTTC200
201ATCAGATGCAAGCGTTATATGGCCAGCATTTTCCCATTGA240
241GGTGCGGCATTATTTATCCCAGTGGATTGAAAGCCAAGCA280
281TGGGACTCAGTAGATCTTGATAATCCACAGGAGAACATTA320
321AGGCCACCCAGCTCCTGGAGGGCCTGGTGCAGGAGCTGCA360
361GAAGAAGGCAGAGCACCAGGTGGGGGAAGATGGGTTTTTA400
401CTGAAGATCAAGCTGGGGCACTATGCCACACAGCTCCAGA440
441ACACGTATGACCGCTGCCCCATGGAGCTGGTCCGCTGCAT480
481CCGCCATATATTGTACAATGAACAGAGGTTGGTCCGAGAA520
521GCCAACAATGGTAGCTCTCCAGCTGGAAGCCTTGCTGATG560
561CCATGTCCCAGAAACACCTCCAGATCAACCAGACGTTTGA600
601GGAGCTGCGACTGGTCACGCAGGACACAGAGAATGAGTTA640
641AAAAAGCTGCAGCAGACTCAGGAGTACTTCATCATCCAGT680
681ACCAGGAGAGCCTGAGGATCCAAGCTCAGTTTGGCCCGCT720
721GGCCCAGCTGAGCCCCCAGGAGCGTCTGAGCCGGGAGACG760
761GCCCTCCAGCAGAAGCAGGTGTCTCTGGAGGCCTGGTTGC800
801AGCGTGAGGCACAGACACTGCAGCAGTACCGCGTGGAGCT840
841GGCCGAGAAGCACCAGAAGACCCTGCAGCTGCTGCGGAAG880
881CAGCAGACCATCATCCTGGATGACGAGCTGATCCAGTGGA920
921AGCGGCGGCAGCAGCTGGCCGGGAACGGCGGGCCCCCCGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。