基因總覽
STARD10 是蛋白質編碼基因,產物為 StAR related lipid transfer domain containing 10。此蛋白屬於含 START 結構域的脂質轉移蛋白,具磷脂轉移能力;來源指出其可在膜之間轉移磷脂醯膽鹼(PC)與磷脂醯乙醇胺(PE)。此外,來源以相似性推定其可能在精子成熟或受精過程中具有代謝作用,但未將此角色描述為已確立的功能。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000334805 ★ | 72,754,729–72,794,047 | 7 |
| ENST00000543304 | 72,753,216–72,793,657 | 8 |
| ENST00000538536 | 72,753,216–72,794,047 | 7 |
| ENST00000545082 | 72,753,216–72,781,923 | 7 |
| ENST00000888238 | 72,753,216–72,787,614 | 7 |
| ENST00000888239 | 72,753,216–72,787,614 | 7 |
| ENST00000888240 | 72,753,216–72,786,678 | 7 |
| ENST00000888241 | 72,753,216–72,782,408 | 7 |
| ENST00000888242 | 72,753,216–72,781,884 | 7 |
| ENST00000888243 | 72,753,216–72,782,947 | 7 |
| ENST00000888244 | 72,753,216–72,782,947 | 7 |
| ENST00000888245 | 72,753,216–72,782,472 | 7 |
顯示 12/51 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
STARD10 的蛋白質產物具有磷脂轉移功能,可在不同膜之間移動磷脂醯膽鹼(PC)與磷脂醯乙醇胺(PE)。其對脂質分子具有選擇性:偏好 sn-1 位置帶有棕櫚醯或硬脂醯鏈,且 sn-2 位置帶有不飽和脂肪醯鏈的脂質;來源所列的 sn-2 脂肪醯鏈為 18:1 或 18:2。這些描述界定了其可轉移的磷脂種類及偏好的脂肪醯鏈組成。
來源另指出,STARD10 可能參與精子成熟或受精相關的代謝作用,但此項功能標註依據相似性推定,應視為可能角色,而非已確立的作用。現有資料未進一步說明該代謝作用的具體過程。
Promoter 與基因調控
>STARD10 ENST00000334805 GRCh38 chr11:72793947-72795047 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ACAATAATCATACATATTCAGCAGGTTTTGGGGAAAAGCTATACATATTTATGAGGGGATGTGAGTGCAT GCACAATGGGTAAACACCTGTAACATATGTTCCATGTTCACTTTGGGATGGGGTTTTTGCGTTAAAGTGA GGTGGAATTTGGTTCTTTGCATCATAAGGTGGACTATAGGACACAAACACAGTTTGCGTGCAGTCTCTAT GAGCTTGCTGAAACTGGCCTGAGGTCTGCAGTTACTTATCAGGAAAGAATGTTTGTAAGGCCTGTCCTCT GTCGATCAGCGTTGTAGTGGTCTGAGTTGTAAATCTCAGTAAAGAAGAGTCTGACAATTTGCATGATAGC TCCTATTGCTAGGGGTTTAGTAAGAGTGTGGTTTTTCTGGCAGCAGTAGAAATTTAAGAAGTTGCCATGC CAGCTGACAGCTGAGCCCTGAGGTAGGCAACGTTTGTTTCCTTAACCTTAACCTTAAGGTCCATCGTAGT TGATAAAAAGGCATCTGGCCAGGCCTGATGGCTCACGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGGTGAGGCG GGAGGCCAGCAGTTCTGGGGCCACTGCACTCCAGCCTGACAGACAGAGACCCTGTCTCAAAAAATAAATA AATAAAAAAGATAAAGGGGCATTTGTCTTGATCGCTCAGATCACACAACTAATAAGTAGCATTCTTTCTA AAAGCCGCAACAATGCTACTCCTCTCTTATAAGAGCTACTGTGTAACTCCTGCCCAACTCAAACCCACAG GCCCAGGCTCAGAACACTTGGCTCCATTGCTTCACTGTTTCCCTGCTAGCACGAACCCCCCAAACTCCAT CTCCCAACATGCCGCGGGCCCCCTTTCTGTCAGCCTGACTCTTGAGCTCCTGAGAAATGTAGTTTTTCCA GCGGCCCAGCCCCAGAAAGGTCCTAGCCAAGAACTACAGTTCCCATGTGGCAATGCGCGCGCCATTCCGG TGGAATTCACCGCGGTCTCCAGTTTGCCATGATGGATGCCAGAACCTGCACGTGGGGCTTGGTGACGCGA TGACTGAGATGCTGGAGTCCCCGGTCAGAAGGACGATGCCGAGCGCGCCGT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 5 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| STARD10_3 ↗ | 11:72,781,251 | 負股 | 72,781,241–72,781,300 |
| STARD10_5 ↗ | 11:72,781,733 | 負股 | 72,781,723–72,781,782 |
| STARD10_2 ↗ | 11:72,781,884 | 負股 | 72,781,874–72,781,933 |
| STARD10_4 ↗ | 11:72,782,370 | 負股 | 72,782,360–72,782,419 |
| STARD10_1 ↗ | 11:72,793,657 | 負股 | 72,793,647–72,793,706 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR11_BJG2X · enhancer · 72789456–72790327 · regulatory
ENSR11_C982N · enhancer · 72792562–72793588 · regulatory
ENSR11_845R7Z · promoter · 72793589–72793791 · regulatory
ENSR11_5M59QQ · CTCF_binding_site · 72793667–72793688 · regulatory
ENSR11_845R84 · enhancer · 72793792–72794036 · regulatory
ENSR11_5M59RG · CTCF_binding_site · 72793820–72793841 · regulatory
ENSR11_933W56 · promoter · 72794037–72794537 · regulatory
ENSR11_933W6F · enhancer · 72798416–72798781 · regulatory
· motif · 72789730–72789743 · motif
· motif · 72789730–72789744 · motif
· motif · 72789730–72789745 · motif
· motif · 72789730–72789745 · motif
· motif · 72792669–72792682 · motif
· motif · 72793387–72793400 · motif
· motif · 72793669–72793685 · motif
· motif · 72793675–72793684 · motif
· motif · 72793677–72793693 · motif
· motif · 72793677–72793693 · motif
· motif · 72793704–72793715 · motif
· motif · 72793704–72793715 · motif
· motif · 72793751–72793762 · motif
· motif · 72793751–72793762 · motif
· motif · 72793822–72793838 · motif
· motif · 72794490–72794512 · motif
· motif · 72794490–72794512 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:291 aa
STARD10 蛋白質長 291 個胺基酸,含有位於第 14 至 224 位的 START 結構域。序列註解另將第 1 至 20 位及第 260 至 291 位標示為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
在睪丸中,依相似性推定,其訊號主要見於延長期精子的鞭毛,在附睪精子的尾部也有較強訊號;資料亦列出膜、細胞突起、纖毛與鞭毛等定位。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Cell projection, cilium, flagellum;Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- PRMT6Q96LA8 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | STARD10 是磷脂轉移蛋白,可在膜之間轉移磷脂醯膽鹼(PC)與磷脂醯乙醇胺(PE),並偏好 sn-1 帶棕櫚醯或硬脂醯鏈、sn-2 帶 18:1 或 18:2 不飽和脂肪醯鏈的脂質。其可能參與精子成熟或受精的代謝作用,屬相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源May play metabolic roles in sperm maturation or fertilization (By similarity). Phospholipid transfer protein that preferentially selects lipid species containing a palmitoyl or stearoyl chain on the sn-1 and an unsaturated fatty acyl chain (18:1 or 18:2) on the sn-2 position. Able to transfer phosphatidylcholine (PC) and phosphatidyetanolamline (PE) between membranes PMID 15911624 ↗ |
| 細胞定位 | STARD10 主要位於細胞質,資料亦列出膜、細胞突起、纖毛與鞭毛等位置。依相似性推定,在睪丸中訊號主要位於延長期精子的鞭毛,附睪精子尾部也有較強訊號。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell projection, cilium, flagellum; Cytoplasm; Membrane; In testis was predominantly detected at the flagella of elongated spermatids, with a strong signal also found at the tail of epididymal sperm (By similarity). Mainly cytosolic PMID 17561512 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTTTGCCATGATGGATGCCAGAACCTGCACGTGGGGCTT40GGTGACGCGATGACTGAGATGCTGGAGTCCCCGGTCAGAA80GGACGATGCCGAGCGCGCCGTATTTTCTCCTGCCTCTCCT120CAGATCGCCGCCGTTGTTGGGCTGTGGAGACGTCTCAACC160AAAGTGGAGCCGACAGAGGCCCCGGGAGCCGTGGTGACAG200AGCGGCCACAACCACTAGGGGGCGGGAGGCAGAGCGGCCC240CTAGTCCGCCCCTAGTCCGGGACCTCTGGGCGGTCCCGGG280CGGGAAGCGCACGCGCAAACGCGGGGCTTCGCGGCCGCTG320TAAACACCAAAGAGCGCCTGCGCAAGCCGAGAGTCTCGGG360ATCGACACGTGGGGGCGCCTGAGCGAAGATAACCGTAATA400AATAGTAACCTAACGGTCCAGTCATCGTTCTGTGGTCCTT440TCTTTTATGATTCACAAGGAATGACCCTCTTCATCGCCTC480TCCTAATTCAGTCCTCACAACAGTCCTTTTACAAATGGGA520CAACAGGTTAGAGGAAGTCAGGCAGATTTCCAGCATCATA560GAGAGTAAAGGACCAGGGAAGGATCAGGATTCAAGGACTG600CACCCAGGCTCTGCTTCCAGCTTGCTGTGTGACTTTGGGT640AATTTTGTTCCCTTAGGGAACTGAGCTTTCTCATTTGTAA680ATGCAAACAGGCTGTTGGGAGGATCAAATGAGATCCAGGG720GTGAAAACAGCTTAGTTTACTTTCAGGAATTTACCCACGC760GGTATATAAAGGCAAAATATTATTATAGTCAGGTGATTGT800AGATTGAGGAACCCATTTCCTCATTCTGCAAATTGCAAAC840CTGAGGGCCCAAAGAGGGACAGGGGCTTGCCCCAGGTCTC880AGCAGGCTGTGAGCAAGAGCTAAAGCCTAATCCTCCTGCC920TTTGGGCCTGGAGCCCTTCCTTGTACCCCAGGGGTCAGTG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。