演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

STARD10NY-CO-28

StAR related lipid transfer domain containing 10

STARD10 編碼磷脂轉移蛋白,能在膜之間轉移特定磷脂;其在精子成熟或受精中的代謝作用仍屬相似性推定。

Homo sapiens11q13.4UniProt Q9Y365
OFFICIAL SYMBOL
STARD10
CHROMOSOME
11
UNIPROT
Q9Y365
PDB / ALPHAFOLD
6SER
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

STARD10 是蛋白質編碼基因,產物為 StAR related lipid transfer domain containing 10。此蛋白屬於含 START 結構域的脂質轉移蛋白,具磷脂轉移能力;來源指出其可在膜之間轉移磷脂醯膽鹼(PC)與磷脂醯乙醇胺(PE)。此外,來源以相似性推定其可能在精子成熟或受精過程中具有代謝作用,但未將此角色描述為已確立的功能。

Official symbol
STARD10
Gene name
StAR related lipid transfer domain containing 10
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10666
UniProt
Q9Y365
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
NY-CO-28CGI-52PCTP2SDCCAG28

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111q13.4
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegSTARD10pq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr11:72,753,216–72,794,047
Gene span
40,832 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000334805 ★72,754,729–72,794,0477
ENST0000054330472,753,216–72,793,6578
ENST0000053853672,753,216–72,794,0477
ENST0000054508272,753,216–72,781,9237
ENST0000088823872,753,216–72,787,6147
ENST0000088823972,753,216–72,787,6147
ENST0000088824072,753,216–72,786,6787
ENST0000088824172,753,216–72,782,4087
ENST0000088824272,753,216–72,781,8847
ENST0000088824372,753,216–72,782,9477
ENST0000088824472,753,216–72,782,9477
ENST0000088824572,753,216–72,782,4727

顯示 12/51 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

STARD10 的蛋白質產物具有磷脂轉移功能,可在不同膜之間移動磷脂醯膽鹼(PC)與磷脂醯乙醇胺(PE)。其對脂質分子具有選擇性:偏好 sn-1 位置帶有棕櫚醯或硬脂醯鏈,且 sn-2 位置帶有不飽和脂肪醯鏈的脂質;來源所列的 sn-2 脂肪醯鏈為 18:1 或 18:2。這些描述界定了其可轉移的磷脂種類及偏好的脂肪醯鏈組成。

來源另指出,STARD10 可能參與精子成熟或受精相關的代謝作用,但此項功能標註依據相似性推定,應視為可能角色,而非已確立的作用。現有資料未進一步說明該代謝作用的具體過程。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 72794047 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>STARD10 ENST00000334805 GRCh38 chr11:72793947-72795047 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ACAATAATCATACATATTCAGCAGGTTTTGGGGAAAAGCTATACATATTTATGAGGGGATGTGAGTGCAT
GCACAATGGGTAAACACCTGTAACATATGTTCCATGTTCACTTTGGGATGGGGTTTTTGCGTTAAAGTGA
GGTGGAATTTGGTTCTTTGCATCATAAGGTGGACTATAGGACACAAACACAGTTTGCGTGCAGTCTCTAT
GAGCTTGCTGAAACTGGCCTGAGGTCTGCAGTTACTTATCAGGAAAGAATGTTTGTAAGGCCTGTCCTCT
GTCGATCAGCGTTGTAGTGGTCTGAGTTGTAAATCTCAGTAAAGAAGAGTCTGACAATTTGCATGATAGC
TCCTATTGCTAGGGGTTTAGTAAGAGTGTGGTTTTTCTGGCAGCAGTAGAAATTTAAGAAGTTGCCATGC
CAGCTGACAGCTGAGCCCTGAGGTAGGCAACGTTTGTTTCCTTAACCTTAACCTTAAGGTCCATCGTAGT
TGATAAAAAGGCATCTGGCCAGGCCTGATGGCTCACGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGGTGAGGCG
GGAGGCCAGCAGTTCTGGGGCCACTGCACTCCAGCCTGACAGACAGAGACCCTGTCTCAAAAAATAAATA
AATAAAAAAGATAAAGGGGCATTTGTCTTGATCGCTCAGATCACACAACTAATAAGTAGCATTCTTTCTA
AAAGCCGCAACAATGCTACTCCTCTCTTATAAGAGCTACTGTGTAACTCCTGCCCAACTCAAACCCACAG
GCCCAGGCTCAGAACACTTGGCTCCATTGCTTCACTGTTTCCCTGCTAGCACGAACCCCCCAAACTCCAT
CTCCCAACATGCCGCGGGCCCCCTTTCTGTCAGCCTGACTCTTGAGCTCCTGAGAAATGTAGTTTTTCCA
GCGGCCCAGCCCCAGAAAGGTCCTAGCCAAGAACTACAGTTCCCATGTGGCAATGCGCGCGCCATTCCGG
TGGAATTCACCGCGGTCTCCAGTTTGCCATGATGGATGCCAGAACCTGCACGTGGGGCTTGGTGACGCGA
TGACTGAGATGCTGGAGTCCCCGGTCAGAAGGACGATGCCGAGCGCGCCGT
STARD10 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 5 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
STARD10_3 ↗11:72,781,251負股72,781,241–72,781,300
STARD10_5 ↗11:72,781,733負股72,781,723–72,781,782
STARD10_2 ↗11:72,781,884負股72,781,874–72,781,933
STARD10_4 ↗11:72,782,370負股72,782,360–72,782,419
STARD10_1 ↗11:72,793,657負股72,793,647–72,793,706

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR11_BJG2X · enhancer · 72789456–72790327 · regulatory

ENSR11_C982N · enhancer · 72792562–72793588 · regulatory

ENSR11_845R7Z · promoter · 72793589–72793791 · regulatory

ENSR11_5M59QQ · CTCF_binding_site · 72793667–72793688 · regulatory

ENSR11_845R84 · enhancer · 72793792–72794036 · regulatory

ENSR11_5M59RG · CTCF_binding_site · 72793820–72793841 · regulatory

ENSR11_933W56 · promoter · 72794037–72794537 · regulatory

ENSR11_933W6F · enhancer · 72798416–72798781 · regulatory

· motif · 72789730–72789743 · motif

· motif · 72789730–72789744 · motif

· motif · 72789730–72789745 · motif

· motif · 72789730–72789745 · motif

· motif · 72792669–72792682 · motif

· motif · 72793387–72793400 · motif

· motif · 72793669–72793685 · motif

· motif · 72793675–72793684 · motif

· motif · 72793677–72793693 · motif

· motif · 72793677–72793693 · motif

· motif · 72793704–72793715 · motif

· motif · 72793704–72793715 · motif

· motif · 72793751–72793762 · motif

· motif · 72793751–72793762 · motif

· motif · 72793822–72793838 · motif

· motif · 72794490–72794512 · motif

· motif · 72794490–72794512 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:291 aa

1 aa291 aa結構域功能區域
依 Q9Y365 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

STARD10 蛋白質長 291 個胺基酸,含有位於第 14 至 224 位的 START 結構域。序列註解另將第 1 至 20 位及第 260 至 291 位標示為無序區域。

結構域START14–224 aa
功能區域Disordered1–20 aa
功能區域Disordered260–291 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 6SER…

PDB · 6SER

X-ray · 2.30 A · A=1-291

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell projection, cilium, flagellum;Cytoplasm;Membrane

在睪丸中,依相似性推定,其訊號主要見於延長期精子的鞭毛,在附睪精子的尾部也有較強訊號;資料亦列出膜、細胞突起、纖毛與鞭毛等定位。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Cell projection, cilium, flagellum;Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
NY-CO-28STARD10PRMT6
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能STARD10 是磷脂轉移蛋白,可在膜之間轉移磷脂醯膽鹼(PC)與磷脂醯乙醇胺(PE),並偏好 sn-1 帶棕櫚醯或硬脂醯鏈、sn-2 帶 18:1 或 18:2 不飽和脂肪醯鏈的脂質。其可能參與精子成熟或受精的代謝作用,屬相似性推定。含實驗來源
證據與來源

May play metabolic roles in sperm maturation or fertilization (By similarity). Phospholipid transfer protein that preferentially selects lipid species containing a palmitoyl or stearoyl chain on the sn-1 and an unsaturated fatty acyl chain (18:1 or 18:2) on the sn-2 position. Able to transfer phosphatidylcholine (PC) and phosphatidyetanolamline (PE) between membranes

PMID 15911624 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位STARD10 主要位於細胞質,資料亦列出膜、細胞突起、纖毛與鞭毛等位置。依相似性推定,在睪丸中訊號主要位於延長期精子的鞭毛,附睪精子尾部也有較強訊號。含實驗來源
證據與來源

Cell projection, cilium, flagellum; Cytoplasm; Membrane; In testis was predominantly detected at the flagella of elongated spermatids, with a strong signal also found at the tail of epididymal sperm (By similarity). Mainly cytosolic

PMID 17561512 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000334805 · 2,330 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTTTGCCATGATGGATGCCAGAACCTGCACGTGGGGCTT40
41GGTGACGCGATGACTGAGATGCTGGAGTCCCCGGTCAGAA80
81GGACGATGCCGAGCGCGCCGTATTTTCTCCTGCCTCTCCT120
121CAGATCGCCGCCGTTGTTGGGCTGTGGAGACGTCTCAACC160
161AAAGTGGAGCCGACAGAGGCCCCGGGAGCCGTGGTGACAG200
201AGCGGCCACAACCACTAGGGGGCGGGAGGCAGAGCGGCCC240
241CTAGTCCGCCCCTAGTCCGGGACCTCTGGGCGGTCCCGGG280
281CGGGAAGCGCACGCGCAAACGCGGGGCTTCGCGGCCGCTG320
321TAAACACCAAAGAGCGCCTGCGCAAGCCGAGAGTCTCGGG360
361ATCGACACGTGGGGGCGCCTGAGCGAAGATAACCGTAATA400
401AATAGTAACCTAACGGTCCAGTCATCGTTCTGTGGTCCTT440
441TCTTTTATGATTCACAAGGAATGACCCTCTTCATCGCCTC480
481TCCTAATTCAGTCCTCACAACAGTCCTTTTACAAATGGGA520
521CAACAGGTTAGAGGAAGTCAGGCAGATTTCCAGCATCATA560
561GAGAGTAAAGGACCAGGGAAGGATCAGGATTCAAGGACTG600
601CACCCAGGCTCTGCTTCCAGCTTGCTGTGTGACTTTGGGT640
641AATTTTGTTCCCTTAGGGAACTGAGCTTTCTCATTTGTAA680
681ATGCAAACAGGCTGTTGGGAGGATCAAATGAGATCCAGGG720
721GTGAAAACAGCTTAGTTTACTTTCAGGAATTTACCCACGC760
761GGTATATAAAGGCAAAATATTATTATAGTCAGGTGATTGT800
801AGATTGAGGAACCCATTTCCTCATTCTGCAAATTGCAAAC840
841CTGAGGGCCCAAAGAGGGACAGGGGCTTGCCCCAGGTCTC880
881AGCAGGCTGTGAGCAAGAGCTAAAGCCTAATCCTCCTGCC920
921TTTGGGCCTGGAGCCCTTCCTTGTACCCCAGGGGTCAGTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。