基因總覽
STAM（signal transducing adaptor molecule）是蛋白質編碼基因，產物屬於 STAM family。此蛋白質與細胞內訊號傳遞及受體運輸相關；其結構包含多個已註解區域，包括 VHS、UIM、SH3 與 ITAM，蛋白質末端另有一段被註解為無序區域。這些結構資訊構成其基本分子特徵；來源並指出 STAM 可與 HGS 組成 ESCRT-0 complex，參與受體分選相關過程。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000377524 ★ | 17,644,151–17,716,824 | 14 |
| ENST00000892729 | 17,644,124–17,715,914 | 13 |
| ENST00000892730 | 17,644,124–17,715,296 | 14 |
| ENST00000925944 | 17,644,124–17,715,906 | 13 |
| ENST00000945545 | 17,644,124–17,715,373 | 14 |
| ENST00001105791 | 17,644,124–17,663,971 | 2 |
| ENST00001115371 | 17,644,124–17,709,640 | 13 |
| ENST00001121282 | 17,644,124–17,715,907 | 14 |
| ENST00001124083 | 17,644,124–17,735,901 | 15 |
| ENST00001124084 | 17,644,124–17,715,908 | 15 |
| ENST00001142811 | 17,644,124–17,716,824 | 14 |
| ENST00000377500 | 17,644,208–17,700,221 | 6 |
顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
STAM 參與由細胞激素與生長因子介導的細胞內訊號傳遞。受到 IL-2 或 GM-CSL 刺激時，它參與可促成 DNA 合成及 MYC 誘導的訊號作用；來源也指出 STAM 可能參與 T 細胞發育，但未進一步說明其作用方式。
除了訊號傳遞，STAM 也參與受體酪胺酸激酶的下調。當 STAM 與 HGS 組成 ESCRT-0 complex 時，此複合體可結合 ubiquitin，並作為分選機制辨識已泛素化的受體，再將其轉交給後續連續進行的溶酶體分選與運輸流程。此作用將受體辨識與後續運送相連，參與受體酪胺酸激酶的調控。
在微生物感染相關敘述中，STAM 被指出對 Dengue virus 進入具有重要作用；來源未提供此作用的分子機制或其他條件。
Promoter 與基因調控
>STAM ENST00000377524 GRCh38 chr10:17643151-17644251 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TAATGAATTTTTAAGCACTCTTTGATTACTATGTATTAATCCTGTGTTGACATGTCAATATTAGTTTCCA CGCTACATTTGGAGATGCCGTAATTTGCGGGATAATTTCCATTTACGTACAAGATGTGCTTACTAAGTTT GTTCCAAGTGGGACGCAACATCTCTAGTAGATGCTCCTTAAAACTTCTCCATCACACAGAGAATAATTTT TATTGGTTAACTAAACTTATAAGTAAAATAAATAAACCAACATTTTGGGTTGCTAGGAATCACTCACTGA TCAACTTTTAGCTCCAGTTTTTTTCTGTTTTCTTTTTTTTGCTCAGTCTAGGGAGGCTATCTTGGGCTGT GAAAGACATGTCACCAACCATCACAGCTGCTGAGTGATTGCACGGTTAGTCAGTAGGTGCCAACGCCCTG CTAGAAGAGCTGTCTGCAGATTCCAAAGCCGGGCGTTCAGGGACTCCCGGGAAGGAGCCAGCGTTACCTC AGCCTCTCCGAGGGACACGCGCGCCCTGAACACTCCCCTCTTGGGATTCAGGCCAATTCGTTCAGCTCCC ATGACTTCATCCGAGCAAGTTTGTCACCTCACGCAGCTAATTAAACTGTTTACCTAGAAGATGATCCAAA GGAATTTCCATTTCCTTCCAGAGGGAATACAAGGTTATGATAACCGAGAGAGCGAGAGGAAAAAAGGCGC ACAGCTCGACCCGAACTCAACCTGCTTTCTTTCTCCTGGCTCTCCCAGTCACTCCTGGGGTTGTTAGTAG GCTTCAGCACGCCTGAAGGACCCCGTCCTACGGAGACTCCTAGCCAAGGGAAAAGCAGAAAACACAAGAA CTAATTCCACTCTTATGTGTGACTAATTAAAAGAGGAGTCAGGCAGAGGGGACTCCCTGTTCAGCCTTTA CCGATGGGGCAGGCTCGGGGCAGCTTTGAGACAGGCAGCGCCAAGGTCGCCCAGATTCCCGACAAGCTCC GCGCGGGGGCTTCCTCGGCTCCTTGCTGTTGCCGCCGCCGCAGCTGCTGCCGCGGTTGGTGGGGTTGGGT GAGAGGAGGAGCTGTCGCGGACCCTGTAGAGTCGGTCTCTGTTGCTCTTTT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| STAM_1 ↗ | 10:17,644,151 | 正股 | 17,644,102–17,644,161 |
| STAM_2 ↗ | 10:17,644,253 | 正股 | 17,644,204–17,644,263 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR10_B5HJK · enhancer · 17643086–17643867 · regulatory
ENSR10_9924B · promoter · 17643868–17644161 · regulatory
ENSR10_B5HJQ · enhancer · 17644162–17645041 · regulatory
ENSR10_B5HJX · enhancer · 17645628–17646392 · regulatory
ENSR10_8J28N · enhancer · 17647449–17647629 · regulatory
· motif · 17643520–17643533 · motif
· motif · 17643709–17643722 · motif
· motif · 17643709–17643722 · motif
· motif · 17644180–17644197 · motif
· motif · 17644308–17644321 · motif
· motif · 17644308–17644321 · motif
· motif · 17645815–17645830 · motif
· motif · 17647644–17647664 · motif
· motif · 17648082–17648094 · motif
· motif · 17648756–17648768 · motif
· motif · 17649036–17649048 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：540 aa
STAM 蛋白質長 540 個胺基酸，屬於 STAM family。其註解區域包括第 16–143 位的 VHS、第 171–190 位的 UIM、第 210–269 位的 SH3，以及第 370–387 位的 ITAM；第 500–540 位則被註解為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
STAM 位於細胞質，也定位於早期胞內體膜，並以周邊膜蛋白形式分布在膜的細胞質側。 來源未指出其他定位條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 12 個夥伴
- HGSO14964 · UniProt INTERACTION · 8 experiments · 3 筆來源紀錄
- LCP2Q13094 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- STAMBPO95630 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- UBCP0CG48 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- UBBP0CG53 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- HgsQ99LI8 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- CHATP28329-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FGFR3P22607 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HRASP01112 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LSAMPQ13449 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NUP58Q9BVL2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RNF11Q9Y3C5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
STAM 或 STAM2 可與 HGS 組成 ESCRT-0 complex；另有資料指出可能形成至少含 HGS、STAM 與 EPS15 的複合體。STAM 也被發現與 HGS、ITCH 及 DTX3L 同處複合體，並與 DTX3L 互作；此互作可促進 STAM 與 HGS 招募至早期胞內體，並降低兩者受 ITCH 泛素化的程度。STAM 與 LITAF 有直接互作，且曾與 HGS、LITAF 一同被發現於複合體中。其他互作對象包括 STAMBP/AMSH、PDGFRB 與 HAVCR1。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | STAM 參與細胞激素與生長因子介導的細胞內訊號傳遞；在 IL-2 或 GM-CSL 刺激下，參與促進 DNA 合成及 MYC 誘導的訊號，也可能參與 T 細胞發育。與 HGS 組成 ESCRT-0 complex 時，則參與受體酪胺酸激酶下調；該複合體辨識泛素化受體並將其轉交至後續溶酶體分選與運輸流程。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Involved in intracellular signal transduction mediated by cytokines and growth factors. Upon IL-2 and GM-CSL stimulation, it plays a role in signaling leading to DNA synthesis and MYC induction. May also play a role in T-cell development. Involved in down-regulation of receptor tyrosine kinase via multivesicular body (MVBs) when complexed with HGS (ESCRT-0 complex). The ESCRT-0 complex binds ubiquitin and acts as a sorting machinery that recognizes ubiquitinated receptors and transfers them to further sequential lysosomal sorting/trafficking processes |
| 功能 | 在微生物感染相關情境中，STAM 被指出對 Dengue virus 進入具有重要作用；來源未提供其作用機制或其他實驗條件。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | STAM 或 STAM2 可與 HGS 組成 ESCRT-0 complex，也可能與 HGS、STAM、EPS15 形成複合體；另曾與 HGS、ITCH、DTX3L 同處複合體。STAM 與 DTX3L 互作可促進 STAM、HGS 招募至早期胞內體，並降低兩者受 ITCH 泛素化的程度；此外，STAM 與 STAMBP/AMSH、PDGFRB、LITAF、HAVCR1 有互作，其中與 LITAF 為直接互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the ESCRT-0 complex composed of STAM or STAM2 and HGS. Probably part of a complex at least composed of HSG, STAM and EPS15. Found in a complex with HGS and E3 ligase ITCH and DTX3L. Interacts with E3 ligase DTX3L; the interaction brings together STAM and HSG, promotes their recruitment to early endosomes and decreases STAM and HGS ubiquitination by ITCH. Interacts with STAMBP/AMSH. Interacts with PDGFRB. Interacts with LITAF; the interaction is direct. Identified in a complex with HGS and LITAF. Interacts with HAVCR1 PMID 10383417 ↗ · PMID 11687594 ↗ · PMID 12551915 ↗ · PMID 19278655 ↗ · PMID 20150893 ↗ · PMID 20494825 ↗ · PMID 23166352 ↗ · PMID 24790097 ↗ · PMID 29742433 ↗ · PMID 9407053 ↗ |
| 細胞定位 | STAM 定位於細胞質及早期胞內體膜，並以周邊膜蛋白形式位於膜的細胞質側。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Early endosome membrane / Peripheral membrane protein / Cytoplasmic side PMID 23166352 ↗ · PMID 24790097 ↗ |
核酸與蛋白質序列
CCTTGCTGTTGCCGCCGCCGCAGCTGCTGCCGCGGTTGGT40GGGGTTGGGTGAGAGGAGGAGCTGTCGCGGACCCTGTAGA80GTCGGTCTCTGTTGCTCTTTTTGCCTGAGGAGTCTTCCAT120CCTACGTCGAGCTCTGACTCCCGTGCTGTCGAGAGGGAGT160CCCCGGGGACACCTCGGCACGCAGCGGAGATGCCTCTTTT200TGCCACCAATCCCTTCGATCAGGATGTTGAGAAAGCAACC240AGCGAGATGAATACTGCTGAGGACTGGGGCCTCATTTTGG280ATATCTGTGATAAAGTTGGTCAGTCTCGCACTGGACCTAA320GGATTGTCTTCGGTCTATTATGAGAAGAGTGAACCACAAA360GATCCTCACGTTGCTATGCAGGCTTTGACTCTTCTAGGAG400CATGTGTATCAAACTGTGGCAAAATTTTTCATTTAGAAGT440ATGTTCAAGAGATTTTGCTAGTGAAGTAAGCAACGTATTA480AATAAGGGTCATCCTAAAGTATGTGAAAAATTAAAGGCTC520TTATGGTTGAATGGACAGATGAATTTAAGAATGATCCACA560GCTTAGTCTAATATCAGCAATGATTAAGAACCTTAAGGAA600CAAGGAGTTACGTTCCCAGCTATTGGCTCTCAGGCTGCAG640AACAAGCAAAAGCAAGCCCAGCTCTTGTAGCCAAGGATCC680TGGTACTGTGGCTAACAAAAAAGAAGAAGAAGATTTAGCA720AAAGCCATTGAGTTGTCTCTCAAGGAACAAAGGCAGCAGT760CAACCACCCTTTCCACTTTGTATCCAAGCACATCCAGTCT800CTTAACTAACCACCAACATGAAGGCCGAAAAGTTCGTGCT840ATATATGACTTTGAAGCTGCTGAAGACAATGAACTTACTT880TTAAAGCTGGAGAAATTATTACAGTTCTTGATGACAGTGA920TCCTAACTGGTGGAAAGGTGAAACCCATCAAGGCATAGGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。