演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ST8SIA4PST

ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4

ST8SIA4 編碼的 ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4,參與多聚唾液酸的合成,可作用於多種唾液酸化的醣鏈。

Homo sapiens5q21.1UniProt Q92187
OFFICIAL SYMBOL
ST8SIA4
CHROMOSOME
5
UNIPROT
Q92187
PDB / ALPHAFOLD
6AHZ
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ST8SIA4 是蛋白質編碼基因,其產物為 ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4,屬於 glycosyltransferase 29 family。這種酵素參與蛋白質醣鏈的修飾,能在受體醣鏈上形成 alpha-2,8 連結;其作用涉及多聚唾液酸的合成。蛋白質具有單次穿膜的第二型膜蛋白拓樸:短小的細胞質區域之後接著穿膜區,較大的部分位於膜腔側。這些特徵概述了其酵素家族、膜蛋白結構與主要生化角色。

Official symbol
ST8SIA4
Gene name
ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10871
UniProt
Q92187
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
PSTPST1SIAT8D

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 55q21.1
chr5 · 181,538,259 bp · GRCh38chr5p15.33 · 1–4400000 · gnegchr5p15.32 · 4400001–6300000 · gpos25chr5p15.31 · 6300001–9900000 · gnegchr5p15.2 · 9900001–15000000 · gpos50chr5p15.1 · 15000001–18400000 · gnegchr5p14.3 · 18400001–23300000 · gpos100chr5p14.2 · 23300001–24600000 · gnegchr5p14.1 · 24600001–28900000 · gpos100chr5p13.3 · 28900001–33800000 · gnegchr5p13.2 · 33800001–38400000 · gpos25chr5p13.1 · 38400001–42500000 · gnegchr5p12 · 42500001–46100000 · gpos50chr5p11 · 46100001–48800000 · acenchr5q11.1 · 48800001–51400000 · acenchr5q11.2 · 51400001–59600000 · gnegchr5q12.1 · 59600001–63600000 · gpos75chr5q12.2 · 63600001–63900000 · gnegchr5q12.3 · 63900001–67400000 · gpos75chr5q13.1 · 67400001–69100000 · gnegchr5q13.2 · 69100001–74000000 · gpos50chr5q13.3 · 74000001–77600000 · gnegchr5q14.1 · 77600001–82100000 · gpos50chr5q14.2 · 82100001–83500000 · gnegchr5q14.3 · 83500001–93000000 · gpos100chr5q15 · 93000001–98900000 · gnegchr5q21.1 · 98900001–103400000 · gpos100chr5q21.2 · 103400001–105100000 · gnegchr5q21.3 · 105100001–110200000 · gpos100chr5q22.1 · 110200001–112200000 · gnegchr5q22.2 · 112200001–113800000 · gpos50chr5q22.3 · 113800001–115900000 · gnegchr5q23.1 · 115900001–122100000 · gpos100chr5q23.2 · 122100001–127900000 · gnegchr5q23.3 · 127900001–131200000 · gpos100chr5q31.1 · 131200001–136900000 · gnegchr5q31.2 · 136900001–140100000 · gpos25chr5q31.3 · 140100001–145100000 · gnegchr5q32 · 145100001–150400000 · gpos75chr5q33.1 · 150400001–153300000 · gnegchr5q33.2 · 153300001–156300000 · gpos50chr5q33.3 · 156300001–160500000 · gnegchr5q34 · 160500001–169000000 · gpos100chr5q35.1 · 169000001–173300000 · gnegchr5q35.2 · 173300001–177100000 · gpos25chr5q35.3 · 177100001–181538259 · gnegST8SIA4pq1 bp181,538,259 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr5:100,806,933–100,903,290
Gene span
96,358 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000231461 ★100,806,933–100,903,2825
ENST00000881366100,806,933–100,903,2904
ENST00000881367100,806,933–100,903,2904
ENST00000956904100,806,933–100,903,2904
ENST00001132544100,806,933–100,903,2905
ENST00001108396100,849,060–100,903,2905
ENST00001127062100,856,000–100,903,2904
ENST00001127063100,863,736–100,903,2904
ENST00000451528100,885,311–100,903,2903

顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ST8SIA4 的產物催化唾液酸轉移,使用 CMP 連結的唾液酸作為供體,將唾液酸加到蛋白質受體的 N-連結醣鏈末端。受體末端可帶有 alpha-2,3、alpha-2,6 或 alpha-2,8 連結的唾液酸;酵素則以 alpha-2,8 連結方式延長醣鏈。此反應可使既有的唾液酸化醣鏈進一步形成多聚唾液酸。

其作用底物包括多種唾液酸化的 N-acetyllactosaminyl 寡醣,來源列出 NCAM1 的 N-醣鏈、FETUB 的 N-醣鏈及 AHSG。這表示 ST8SIA4 可參與不同蛋白質受體上的多聚唾液酸合成,而非只作用於單一受體。來源指出,alpha-2,3 連結的唾液酸看來比 alpha-2,6 連結者更適合作為受體;這是相對偏好,並不表示其他列出的受體類型不能被利用。

反應中,CMP-N-acetyl-beta-neuraminate 提供唾液酸,使既有的 alpha-2,8 連結唾液酸鏈增加一個單位,同時產生 CMP 與 H⁺。因此,ST8SIA4 的直接功能屬於蛋白質醣基化相關修飾,具體而言是催化多聚唾液酸鏈的延伸。現有資料支持其酵素反應與受體範圍,但未提供足以進一步界定特定生理情境或下游效應的資訊。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 100903282 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ST8SIA4 ENST00000231461 GRCh38 chr5:100903182-100904282 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGGTACTCAGAGTGAACAATCGAACACAGAACTCTTGAAAAGTGTCCCTGCCACCCAATACAAGTACGAA
AAATGGTGGGACGGAGGAGAGGTGACAATCAGAGGCTATATATATAATTGAGACTTTTAGAGAGGACTTT
GCTCTTCCTTCCTCCCCTCCCTTTTCTTTCCTTTCTTTCTTTCCTTCCTTCCTTGGTATCCGAATGTGTG
TGGGTGTACTTGCGTTTAAAAGAGAGGTCCATGGTAGCTGCTTTTTTTTCAGAACTCTGTTTCTCCGCAA
TGAAGTTTAAGTGGGATTGGAGTTTCCTTGACTTCTGCGTGAGGAGTTTCCAAATGGCAATGAAAGGGAG
GCGCATAAATATCCATAAAGTTCCTAATGACACCTCTATCATCACTTGTTTCCTGCAGAATCCTGAGCCA
GGGTCGTCGTCCACCACCCATGCAGAGTGGGCCCATCGGCTAACAGGTTCATGTGTGTATTTGCACTTTC
CAGATTGAGTAATAAAAGTCTTCTTCCTTCCACCGCCGTCCCCACCCCCGCACCCCGTTTCACTCCACCT
TGGAGGGCGTGTTTTTGCGTGTGAGGGTGTGTGTTTAGCAAAAGCGATTGAAAGAAGGTACTCTTCTTGC
AATCCACCCCTAGCTCTACCTGAAGCATTCCTCTGGCGGGACGCTTTTGTAATCTGTCCCCAGGCGAGGT
GCCCTCTCACCTAGATGCGGATAGACTATCTTGGAGCTCCCAGGTCCAGAGAGCTGATGCTTTGATGTCC
CAGGAGAGTGTGTGTGATTCTGCGTGTACGTGTGTGTGCATATGTATGTATGTGTGTATGTATGTATATG
TGTATGTGCGCGAGCTCGCAGGCGCGTAGCACTGTGAGCTTCCTCTCCCGGCACAGAGCAGGCAGAGCCG
GGGACGTTACTCTCCAAGCAGCCTCCGCCCCCTCAGCCTGGTGATTGGCTTTGCGCAGCGTTTATCTCCT
AGCAAGAGGGAAGGGCCAGTGACGCCCCCGAACCCAGCTGCAGAAGCTGCCGCCACCTCCAATGCACAAG
GTGTCTCATCTGAAAAGAAACCTGAGCCCCAGGGAGGCGGCGCGGAGCGAC
ST8SIA4 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ST8SIA4_1 ↗5:100,903,263負股100,903,253–100,903,312

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR5_BQ2MM · enhancer · 100898537–100899461 · regulatory

ENSR5_5TPR7L · CTCF_binding_site · 100900630–100900651 · regulatory

ENSR5_5TPRGB · CTCF_binding_site · 100902079–100902100 · regulatory

ENSR5_84Z4P5 · promoter · 100903204–100903402 · regulatory

ENSR5_CD2C7 · enhancer · 100903403–100904687 · regulatory

ENSR5_93H3D2 · promoter · 100904688–100905188 · regulatory

· motif · 100898571–100898583 · motif

· motif · 100898602–100898609 · motif

· motif · 100898662–100898675 · motif

· motif · 100898662–100898675 · motif

· motif · 100898681–100898693 · motif

· motif · 100900026–100900037 · motif

· motif · 100900133–100900146 · motif

· motif · 100900140–100900155 · motif

· motif · 100900264–100900281 · motif

· motif · 100900281–100900292 · motif

· motif · 100900438–100900446 · motif

· motif · 100900507–100900518 · motif

· motif · 100900632–100900648 · motif

· motif · 100900689–100900706 · motif

· motif · 100900774–100900787 · motif

· motif · 100901037–100901050 · motif

· motif · 100901160–100901169 · motif

· motif · 100901248–100901261 · motif

· motif · 100901613–100901629 · motif

· motif · 100901771–100901784 · motif

· motif · 100901771–100901784 · motif

· motif · 100902081–100902097 · motif

· motif · 100902132–100902144 · motif

· motif · 100902294–100902305 · motif

· motif · 100902294–100902305 · motif

· motif · 100902401–100902412 · motif

· motif · 100902590–100902601 · motif

· motif · 100902630–100902645 · motif

· motif · 100903417–100903428 · motif

· motif · 100903465–100903478 · motif

· motif · 100903465–100903478 · motif

· motif · 100903504–100903517 · motif

· motif · 100903504–100903517 · motif

· motif · 100903696–100903709 · motif

· motif · 100903739–100903752 · motif

· motif · 100903796–100903811 · motif

· motif · 100904185–100904198 · motif

· motif · 100904349–100904358 · motif

· motif · 100904507–100904524 · motif

· motif · 100904567–100904578 · motif

· motif · 100904569–100904578 · motif

· motif · 100904613–100904624 · motif

· motif · 100905375–100905386 · motif

· motif · 100905419–100905430 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:359 aa

1 aa359 aa跨膜區拓樸區域
依 Q92187 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ST8SIA4 蛋白質長 359 個胺基酸,屬於 glycosyltransferase 29 family。序列註解指出,其第 1–7 位為細胞質區域,第 8–20 位為螺旋狀穿膜區,並作為第二型膜蛋白的訊號錨定區;第 21–359 位位於膜腔側。

拓樸區域Cytoplasmic1–7 aa
跨膜區Helical; Signal-anchor for type II membrane protein8–20 aa
拓樸區域Lumenal21–359 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 6AHZ…

PDB · 6AHZ

NMR · - · A=245-279

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Golgi apparatus membrane;Secreted

資料將 ST8SIA4 標示為 Golgi apparatus 膜上的單次穿膜第二型膜蛋白,並另列為分泌型。 現有定位資訊未進一步說明這兩種標示的條件或轉換情形,因此不宜據此推定其定位動態。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
PSTST8SIA4
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ST8SIA4 以 CMP 連結的唾液酸為供體,將唾液酸以 alpha-2,8 連結加到蛋白質 N-連結醣鏈末端的 alpha-2,3、alpha-2,6 或 alpha-2,8 連結唾液酸上,參與多聚唾液酸合成。受體包括 NCAM1 與 FETUB 的 N-醣鏈及 AHSG;alpha-2,3 連結者看來比 alpha-2,6 連結者更適合作為受體。含實驗來源
證據與來源

Catalyzes the transfer of a sialic acid from a CMP-linked sialic acid donor onto a terminal alpha-2,3-, alpha-2,6-, or alpha-2,8-linked sialic acid of an N-linked glycan protein acceptor through alpha-2,8-linkages. Therefore, participates in polysialic acid synthesis on various sialylated N-acetyllactosaminyl oligosaccharides, including NCAM1 N-glycans, FETUB N-glycans and AHSG. It is noteworthy that alpha-2,3-linked sialic acid is apparently a better acceptor than alpha-2,6-linked sialic acid

PMID 10766765 ↗ · PMID 11279095 ↗ · PMID 28810663 ↗ · PMID 9774483 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性[N-acetyl-alpha-D-neuraminosyl-(2->8)](n) + CMP-N-acetyl-beta-neuraminate = [N-acetyl-alpha-D-neuraminosyl-(2->8)](n+1) + CMP + H(+)含實驗來源
證據與來源

[N-acetyl-alpha-D-neuraminosyl-(2->8)](n) + CMP-N-acetyl-beta-neuraminate = [N-acetyl-alpha-D-neuraminosyl-(2->8)](n+1) + CMP + H(+)

PMID 10766765 ↗ · PMID 11279095 ↗ · PMID 28810663 ↗ · PMID 9774483 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性ST8SIA4 的功能分類包含蛋白質修飾與蛋白質醣基化;此分類指出其作用屬於蛋白質的化學修飾與醣鏈相關處理,但未在這筆資料中提供更細的反應、受體或實驗條件。資料庫紀錄
證據與來源

Protein modification; protein glycosylation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ST8SIA4 被標示為 Golgi apparatus 膜上的單次穿膜第二型膜蛋白,資料也列出分泌型。這筆定位資訊未說明分泌標示的條件、蛋白質形式或定位變化,因此不能據此推定其細胞內定位的動態。含實驗來源
證據與來源

Golgi apparatus membrane / Single-pass type II membrane protein; Secreted

PMID 9852130 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000231461 · 6,321 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GACGCCCCCGAACCCAGCTGCAGAAGCTGCCGCCACCTCC40
41AATGCACAAGGTGTCTCATCTGAAAAGAAACCTGAGCCCC80
81AGGGAGGCGGCGCGGAGCGACCCTGGCAGAGCTGGCGCAA120
121ACAGGGCGAGAGGTCGCTGGGCAGCGTTCGAGGACCAGAG160
161GGAGCTCGGCCACAGAAGACCCCAGTGATCTGATCCCGGG200
201ATCCCGGCTCCAAGCTCTCCTCGCATTTTACAGATTTCAC240
241CCCCGCGACTATCTCCCCAAAACGGAGCCTTTATATCAAG280
281AGAAGGTGCGGGAGCTGGGGCAACCAGGACTTTCTCGGGC320
321ACCCAAGATGCGCTCCATTAGGAAGAGGTGGACGATCTGC360
361ACAATAAGTCTGCTCCTGATCTTTTATAAGACAAAAGAAA400
401TAGCAAGAACTGAGGAGCACCAGGAGACGCAACTCATCGG440
441AGATGGTGAATTGTCTTTGAGTCGGTCACTTGTCAATAGC480
481TCTGATAAAATCATTCGAAAGGCTGGCTCTTCAATCTTCC520
521AGCACAATGTAGAAGGTTGGAAAATCAATTCCTCTTTGGT560
561CCTAGAGATAAGGAAGAACATACTTCGTTTCTTAGATGCA600
601GAACGAGATGTGTCAGTGGTCAAGAGCAGTTTTAAGCCTG640
641GTGATGTCATACACTATGTGCTTGACAGGCGCCGGACACT680
681AAACATTTCTCATGATCTACATAGCCTCCTACCTGAAGTT720
721TCACCAATGAAGAATCGCAGGTTTAAGACCTGTGCAGTTG760
761TTGGAAATTCTGGCATTCTGTTAGACAGTGAATGTGGAAA800
801GGAGATTGACAGTCACAATTTTGTAATAAGGTGTAATCTA840
841GCTCCTGTGGTGGAGTTTGCTGCAGATGTGGGAACTAAAT880
881CAGATTTTATTACCATGAATCCATCAGTTGTACAAAGAGC920
921ATTTGGAGGCTTTCGAAATGAGAGTGACAGAGAAAAATTT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。