演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ST8SIA2STX

ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 2

ST8SIA2 編碼一種糖基轉移酶,參與多聚唾液酸的合成,並與神經元突起生長及少突膠細胞分化相關。

Homo sapiens15q26.1UniProt Q92186
OFFICIAL SYMBOL
ST8SIA2
CHROMOSOME
15
UNIPROT
Q92186
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ST8SIA2 是蛋白質編碼基因,其正式名稱為 ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 2。此基因產物屬於糖基轉移酶,具有唾液酸轉移相關功能,參與細胞表面與蛋白質醣鏈的修飾。它的生物學角色涵蓋多聚唾液酸的形成,並涉及神經系統中的細胞過程。這些特性使 ST8SIA2 成為參與醣鏈修飾的酵素之一;其具體受質與作用情境則依賴不同的醣鏈及蛋白質受體。

Official symbol
ST8SIA2
Gene name
ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10870
UniProt
Q92186
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
STXST8SIA-IIHsT19690SIAT8B

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1515q26.1
chr15 · 101,991,189 bp · GRCh38chr15p13 · 1–4200000 · gvarchr15p12 · 4200001–9700000 · stalkchr15p11.2 · 9700001–17500000 · gvarchr15p11.1 · 17500001–19000000 · acenchr15q11.1 · 19000001–20500000 · acenchr15q11.2 · 20500001–25500000 · gnegchr15q12 · 25500001–27800000 · gpos50chr15q13.1 · 27800001–30000000 · gnegchr15q13.2 · 30000001–30900000 · gpos50chr15q13.3 · 30900001–33400000 · gnegchr15q14 · 33400001–39800000 · gpos75chr15q15.1 · 39800001–42500000 · gnegchr15q15.2 · 42500001–43300000 · gpos25chr15q15.3 · 43300001–44500000 · gnegchr15q21.1 · 44500001–49200000 · gpos75chr15q21.2 · 49200001–52600000 · gnegchr15q21.3 · 52600001–58800000 · gpos75chr15q22.1 · 58800001–59000000 · gnegchr15q22.2 · 59000001–63400000 · gpos25chr15q22.31 · 63400001–66900000 · gnegchr15q22.32 · 66900001–67000000 · gpos25chr15q22.33 · 67000001–67200000 · gnegchr15q23 · 67200001–72400000 · gpos25chr15q24.1 · 72400001–74900000 · gnegchr15q24.2 · 74900001–76300000 · gpos25chr15q24.3 · 76300001–78000000 · gnegchr15q25.1 · 78000001–81400000 · gpos50chr15q25.2 · 81400001–84700000 · gnegchr15q25.3 · 84700001–88500000 · gpos50chr15q26.1 · 88500001–93800000 · gnegchr15q26.2 · 93800001–98000000 · gpos50chr15q26.3 · 98000001–101991189 · gnegST8SIA2pq1 bp101,991,189 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr15:92,393,844–92,468,728
Gene span
74,885 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000268164 ★92,393,881–92,468,7286
ENST0000095792492,393,844–92,468,7287
ENST0000113767392,393,844–92,468,7286
ENST0000053911392,394,041–92,464,3855
ENST0000055543492,394,065–92,464,3845

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ST8SIA2 可能催化唾液酸轉移:它以 CMP 結合的唾液酸為供體,將唾液酸接到 N-linked glycan 受體末端已有的 α-2,3、α-2,6 或 α-2,8 連結唾液酸上,形成 α-2,8 連結。此反應參與多聚唾液酸的合成;來源指出,ST8SIA2 本身不具唾液酸聚合酶活性(依相似性推定),因此不應將其作用描述為直接催化聚合反應。

其參與的醣鏈受質包括多種已唾液酸化的 N-acetyllactosaminyl 寡醣,相關受質有 NCAM1、NCAM1 的 N-醣鏈及 FETUB 的 N-醣鏈;對 sialylparagloboside(SPG)與 AHSG 的作用程度較低。來源亦指出,SPG 與 AHSG 的多聚唾液酸合成不要求先加入 α-2,8 連結的唾液酸。以上受質與反應條件顯示,其作用可涉及不同起始連結型態的唾液酸化醣鏈。

在海馬迴中,ST8SIA2 催化 NCAM1 的多聚唾液酸合成,並支持神經突起生長。這項作用將醣鏈修飾與神經元形態相關過程連結起來。另有依相似性推定的資料指出,ST8SIA2 介導的多聚唾液酸化會影響少突膠細胞分化,並可能促進髓鞘與軸突的完整性;後者屬於推定的功能意義,不能視為已確立的因果結論。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 92393881 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ST8SIA2 ENST00000268164 GRCh38 chr15:92392881-92393981 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AATAAAAGGTAATTATCTAATTCCAGTAAAACTTAATGGGGCCCTTCCCACCCCTGGCCAATGGTTGGTG
TGAAATGTAATTTGACTTAAACTGTCTAAGGCTGTGAAAGTGTACAATATTCGGAAGGGTGGGGGGCATT
ACCCCTTGTGGGAGCCATATTTTTCTAGAAGGCATTTTGATCAAGACAGGCCTCCCGCGGTTATTGATCT
TAGGGTCATTGAGAGTCCAAGAACTGGGGAGATGAAGGCCACCCGGCGTCAGCACCGCGAGGGCGGAGGG
AAGGCGGGCGCTGAGTCTCCCATTGGGGTTCTAGCCGAGGGTTCCAGCCAGGACTGCGTGATCTGGGGGC
AGCTCGGAGAGCTCTCCCGACCCAGTATCGGGTCTATAAATGGAGATAAAGATCAGCACCTGGAGGGAGT
GGTTTCTCGAGGGCTGAGAGCCTCGCCCACAAACTGTAGTCAGCATCTTCACTGAAGTTGGCCTGTCTTG
GATATTTCTTCTCTCCTCCCCTTCCCCCACCTCCCCTCCTAATTCATCAACTGCTGAAACATCTGCCTGG
CTGAAACCGCCTTCTCGCCGCGCGCTGGGGGCTGTCCCCAGGTGTTGGTCTTTGTGTCGAGAAAACTTTG
CGAGGAGGCGAGGGAGCTGGACAAAGAGCGGGCGAGGGAGGGCGTTTGCCAGCCTGAGGGGTGCGCCGGG
CGGTGCGCGCACTTCCCTGGGCTCAGCTCCGTACCCGGTCGCTCGCGGTGGCCAGAGCCCAGTCTCTCTA
GGCCAGGAGTGGCGTCCGGCTGCATCCCCGCGCCCTCGGGAGCTGAATAAAGCCAGGCGGGAGAAGCAAA
GGCTAGCGCCTGGACGCTGGAGTTGGTGGGAGGAGGCGAGCAGAGGCGCGGAGCAAAGCTGTCAAACTGC
GCGCGGAGCCGGGCGCGGGGCGGGGGAAGGGAGAGGAGGGAGGGAGGGGCAGGCGGGAGCCGGGAGGGAG
CGAGCGGGCTCGCCGCGCCTGAGCAACCCCTGCCTGTCGCTGCCGCTGCCGCTGCCGCTGCCGCCGCCGG
CCCGGACTCGTCCGGAGCGCAGGGTGTCTGCCCAGCTGCGCGCGGCGCGCG
ST8SIA2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ST8SIA2_1 ↗15:92,393,896正股92,393,847–92,393,906

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR15_CC6JG · enhancer · 92391703–92392814 · regulatory

ENSR15_5RPQ7W · CTCF_binding_site · 92391813–92391834 · regulatory

ENSR15_BNC45 · promoter · 92393391–92394051 · regulatory

ENSR15_5RPQMD · CTCF_binding_site · 92394293–92394314 · regulatory

ENSR15_BNC49 · promoter · 92394431–92395036 · regulatory

ENSR15_5RPQPB · CTCF_binding_site · 92394702–92394723 · regulatory

ENSR15_84PCCP · enhancer · 92395569–92395786 · regulatory

· motif · 92390854–92390867 · motif

· motif · 92391815–92391831 · motif

· motif · 92394295–92394311 · motif

· motif · 92394704–92394720 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:375 aa

1 aa375 aa跨膜區拓樸區域
依 Q92186 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ST8SIA2 蛋白長 375 個胺基酸,屬於 glycosyltransferase 29 家族。其 N 端第 1–6 位胺基酸位於細胞質側,第 7–23 位形成螺旋型跨膜區,作為第二型單次跨膜蛋白的訊號錨定區;第 24–375 位則位於腔內。

拓樸區域Cytoplasmic1–6 aa
跨膜區Helical; Signal-anchor for type II membrane protein7–23 aa
拓樸區域Lumenal24–375 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q92186…

AlphaFold · Q92186

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Golgi apparatus membrane;Secreted;Cell membrane

ST8SIA2 位於 Golgi apparatus 膜,並可運送至細胞表面;資料亦列出細胞膜及分泌狀態。 其定位資訊描述的是 ST8SIA2 本身,不代表其受質或互作分子的定位。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
STXST8SIA2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ST8SIA2 可能以 CMP 結合的唾液酸為供體,將唾液酸接到末端含 α-2,3、α-2,6 或 α-2,8 連結唾液酸的 N-linked glycan 上,形成 α-2,8 連結並參與多聚唾液酸合成。受質包括 NCAM1、NCAM1 與 FETUB 的 N-醣鏈,並較少涉及 SPG 和 AHSG;後兩者不需先加入 α-2,8 連結唾液酸。其不具唾液酸聚合酶活性為依相似性推定;海馬迴中的 NCAM1 多聚唾液酸化支持神經突起生長,而其對少突膠細胞分化及髓鞘、軸突完整性的影響亦為依相似性推定。含實驗來源
證據與來源

Catalyzes the transfer of a sialic acid from a CMP-linked sialic acid donor onto a terminal alpha-2,3-, alpha-2,6-, or alpha-2,8-linked sialic acid of an N-linked glycan acceptor through alpha-2,8-linkages (Probable). Therefore, participates in polysialic acid synthesis on various sialylated N-acetyllactosaminyl oligosaccharides (alpha-2,3-, alpha-2,6-, or alpha-2,8-linked sialic acid), including NCAM1, NCAM1 N-glycans, FETUB N-glycans, and to a lesser extent sialylparagloboside (SPG) and AHSG, which does not require the initial addition of an alpha 2,8-sialic acid (Probable). However, does not exhibit sialic acid-polymerase activity (By similarity). Catalyzes polysialic acid synthesis in the hippocampal on NCAM1 and supports neurite outgrowth. ST8SIA2-mediated polysialylation influences on oligodendrocyte differentiation and may promote the integrity of myelin and axons (By similarity)

PMID 10766765 ↗ · PMID 11744634 ↗ · PMID 7559389 ↗ · PMID 9054414 ↗ · PMID 9774483 ↗ · PMID 28810663 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性[N-acetyl-alpha-D-neuraminosyl-(2->8)](n) + CMP-N-acetyl-beta-neuraminate = [N-acetyl-alpha-D-neuraminosyl-(2->8)](n+1) + CMP + H(+)含實驗來源
證據與來源

[N-acetyl-alpha-D-neuraminosyl-(2->8)](n) + CMP-N-acetyl-beta-neuraminate = [N-acetyl-alpha-D-neuraminosyl-(2->8)](n+1) + CMP + H(+)

PMID 10766765 ↗ · PMID 11744634 ↗ · PMID 28810663 ↗ · PMID 9054414 ↗ · PMID 9774483 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性ST8SIA2 的功能分類包括蛋白質修飾與蛋白質醣基化。資料庫紀錄
證據與來源

Protein modification; protein glycosylation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ST8SIA2 被列於 Golgi apparatus 膜,為第二型單次跨膜蛋白;資料也列出其分泌、位於細胞膜及運送至細胞表面的資訊。含實驗來源
證據與來源

Golgi apparatus membrane / Single-pass type II membrane protein; Secreted; Cell membrane; Also trafficks to the cell surface

PMID 11744634 ↗ · PMID 9852130 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000268164 · 5,655 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GAGCAACCCCTGCCTGTCGCTGCCGCTGCCGCTGCCGCTG40
41CCGCCGCCGGCCCGGACTCGTCCGGAGCGCAGGGTGTCTG80
81CCCAGCTGCGCGCGGCGCGCGGAGGCTCCGGCGTCCGCCG120
121CTGCGCCCTCCGGCCCCTGCTCCTCGCGCCGGCCCGCGTG160
161GGTCCCGGCGGGCGCGAACCCACCATGCAGCTGCAGTTCC200
201GGAGCTGGATGCTGGCCGCGCTCACGCTGCTCGTGGTCTT240
241CCTCATCTTCGCAGACATCTCAGAGATCGAAGAAGAAATC280
281GGGAATTCGGGAGGCAGAGGTACAATCAGATCAGCTGTGA320
321ACAGCTTACATAGCAAATCTAATAGAGCTGAAGTTGTAAT360
361AAACGGCTCCTCATCACCAGCTGTTGTTGACAGAAGTAAT400
401GAAAGCATCAAGCACAACATCCAGCCAGCCTCGTCCAAAT440
441GGAGACATAACCAGACGCTCTCTCTGAGGATCAGGAAGCA480
481GATTTTAAAGTTCTTGGATGCTGAAAAGGACATTTCTGTC520
521CTAAAGGGAACCCTGAAGCCTGGAGATATTATTCATTACA560
561TCTTCGATCGAGACAGCACCATGAATGTGTCCCAGAACCT600
601CTACGAGCTCCTCCCCAGGACTTCGCCACTGAAGAATAAG640
641CACTTTGGGACTTGTGCCATCGTGGGCAACTCGGGGGTCT680
681TGCTGAACAGCGGCTGTGGGCAGGAGATTGACGCCCACAG720
721CTTCGTCATCAGGTGCAACCTGGCCCCAGTACAGGAGTAT760
761GCCCGGGATGTGGGGCTCAAGACAGACCTGGTAACCATGA800
801ACCCCTCGGTCATCCAGCGGGCCTTTGAGGACTTGGTCAA840
841TGCCACGTGGCGGGAGAAGCTGCTGCAACGGCTGCACAGC880
881CTCAATGGCAGCATCCTGTGGATCCCTGCCTTCATGGCCC920
921GGGGCGGCAAGGAGCGTGTTGAGTGGGTCAACGAGCTTAT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。