基因總覽
ST7(suppression of tumorigenicity 7)是人類蛋白質編碼基因,所屬蛋白質家族為 ST7 family。其蛋白質產物名為 Suppressor of tumorigenicity 7 protein,長度為 585 個胺基酸,具有多段跨膜螺旋。現有資料將其主要角色描述為可能具有腫瘤抑制作用,但未提供更具體的作用機制或生物學過程。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000323984 ★ | 116,953,501–117,230,176 | 16 |
| ENST00000393446 | 116,952,980–117,230,812 | 14 |
| ENST00000265437 | 116,952,980–117,223,907 | 16 |
| ENST00000393451 | 116,952,980–117,230,812 | 15 |
| ENST00000393449 | 116,952,980–117,230,812 | 16 |
| ENST00000903532 | 116,952,980–117,230,812 | 15 |
| ENST00000903533 | 116,952,980–117,230,812 | 17 |
| ENST00000903534 | 116,952,980–117,230,812 | 12 |
| ENST00000923796 | 116,952,980–117,230,812 | 15 |
| ENST00000923797 | 116,952,980–117,230,812 | 13 |
| ENST00000923798 | 116,952,980–117,230,812 | 12 |
| ENST00000946966 | 116,952,980–117,230,812 | 16 |
顯示 12/34 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ST7 的蛋白質產物可能具有腫瘤抑制作用。此描述保留可能性,表示現有資料並未將該作用表述為確定的功能。
目前提供的功能資料未進一步說明 ST7 如何產生此作用,也未指出涉及哪些分子機制、生物學過程或細胞情境。因此,無法據此詳述其作用方式或功能影響。
Promoter 與基因調控
>ST7 ENST00000323984 GRCh38 chr7:116952501-116953601 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AACCTGCAATTTCCTCATTACCATCTAATACATAGAAAGTCAAATCACTTACGGACAGAAACAGACTTGA AAATTTCAGCTGAGAAAACATTTTAGAATAAAAGAAACATTTTATTCAGCACAGTCAAAACAAAACAAAA ACAACAAAACAATGTTTAAAATGGACTTTCTGTTAGAGGTGGCCGTTTCACAGTCAAAATTATCCCAGAG AATTGTTTATATTAAAAACAGGCTGAGAATAGTTTGACCTCTGATCACCAAAAAACCTGGAGGATAAACA TTCATCTGTCAAGATTTCTCTGGAAAATCCCTGCGCTGCTTCAAAGAGACAGAACAAAGGTAAATAGCAT CTGCCACCCAAATCTTGCTGAATAGAGTGATTTATCTTCAGGCCTACTAGCCGGCGACAGGAGCGCACCT CCTCCCTTCTCCTAGCTGTCCCGGGTTTATTCATTCCCTGAGCCTGAATCCTGATAAGGGAGCAGAGTAG GGTTTAAGACCTCGGACCCCAGAATACACCACTGCAATTGAATTTTGGTTCCACCTTAAGGTAAACTACG CAGCTGCTGTGAGCCTCAGTTTCCCTACCTATAGAAAGAGGATCGTAGTGGGGAATTGTTGCAGGGGTTA AATGAGATTGTACGGATCGTGGAGCAGCGCCTGGCGTGTGGTAAACGCTCAACTTATGCGGGTTGTAACT GCCTGAGGCGTTTCCTTCGGCGCGCCACTTGGCCTTCTCTTTCTAAATATTAGCATAATAAATATAAATG GACCCAGAACGCGAGGGGGCAGGGGCCACGTGATCGCTCCACGAAAGCCACTTGTAGGGACCTTTAGAGA GTTAGCAATAAGGCTGGAGAAGGAAAAGCCGGCGCGCCCGCGGCCCGCGCGATTTCCCGCCGAGCCCGCG TCCCCGGCGGCGGGCGGGCTCCGGGGGCGCCCGGGCCGCGGCGGCGGCGGCGGCGCGAGCTGCGCCTCCG GGCCGGTGAATCATCCCGGCAGACACCAAGAGCCGCGGCAGCAGAGAGGAGCGCTGAAACATGGCTGAAG CGGCCACGGGCTTTCTGGAGCAGCTCAAGTCCTGCATAGTTTGGTCTTGGA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 5 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ST7_4 ↗ | 7:116,952,976 | 正股 | 116,952,927–116,952,986 |
| ST7_3 ↗ | 7:116,953,320 | 正股 | 116,953,271–116,953,330 |
| ST7_1 ↗ | 7:116,953,501 | 正股 | 116,953,452–116,953,511 |
| ST7_2 ↗ | 7:117,020,218 | 正股 | 117,020,169–117,020,228 |
| ST7_5 ↗ | 7:117,119,647 | 正股 | 117,119,598–117,119,657 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_93PFBG · enhancer · 116948979–116949359 · regulatory
ENSR7_BT7N5 · enhancer · 116951553–116952066 · regulatory
ENSR7_CFLC6 · promoter · 116952748–116954249 · regulatory
ENSR7_532HPPD · CTCF_binding_site · 116953275–116953296 · regulatory
ENSR7_78TNGS · promoter · 116954324–116954401 · regulatory
ENSR7_CFLC9 · enhancer · 116954402–116955448 · regulatory
ENSR7_BT7NP · enhancer · 116955700–116956540 · regulatory
· motif · 116953246–116953259 · motif
· motif · 116953277–116953293 · motif
· motif · 116953295–116953304 · motif
· motif · 116953295–116953304 · motif
· motif · 116953607–116953624 · motif
· motif · 116953725–116953738 · motif
· motif · 116953838–116953855 · motif
· motif · 116953849–116953862 · motif
· motif · 116953871–116953884 · motif
· motif · 116953895–116953908 · motif
· motif · 116954404–116954419 · motif
· motif · 116954464–116954480 · motif
· motif · 116954464–116954480 · motif
· motif · 116954974–116954987 · motif
· motif · 116954974–116954987 · motif
· motif · 116955981–116955994 · motif
· motif · 116956091–116956106 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:585 aa
ST7 蛋白質屬於 ST7 family,長度為 585 個胺基酸。序列註解標示三段跨膜螺旋,分別位於第 15–35、第 62–82 及第 512–532 個胺基酸位置。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ST7 蛋白質被註記為膜蛋白及多次跨膜蛋白;資料未提供定位變化條件或不同異構型之間的定位差異。
未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- DCAF4Q8WV16 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ST7 的蛋白質產物可能具有腫瘤抑制作用。此描述帶有不確定性,資料未進一步指出其作用機制、涉及的生物學過程或發揮作用的條件。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | ST7 蛋白質被描述為膜蛋白,並具有多次跨膜特徵;此項定位資料未列出特定條件、異構型差異或定位變化。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGACACCAAGAGCCGCGGCAGCAGAGAGGAGCGCTGAAAC40ATGGCTGAAGCGGCCACGGGCTTTCTGGAGCAGCTCAAGT80CCTGCATAGTTTGGTCTTGGACGTATCTGTGGACCGTGTG120GTTCTTCATCGTGCTATTCCTGGTCTACATCCTGCGGGTG160CCTTTGAAAATCAACGACAACTTGAGCACAGTGAGCATGT200TTTTGAACACATTAACACCGAAGTTCTACGTGGCCCTAAC240AGGCACTTCCTCACTAATATCAGGGCTTATTTTGATATTT280GAATGGTGGTATTTTCGCAAATACGGAACTTCATTCATTG320AACAAGTCTCAGTAAGCCACTTGCGCCCCCTTCTGGGAGG360GGTTGACAACAACTCTTCCAACAATTCTAATTCCAGTAAC400GGGGACTCAGATTCCAATAGGCAAAGTGTCTCAGAATGCA440AAGTATGGCGAAATCCACTAAATTTATTTAGGGGTGCTGA480ATACAATCGGTATACTTGGGTGACAGGACGAGAGCCTCTT520ACTTACTATGACATGAATCTCTCTGCCCAAGACCACCAGA560CATTCTTTACTTGTGACTCGGACCATCTGCGTCCCGCAGA600TGCAATAATGCAGAAAGCCTGGAGAGAGAGAAACCCCCAA640GCTAGGATTTCTGCAGCTCATGAAGCCTTGGAGATAAATG680AAATTAGGTCCAGAGTTGAAGTTCCCCTAATTGCTTCCTC720TACCATCTGGGAGATAAAATTGTTACCAAAGTGTGCAACT760GCTTATATTCTCTTGGCTGAAGAGGAAGCAACAACCATTG800CTGAAGCAGAAAAATTATTTAAGCAGGCCCTGAAGGCTGG840AGATGGCTGTTACCGACGCTCTCAGCAGCTACAACATCAT880GGATCCCAGTATGAAGCCCAACATAGACGAGACACCAATG920TCTTGGTGTACATCAAAAGAAGGCTAGCAATGTGTGCCAG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。