演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ST6GAL2KIAA1877

ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2

ST6GAL2 編碼 ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2,屬於 glycosyltransferase 29 family,可將唾液酸轉移至特定半乳糖結構。

Homo sapiens2q12.3UniProt Q96JF0
OFFICIAL SYMBOL
ST6GAL2
CHROMOSOME
2
UNIPROT
Q96JF0
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ST6GAL2 是蛋白質編碼基因,其產物為 ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2,歸屬於 glycosyltransferase 29 family。這種酵素具有 alpha-2,6-sialyltransferase 活性,可將唾液酸轉移至特定含半乳糖的受體寡醣。來源資料指出,它對特定寡醣受體具有活性,但對糖蛋白與糖脂的活性較弱或沒有活性。

Official symbol
ST6GAL2
Gene name
ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10861
UniProt
Q96JF0
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
KIAA1877St6GalIISIAT2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 22q12.3
chr2 · 242,193,529 bp · GRCh38chr2p25.3 · 1–4400000 · gnegchr2p25.2 · 4400001–6900000 · gpos50chr2p25.1 · 6900001–12000000 · gnegchr2p24.3 · 12000001–16500000 · gpos75chr2p24.2 · 16500001–19000000 · gnegchr2p24.1 · 19000001–23800000 · gpos75chr2p23.3 · 23800001–27700000 · gnegchr2p23.2 · 27700001–29800000 · gpos25chr2p23.1 · 29800001–31800000 · gnegchr2p22.3 · 31800001–36300000 · gpos75chr2p22.2 · 36300001–38300000 · gnegchr2p22.1 · 38300001–41500000 · gpos50chr2p21 · 41500001–47500000 · gnegchr2p16.3 · 47500001–52600000 · gpos100chr2p16.2 · 52600001–54700000 · gnegchr2p16.1 · 54700001–61000000 · gpos100chr2p15 · 61000001–63900000 · gnegchr2p14 · 63900001–68400000 · gpos50chr2p13.3 · 68400001–71300000 · gnegchr2p13.2 · 71300001–73300000 · gpos50chr2p13.1 · 73300001–74800000 · gnegchr2p12 · 74800001–83100000 · gpos100chr2p11.2 · 83100001–91800000 · gnegchr2p11.1 · 91800001–93900000 · acenchr2q11.1 · 93900001–96000000 · acenchr2q11.2 · 96000001–102100000 · gnegchr2q12.1 · 102100001–105300000 · gpos50chr2q12.2 · 105300001–106700000 · gnegchr2q12.3 · 106700001–108700000 · gpos25chr2q13 · 108700001–112200000 · gnegchr2q14.1 · 112200001–118100000 · gpos50chr2q14.2 · 118100001–121600000 · gnegchr2q14.3 · 121600001–129100000 · gpos50chr2q21.1 · 129100001–131700000 · gnegchr2q21.2 · 131700001–134300000 · gpos25chr2q21.3 · 134300001–136100000 · gnegchr2q22.1 · 136100001–141500000 · gpos100chr2q22.2 · 141500001–143400000 · gnegchr2q22.3 · 143400001–147900000 · gpos100chr2q23.1 · 147900001–149000000 · gnegchr2q23.2 · 149000001–149600000 · gpos25chr2q23.3 · 149600001–154000000 · gnegchr2q24.1 · 154000001–158900000 · gpos75chr2q24.2 · 158900001–162900000 · gnegchr2q24.3 · 162900001–168900000 · gpos75chr2q31.1 · 168900001–177100000 · gnegchr2q31.2 · 177100001–179700000 · gpos50chr2q31.3 · 179700001–182100000 · gnegchr2q32.1 · 182100001–188500000 · gpos75chr2q32.2 · 188500001–191100000 · gnegchr2q32.3 · 191100001–196600000 · gpos75chr2q33.1 · 196600001–202500000 · gnegchr2q33.2 · 202500001–204100000 · gpos50chr2q33.3 · 204100001–208200000 · gnegchr2q34 · 208200001–214500000 · gpos100chr2q35 · 214500001–220700000 · gnegchr2q36.1 · 220700001–224300000 · gpos75chr2q36.2 · 224300001–225200000 · gnegchr2q36.3 · 225200001–230100000 · gpos100chr2q37.1 · 230100001–234700000 · gnegchr2q37.2 · 234700001–236400000 · gpos50chr2q37.3 · 236400001–242193529 · gnegST6GAL2pq1 bp242,193,529 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr2:106,801,600–106,887,286
Gene span
85,687 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000409382 ★106,801,600–106,886,1676
ENST00000361686106,801,600–106,887,1246
ENST00001017728106,801,600–106,887,2866
ENST00001081494106,801,600–106,887,2776
ENST00001081495106,801,600–106,886,6416
ENST00001145321106,801,600–106,886,6416
ENST00000868339106,801,602–106,887,2866
ENST00000868340106,801,605–106,887,2776
ENST00000361803106,801,608–106,830,0793
ENST00000964517106,806,109–106,844,0345
ENST00000977352106,812,794–106,887,2776
ENST00000409087106,813,076–106,887,1246

顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ST6GAL2 的產物可催化唾液酸轉移反應:以 CMP-sialic acid 作為供體,將唾液酸轉移至含半乳糖的受體。反應產物為帶有 N-acetyl-alpha-neuraminyl-(2->6) 結構的半乳糖衍生物,並同時生成 CMP 與 H+。

其 alpha-2,6-sialyltransferase 活性具有受體結構偏好。當寡醣的非還原端具有 Gal-beta-1,4-GlcNAc 序列時,ST6GAL2 可對其進行唾液酸化;相較之下,對糖蛋白與糖脂的活性較弱或沒有活性。這表示來源所支持的受體範圍主要是符合該末端序列的寡醣,不能據此推定它普遍修飾各類糖蛋白或糖脂。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 106886167 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ST6GAL2 ENST00000409382 GRCh38 chr2:106886067-106887167 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGTAGCCCGGCCTTCCGCGCTGGCGGGGGGAGGTGTTGGACAGGGTACACAAAGACTCACTTCCGCCGGG
GCAGGCGCCGGGACTCCCTCCTGGCCGCCCACAGCCTGTGCGCATTCCTGCATTCCTGCCGCCGCCCGGG
ACCCGAGTGCCCCGGAGGTGTCCAGGCGCGGTGCCAGGCGGGTACTGTGCAGGTAACCTTCGGAAGAACT
AGGGCTGGATGGAGGCGGCGGCCGGGGAGAAACACGCCTTTTTAGGCAGCCGTGCTGCCCCGCACCGCCC
CACGCAGCCCAAGTCTGCAGTCACTCTCCGCGACAAGCAGAAATCCGCGCGCAGCCAGGGAGCGCCCCGC
CTGCGCTCGCCGGCGGGCCGAGCTGCCGGGCCGGGGGCGCGGGGAGGGGGCAGCCCAACTTCCCAGTGCC
CGGCTCCCGCCAGCTAGGTGAGCCTGGAGCGGGAAGGATGAAAGGGATCGCGGAGAGGGAGGGGGCTCTG
GGGCGAGCGGAGCTCGGGGGCGGGGCGCGGCGCAGCCTCGGTGCGTGGGCCGGGAACCGCCGCCTCTCCC
CGGGGCTCGGGGCCGCGGTTCCTCTGGCCGCGGGAGCCGCCGCCGCGCTGCCCGAAACAATGAGGCGTGC
AGCGCGGGGCTGAGCGTAGCCTCCCGCCGGCTTTGAGGCCGAGCCACCCGCTGTGCCCCGCCGCCCGCGC
TTGCAGCTGCCGCCGGCGCGGAGCAGCGCTGGCCCCGGAGAGGTGATCCCGCAGGCCGCCTGGGACGGGA
GCGCGGGGCAGCTCCGAGACCCCACGGTGGCAGGAGGAGGACTCGAGCCTGCGGCAGGACGACTCCCGCC
GCGCACTCGCCTTCTGCAGCCCCCAAGTTCCGCGGCGTGAGTCGGGGACCCCGGCCAGGGTCCCAGCTCT
AGCGGGCGCCAGCGTGAGTGTGGGAGCGCGTAGCGCGCGCACCCGAGCGGCTGCCGGGGAATAAAATGTG
ACACGCACGCCTTGGACTCCAGTGCCGCGCTGCCAGGGGGAGCACCGAGCACCACGGTGTCGTGCGCTTC
GAGGCGCGGCGTGGGAAGAAGGCTGGTAAGGGAGGGCACTGGGTAAGGGTT
ST6GAL2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 4 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ST6GAL2_3 ↗2:106,886,167負股106,886,157–106,886,216
ST6GAL2_4 ↗2:106,886,576負股106,886,566–106,886,625
ST6GAL2_2 ↗2:106,887,088負股106,887,078–106,887,137
ST6GAL2_1 ↗2:106,887,277負股106,887,267–106,887,326

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR2_5X5QZN · CTCF_binding_site · 106882985–106883006 · regulatory

ENSR2_BR7PR · enhancer · 106885258–106886156 · regulatory

ENSR2_BR7PW · promoter · 106886157–106886862 · regulatory

ENSR2_5X5RJK · CTCF_binding_site · 106886204–106886225 · regulatory

ENSR2_855SXW · enhancer · 106886863–106887096 · regulatory

ENSR2_93KFH3 · promoter · 106887097–106887598 · regulatory

· motif · 106882987–106883003 · motif

· motif · 106886206–106886222 · motif

· motif · 106887048–106887057 · motif

· motif · 106888175–106888189 · motif

· motif · 106888175–106888189 · motif

來源記載 ST6GAL2 的調控與 IL6(interleukin-6)及 IL8(interleukin-8)相關,但未提供調控方向或作用條件。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:529 aa

1 aa529 aa跨膜區拓樸區域
依 Q96JF0 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ST6GAL2 蛋白長 529 個胺基酸,屬於 glycosyltransferase 29 family。其第 1–11 位為細胞質區,第 12–32 位為螺旋型跨膜區,並作為 type II 膜蛋白的訊號錨定區;第 33–529 位則位於腔內。

拓樸區域Cytoplasmic1–11 aa
跨膜區Helical; Signal-anchor for type II membrane protein12–32 aa
拓樸區域Lumenal33–529 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q96JF0…

AlphaFold · Q96JF0

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Golgi apparatus, Golgi stack membrane

ST6GAL2 位於高基氏體,並與高基氏體堆疊膜相關;其膜型態為單次跨膜的 type II 膜蛋白。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 14 個夥伴 · 最多顯示 50 個
KIAA1877ST6GAL2AQP6CD53FNDC9GIPC3GOLM1GPX8HSD17B13PGRMC2SLC26A1SLC39A2SLC7A1TIMMDC1TMEM14BTMEM237
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 14 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ST6GAL2 以 CMP-sialic acid 為唾液酸供體,對受體寡醣進行 alpha-2,6 唾液酸轉移;活性偏向非還原端具有 Gal-beta-1,4-GlcNAc 序列的寡醣,對糖蛋白與糖脂則較弱或沒有活性。含實驗來源
證據與來源

Transfers sialic acid from the donor of substrate CMP-sialic acid to galactose containing acceptor substrates. Has alpha-2,6-sialyltransferase activity toward oligosaccharides that have the Gal-beta-1,4-GlcNAc sequence at the non-reducing end of their carbohydrate groups, but it has weak or no activities toward glycoproteins and glycolipids

PMID 12235148 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性a beta-D-galactoside + CMP-N-acetyl-beta-neuraminate = an N-acetyl-alpha-neuraminyl-(2->6)-beta-D-galactosyl derivative + CMP + H(+)含實驗來源
證據與來源

a beta-D-galactoside + CMP-N-acetyl-beta-neuraminate = an N-acetyl-alpha-neuraminyl-(2->6)-beta-D-galactosyl derivative + CMP + H(+)

PMID 12235148 ↗ · PMID 12603328 ↗ · PMID 16439063 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ST6GAL2 位於高基氏體及其堆疊膜,屬於單次跨膜的 type II 膜蛋白。推論支持
證據與來源

Golgi apparatus, Golgi stack membrane / Single-pass type II membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

調控ST6GAL2 的調控與 IL6(interleukin-6)及 IL8(interleukin-8)相關;資料未說明調控的方向、條件或具體方式。含實驗來源
證據與來源

By IL6/interleukin-6 and IL8//interleukin-8

PMID 17944600 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000409382 · 6,800 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AGTGCCGCGCTGCCAGGGGGAGCACCGAGCACCACGGTGT40
41CGTGCGCTTCGAGGCGCGGCGTGGGAAGAAGGCTGGTTCA80
81TTCTGCCACCCATCTGCATTAAGACACAAGGTGCTGACCG120
121CAGAGACCTGCCATGAAACCACACTTGAAGCAATGGAGAC160
161AACGAATGCTTTTCGGAATATTCGCTTGGGGGCTCCTCTT200
201TTTGCTGATTTTCATCTACTTCACCGACAGCAACCCCGCT240
241GAGCCTGTACCCAGCTCCCTCTCCTTCCTGGAGACCAGGA280
281GGCTCCTGCCGGTGCAGGGGAAGCAGCGGGCCATCATGGG320
321CGCCGCACATGAGCCCTCCCCGCCTGGGGGCCTGGACGCA360
361CGCCAGGCGCTGCCCCGCGCCCACCCAGCCGGTTCCTTTC400
401ATGCGGGGCCTGGAGACCTGCAGAAATGGGCCCAGTCCCA440
441AGATGGGTTTGAACATAAAGAGTTTTTTTCATCCCAGGTG480
481GGGAGAAAATCTCAAAGTGCTTTCTACCCGGAGGATGACG520
521ACTACTTTTTTGCTGCTGGTCAGCCAGGGTGGCACAGCCA560
561CACTCAGGGGACATTGGGATTCCCTTCCCCCGGGGAGCCA600
601GGCCCACGGGAGGGGGCTTTTCCGGCTGCACAGGTCCAGA640
641GGAGGCGGGTGAAGAAGAGGCACCGGAGGCAGAGAAGGAG680
681CCACGTGTTGGAGGAGGGCGACGACGGCGACAGGCTGTAC720
721TCCTCCATGTCCAGGGCCTTCCTGTACCGGCTCTGGAAGG760
761GGAACGTCTCTTCCAAAATGCTGAACCCGCGCCTGCAGAA800
801GGCGATGAAGGATTACCTGACCGCCAACAAGCACGGGGTG840
841CGCTTCCGCGGGAAGCGGGAGGCCGGGCTGAGCAGGGCAC880
881AGCTGCTGTGCCAGCTGCGGAGCCGCGCGCGCGTGCGGAC920
921GCTGGACGGCACCGAGGCGCCCTTTTCTGCGCTGGGCTGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。