基因總覽
SSX5（SSX family member 5）是位於 X 染色體的蛋白質編碼基因，所屬蛋白質家族為 SSX family。其產物長 188 個胺基酸，具有 KRAB-related 區域，並含有一段被註記為無序的區域。現有資料將其可能角色描述為轉錄調節因子，但未提供更具體的作用方式或生物學情境。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000347757 ★ | 48,186,220–48,196,795 | 8 |
| ENST00000311798 | 48,186,220–48,196,797 | 9 |
| ENST00001132175 | 48,186,220–48,196,797 | 8 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SSX5 的蛋白質可能作為轉錄調節因子，影響轉錄活動。此功能描述以「可能」表述，現有資料未進一步說明 SSX5 如何作用於轉錄，也未指出其調節方向、作用靶點或所需條件。因此，目前能支持的功能範圍僅限於其可能調節轉錄，不能據此推定特定基因、轉錄複合體或分子機制。
Promoter 與基因調控
>SSX5 ENST00000347757 GRCh38 chrX:48196695-48197795 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TAGTGTGGGCAGGGTGGTGCATGCCTGTAGTCCCGAGGCCGAGGTGGGAGGATCCCTTCAGCCCAGCAGC TTGACGCCGGCCTGGCCAACATAACAAAACCTGGTTTCCACTAAAAAATAAAAATAAAAAAAAATTTAAA AAAGCGTCGGCAGGGTGGTGCATGCCTGTAGTCCCAGGGCTGCGGCGGGAGGATCGCTTGAGCCCAGGAT GATGAGACCAGCCTGGCCAATACAGCAAAACCGTCTCTATTAAAAAATCAAAAAACAAAAAATATGAGTG GGGGTGGGGTGGTTCCTGCCTGTAGTCCCGAGACTGAGGCGGAAGGATTGGCTAAGGTGGATGTAACCAA TACCACAATCACATCCCATAAGTAAATACATTTTCGTCTCTCCAGGGCTACAGGTAAAGGATGGTAATTG TGCACACCACACTTAGATTCCCTTTCAAAACTGTAATCAGAGGTTGGAGGGCCTTGGACTGTTTATTCAG TTGCAACAGATATAGAAGCCACTGAAGAATGAAAGCCACGACTAAGTACAGCAAAGCTCTGCAAATGTGC TAGTTTGGAAAACATTGTGTCTTTCAAGTGGAAAAATCACAGATCAACTATTTTTTTCTTCTCGCTGTTC AGACTAGAATACAGATGTTTAACCCAAGATCCAGGGACAGTCTTCAGAGAGTTCAACATCTCCTGACGGC GCCTGAGGACCACCCACTTTTTGGGTGTTGCAGTGGCAACAAAGTGTGGCTGGAGGAGGAGACAATATTG TGCAATGTCACTGCCCAAGGAGATGGACCAATCAGAGCAGTTAGTGAACTCCATCTGGCCAATCAGAAGT CAGAACAGTAGGCGGAACAAGCGAAGCTGATGTGGCGTCTGTCAGTCCAACCTCCAGGGACAGCACCTTC TCAAAGTGGGGGTGGAGACTCTAATTTTCCCGCCTAAAGCATACCCTGGGATTGGCTACTTTAAGTTCAG AGTACGCATGCTCTGACTTTCTCTCTCTCTCGATTTTTCCACAGAGTACGCACGCTCTGATTGTTTCGAT TCTTCCAAAATCAGAGTAAGCATTTGCTGATTTTCTTTTTCCATTCTTCCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
· motif · 48197020–48197029 · motif
· motif · 48197020–48197029 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：188 aa
SSX5 蛋白長 188 個胺基酸，屬於 SSX family。其第 20 至 83 位胺基酸區段註記為 KRAB-related；第 78 至 188 位則被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- AGTRAPQ6RW13 · UniProt INTERACTION · 5 experiments · 2 筆來源紀錄
- AKAP9Q6PJH3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CMTM5Q96DZ9-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GOLGA6L9A6NEM1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SYPP08247 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SSX5 蛋白可能具有調節轉錄的作用；資料僅指出這項可能性，未說明其作用機制、調節方向或特定生物學條件。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
CTCTCTCTCTCGATTTTTCCACAGAGTACGCACGCTCTGA40TTGTTTCGATTCTTCCAAAATCAGAGACAGAGTGCTCCCG80GTGCCATGAACGGAGACGATGCCTTTGTACGGAGACCTAG120GGTTGGTTCTCAAATACCAGAGAAGATGCAAAAGGCCTTC160GATGATATTGCCAAATACTTCTCTGAGAAAGAGTGGGAAA200AGATGAAAGCCTCGGAGAAAATCATCTATGTGTATATGAA240GAGAAAGTATGAGGCCATGACTAAACTAGGTTTCAAGGCC280ACCCTCCCACCTTTCATGCGTAATAAACGGGTCGCAGACT320TCCAGGGGAATGATTTTGATAATGACCCTAACCGTGGGAA360TCAGGTTGAACATCCTCAGATGACTTTCGGCAGGCTCCAG400GGAATCTTCCCGAAGATCACGCCCGAGAAGCCAGCAGAGG440AAGGAAATGATTCGAAGGGAGTGCCAGAAGCATCTGGCCC480ACAGAACAATGGGAAACAGCTGCGCCCCTCAGGAAAACTA520AATACCTCTGAGAAGGTTAACAAGACATCTGGACCCAAAA560GGGGGAAACATGCCTGGACCCACAGAGTGCGTGAGAGAAA600GCAACTGGTGATTTATGAAGAGATCAGCGACCCTCAGGAA640GATGACGAGTAACTCCCCTCGGGGATATGACACATGCCCA680TGATGAGAAGCAGAACGTGGTGACCTTTCACGAACATGGG720CATGGCTGCGGATCCCTCGTCATCAGGTGTATAGCAAGTG760AAAGCAAGTGTTCACAACAGTGAAAAGTTGAGCGTCATTT800TTCTTAGTGTGCCAAGAGTTCGATGTTAGTGTTTCTGTTG840TATTTTGTTACAGTGTGCCATTCTGTTAGATATTAGCGTT880TTCACTGATGAGCAAGACATACTTAATGCATATTTCAGTT920TGTGTATCCATGCACCTACCTCAGAAAACAAGTATCGTCA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。