01 / GENE OVERVIEW
基因總覽
SSX4（SSX family member 4）是位於 X 染色體的蛋白質編碼基因，所產生的蛋白質屬於 SSX family。現有資料將其可能角色描述為轉錄調節因子，但未提供更具體的作用方式或生物學情境，因此此功能仍應視為可能性，而非已確立的結論。
Official symbol
SSX4
Gene name
SSX family member 4
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11338
UniProt
O60224
02 / NOMENCLATURE
基因異名與舊稱
Alternative gene names & synonyms
CT5.4
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
03 / GENOMIC CONTEXT
染色體位置與基因結構
Chromosome XXp11.23
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chrX:48,383,516–48,393,347
Gene span
9,832 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000595689 ★ | 48,383,539–48,393,347 | 8 |
| ENST00000620320 | 48,383,516–48,393,347 | 7 |
| ENST00001132333 | 48,383,516–48,393,347 | 8 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
04 / BIOLOGICAL FUNCTION
分子功能與生物學過程
SSX4 的功能資料指出，它可能作為轉錄的調節因子。這項描述僅提出可能的角色，未說明它如何影響轉錄，也沒有提供特定細胞、組織或生物學過程中的證據；因此，目前可據以整理的功能範圍有限，不宜進一步推定其作用機制或調控方向。
05 / GENE REGULATION
Promoter 與基因調控
依所選 TSS 來源，取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算；調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SSX4 ENST00000595689 GRCh38 chrX:48382539-48383639 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AACCCAAATGTCCAACAATGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATATACACCATGGAATACTATGC AGCCATAAAAATTGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAATTGGAAATCATCATTCTCAGT AAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCATATTCTCACTCATAGGTGGGAATTGAACAATGAGAT CACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGACTGTTGTGGGGTGGGGGGAGGGGGGAGGGATA GCATTGGGAGATATACCCAATGCTAGATGACGAGTTAGTGGGTGCAGCGCACCAGCGTGGCACATGTATA CATATGTAACTAACCTGCACAATGTGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAATAAAAGAAAAAAA AAAGAAAACTACAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAATAAGAATAAAAGAGGTTGGAGGGCCTTGGACT GTTTTTTTAGTTCCAACAGATGTAGAAGCCACTGAAGAATGAACTCCACGACTAAGTACAGCAAACCTCC GCAAATGTGCTAGTTTGGAAAACATTGTGTCTTTCAAATAGAAAAATCACAGATCGACTATTTTTTCTTC CCACGGTTCAGACTAGAATCCAGATGTTTAACCCAAGATCCAGGGACGGTCTTCAGAGAGTTCAAAATCT CCTGATGGCGCCTGAGGACCACCCACTTTGTCGCACAAAGTGTGGCTGGAGGAGGCGACAACATTCTGCA ATGTCACTGCCCAAGGATGATGGACCAATCAGGGCAGTTAGTGAACTCCATCTGGCCAATTAGAAGTCAG AACAGTAGGCGGAACAAGCGAAGCTGATGTGGCGTCTGTCAGTCCAGGCTCTAGGGACAGAACCTTCCCA AGGCGGGGGGGAGGGGAGACTCTGATTTTCCCGCCGAAAGCGTCCCCTTGGATTGGCTACTTTAAATTCA GAGTACGCACACGCCGATTTGCCCTTTTGATTCTTCCACAATCAGGGTAAGCATGCGCTGATTTTCTCTT TCCATTCTTCCTACCCCTCCCCTCCGCCGTGGTGCACTTCTTATCTAATTT
SSX4 位於正股。上下游依轉錄方向計算，序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示；負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SSX4_1 ↗ | X:48,383,539 | 正股 | 48,383,490–48,383,549 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算；該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：188 aa
Protein SSX4 長 188 個胺基酸，屬於 SSX family。序列第 20–83 位註記為 KRAB-related 結構域；第 116–167 位則被註記為無序區域。
結構域KRAB-related20–83 aa
功能區域Disordered116–167 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY
蛋白質三維結構
自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O60224…
08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION
細胞內定位
定位：尚未取得定位註解
UniProtKB
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
09 / PROTEIN NETWORK
交互作用與訊號網絡
圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
來源支持的結構／直接結合關係其他來源關係紀錄
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
3 個夥伴
- C14orf119Q9NWQ9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FLACC1Q96Q35-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HIF1AQ16665 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
第 1 頁
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
10 / HUMAN HEALTH
疾病與遺傳關聯
目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據；基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX
Contextual Functional Evidence Matrix
功能證據與細胞情境矩陣
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
1 筆功能證據／註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預／量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」，空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SSX4 可能參與轉錄調節；這項描述屬於可能性，來源未提供更具體的作用機制或相關情境。 | 資料庫紀錄 |
情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀，不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識；未逐篇核對原始方法的紀錄，不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER
核酸與蛋白質序列
完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列，保留非編碼區。
1
GCCCTTTTGATTCTTCCACAATCAGGGTGAGACTGCTCCC4041
AGTGCCATGAACGGAGACGACGCCTTTGCAAGGAGACCCA8081
GGGATGATGCTCAAATATCAGAGAAGTTACGAAAGGCCTT120121
CGATGATATTGCCAAATACTTCTCTAAGAAAGAGTGGGAA160161
AAGATGAAATCCTCGGAGAAAATCGTCTATGTGTATATGA200201
AGCTAAACTATGAGGTCATGACTAAACTAGGTTTCAAGGT240241
CACCCTCCCACCTTTCATGCGTAGTAAACGGGCTGCAGAC280281
TTCCACGGGAATGATTTTGGTAACGATCGAAACCACAGGA320321
ATCAGGTTGAACGTCCTCAGATGACTTTCGGCAGCCTCCA360361
GAGAATCTTCCCGAAGATCATGCCCAAGAAGCCAGCAGAG400401
GAAGAAAATGGTTTGAAGGAAGTGCCAGAGGCATCTGGCC440441
CACAAAATGATGGGAAACAGCTGTGCCCCCCGGGAAATCC480481
AAGTACCTTGGAGAAGATTAACAAGACATCTGGACCCAAA520521
AGGGGGAAACATGCCTGGACCCACAGACTGCGTGAGAGAA560561
AGCAGCTGGTGGTTTATGAAGAGATCAGCGACCCTGAGGA600601
AGATGACGAGTAACTCCCCTCGGGGATATGACACATGCCC640641
ATGATGAGAAGCAGAACGTGGTGACCTTTCACGAACATGG680681
GCATGGCTGCGGACCCCTCGTCATCAGGTGCATAGCAAGT720721
GAAAGCAAGTGTTCACAACAGTGAAAAGTTGAGCGTCATT760761
TTTCTTAGTGTGCCAAGAGTTCGATGTTGGCGTTTCCGCT800801
GTATTTTCTTGCAGTGTGCCATTCTGTTAGACATTAGCGT840841
TTTCGTTGATGAGCAAGACATGCTTAATGCATATTTCGGC880881
TTGTGTATCCATGCACCTACCTCAGAAAACAAGTATTGTC920921
AGGTATTCTCTCCATAGAACAGCACTACCCTCCTCTCTCC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。
13 / DATA PROVENANCE