演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
基因索引
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Human Gene Atlas›SSX3
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SSX3CT5.3

SSX family member 3

SSX3 是 SSX family member 3，屬於 SSX family 的蛋白質；來源指出它可能調節轉錄。

Homo sapiensXp11.23UniProt Q99909
OFFICIAL SYMBOL
SSX3
CHROMOSOME
X
UNIPROT
Q99909
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SSX3（SSX family member 3）是位於 X 染色體 Xp11.23 的蛋白質編碼基因，產物屬於 SSX family。其蛋白質長 188 個胺基酸，帶有 KRAB-related 區域，並含有一段被註記為無序的區域。現有資料對其主要角色僅提供概括性描述，未詳述其他生物學功能。

Official symbol
SSX3
Gene name
SSX family member 3
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11337
UniProt
Q99909
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CT5.3

異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome XXp11.23
chrX · 156,040,895 bp · GRCh38chrXp22.33 · 1–4400000 · gnegchrXp22.32 · 4400001–6100000 · gpos50chrXp22.31 · 6100001–9600000 · gnegchrXp22.2 · 9600001–17400000 · gpos50chrXp22.13 · 17400001–19200000 · gnegchrXp22.12 · 19200001–21900000 · gpos50chrXp22.11 · 21900001–24900000 · gnegchrXp21.3 · 24900001–29300000 · gpos100chrXp21.2 · 29300001–31500000 · gnegchrXp21.1 · 31500001–37800000 · gpos100chrXp11.4 · 37800001–42500000 · gnegchrXp11.3 · 42500001–47600000 · gpos75chrXp11.23 · 47600001–50100000 · gnegchrXp11.22 · 50100001–54800000 · gpos25chrXp11.21 · 54800001–58100000 · gnegchrXp11.1 · 58100001–61000000 · acenchrXq11.1 · 61000001–63800000 · acenchrXq11.2 · 63800001–65400000 · gnegchrXq12 · 65400001–68500000 · gpos50chrXq13.1 · 68500001–73000000 · gnegchrXq13.2 · 73000001–74700000 · gpos50chrXq13.3 · 74700001–76800000 · gnegchrXq21.1 · 76800001–85400000 · gpos100chrXq21.2 · 85400001–87000000 · gnegchrXq21.31 · 87000001–92700000 · gpos100chrXq21.32 · 92700001–94300000 · gnegchrXq21.33 · 94300001–99100000 · gpos75chrXq22.1 · 99100001–103300000 · gnegchrXq22.2 · 103300001–104500000 · gpos50chrXq22.3 · 104500001–109400000 · gnegchrXq23 · 109400001–117400000 · gpos75chrXq24 · 117400001–121800000 · gnegchrXq25 · 121800001–129500000 · gpos100chrXq26.1 · 129500001–131300000 · gnegchrXq26.2 · 131300001–134500000 · gpos25chrXq26.3 · 134500001–138900000 · gnegchrXq27.1 · 138900001–141200000 · gpos75chrXq27.2 · 141200001–143000000 · gnegchrXq27.3 · 143000001–148000000 · gpos100chrXq28 · 148000001–156040895 · gnegSSX3pq1 bp156,040,895 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chrX:48,337,725–48,356,750
Gene span
19,026 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000298396 ★48,346,427–48,356,7038
ENST0000109540148,337,725–48,356,7508
ENST0000109540348,346,427–48,356,7507
ENST0000113652748,346,427–48,356,7508
ENST0000037689348,348,257–48,356,7508
ENST0000061249748,349,446–48,355,2725

顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SSX3 的功能資料指出，它可能作為轉錄調節因子。這項描述保留「可能」的語氣，代表來源提出的是潛在作用，而非已明確界定的轉錄調控機制。

現有資料沒有進一步說明 SSX3 影響哪些基因、如何作用於轉錄過程，或其作用方向與條件，因此無法據此推定特定的分子路徑或生物學結果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準：負數為上游、正數為下游，包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 48356703 · 負股
查看轉錄本與 TSS ↗
依所選 TSS 來源，取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算；調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SSX3 ENST00000298396 GRCh38 chrX:48356603-48357703 strand=-1 5′→3′
相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter
AGGCAGGGTAGTGCATGCCTGTAGTCTCGAGGCCATGGTGGAAGAATGCCTTGAGCCCAGGACGATGAGA
CCAACCTGGCCAATGAGACCAGCCTGGCCAACATAGCAAAACCTGGTTTCTACTTAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAGCGTAGGCAGGGTGGTGAATGCCTGTAGTCCCGAGGCCGAGGTGGGAGGATCGCTTGAGCCCA
GGACGTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGCAAAACCTTCTCTATTAAAAAATCAAAAAATAAAAAATATT
AGTGGGGGTGGGGTGGTTTGCGCCTGTAGTCCCGAGACAGAGGCGGGAGGATTGGCCAAGGCAGATGTAA
CCAATACCACAATCACATCCCATAAGTAAATACATTTTCCTCTCTCCAGGGCTACAGGTAAAGGATGGTA
ATTCTGCACACCACACTTAGATTCCCTTTCAAAAATGTAAGCAGAGGTTGGAGGGCCTTGGACTGTTTTT
TCAGTGGCAACAGATATAGAAGCCACTGAAGAATGAACTCCACGACTAATTATAGCAAACCTCCGCAAAT
GTGCTAGTTTGGAAAACATTGTGGCTTTCAAGTAGAAAAATCACAGATTGACTATTTTTTTCTTCCCACA
GTTCAGACTAGAATCCAGATTTTTAACCCAAGATCCAGGAACAGTCTTCAGAGAGATCAAAATCTGACGG
CGCCTGAGGACCACCCACTTTTTCGCAGTGGCGACAAGGTGTGGCTGGAGGAGGAGACATTATTCTGCAA
TGTCGCTGCCCAAGGATGATGGACCAATCAGGGCAGTTAGTGAACTCCATCTGGCCAATTAGAAGTCAGA
ACAGTAGGCGGAACAAGCGAAGCGGATGTGGCTTCTATCAGTCCCGGCTCCAGGGACACAACCTTCTCAA
AGTGGGGGTGGAGACTCTAATTTTCCCGCCTAAAGCATCCCCTGGGATTCGCTACTTTAAGTTCAGAGTA
CGCATGCTCTGATTTTCTCTCTCTTTCGATTCTTCCATACTCAAGAGTACGCACGGTCTGATTTTCTCTT
TGGATTCTTCCAAAATCAGAGTAAGAATACACTGATTTTCTTTTTCCATTC
SSX3 位於負股。上下游依轉錄方向計算，序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示；負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS（1-based）股向來源顯示區間
SSX3_1 ↗X:48,356,701負股48,356,691–48,356,750

EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算；該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度：188 aa

1 aa188 aa結構域功能區域
依 Q99909 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製；結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列，重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型，並非活性或信心分數。

SSX3 蛋白長 188 個胺基酸，屬於 SSX family。其第 20 至 83 位胺基酸區段註記為 KRAB-related；第 113 至 162 位則被標示為無序區域。

結構域KRAB-related20–83 aa
功能區域Disordered113–162 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q99909…

AlphaFold · Q99909

現有 AlphaFold DB 預測；低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型；依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質；細胞核內有核仁，粗面內質網鄰接核膜，粒線體含內膜摺疊，高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位，器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量；未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體：外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡（示意）
定位：尚未取得定位註解
UniProtKB

動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 16 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CT5.3SSX3AGTRAPAKAP9CBY2CEP63CEP70CMTM4CMTM5KRT27MED4MEOX2MIPOL1PIH1D2RABGEF1RHOJSSX2IPZNG1A
來源支持的結構／直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 16 個夥伴
16 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

SSX3 與 SSX2IP 有交互作用。來源未進一步說明這項關係是否涉及直接結合或特定複合體，也未提供其功能後果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據；基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據／註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預／量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」，空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SSX3 可能作為轉錄調節因子；來源以可能性描述此作用，未提供具體的調控機制、作用標的或條件。資料庫紀錄
證據與來源

Could act as a modulator of transcription

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用SSX3 與 SSX2IP 有交互作用；來源未說明此關係是否為直接結合，也未描述相關複合體或功能後果。含實驗來源
證據與來源

Interacts with SSX2IP

PMID 12007189 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀，不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識；未逐篇核對原始方法的紀錄，不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000298396 · 1,270 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列，保留非編碼區。
1CTCTTTCGATTCTTCCATACTCAAGAGTACGCACGGTCTG40
41ATTTTCTCTTTGGATTCTTCCAAAATCAGAGTCAGACTAC80
81TCCCTGTGCCATGAACGGAGATGACACCTTTGCAAGGAGA120
121CCCACGGTTGGTGCTCAAATACCAGAGAAGATACAAAAGG160
161CCTTCGATGATATTGCCAAATACTTCTCTAAGGAAGAGTG200
201GGAAAAGATGAAAGTCTCGGAGAAAATCGTCTATGTGTAT240
241ATGAAGAGAAAGTATGAGGCCATGACTAAACTAGGTTTCA280
281AGGCCATCCTCCCATCTTTCATGCGTAATAAACGGGTCAC320
321AGACTTCCAGGGGAATGATTTTGATAATGACCCTAACCGT360
361GGGAATCAGGTTCAACGTCCTCAGATGACTTTCGGCAGGC400
401TCCAGGGAATCTTCCCGAAGATCATGCCCAAGAAGCCAGC440
441AGAGGAAGGAAATGTTTCGAAGGAAGTGCCAGAAGCATCT480
481GGCCCACAAAACGATGGGAAACAGCTGTGCCCCCCGGGAA520
521AACCAACTACCTCTGAGAAGATTAACATGATATCTGGACC560
561CAAAAGGGGGGAACATGCCTGGACCCACAGACTGCGTGAG600
601AGAAAGCAGCTGGTGATTTATGAAGAGATCAGCGATCCTG640
641AGGAAGATGATGAGTAACTCCCCTTGGGGATATGACACAT680
681GCCCATGATGAGAAGCAGAACGTGGTGACCTTTCACGAAC720
721ATGGGCATGGCTGTGGACCCCTCGTCATCAGGTGCATAGC760
761AAGTGAAAGCAAGTGTTCACAACAGTGAAAAGTTGAGCGT800
801CATTTTTCTTAGTGTGCCAAGAGTACGATATTAGCGTTTC840
841CATTGTATTTTCTTGAAGTGTGTCATTCTGTTAGATATTA880
881ACATTTTCACTGATGAGCAAGACATACTTAATGCATATTT920
921TGGTTTGTGTATCCATGCACCTACCTTAGAAAACAAGTAT960

cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。

13 / DATA PROVENANCE

資料來源與研究連結

HGNC ↗NCBI Gene ↗Ensembl ↗UniProtKB ↗AlphaFold DB ↗EPDnew v006 · UCSC ↗

HGNC · CC0 ↗ · UniProt Consortium · CC BY 4.0 ↗ · Ensembl · 資料使用說明 ↗ · AlphaFold DB · CC BY 4.0 ↗ · EPD team／SIB · CC BY 4.0 ↗

資料更新：2026-11-05