演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SSTR5

somatostatin receptor 5

SSTR5 是 somatostatin receptor 5,屬於 G protein-coupled receptor 1 家族,可辨識 somatostatin,並透過 G proteins 抑制 adenylyl cyclase。

Homo sapiens16p13.3UniProt P35346
OFFICIAL SYMBOL
SSTR5
CHROMOSOME
16
UNIPROT
P35346
PDB / ALPHAFOLD
8X8L
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SSTR5 基因是蛋白質編碼基因,其產物 somatostatin receptor 5 屬於 G protein-coupled receptor 1 家族。這種受體是多次穿越細胞膜的膜蛋白,具有七段跨膜螺旋;序列兩端及各段跨膜區之間的區域分布於細胞外側或細胞質側。其胞質端較長,部分區域被註記為無序區。這些結構特徵構成受體的基本架構,並使其能在細胞膜上接收 somatostatin 訊號。

Official symbol
SSTR5
Gene name
somatostatin receptor 5
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11334
UniProt
P35346
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616p13.3
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegSSTR5pq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr16:1,063,867–1,081,470
Gene span
17,604 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000689027 ★1,072,747–1,081,4542
ENST000007116151,063,867–1,081,4702
ENST000008865191,072,745–1,081,4703
ENST000009642741,072,745–1,081,4703
ENST000009642751,072,745–1,081,4703
ENST000009642761,072,745–1,081,4703
ENST000011396531,072,745–1,081,4702
ENST000009642771,073,700–1,081,4702
ENST000002938971,078,781–1,081,4541
ENST000007116161,078,842–1,081,4542

顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SSTR5 是 somatostatin 的受體,對 somatostatin 28 有反應,對 somatostatin-14 的反應程度較低。配體與受體作用後,訊號由 G proteins 傳遞,並抑制 adenylyl cyclase。這是來源所述的主要訊號作用方式;現有資料未進一步說明不同配體如何影響此路徑,也未提供下游反應的細節,因此不宜延伸推論其他機制。

SSTR5 也與 SSTR2 的細胞生長抑制活性相關:兩者形成異源二聚體後,SSTR2 的細胞生長抑制活性增加。這項描述指出 SSTR5 可在與另一種 somatostatin receptor 結合時,影響 SSTR2 的功能表現;增加的活性明確指向 SSTR2,而非資料所稱的 SSTR5 自身活性。來源未提供此效果發生的細胞或實驗條件,也未說明異源二聚體如何造成活性增強。

因此,來源支持的功能重點包括 somatostatin 配體辨識、經 G proteins 抑制 adenylyl cyclase,以及與 SSTR2 異源二聚後增強其細胞生長抑制活性。這些主張分別描述受體訊號傳遞與受體間的功能關係,不能據此推定更廣泛的生理作用或未提及的下游機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 1072747 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SSTR5 ENST00000689027 GRCh38 chr16:1071747-1072847 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GTCCCGGTACCCGGCCTTCAAGGGAGCTGCTGGCGCCTGTTCAACAGGAGCCGACCCCACCTGTGAACAG
ACGGCAGGCGGCTGCTCCCATGTCCCCTCAGAGAGGGGCCCTCCGAGTTCTGCTGTCACCTGGGGGCGCC
TCACTTCATTCAGCCAGTGGCGGGGCTCCCTGGGTCGGCACAGAGTCAGGGGAGGGGGCTGGGGGACCTC
CTGGTGGGAAAATGTCCGGTGATCCCCAGCCTCCGCGCTCAGCGGGAGGAGGCGCTCGGTCCCGCTTCTT
ACAACCAGCGGCGCTCACGGCGGGCCCGGGGATCAGCATCCCGGGAGCTTCTCAGGAATGCAGATTCCCA
GGCCCTCACTGCCTGGGGAGTCGGGGGCCCAGCTCGAGGCCCAGGAATCTGCTTTGAGGACCCAGGTGAC
TCTGCTGCCTGCCTGAGAACCCCACCTTAGGTGAGGGACTAAGGTGTACCCATGGATTCATTTCAGGGGA
AATAAAAAGAACAACTTAGCAGGTAGTCTATGCTTAAATATGTGTAGGATCCACAAATAAGGCATGGATA
AAACCCGAGTGGAGTGTCCTGGAAATCCCACGACCACGGACCCCCCTCGCTGGGGCTGCCTGCCGCCCCC
ACCAGCCTCCACACACCCACTTATCTCCACAACCCCAGCCCACCCCTCAGAGACGTCTGCAGAGCCCCTG
ACCCTCTCCCCTTGAACAAGGACCCTCCACCCTCTTCAGACTCTCGACGAGGGACCCCCTGGACTCCTGC
TGGCGGCAGGACCCCCACCCCAAGCTGGGGTCTACCACAGAGCGGACAGCAAGAAAATAGGGTGGGGGCG
CAGGCGATCATGGGGTCACTGCCAGTGGGACCAGGGCTGTGGGCGAGTGCGCCAGGGTTCCCGGAGGCCA
GACGTGGGACCCGGGAGTCGAGCAGGTGAAGCGGCCCTGCCCCGCCCCCACCAGGCACTGCCCCGCCCCC
GCCCCGCCCCGCCCCCTCCCAGCCGGCGCCCGGGAGCCCGGAGCCAGTGCCGCGCGGACATCGGGGCTCC
CCCGTTCAGAGGGCGCCGCCGCCCAGGTGAGTGCCGCCCGCCCCTGTCCCC
SSTR5 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_9FG7 · enhancer · 1068484–1068809 · regulatory

ENSR16_9FGF · enhancer · 1069215–1069470 · regulatory

ENSR16_9FGT · enhancer · 1070684–1071044 · regulatory

ENSR16_B7Q4 · enhancer · 1071603–1072255 · regulatory

ENSR16_73NZK · promoter · 1072657–1072757 · regulatory

ENSR16_B7QD · enhancer · 1073722–1074252 · regulatory

· motif · 1067750–1067767 · motif

· motif · 1067752–1067767 · motif

· motif · 1067759–1067767 · motif

· motif · 1067767–1067784 · motif

· motif · 1067788–1067796 · motif

· motif · 1067794–1067811 · motif

· motif · 1067818–1067835 · motif

· motif · 1067820–1067835 · motif

· motif · 1067827–1067844 · motif

· motif · 1067836–1067844 · motif

· motif · 1067836–1067853 · motif

· motif · 1067845–1067862 · motif

· motif · 1067854–1067862 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:364 aa

1 aa364 aa功能區域跨膜區拓樸區域
依 P35346 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

somatostatin receptor 5 長 364 個胺基酸,屬於 G protein-coupled receptor 1 家族,具有七段跨膜螺旋。序列包含細胞外、細胞質側拓樸區域;N 端前 20 個胺基酸及 C 端第 327–364 位被註記為無序區。

拓樸區域Extracellular1–38 aa
跨膜區Helical; Name=139–66 aa
拓樸區域Cytoplasmic67–76 aa
跨膜區Helical; Name=277–101 aa
拓樸區域Extracellular102–113 aa
跨膜區Helical; Name=3114–135 aa
拓樸區域Cytoplasmic136–157 aa
跨膜區Helical; Name=4158–178 aa
拓樸區域Extracellular179–197 aa
跨膜區Helical; Name=5198–222 aa
拓樸區域Cytoplasmic223–247 aa
跨膜區Helical; Name=6248–273 aa
拓樸區域Extracellular274–283 aa
跨膜區Helical; Name=7284–308 aa
拓樸區域Cytoplasmic309–364 aa
功能區域Disordered1–20 aa
功能區域Disordered327–364 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 8X8L…

PDB · 8X8L

EM · 2.70 A · R=1-364

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

somatostatin receptor 5 位於細胞膜,屬於多次穿越膜的蛋白質。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 28 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SSTR5SSTR5APBA1APBA2DLG1DLG3DLG4ERBINFRMPD2GRID2IPGRIP1GRIP2IL16LNX1LNX2MAGI1MAGI2MPDZNHERF4PATJPDZK1RAMP1RAMP2RAMP3SCRIBSSTR1SSTR2SSTR4TJP1WHRN
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 28 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

SSTR5 與 SSTR2 形成異源二聚體;此異源二聚化會增加 SSTR2 的細胞生長抑制活性。資料描述的是複合體形成及其功能效果,未列出其他結合夥伴。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SSTR5 可辨識 somatostatin 28,對 somatostatin-14 的作用程度較低。其受體活性由 G proteins 傳遞,並抑制 adenylyl cyclase;此外,SSTR5 與 SSTR2 形成異源二聚體後,會增加 SSTR2 的細胞生長抑制活性。含實驗來源
證據與來源

Receptor for somatostatin 28 and to a lesser extent for somatostatin-14. The activity of this receptor is mediated by G proteins which inhibit adenylyl cyclase. Increases cell growth inhibition activity of SSTR2 following heterodimerization

PMID 12072395 ↗ · PMID 7908405 ↗ · PMID 8078491 ↗ · PMID 8373420 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用SSTR5 可與 SSTR2 形成異源二聚體;形成此異源二聚體後,SSTR2 的細胞生長抑制活性增加。含實驗來源
證據與來源

Heterodimer with SSTR2. Heterodimerization with SSTR2 increases cell growth inhibition activity of SSTR2

PMID 18653781 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SSTR5 位於細胞膜,並屬於多次穿越膜的蛋白質。資料庫紀錄
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000689027 · 2,689 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGCCGGCGCCCGGGAGCCCGGAGCCAGTGCCGCGCGGACA40
41TCGGGGCTCCCCCGTTCAGAGGGCGCCGCCGCCCAGAGCC80
81TGACGCACCCCAGGGCTGCCGCCATGGAGCCCCTGTTCCC120
121AGCCTCCACGCCCAGCTGGAACGCCTCCTCCCCGGGGGCT160
161GCCTCTGGAGGCGGTGACAACAGGACGCTGGTGGGGCCGG200
201CGCCCTCGGCAGGGGCCCGGGCGGTGCTGGTGCCCGTGCT240
241GTACCTGCTGGTGTGTGCGGCCGGGCTGGGCGGGAACACG280
281CTGGTCATCTACGTGGTGCTGCGCTTCGCCAAGATGAAGA320
321CCGTCACCAACATCTACATTCTCAACCTGGCAGTGGCCGA360
361CGTCCTGTACATGCTGGGGCTGCCTTTCCTGGCCACGCAG400
401AACGCCGCGTCCTTCTGGCCCTTCGGCCCCGTCCTGTGCC440
441GCCTGGTCATGACGCTGGACGGCGTCAACCAGTTCACCAG480
481TGTCTTCTGCCTGACAGTCATGAGCGTGGACCGCTACCTG520
521GCAGTGGTGCACCCGCTGAGCTCGGCCCGCTGGCGCCGCC560
561CGCGTGTGGCCAAGCTGGCGAGCGCCGCGGCCTGGGTCCT600
601GTCTCTGTGCATGTCGCTGCCGCTCCTGGTGTTCGCGGAC640
641GTGCAGGAGGGCGGTACCTGCAACGCCAGCTGGCCGGAGC680
681CCGTGGGGCTGTGGGGCGCCGTCTTCATCATCTACACGGC720
721CGTGCTGGGCTTCTTCGCGCCGCTGCTGGTCATCTGCCTG760
761TGCTACCTGCTCATCGTGGTGAAGGTGAGGGCGGCGGGCG800
801TGCGCGTGGGCTGCGTGCGGCGGCGCTCGGAGCGGAAGGT840
841GACGCGCATGGTGTTGGTGGTGGTGCTGGTGTTTGCGGGA880
881TGTTGGCTGCCCTTCTTCACCGTCAACATCGTCAACCTGG920
921CCGTGGCGCTGCCCCAGGAGCCCGCCTCCGCCGGCCTCTA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。