基因總覽
SSTR5 基因是蛋白質編碼基因,其產物 somatostatin receptor 5 屬於 G protein-coupled receptor 1 家族。這種受體是多次穿越細胞膜的膜蛋白,具有七段跨膜螺旋;序列兩端及各段跨膜區之間的區域分布於細胞外側或細胞質側。其胞質端較長,部分區域被註記為無序區。這些結構特徵構成受體的基本架構,並使其能在細胞膜上接收 somatostatin 訊號。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000689027 ★ | 1,072,747–1,081,454 | 2 |
| ENST00000711615 | 1,063,867–1,081,470 | 2 |
| ENST00000886519 | 1,072,745–1,081,470 | 3 |
| ENST00000964274 | 1,072,745–1,081,470 | 3 |
| ENST00000964275 | 1,072,745–1,081,470 | 3 |
| ENST00000964276 | 1,072,745–1,081,470 | 3 |
| ENST00001139653 | 1,072,745–1,081,470 | 2 |
| ENST00000964277 | 1,073,700–1,081,470 | 2 |
| ENST00000293897 | 1,078,781–1,081,454 | 1 |
| ENST00000711616 | 1,078,842–1,081,454 | 2 |
顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SSTR5 是 somatostatin 的受體,對 somatostatin 28 有反應,對 somatostatin-14 的反應程度較低。配體與受體作用後,訊號由 G proteins 傳遞,並抑制 adenylyl cyclase。這是來源所述的主要訊號作用方式;現有資料未進一步說明不同配體如何影響此路徑,也未提供下游反應的細節,因此不宜延伸推論其他機制。
SSTR5 也與 SSTR2 的細胞生長抑制活性相關:兩者形成異源二聚體後,SSTR2 的細胞生長抑制活性增加。這項描述指出 SSTR5 可在與另一種 somatostatin receptor 結合時,影響 SSTR2 的功能表現;增加的活性明確指向 SSTR2,而非資料所稱的 SSTR5 自身活性。來源未提供此效果發生的細胞或實驗條件,也未說明異源二聚體如何造成活性增強。
因此,來源支持的功能重點包括 somatostatin 配體辨識、經 G proteins 抑制 adenylyl cyclase,以及與 SSTR2 異源二聚後增強其細胞生長抑制活性。這些主張分別描述受體訊號傳遞與受體間的功能關係,不能據此推定更廣泛的生理作用或未提及的下游機制。
Promoter 與基因調控
>SSTR5 ENST00000689027 GRCh38 chr16:1071747-1072847 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GTCCCGGTACCCGGCCTTCAAGGGAGCTGCTGGCGCCTGTTCAACAGGAGCCGACCCCACCTGTGAACAG ACGGCAGGCGGCTGCTCCCATGTCCCCTCAGAGAGGGGCCCTCCGAGTTCTGCTGTCACCTGGGGGCGCC TCACTTCATTCAGCCAGTGGCGGGGCTCCCTGGGTCGGCACAGAGTCAGGGGAGGGGGCTGGGGGACCTC CTGGTGGGAAAATGTCCGGTGATCCCCAGCCTCCGCGCTCAGCGGGAGGAGGCGCTCGGTCCCGCTTCTT ACAACCAGCGGCGCTCACGGCGGGCCCGGGGATCAGCATCCCGGGAGCTTCTCAGGAATGCAGATTCCCA GGCCCTCACTGCCTGGGGAGTCGGGGGCCCAGCTCGAGGCCCAGGAATCTGCTTTGAGGACCCAGGTGAC TCTGCTGCCTGCCTGAGAACCCCACCTTAGGTGAGGGACTAAGGTGTACCCATGGATTCATTTCAGGGGA AATAAAAAGAACAACTTAGCAGGTAGTCTATGCTTAAATATGTGTAGGATCCACAAATAAGGCATGGATA AAACCCGAGTGGAGTGTCCTGGAAATCCCACGACCACGGACCCCCCTCGCTGGGGCTGCCTGCCGCCCCC ACCAGCCTCCACACACCCACTTATCTCCACAACCCCAGCCCACCCCTCAGAGACGTCTGCAGAGCCCCTG ACCCTCTCCCCTTGAACAAGGACCCTCCACCCTCTTCAGACTCTCGACGAGGGACCCCCTGGACTCCTGC TGGCGGCAGGACCCCCACCCCAAGCTGGGGTCTACCACAGAGCGGACAGCAAGAAAATAGGGTGGGGGCG CAGGCGATCATGGGGTCACTGCCAGTGGGACCAGGGCTGTGGGCGAGTGCGCCAGGGTTCCCGGAGGCCA GACGTGGGACCCGGGAGTCGAGCAGGTGAAGCGGCCCTGCCCCGCCCCCACCAGGCACTGCCCCGCCCCC GCCCCGCCCCGCCCCCTCCCAGCCGGCGCCCGGGAGCCCGGAGCCAGTGCCGCGCGGACATCGGGGCTCC CCCGTTCAGAGGGCGCCGCCGCCCAGGTGAGTGCCGCCCGCCCCTGTCCCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR16_9FG7 · enhancer · 1068484–1068809 · regulatory
ENSR16_9FGF · enhancer · 1069215–1069470 · regulatory
ENSR16_9FGT · enhancer · 1070684–1071044 · regulatory
ENSR16_B7Q4 · enhancer · 1071603–1072255 · regulatory
ENSR16_73NZK · promoter · 1072657–1072757 · regulatory
ENSR16_B7QD · enhancer · 1073722–1074252 · regulatory
· motif · 1067750–1067767 · motif
· motif · 1067752–1067767 · motif
· motif · 1067759–1067767 · motif
· motif · 1067767–1067784 · motif
· motif · 1067788–1067796 · motif
· motif · 1067794–1067811 · motif
· motif · 1067818–1067835 · motif
· motif · 1067820–1067835 · motif
· motif · 1067827–1067844 · motif
· motif · 1067836–1067844 · motif
· motif · 1067836–1067853 · motif
· motif · 1067845–1067862 · motif
· motif · 1067854–1067862 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:364 aa
somatostatin receptor 5 長 364 個胺基酸,屬於 G protein-coupled receptor 1 家族,具有七段跨膜螺旋。序列包含細胞外、細胞質側拓樸區域;N 端前 20 個胺基酸及 C 端第 327–364 位被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
somatostatin receptor 5 位於細胞膜,屬於多次穿越膜的蛋白質。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 28 個夥伴
- APBA1Q02410 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APBA2Q99767 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG1Q12959 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG3Q92796 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
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- GRID2IPA4D2P6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GRIP1Q9Y3R0 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- GRIP2Q9C0E4 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- IL16Q14005 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX2Q8N448 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI1Q96QZ7 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI2Q86UL8 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- MPDZO75970 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NHERF4Q86UT5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PATJQ8NI35 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- PDZK1Q5T2W1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RAMP1O60894 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RAMP2O60895 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RAMP3O60896 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- SCRIBQ14160 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- SSTR1P30872 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SSTR2P30874 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
SSTR5 與 SSTR2 形成異源二聚體;此異源二聚化會增加 SSTR2 的細胞生長抑制活性。資料描述的是複合體形成及其功能效果,未列出其他結合夥伴。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SSTR5 可辨識 somatostatin 28,對 somatostatin-14 的作用程度較低。其受體活性由 G proteins 傳遞,並抑制 adenylyl cyclase;此外,SSTR5 與 SSTR2 形成異源二聚體後,會增加 SSTR2 的細胞生長抑制活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Receptor for somatostatin 28 and to a lesser extent for somatostatin-14. The activity of this receptor is mediated by G proteins which inhibit adenylyl cyclase. Increases cell growth inhibition activity of SSTR2 following heterodimerization PMID 12072395 ↗ · PMID 7908405 ↗ · PMID 8078491 ↗ · PMID 8373420 ↗ |
| 交互作用 | SSTR5 可與 SSTR2 形成異源二聚體;形成此異源二聚體後,SSTR2 的細胞生長抑制活性增加。 | 含實驗來源 | 證據與來源Heterodimer with SSTR2. Heterodimerization with SSTR2 increases cell growth inhibition activity of SSTR2 PMID 18653781 ↗ |
| 細胞定位 | SSTR5 位於細胞膜,並屬於多次穿越膜的蛋白質。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AGCCGGCGCCCGGGAGCCCGGAGCCAGTGCCGCGCGGACA40TCGGGGCTCCCCCGTTCAGAGGGCGCCGCCGCCCAGAGCC80TGACGCACCCCAGGGCTGCCGCCATGGAGCCCCTGTTCCC120AGCCTCCACGCCCAGCTGGAACGCCTCCTCCCCGGGGGCT160GCCTCTGGAGGCGGTGACAACAGGACGCTGGTGGGGCCGG200CGCCCTCGGCAGGGGCCCGGGCGGTGCTGGTGCCCGTGCT240GTACCTGCTGGTGTGTGCGGCCGGGCTGGGCGGGAACACG280CTGGTCATCTACGTGGTGCTGCGCTTCGCCAAGATGAAGA320CCGTCACCAACATCTACATTCTCAACCTGGCAGTGGCCGA360CGTCCTGTACATGCTGGGGCTGCCTTTCCTGGCCACGCAG400AACGCCGCGTCCTTCTGGCCCTTCGGCCCCGTCCTGTGCC440GCCTGGTCATGACGCTGGACGGCGTCAACCAGTTCACCAG480TGTCTTCTGCCTGACAGTCATGAGCGTGGACCGCTACCTG520GCAGTGGTGCACCCGCTGAGCTCGGCCCGCTGGCGCCGCC560CGCGTGTGGCCAAGCTGGCGAGCGCCGCGGCCTGGGTCCT600GTCTCTGTGCATGTCGCTGCCGCTCCTGGTGTTCGCGGAC640GTGCAGGAGGGCGGTACCTGCAACGCCAGCTGGCCGGAGC680CCGTGGGGCTGTGGGGCGCCGTCTTCATCATCTACACGGC720CGTGCTGGGCTTCTTCGCGCCGCTGCTGGTCATCTGCCTG760TGCTACCTGCTCATCGTGGTGAAGGTGAGGGCGGCGGGCG800TGCGCGTGGGCTGCGTGCGGCGGCGCTCGGAGCGGAAGGT840GACGCGCATGGTGTTGGTGGTGGTGCTGGTGTTTGCGGGA880TGTTGGCTGCCCTTCTTCACCGTCAACATCGTCAACCTGG920CCGTGGCGCTGCCCCAGGAGCCCGCCTCCGCCGGCCTCTA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。