演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SSTR4

somatostatin receptor 4

SSTR4 是 somatostatin receptor 4,屬於 G protein-coupled receptor 家族,接收 somatostatin-14 訊號,並參與多種細胞訊息反應。

Homo sapiens20p11.21UniProt P31391
OFFICIAL SYMBOL
SSTR4
CHROMOSOME
20
UNIPROT
P31391
PDB / ALPHAFOLD
7XMS
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SSTR4 的正式名稱為 somatostatin receptor 4,是由蛋白質編碼基因產生的細胞膜受體,屬於 G protein-coupled receptor 1 family。其蛋白質為多次穿膜結構,具有穿越膜層的螺旋區段,並在膜外與膜內兩側分布不同區域。這種拓樸構造使受體能位於細胞膜上,作為 somatostatin-14 的受體。

Official symbol
SSTR4
Gene name
somatostatin receptor 4
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11333
UniProt
P31391
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2020p11.21
chr20 · 64,444,167 bp · GRCh38chr20p13 · 1–5100000 · gnegchr20p12.3 · 5100001–9200000 · gpos75chr20p12.2 · 9200001–12000000 · gnegchr20p12.1 · 12000001–17900000 · gpos75chr20p11.23 · 17900001–21300000 · gnegchr20p11.22 · 21300001–22300000 · gpos25chr20p11.21 · 22300001–25700000 · gnegchr20p11.1 · 25700001–28100000 · acenchr20q11.1 · 28100001–30400000 · acenchr20q11.21 · 30400001–33500000 · gnegchr20q11.22 · 33500001–35800000 · gpos25chr20q11.23 · 35800001–39000000 · gnegchr20q12 · 39000001–43100000 · gpos75chr20q13.11 · 43100001–43500000 · gnegchr20q13.12 · 43500001–47800000 · gpos25chr20q13.13 · 47800001–51200000 · gnegchr20q13.2 · 51200001–56400000 · gpos75chr20q13.31 · 56400001–57800000 · gnegchr20q13.32 · 57800001–59700000 · gpos50chr20q13.33 · 59700001–64444167 · gnegSSTR4pq1 bp64,444,167 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr20:23,035,312–23,039,237
Gene span
3,926 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000255008 ★23,035,312–23,039,2371

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SSTR4 是 somatostatin-14 的受體。受體活性由 G proteins 傳遞,並與多種下游訊息反應相連;其中一項作用是抑制 adenylyl cyclase。這表示 somatostatin-14 經由 SSTR4 所引發的訊號,可調節該酵素的活性。

SSTR4 的功能連結不限於 adenylyl cyclase 抑制,也包括 arachidonate 釋放的活化,以及 mitogen-activated protein(MAP)kinase cascade 的活化。這些反應代表受體訊號可連接至不同的細胞內反應路徑;來源未進一步說明其間的先後關係或具體分子步驟。

在腫瘤細胞中,SSTR4 介導 somatostatin 的抗增殖作用。此功能將受體訊號與腫瘤細胞增殖受到抑制相連,但現有資料未提供特定腫瘤類型、實驗條件或作用程度,因此不宜延伸為對所有腫瘤細胞均適用的結論。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 23035312 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SSTR4 ENST00000255008 GRCh38 chr20:23034312-23035412 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCCTGTGCCAGCTAGAGGGACTAGGGCTGGAGCCGGCGGCTGCTCCTGGGTGTCCAGTCCAGGAGCCAGT
GAACTCACTATCTCTGGAGTTTAGCAGAAGAAGGGTAATTCCAGGCCGGAACCCCTTTCTTTCCCGACCT
CTCGACCACAGTCCTCCCCAGGCACATTTTAGTGGCCAGGGATGGAGACCCGCGGATAATGACTGAACCA
GGTCACAGGGTGAAGGTTCTGAGATGTCCGGCTCCCGTAGCTTCTGCCAGTTCCCGAGGGAGCTAGCACA
GGCTTGGCCTTCTTTGGTGGCATCTCTGCCTCCACCTGTCCGTCTCCATTCCTTGTGCCCATAGCACCTC
AGCTGCTCGGACACAGAAGTTAAAAGGTCCGGCATCTGCACTTGTCCAGAGTGGGTTGGGGAGCAGAGAA
AGGAGTGGTGAGCTGTGGGGAAAACTGGACATCCTGACAGACCTGAAATTCACCAAGCCGCCAGTGGAAG
CCTCAGGTTCCGCCTCTATAAAAGGGACTCAGCCATGTGCAAGGATGGGTCGTCGCGAGGATTAAAGGGC
AGGGTGAGGGGATGTCAAGTGCAAGGCAAGTGGTCCAAGCTTCCAGGTGGTCCCTGACCAGTTCCGGGCA
CATCTTTACCCAAAGGGAGGACTCCGGGACCCCCAGCCCCGCCGCCGCAGACCCCCTGTAGCAAAGCAGG
GAACTGGACCTCAAAGGGCTGCTGGGGAAGACGGGATCTGAATAGAGGTCTGAAGGAAAGAAGCCAGGCG
GGGGACCCCGGGAGGGCCGGACGGGGCTGGGGGTGCTGTTGACACTGGAGCCGGACTGGAGACCTGGGAA
CCTGGGGCAGAGTCGGCAGCGGGGAGGGGGCGACCGAGGTGGGAAAACGGGGCGGGGCCGGAGACGACTC
CAGGGCTGGGTGAGGCGCTGACCCCCAGGAGCTGGGGTGCCGAGGGGCGCGGGCCACAGCGGTGCGAGCC
AGTCGGGCGCCCGCGCGGTGGGGCGCGCGGCGCGGGGATTGGCGGGCGCTCCCCGGTGCCCGCAGCTCTT
CAGCGTAGCCGGGAAGAGCCGCGCGTCTGCGCGCCAGCCCCCGCCCTGGGC
SSTR4 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR20_73CKBQ · enhancer · 23032259–23032360 · regulatory

ENSR20_9C5SJ · enhancer · 23032493–23032779 · regulatory

ENSR20_73CKG7 · promoter · 23035222–23035322 · regulatory

ENSR20_9C5TS · enhancer · 23037012–23037273 · regulatory

ENSR20_8N9SB · enhancer · 23039875–23040066 · regulatory

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:388 aa

1 aa388 aa跨膜區拓樸區域
依 P31391 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SSTR4 蛋白長 388 個胺基酸,屬於 G protein-coupled receptor 1 family。其序列註解列出七段螺旋型穿膜區,並由膜外與細胞質側區域交替連接;C 端較長的細胞質區域延伸至第 388 個胺基酸。

拓樸區域Extracellular1–46 aa
跨膜區Helical; Name=147–73 aa
拓樸區域Cytoplasmic74–83 aa
跨膜區Helical; Name=284–104 aa
拓樸區域Extracellular105–120 aa
跨膜區Helical; Name=3121–142 aa
拓樸區域Cytoplasmic143–161 aa
跨膜區Helical; Name=4162–185 aa
拓樸區域Extracellular186–208 aa
跨膜區Helical; Name=5209–232 aa
拓樸區域Cytoplasmic233–260 aa
跨膜區Helical; Name=6261–280 aa
拓樸區域Extracellular281–291 aa
跨膜區Helical; Name=7292–314 aa
拓樸區域Cytoplasmic315–388 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7XMS…

PDB · 7XMS

EM · 2.90 A · R=2-328

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

SSTR4 位於細胞膜,屬於多次穿膜蛋白。 來源未提供定位改變的條件、動態或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SSTR4SSTR4RAMP2RAMP3SSTR5
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SSTR4 是 somatostatin-14 的受體,其活性由 G proteins 傳遞,可抑制 adenylyl cyclase;受體功能也連結至 arachidonate 釋放與 mitogen-activated protein(MAP)kinase cascade 的活化。此外,SSTR4 會介導 somatostatin 在腫瘤細胞中的抗增殖作用。資料庫紀錄
證據與來源

Receptor for somatostatin-14. The activity of this receptor is mediated by G proteins which inhibits adenylyl cyclase. It is functionally coupled not only to inhibition of adenylate cyclase, but also to activation of both arachidonate release and mitogen-activated protein (MAP) kinase cascade. Mediates antiproliferative action of somatostatin in tumor cells

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SSTR4 是位於細胞膜的多次穿膜蛋白。資料庫紀錄
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000255008 · 3,926 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1GGGCGCGCGGCGCGGGGATTGGCGGGCGCTCCCCGGTGCC40
41CGCAGCTCTTCAGCGTAGCCGGGAAGAGCCGCGCGTCTGC80
81GCGCCAGCCCCCGCCCTGGGCCCGCCGCCCGAGCTCTCTG120
121GCGCAGCGCTAGCTCCGCCGCGCTCAGCTGCCCTGCGCCG160
161GCACCCCTGGTCATGAGCGCCCCCTCGACGCTGCCCCCCG200
201GGGGCGAGGAAGGGCTGGGGACGGCCTGGCCCTCTGCAGC240
241CAATGCCAGTAGCGCTCCGGCGGAGGCGGAGGAGGCGGTG280
281GCGGGGCCCGGGGACGCGCGGGCGGCGGGCATGGTCGCTA320
321TCCAGTGCATCTACGCGCTGGTGTGCCTGGTGGGGCTGGT360
361GGGCAACGCCCTGGTCATCTTCGTGATCCTTCGCTACGCC400
401AAGATGAAGACGGCTACCAACATCTACCTGCTCAACCTGG440
441CCGTAGCCGACGAGCTCTTCATGCTGAGCGTGCCCTTCGT480
481GGCCTCGTCGGCCGCCCTGCGCCACTGGCCCTTCGGCTCC520
521GTGCTGTGCCGCGCGGTGCTCAGCGTCGACGGCCTCAACA560
561TGTTCACCAGCGTCTTCTGTCTCACCGTGCTCAGCGTGGA600
601CCGCTACGTGGCCGTGGTGCACCCTCTGCGCGCGGCGACC640
641TACCGGCGGCCCAGCGTGGCCAAGCTCATCAACCTGGGCG680
681TGTGGCTGGCATCCCTGTTGGTCACTCTCCCCATCGCCAT720
721CTTCGCAGACACCAGACCGGCTCGCGGCGGCCAGGCCGTG760
761GCCTGCAACCTGCAGTGGCCACACCCGGCCTGGTCGGCAG800
801TCTTCGTGGTCTACACTTTCCTGCTGGGCTTCCTGCTGCC840
841CGTGCTGGCCATTGGCCTGTGCTACCTGCTCATCGTGGGC880
881AAGATGCGCGCCGTGGCCCTGCGCGCTGGCTGGCAGCAGC920
921GCAGGCGCTCGGAGAAGAAAATCACCAGGCTGGTGCTGAT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。