基因總覽
SSTR4 的正式名稱為 somatostatin receptor 4,是由蛋白質編碼基因產生的細胞膜受體,屬於 G protein-coupled receptor 1 family。其蛋白質為多次穿膜結構,具有穿越膜層的螺旋區段,並在膜外與膜內兩側分布不同區域。這種拓樸構造使受體能位於細胞膜上,作為 somatostatin-14 的受體。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000255008 ★ | 23,035,312–23,039,237 | 1 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SSTR4 是 somatostatin-14 的受體。受體活性由 G proteins 傳遞,並與多種下游訊息反應相連;其中一項作用是抑制 adenylyl cyclase。這表示 somatostatin-14 經由 SSTR4 所引發的訊號,可調節該酵素的活性。
SSTR4 的功能連結不限於 adenylyl cyclase 抑制,也包括 arachidonate 釋放的活化,以及 mitogen-activated protein(MAP)kinase cascade 的活化。這些反應代表受體訊號可連接至不同的細胞內反應路徑;來源未進一步說明其間的先後關係或具體分子步驟。
在腫瘤細胞中,SSTR4 介導 somatostatin 的抗增殖作用。此功能將受體訊號與腫瘤細胞增殖受到抑制相連,但現有資料未提供特定腫瘤類型、實驗條件或作用程度,因此不宜延伸為對所有腫瘤細胞均適用的結論。
Promoter 與基因調控
>SSTR4 ENST00000255008 GRCh38 chr20:23034312-23035412 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCCTGTGCCAGCTAGAGGGACTAGGGCTGGAGCCGGCGGCTGCTCCTGGGTGTCCAGTCCAGGAGCCAGT GAACTCACTATCTCTGGAGTTTAGCAGAAGAAGGGTAATTCCAGGCCGGAACCCCTTTCTTTCCCGACCT CTCGACCACAGTCCTCCCCAGGCACATTTTAGTGGCCAGGGATGGAGACCCGCGGATAATGACTGAACCA GGTCACAGGGTGAAGGTTCTGAGATGTCCGGCTCCCGTAGCTTCTGCCAGTTCCCGAGGGAGCTAGCACA GGCTTGGCCTTCTTTGGTGGCATCTCTGCCTCCACCTGTCCGTCTCCATTCCTTGTGCCCATAGCACCTC AGCTGCTCGGACACAGAAGTTAAAAGGTCCGGCATCTGCACTTGTCCAGAGTGGGTTGGGGAGCAGAGAA AGGAGTGGTGAGCTGTGGGGAAAACTGGACATCCTGACAGACCTGAAATTCACCAAGCCGCCAGTGGAAG CCTCAGGTTCCGCCTCTATAAAAGGGACTCAGCCATGTGCAAGGATGGGTCGTCGCGAGGATTAAAGGGC AGGGTGAGGGGATGTCAAGTGCAAGGCAAGTGGTCCAAGCTTCCAGGTGGTCCCTGACCAGTTCCGGGCA CATCTTTACCCAAAGGGAGGACTCCGGGACCCCCAGCCCCGCCGCCGCAGACCCCCTGTAGCAAAGCAGG GAACTGGACCTCAAAGGGCTGCTGGGGAAGACGGGATCTGAATAGAGGTCTGAAGGAAAGAAGCCAGGCG GGGGACCCCGGGAGGGCCGGACGGGGCTGGGGGTGCTGTTGACACTGGAGCCGGACTGGAGACCTGGGAA CCTGGGGCAGAGTCGGCAGCGGGGAGGGGGCGACCGAGGTGGGAAAACGGGGCGGGGCCGGAGACGACTC CAGGGCTGGGTGAGGCGCTGACCCCCAGGAGCTGGGGTGCCGAGGGGCGCGGGCCACAGCGGTGCGAGCC AGTCGGGCGCCCGCGCGGTGGGGCGCGCGGCGCGGGGATTGGCGGGCGCTCCCCGGTGCCCGCAGCTCTT CAGCGTAGCCGGGAAGAGCCGCGCGTCTGCGCGCCAGCCCCCGCCCTGGGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR20_73CKBQ · enhancer · 23032259–23032360 · regulatory
ENSR20_9C5SJ · enhancer · 23032493–23032779 · regulatory
ENSR20_73CKG7 · promoter · 23035222–23035322 · regulatory
ENSR20_9C5TS · enhancer · 23037012–23037273 · regulatory
ENSR20_8N9SB · enhancer · 23039875–23040066 · regulatory
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:388 aa
SSTR4 蛋白長 388 個胺基酸,屬於 G protein-coupled receptor 1 family。其序列註解列出七段螺旋型穿膜區,並由膜外與細胞質側區域交替連接;C 端較長的細胞質區域延伸至第 388 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SSTR4 位於細胞膜,屬於多次穿膜蛋白。 來源未提供定位改變的條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- RAMP2O60895 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RAMP3O60896 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- SSTR5P35346 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SSTR4 是 somatostatin-14 的受體,其活性由 G proteins 傳遞,可抑制 adenylyl cyclase;受體功能也連結至 arachidonate 釋放與 mitogen-activated protein(MAP)kinase cascade 的活化。此外,SSTR4 會介導 somatostatin 在腫瘤細胞中的抗增殖作用。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Receptor for somatostatin-14. The activity of this receptor is mediated by G proteins which inhibits adenylyl cyclase. It is functionally coupled not only to inhibition of adenylate cyclase, but also to activation of both arachidonate release and mitogen-activated protein (MAP) kinase cascade. Mediates antiproliferative action of somatostatin in tumor cells |
| 細胞定位 | SSTR4 是位於細胞膜的多次穿膜蛋白。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GGGCGCGCGGCGCGGGGATTGGCGGGCGCTCCCCGGTGCC40CGCAGCTCTTCAGCGTAGCCGGGAAGAGCCGCGCGTCTGC80GCGCCAGCCCCCGCCCTGGGCCCGCCGCCCGAGCTCTCTG120GCGCAGCGCTAGCTCCGCCGCGCTCAGCTGCCCTGCGCCG160GCACCCCTGGTCATGAGCGCCCCCTCGACGCTGCCCCCCG200GGGGCGAGGAAGGGCTGGGGACGGCCTGGCCCTCTGCAGC240CAATGCCAGTAGCGCTCCGGCGGAGGCGGAGGAGGCGGTG280GCGGGGCCCGGGGACGCGCGGGCGGCGGGCATGGTCGCTA320TCCAGTGCATCTACGCGCTGGTGTGCCTGGTGGGGCTGGT360GGGCAACGCCCTGGTCATCTTCGTGATCCTTCGCTACGCC400AAGATGAAGACGGCTACCAACATCTACCTGCTCAACCTGG440CCGTAGCCGACGAGCTCTTCATGCTGAGCGTGCCCTTCGT480GGCCTCGTCGGCCGCCCTGCGCCACTGGCCCTTCGGCTCC520GTGCTGTGCCGCGCGGTGCTCAGCGTCGACGGCCTCAACA560TGTTCACCAGCGTCTTCTGTCTCACCGTGCTCAGCGTGGA600CCGCTACGTGGCCGTGGTGCACCCTCTGCGCGCGGCGACC640TACCGGCGGCCCAGCGTGGCCAAGCTCATCAACCTGGGCG680TGTGGCTGGCATCCCTGTTGGTCACTCTCCCCATCGCCAT720CTTCGCAGACACCAGACCGGCTCGCGGCGGCCAGGCCGTG760GCCTGCAACCTGCAGTGGCCACACCCGGCCTGGTCGGCAG800TCTTCGTGGTCTACACTTTCCTGCTGGGCTTCCTGCTGCC840CGTGCTGGCCATTGGCCTGTGCTACCTGCTCATCGTGGGC880AAGATGCGCGCCGTGGCCCTGCGCGCTGGCTGGCAGCAGC920GCAGGCGCTCGGAGAAGAAAATCACCAGGCTGGTGCTGAT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。