基因總覽
SSTR3(somatostatin receptor 3)是蛋白質編碼基因,產物為 somatostatin receptor 3。此受體可辨識 somatostatin-14 與 somatostatin-28,並透過 G 蛋白傳遞訊號。現有資料支持其受體身分與基本訊號連結;蛋白質家族及跨膜結構等特徵另見蛋白質特徵說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000610913 ★ | 37,204,237–37,212,477 | 2 |
| ENST00000617123 | 37,204,237–37,210,965 | 2 |
| ENST00000959749 | 37,204,237–37,212,482 | 3 |
| ENST00001135604 | 37,204,237–37,212,482 | 2 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SSTR3 的產物是 somatostatin receptor 3,作用之一是辨識 somatostatin-14 與 somatostatin-28。受體接收這兩種 somatostatin 訊號後,可經由對百日咳毒素敏感的 G 蛋白,連結至 adenylyl cyclase 活性的抑制。
這項資料指出受體與 G 蛋白訊號間的關聯,以及訊號所指向的細胞反應;但未提供更細的分子步驟或其他下游效應,因此不宜延伸推定其作用途徑。
Promoter 與基因調控
>SSTR3 ENST00000610913 GRCh38 chr22:37212377-37213477 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CAGGTACCTAGTGACAAAGGAGGTCCAGCCCTGGTCCCAGGGAATGGCCCAGTTTGGAAAGCAGCCTAGG TACAGCCTGGCACATAGTAGGTGCTCAGCCAAGACGTGTGTCCTTTTCCCTTCCGTCTCTGACTGTTCCT TTCCTTATCACTCCTGTGCTGAGGCAGGAATCAGCACAGGCAGGGGCACGGCATCCCAAGACATCTGGGC CTGTGCTCAGGACTGTACGGCAGAGTCTCTTAGACCAAAGATCAGTAAATATGGCCCACGGGGCAAATCC CACCCACTGCCTGTTTTTGTACAGCCTAGGAGCTGAGAATGGTTTTTACGGATGAACATTTGCAATCGGT TTGATGAAACACTAACTCTAAACTCCAATTAAGCAAAAGGTGATGTCTGTAAAAAGAACTCTATTCTTCT CATGAGTGGACCTACATTACAAAATACTGGCCTCAATTATTATTATTCTATTTTGAGTTTTGTCAGTTAC AAAATAGTAAAAATCTGTTTTCTCACTGCACAATGATTTTGCCCTCAAAGCCTAAAATATTGGTTCTCTG TTCTGTCCTTCCACTCCTCACCCTGCCTGGGGCTCTCCAGATGTAACCAATCCCAGGACTAATGACCCCC ACCCGGCCTCCCCAGTGGTCCGTGCTGCGGCCGGTGTGCCCGACTGCAGGGCTGGACTGTGGACTCCCGG GCTGGCCAGCCCCACACCCAGCCTTGCCTTGGGACACAGCTGCTGCCCCGGGGGACCTGTGCCGCAGTGG CCTCACGAGCTGCTCTGGCTACTGGCTGGCAGCCTCGGCTCCCCTGAGCACTGAGCACATTCTTCTCTCC AACTCCCTGCAGGAGCCAAGGCCAGCGGGCGTGGGTGGCTGAAATCTCCCCGGTAACAGGGTCTGCGCCC CTCCTGCTCCCTCTCCGGGCCTCCTCCCTTAACCTGCACCCCGCCCCCACCCCCCACACCTGCTCTCCGG CCCTCAGCCCCTCCCTGCTTACTCCCTCCTTCACGGGCTCCATGTCACCATCTGTGGCACAGTCCCTCTC TGTCACTCTCCCTGCCACCCCCTCATTCTCCTTCCTCCCTCCTGCCTCTCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SSTR3_2 ↗ | 22:37,212,403 | 負股 | 37,212,393–37,212,452 |
| SSTR3_1 ↗ | 22:37,220,729 | 負股 | 37,220,719–37,220,778 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR22_9JQRJ · promoter · 37212467–37212839 · regulatory
· motif · 37215890–37215901 · motif
· motif · 37215908–37215923 · motif
· motif · 37216044–37216056 · motif
· motif · 37216077–37216088 · motif
· motif · 37216077–37216088 · motif
· motif · 37216083–37216094 · motif
· motif · 37216254–37216265 · motif
· motif · 37216905–37216917 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:418 aa
somatostatin receptor 3 屬於 G protein-coupled receptor 1 family,蛋白質長度為 418 個胺基酸。其結構包含七段螺旋型跨膜區,並交替分布於細胞外與細胞質側的區域。資料另將 N 端第 1–21 位及 C 端第 335–418 位標註為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
somatostatin receptor 3 位於細胞膜,屬多次跨膜蛋白;somatostatin 刺激後,受體會內化至內質網囊泡。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- APPP05067 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MPDZO75970 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- RAMP1O60894 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RAMP2O60895 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- SSTR2P30874 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MpdzO55164 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
somatostatin receptor 3 可形成同源二聚體,也可與 SSTR2 形成異源二聚體。資料指出,與 SSTR2 異源二聚化會使 SSTR3 受體功能失活;此功能關係標示為依相似性推定。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | somatostatin receptor 3 可辨識 somatostatin-14 與 somatostatin-28,並透過對百日咳毒素敏感的 G 蛋白,連結至 adenylyl cyclase 的抑制。 | 含實驗來源 | 證據與來源Receptor for somatostatin-14 and -28. This receptor is coupled via pertussis toxin sensitive G proteins to inhibition of adenylyl cyclase PMID 1337145 ↗ |
| 交互作用 | SSTR3 可形成同源二聚體,也可與 SSTR2 形成異源二聚體;與 SSTR2 異源二聚化會使 SSTR3 受體功能失活。此關係為依相似性推定。 | 推論支持 | 證據與來源Homodimer and heterodimer with SSTR2. Heterodimerization with SSTR2 inactivates SSTR3 receptor function (By similarity) |
| 細胞定位 | SSTR3 是位於細胞膜的多次跨膜蛋白;受到 somatostatin 刺激後,受體會內化至內質網囊泡。 | 推論支持 | 證據與來源Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Internalized into endoplasmic vesicles upon somatostatin-stimulation |
核酸與蛋白質序列
ACTCCCTCCTTCACGGGCTCCATGTCACCATCTGTGGCAC40AGTCCCTCTCTGTCACTCTCCCTGCCACCCCCTCATTCTC80CTTCCTCCCTCCTGCCTCTCTCTGCATCTCTCCCTCTCAC120CCGTGTCTCCTCTCCTCTCTTTCCTTCTCGTCTTCTCCCT160GTCACGCATCTCTCATCACTCCCCCTCATTCTGCCTTTCC200TCCTACTCACGGTCTCCTCTCCCTCTCCCTCTCTCTCTCT240CCCCCTCCCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCCACCTCC280TCCCGACCCCCTTTCCCCTCTATTTCTATTGGCTTCTGTG320TCCCTTGCTCCCCTCTTCTCTTCCTCACCCTGGGAAGCTT360CTCCCCCCTATCCTTGCCCCTGCCCCCCCAGGATGTGTCC400TGGAGATGGGGGGTGACGTACCAGGCTCTGGTTGGGAAGT440CAGGGCCGGAGACCAGATGGGAGAGGCTCTGTGGACAGCC480GTGGCCGAGGGCCTGGGAGGGAACCTGAGCCCGCAAGCGG520TCTAGAAGTGGGTGCCTTGTGGGGACCCTAGTTAGGAGTG560CCCTGGGGGCACCTGGGGACTGGGCAGGGAGAGGGGACAG600CAGAATGATAACCAGCCTGGCGGCAAGGAGGGAAGCCCTC640ACCCCATGGGCAGGCAAATAGCTGACTGCTGACCACCCTC680CCCTCAGCCATGGACATGCTTCATCCATCATCGGTGTCCA720CGACCTCAGAACCTGAGAATGCCTCCTCGGCCTGGCCCCC760AGATGCCACCCTGGGCAACGTGTCGGCGGGCCCAAGCCCG800GCAGGGCTGGCCGTCAGTGGCGTTCTGATCCCCCTGGTCT840ACCTGGTGGTGTGCGTGGTGGGCCTGCTGGGTAACTCGCT880GGTCATCTATGTGGTCCTGCGGCACACGGCCAGCCCTTCA920GTCACCAACGTCTACATCCTCAACCTGGCGCTGGCCGACG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。