基因總覽
SSTR2 的正式名稱為 somatostatin receptor 2,屬於蛋白質編碼基因,其產物是 G protein-coupled receptor 1 家族的受體。此蛋白質長 369 個胺基酸,具有多次穿越細胞膜的拓樸結構:多段螺旋區域穿過膜層,並由細胞外與細胞質區段交錯連接。這種膜蛋白架構與其受體身分相符;其主要角色是辨識 somatostatin-14 和 somatostatin-28,並將訊號傳入細胞。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000357585 ★ | 73,165,010–73,176,633 | 2 |
| ENST00001090574 | 73,164,253–73,176,633 | 2 |
| ENST00001143499 | 73,164,975–73,176,633 | 2 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SSTR2 是 somatostatin-14 與 somatostatin-28 的受體,可透過不同的 G proteins 調節細胞內訊號。經 pertussis toxin 敏感的 G proteins 傳遞時,受體會抑制 adenylyl cyclase;此外,也能透過 pertussis toxin 敏感或不敏感的 G proteins 刺激 phosphotyrosine phosphatase 與 PLC。SSTR2 亦會抑制電壓依賴性 calcium channels,降低 calcium 進入細胞。
在胰臟 alpha- 與 beta-cells 中,SSTR2 是功能上占主導地位的 somatostatin receptor,負責介導 somatostatin-14 對荷爾蒙分泌的抑制作用。此受體也能抑制細胞生長:它增強 MAPK1 與 MAPK2 的磷酸化,接著提高 CDKN1B 的表現。對 insulin receptor signaling,SSTR2 則透過 PTPN6 介導負向調節。
在神經相關作用方面,SSTR2 可促進神經元遷移與軸突生長;來源指出它可能參與腦部發育期間的神經元發育與成熟,但此作用帶有可能性,不能視為確定的發育功能。SSTR2 與 SSTR3 形成異源二聚體後,會使 SSTR3 的受體功能失活。
Promoter 與基因調控
>SSTR2 ENST00000357585 GRCh38 chr17:73164010-73165110 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGTGAATTGGAAATCAGATAATAGGATGGACAAATCAAGGCAGCTCAGCTCACAGAGAAAGCTAGTTGGG GTTTGCTTTCTGTTTTCACATCCTCTAAAACTGTACTGAGGATGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT GTGTGTGTATACCTATGTACTTGGAGGAGGGTGAGGAAGGGGAGGCTGCAGGATTGATTATGACTTATTA AACTATTGGAAAAGAGGCTGAATCATCACAGTCAAAAATAAACAGCTGCAACTCCATGCGACTCCCACTT CTTGCCTGCTCCCCTTTGCTCCCTCACAGCATGTAGGAGAGACTGTGCTGGGTCAGACCAGCAGGTGCTG ACTGACGTGGCTACAGCAAGGGGACCACCTGTATGGCCGCTGCACCTCCAAGCTGTGGGACGCAGGGACA GCTGGGACCAGTCGACGTCCACTGGCCCTCTGATGGCTCCTAGGACTGAATCTTGGACTCCAGGTGCGGG TTTACACTCCCTGCGCTCATTGGGAACTGCATGGAGAAGCGCTATCCCCTGAGCCCTTTTTCTCCCTACT CTTAGCCTGGCCCTGCGCCCTGCGCCCGGGGCTGGCCCACGGTAAACACAGCTTTGCTAACTTGTTTGGC TAAGGAAATCACAGAGGTCCCGGTATAAGTCTGGGTCACCCCGGCCGCCACTCCAGCTGCCTAGAATATA TGGGTGGAAGGGAATCGACTCTGTGAAATCAGAGGGAAAATAGCGCTTGTCCTTGCCATGAGTCTTGAGG AGACCGAAAACGCTTAACCTTTTACGCCCCCGCAGGCGGGTCCCCTCTCTCCCCGCTCCCCGGCTGTCTG TAAGCTCTGCCTGCGGCCACCCGCAGGCGTTTCAGCCGGTCTCACCCCTGTCCTTCTGCAGGACCCGGGA GGAGGGGTTGGGGGGGCGGAGCGAAGCCGCTGTGACGTAGCGGGAGGGGGGCGTGGGGAAATGTGCCGAG GGGCCCGGGCTGGCTGGGCCAGTCCCAGCGGCGCAGCCACCCATGCGCGCGCGCTCGCAAGACCACCAGC GCCCAGAGCCCCAGTCTGAGGCTTGGCGCCGGGGGTCTGCGGGCGAGGGGA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SSTR2_1 ↗ | 17:73,165,010 | 正股 | 73,164,961–73,165,020 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR17_BJJ36 · promoter · 73164487–73165020 · regulatory
ENSR17_C992M · enhancer · 73165021–73166550 · regulatory
ENSR17_BJJ3H · enhancer · 73166724–73167455 · regulatory
· motif · 73160858–73160869 · motif
· motif · 73164003–73164016 · motif
· motif · 73164492–73164507 · motif
· motif · 73164802–73164815 · motif
· motif · 73164926–73164939 · motif
· motif · 73165581–73165594 · motif
· motif · 73165610–73165623 · motif
· motif · 73166608–73166616 · motif
· motif · 73167176–73167184 · motif
· motif · 73167282–73167297 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:369 aa
somatostatin receptor 2 長 369 個胺基酸,屬於 G protein-coupled receptor 1 家族。其序列註解包含七段穿膜螺旋,並有細胞外及細胞質拓樸區段交錯排列;C 端區域位於細胞質側。
蛋白質三維結構
細胞內定位
基礎狀態下,SSTR2 主要位於細胞表面。 受到 agonist 刺激後,受體會內化並移至細胞質,顯示其定位會隨刺激而改變。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- PIK3R1P27986 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- SSTR3P32745 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SSTR5P35346 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
SSTR2 可形成同源二聚體,也能與 SSTR3 或 SSTR5 形成異源二聚體;與 SSTR3 異源二聚化會使 SSTR3 受體功能失活。SSTR2 agonist 刺激會增強其與 SSTR5 的異源二聚化,並提高 SSTR2 抑制細胞生長的活性。刺激後,同源二聚體解離為單體,此變化是受體內化所需。SSTR2 也會與 beta-arrestin 及 SHANK1 互作;前者對內化必要,而與 SSTR5 異源二聚化會削弱此互作,使 SSTR2 回收至細胞表面的程度增加。SSTR2 透過 C 端與 SHANK1 的 PDZ domain 互作。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SSTR2 是 somatostatin-14 與 somatostatin-28 的受體,可透過 pertussis toxin 敏感的 G proteins 抑制 adenylyl cyclase,並經敏感或不敏感的 G proteins 刺激 phosphotyrosine phosphatase 與 PLC。它也抑制電壓依賴性 calcium channels;在胰臟 alpha-、beta-cells 中主導 somatostatin-14 對荷爾蒙分泌的抑制,並影響細胞生長、神經元遷移與軸突生長、腦部神經發育,以及 insulin receptor signaling。 | 含實驗來源 | 證據與來源Receptor for somatostatin-14 and -28. This receptor is coupled via pertussis toxin sensitive G proteins to inhibition of adenylyl cyclase. In addition it stimulates phosphotyrosine phosphatase and PLC via pertussis toxin insensitive as well as sensitive G proteins. Inhibits calcium entry by suppressing voltage-dependent calcium channels. Acts as the functionally dominant somatostatin receptor in pancreatic alpha- and beta-cells where it mediates the inhibitory effect of somatostatin-14 on hormone secretion. Inhibits cell growth through enhancement of MAPK1 and MAPK2 phosphorylation and subsequent up-regulation of CDKN1B. Stimulates neuronal migration and axon outgrowth and may participate in neuron development and maturation during brain development. Mediates negative regulation of insulin receptor signaling through PTPN6. Inactivates SSTR3 receptor function following heterodimerization PMID 15231824 ↗ · PMID 18653781 ↗ · PMID 19434240 ↗ · PMID 22495673 ↗ · PMID 22932785 ↗ |
| 交互作用 | SSTR2 可形成同源二聚體,或與 SSTR3、SSTR5 形成異源二聚體;與 SSTR3 結合會使其受體功能失活。SSTR2 agonist 刺激會促進與 SSTR5 異源二聚化並增強細胞生長抑制活性。刺激後同源二聚體解離是受體內化所需;beta-arrestin 互作亦為內化所需,而 SSTR5 異源二聚化會削弱此互作並增加 SSTR2 回收至細胞表面。SSTR2 還透過 C 端與 SHANK1 的 PDZ domain 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer and heterodimer with SSTR3 and SSTR5. Heterodimerization with SSTR3 inactivates SSTR3 receptor function. Heterodimerization with SSTR5 is enhanced by agonist stimulation of SSTR2 and increases SSTR2 cell growth inhibition activity. Following agonist stimulation, homodimers dissociate into monomers which is required for receptor internalization. Interacts with beta-arrestin; this interaction is necessary for receptor internalization and is destabilized by heterodimerization with SSTR5 which results in increased recycling of SSTR2 to the cell surface. Interacts (via C-terminus) with SHANK1 (via PDZ domain) PMID 10551867 ↗ · PMID 15231824 ↗ · PMID 18653781 ↗ |
| 細胞定位 | SSTR2 是多次穿越細胞膜的蛋白質,定位於細胞膜與細胞質;在基礎狀態下主要分布於細胞表面。受到 agonist 刺激後,SSTR2 會內化並移至細胞質,顯示其細胞內定位會隨受體刺激而改變。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Cytoplasm; Located mainly at the cell surface under basal conditions. Agonist stimulation results in internalization to the cytoplasm |
核酸與蛋白質序列
AGTCCCAGCGGCGCAGCCACCCATGCGCGCGCGCTCGCAA40GACCACCAGCGCCCAGAGCCCCAGTCTGAGGCTTGGCGCC80GGGGGTCTGCGGGCGAGGGGAGCTCTCTACGTGCGAGGGG120CTAGCGGGAGCCGGCACAAGAGGGTCGAGGAGCCAGGAAC160CCCAAACGTCCGGCGCCAGGCGCTAGCCAAGCTGCTGCGC200GCCCCGGCGCCCAGCTGGCTCGGGGACAGCCGCTGGGTGT240CGGAGACCGGAGCTAGCGGATTGCAGCGGAAAAGCAAAGA280TGTCACACTGGATCCTTGGCCTCCAGGGTCCATTAAGGTG320AGAATAAGATCTCTGGGCTGGCTGGAACTAGCCTAAGACT360GAAAAGCAGCCATGGACATGGCGGATGAGCCACTCAATGG400AAGCCACACATGGCTATCCATTCCATTTGACCTCAATGGC440TCTGTGGTGTCAACCAACACCTCAAACCAGACAGAGCCGT480ACTATGACCTGACAAGCAATGCAGTCCTCACATTCATCTA520TTTTGTGGTCTGCATCATTGGGTTGTGTGGCAACACACTT560GTCATTTATGTCATCCTCCGCTATGCCAAGATGAAGACCA600TCACCAACATTTACATCCTCAACCTGGCCATCGCAGATGA640GCTCTTCATGCTGGGTCTGCCTTTCTTGGCTATGCAGGTG680GCTCTGGTCCACTGGCCCTTTGGCAAGGCCATTTGCCGGG720TGGTCATGACTGTGGATGGCATCAATCAGTTCACCAGCAT760CTTCTGCCTGACAGTCATGAGCATCGACCGATACCTGGCT800GTGGTCCACCCCATCAAGTCGGCCAAGTGGAGGAGACCCC840GGACGGCCAAGATGATCACCATGGCTGTGTGGGGAGTCTC880TCTGCTGGTCATCTTGCCCATCATGATATATGCTGGGCTC920CGGAGCAACCAGTGGGGGAGAAGCAGCTGCACCATCAACT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。