基因總覽
SSTR1 是蛋白質編碼基因,產物 somatostatin receptor 1 屬於 G protein-coupled receptor 1 家族。這是一種辨識 somatostatin 的受體,對 somatostatin-14 的親和力高於 somatostatin-28。其蛋白質具有多段跨膜螺旋,並由細胞外與細胞質區段交錯構成;N 端另有註記為無序的區域。這些特徵使其具備膜受體的拓樸架構。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000267377 ★ | 38,207,904–38,213,067 | 3 |
| ENST00000886873 | 38,207,895–38,213,067 | 2 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
somatostatin receptor 1 是 somatostatin 的受體,對 somatostatin-14 的親和力高於 somatostatin-28。受體與 G 蛋白偶聯後,可將訊號傳至細胞內;不同 G 蛋白敏感性所對應的下游反應有所不同。
透過對百日咳毒素敏感的 G 蛋白,SSTR1 會抑制 adenylyl cyclase。這表示受體活化可調節此酵素的作用,但來源未進一步說明後續訊號變化的幅度或其細胞情境。
此外,SSTR1 也可透過對百日咳毒素不敏感的 G 蛋白,刺激 phosphotyrosine phosphatase 與 Na(+)/H(+) exchanger。這些描述呈現受體能連結不同的細胞內作用途徑;現有資料未提供各途徑之間的先後關係,也未說明其在特定組織或生理條件下的差異。
Promoter 與基因調控
>SSTR1 ENST00000267377 GRCh38 chr14:38206904-38208004 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ACAGATAGTCAGGTGTCTTTAGTCAGTGATTGGCAGAGGCATCTAAGGCATTATATGAGGCTTGGCTAGT AAAATGCTCTTCTGGGATTCTGGGACAATACCCACTCTCTTTTCTTTTAACTTAATGAACATTTATTTTC TCTCCATATGTGCTGTATTTGTAAAGGAAAAATAAATATAACTAAACACCAATTGTACATTCCACTTTAA AGAAGGCAATTTGTTCAGGTAAAATAATGGGTTAAAACAGTTTCAGCCGTATGAAATTTCAAATTCCATC CTAGCACATTCCTCATTAATAATTGCACACATTCCTATGAAAGTCTGTCATTTATTTTAGTCTTTGATTG CTATCATCAACACACTACAGAAGTTATTCTTTCCTGTTCAAGACAATTAGTTTTGGGAACTAAAACACAT GCAGTATATGTAAGTGATTACCTGGATAAAGCAACAGGGCATTAGGAAATATACTTTTTTGTTTTTAATT TCTGCATCCATTTCTTCATTCTGGACCGGTACAGATAGCCTCCATGAGGAGTTTAGCCTCTCCTTGGAGT AAACTCTACTGAGAGGAGGAAAACTGAGACTTACAGTACAGCGGGCACAGCCTGGTTGAGGAGAAGGAGA AACTAAGGAAAAACTGGAGACAGCAAAGCTTGAAGGAGGCAGAGCACTAAGCTGCTGCGGGTCACTCTTC CTGTGAACAGGCTAGTTTCAAATAAAGGCTTGCAGGGATCTTACCGAGCAAAGCAACGTTTATGAAAAGG AACAGGGAAGTTGCATGGAGTGTGATTCTTCCTTCCACAGGAACAGTTGGAAAGCCAAAGAGACCCTAGA GTAAGAATGGTGGTAAGTCCCAGGGTTCGTTTAAAATCCTGATAACGGAACATACATTCTTTCTTACGGG AAAACCGTTTTGATTCTTAAATGAAGTCAGTGAGCTTCAGGCTTGCCTACATTGATATCTCCTAATGGTT TGGGCACGTGACCCAGAGCCAGCTCACAAATCAAGCCTCAGAAAGAGCTGACATCCTAGCTCTTCCCGGA AAAACTCGAATGTCGCCCTGCCGTTCCTGGGGTTGGTGACAGGTCTGGTCA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR14_9K6GG · promoter · 38207472–38207914 · regulatory
ENSR14_C5RCX · enhancer · 38207915–38209175 · regulatory
ENSR14_B9KPZ · promoter · 38209176–38209740 · regulatory
ENSR14_5BZMML · CTCF_binding_site · 38209224–38209245 · regulatory
ENSR14_B9KQ8 · enhancer · 38210672–38211532 · regulatory
· motif · 38206020–38206029 · motif
· motif · 38207886–38207895 · motif
· motif · 38207886–38207895 · motif
· motif · 38208048–38208058 · motif
· motif · 38208103–38208117 · motif
· motif · 38208103–38208118 · motif
· motif · 38208103–38208118 · motif
· motif · 38208557–38208572 · motif
· motif · 38208558–38208572 · motif
· motif · 38208559–38208572 · motif
· motif · 38208973–38208983 · motif
· motif · 38209226–38209242 · motif
· motif · 38209746–38209755 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:391 aa
somatostatin receptor 1 長 391 個胺基酸,屬於 G protein-coupled receptor 1 家族。蛋白質具有七段跨膜螺旋,並在膜的兩側分布細胞外及細胞質區段;N 端第 1 至 50 個胺基酸區域註記為無序。
蛋白質三維結構
細胞內定位
somatostatin receptor 1 位於細胞膜,屬多次跨膜蛋白。 來源未提供定位變化的條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- RAMP3O60896 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- SSTR5P35346 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
資料記載 SSTR1 與 SKB1 有交互作用,但未進一步說明此關係是否代表直接實體結合、兩者是否同屬一個複合體,或其功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SSTR1 是 somatostatin 受體,對 somatostatin-14 的親和力高於 somatostatin-28。它透過對百日咳毒素敏感的 G 蛋白抑制 adenylyl cyclase;此外,也透過對百日咳毒素不敏感的 G 蛋白刺激 phosphotyrosine phosphatase 與 Na(+)/H(+) exchanger。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Receptor for somatostatin with higher affinity for somatostatin-14 than -28. This receptor is coupled via pertussis toxin sensitive G proteins to inhibition of adenylyl cyclase. In addition it stimulates phosphotyrosine phosphatase and Na(+)/H(+) exchanger via pertussis toxin insensitive G proteins |
| 交互作用 | SSTR1 與 SKB1 有交互作用;此描述未進一步界定其為直接結合、複合體關係或功能性關聯。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | somatostatin receptor 1 位於細胞膜,並屬於多次跨膜蛋白。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AGCTCACAAATCAAGCCTCAGAAAGAGCTGACATCCTAGC40TCTTCCCGGAAAAACTCGAATGTCGCCCTGCCGTTCCTGG80GGTTGGTGACAGGTCTGGTCATCGCACGGCGGCAGCTCCT120CACCTGGATTTAGAAGAGCTGGCGTCCCCGCCCGCCCAAG160CCTTTAAACTCTCGTCTGCCAGAACCCGCCAACTCTCCAG200GCTTAGGGCCAGTTTCCGCGATTCTAAGAGTAATTGCGTG240GGCACCTGTGCTGGGGCCAGGCGCAAAGAAGGGAGTTGGT280CTGCGCGAAGATCGTCAACCTGCTAACAGACCGCACATGC320ACTTTGCACCGACCATCTACGTCTCAGTCTGGAGGTTGCG360CACTTTGGCTGCTGACGCGCTGGTGGTGCCTATTAATCAT400TTACCAGTCCAGAGCCGCGCCAGTTAATGGCTGTGCCGTG440CGGTGCTCCCACATCCTGGCCTCTCCTCTCCACGGTCGCC480TGTGCCCGGGCACCCCGGAGCTGCAAACTGCAGAGCCCAG520GCAACCGCTGGGCTGTGCGCCCCGCCGGCGCCGGTAGGAG560CCGCGCTCCCCGCAGCGGTTGCGCTCTACCCGGAGGCGCT600GGGCGGCTGTGGGCTGCAGGCAAGCGGTCGGGTGGGGAGG640GAGGGCGCAGGCGGCGGGTGCGCGAGGAGAAAGCCCCAGC680CCTGGCAGCCCCACTGGCCCCCCTCAGCTGGGATGTTCCC720CAATGGCACCGCCTCCTCTCCTTCCTCCTCTCCTAGCCCC760AGCCCGGGCAGCTGCGGCGAAGGCGGCGGCAGCAGGGGCC800CCGGGGCCGGCGCTGCGGACGGCATGGAGGAGCCAGGGCG840AAATGCGTCCCAGAACGGGACCTTGAGCGAGGGCCAGGGC880AGCGCCATCCTGATCTCTTTCATCTACTCCGTGGTGTGCC920TGGTGGGGCTGTGTGGGAACTCTATGGTCATCTACGTGAT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。