演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SSTSMST

somatostatin

SST 基因編碼 somatostatin,與腦下垂體激素分泌調節有關;來源也記載其可能參與多種其他生理作用,其中部分屬於相似性推論。

Homo sapiens3q27.3UniProt P61278
OFFICIAL SYMBOL
SST
CHROMOSOME
3
UNIPROT
P61278
PDB / ALPHAFOLD
2MI1
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SST 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 somatostatin,產物屬於 somatostatin family。資料所述的主要角色與腦下垂體激素分泌調節有關;另有多項可能的生理作用,但這些內容標示為相似性推論,應視為推測而非已確立的結論。現有來源未提供足以進一步說明基因產物基本性質或家族結構特色的資料。

Official symbol
SST
Gene name
somatostatin
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11329
UniProt
P61278
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SMSTSST1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 33q27.3
chr3 · 198,295,559 bp · GRCh38chr3p26.3 · 1–2800000 · gpos50chr3p26.2 · 2800001–4000000 · gnegchr3p26.1 · 4000001–8100000 · gpos50chr3p25.3 · 8100001–11600000 · gnegchr3p25.2 · 11600001–13200000 · gpos25chr3p25.1 · 13200001–16300000 · gnegchr3p24.3 · 16300001–23800000 · gpos100chr3p24.2 · 23800001–26300000 · gnegchr3p24.1 · 26300001–30800000 · gpos75chr3p23 · 30800001–32000000 · gnegchr3p22.3 · 32000001–36400000 · gpos50chr3p22.2 · 36400001–39300000 · gnegchr3p22.1 · 39300001–43600000 · gpos75chr3p21.33 · 43600001–44100000 · gnegchr3p21.32 · 44100001–44200000 · gpos50chr3p21.31 · 44200001–50600000 · gnegchr3p21.2 · 50600001–52300000 · gpos25chr3p21.1 · 52300001–54400000 · gnegchr3p14.3 · 54400001–58600000 · gpos50chr3p14.2 · 58600001–63800000 · gnegchr3p14.1 · 63800001–69700000 · gpos50chr3p13 · 69700001–74100000 · gnegchr3p12.3 · 74100001–79800000 · gpos75chr3p12.2 · 79800001–83500000 · gnegchr3p12.1 · 83500001–87100000 · gpos75chr3p11.2 · 87100001–87800000 · gnegchr3p11.1 · 87800001–90900000 · acenchr3q11.1 · 90900001–94000000 · acenchr3q11.2 · 94000001–98600000 · gvarchr3q12.1 · 98600001–100300000 · gnegchr3q12.2 · 100300001–101200000 · gpos25chr3q12.3 · 101200001–103100000 · gnegchr3q13.11 · 103100001–106500000 · gpos75chr3q13.12 · 106500001–108200000 · gnegchr3q13.13 · 108200001–111600000 · gpos50chr3q13.2 · 111600001–113700000 · gnegchr3q13.31 · 113700001–117600000 · gpos75chr3q13.32 · 117600001–119300000 · gnegchr3q13.33 · 119300001–122200000 · gpos75chr3q21.1 · 122200001–124100000 · gnegchr3q21.2 · 124100001–126100000 · gpos25chr3q21.3 · 126100001–129500000 · gnegchr3q22.1 · 129500001–134000000 · gpos25chr3q22.2 · 134000001–136000000 · gnegchr3q22.3 · 136000001–139000000 · gpos25chr3q23 · 139000001–143100000 · gnegchr3q24 · 143100001–149200000 · gpos100chr3q25.1 · 149200001–152300000 · gnegchr3q25.2 · 152300001–155300000 · gpos50chr3q25.31 · 155300001–157300000 · gnegchr3q25.32 · 157300001–159300000 · gpos50chr3q25.33 · 159300001–161000000 · gnegchr3q26.1 · 161000001–167900000 · gpos100chr3q26.2 · 167900001–171200000 · gnegchr3q26.31 · 171200001–176000000 · gpos75chr3q26.32 · 176000001–179300000 · gnegchr3q26.33 · 179300001–183000000 · gpos75chr3q27.1 · 183000001–184800000 · gnegchr3q27.2 · 184800001–186300000 · gpos25chr3q27.3 · 186300001–188200000 · gnegchr3q28 · 188200001–192600000 · gpos75chr3q29 · 192600001–198295559 · gnegSSTpq1 bp198,295,559 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr3:187,668,856–187,670,401
Gene span
1,546 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000287641 ★187,668,912–187,670,3942
ENST00001143369187,668,856–187,670,4012

顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

somatostatin 可抑制多種腦下垂體激素的分泌,來源列出的對象包括生長激素 GH1、PRL、ACTH、黃體生成素 LH 與 TSH。它也會削弱 ghrelin 或 GnRH 刺激下 GH1 與 LH 的分泌反應;其中,對 ghrelin 刺激所引起之 GH1 分泌的抑制,還可能因 neuronostatin 而進一步增強。

另一筆來源對基礎分泌與受刺激分泌作了區分:somatostatin 可能抑制基礎狀態下 GH1 或 LH 的分泌,但不抑制 ghrelin 或 GnRH 刺激下的這兩種激素分泌。該來源並指出,它不影響 PRL、ACTH、FSH 或 TSH 的釋放。就刺激條件而言,somatostatin 可增強對 ghrelin 刺激所引發 GH1 分泌的抑制作用,但不會增強對 GnRH 刺激所引發 LH 分泌的抑制作用。

其他可能作用多以「By similarity」標示,證據屬相似性推論。來源指出,它可能增強低血糖誘發的胰臟 alpha 細胞 glucagon 釋放;這項作用可能經由與 GPR107 結合及 PKA 活化介導。它也可能調節心臟收縮功能、降低心肌細胞存活能力,並在中樞神經系統影響記憶保留與海馬迴興奮性;此外,可能具有抗焦慮、抑制食慾的作用,並參與動脈壓調節。這些推論性敘述不應與腦下垂體分泌相關記載混為同等程度的確證。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 187670394 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SST ENST00000287641 GRCh38 chr3:187670294-187671394 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTCCTAGACCTTATATGTCTAAACTGGGGCTTCCTGACATAAAACTATGCTTACCGGCCAGGAATCTGTT
AGAAAACTCAGAGCTCAGTAGAAGGAACACTGGCTTTGGAATGTGGAGGTCTGGTTTTGCTCAAAGTGTG
CAGTATGTGAAGGAGAACAATTTACTGACCATTACTCTGCCTTACTGATTCAAATTCTGAGGTTTATTGA
ATAATTTCTTAGATTGCCTTCCAGCTCTAAATTTCTCAGCACCAAAATGAAGTCCATTTCAATCTCTCTC
TCTCTCTTTCCCTCCCGTACATATACACACACTCATACATATATATGGTCACAATAGAAAGGCAGGTAGA
TCAGAAGTCTCAGTTGCTGAGAAAGAGGGAGGGAGGGTGAGCCAGAGGTACCTTCTCCCCCATTGTAGAG
AAAAGTGAAGTTCTTTTAGAGCCCCGTTACATCTTCAAGGCTTTTTATGAGATAATGGAGGAAATAAAGA
GGGCTCAGTCCTTCTACTGTCCATATTTCATTCTCAAATCTGTTATTAGAGGAATGATTCTGATCTCCAC
CTACCATACACATGCCCTGTTGCTTGTTGGGCCTTCCTAAAATGTTAGAGTATGATGACAGATGGAGTTG
TCTGGGTACATTTGTGTGCATTTAAGGGTGATAGTGTATTTGCTCTTTAAGAGCTGAGTGTTTGAGCCTC
TGTTTGTGTGTAATTGAGTGTGCATGTGTGGGAGTGAAATTGTGGAATGTGTATGCTCATAGCACTGAGT
GAAAATAAAAGATTGTATAAATCGTGGGGCATGTGGAATTGTGTGTGCCTGTGCGTGTGCAGTATTTTTT
TTTTTTTAAGTAAGCCACTTTAGATCTTGTCACCTCCCCTGTCTTCTGTGATTGATTTTGCGAGGCTAAT
GGTGCGTAAAAGGGCTGGTGAGATCTGGGGGCGCCTCCTAGCCTGACGTCAGAGAGAGAGTTTAAAACAG
AGGGAGACGGTTGAGAGCACACAAGCCGCTTTAGGAGCGAGGTTCGGAGCCATCGCTGCTGCCTGCTGAT
CCGCGCCTAGAGTTTGACCAGCCACTCTCCAGCTCGGCTTTCGCGGCGCCG
SST 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SST_1 ↗3:187,670,392負股187,670,382–187,670,441
SST_2 ↗3:187,670,579負股187,670,569–187,670,628

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR3_7F2XT6 · promoter · 187670384–187670484 · regulatory

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:116 aa

1 aa116 aa功能區域訊號胜肽
依 P61278 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

somatostatin 蛋白質長 116 個胺基酸,屬於 somatostatin family。序列註解標示第 1 至 24 位胺基酸為 Signal;第 62 至 82 位則被註記為無序區域(Disordered)。

訊號胜肽1–24 aa
功能區域Disordered62–82 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2MI1…

PDB · 2MI1

NMR · - · A=103-116

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

somatostatin 的定位註記為分泌型(Secreted);來源未提供定位變化的條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SMSTSSTAPPATP1B1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能somatostatin 抑制多種腦下垂體激素分泌,包括 GH1、PRL、ACTH、LH 與 TSH;也會削弱 ghrelin 或 GnRH 刺激下 GH1 與 LH 的分泌,其中對 ghrelin 刺激所致 GH1 分泌的抑制可由 neuronostatin 進一步增強。含實驗來源
證據與來源

Inhibits the secretion of pituitary hormones, including that of growth hormone/somatotropin (GH1), PRL, ACTH, luteinizing hormone (LH) and TSH. Also impairs ghrelin- and GnRH-stimulated secretion of GH1 and LH; the inhibition of ghrelin-stimulated secretion of GH1 can be further increased by neuronostatin

PMID 29615476 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

功能相似性推論指出,somatostatin 可能增強低血糖誘發的胰臟 alpha 細胞 glucagon 釋放,可能經 GPR107 結合與 PKA 活化介導;也可能調節心臟收縮、影響心肌細胞存活、中樞神經系統的記憶保留與海馬迴興奮性,並具有抗焦慮、抑制食慾或調節動脈壓的作用。另有腦下垂體分泌條件差異:可能抑制基礎 GH1 或 LH 分泌,但不抑制 ghrelin 或 GnRH 刺激下的分泌,也不影響 PRL、ACTH、FSH 或 TSH 釋放;它可增強對 ghrelin 刺激所致 GH1 分泌的抑制,卻不增強對 GnRH 刺激所致 LH 分泌的抑制。含實驗來源
證據與來源

May enhance low-glucose-induced glucagon release by pancreatic alpha cells (By similarity). This effect may be mediated by binding to GPR107 and PKA activation (By similarity). May regulate cardiac contractile function (By similarity). May compromise cardiomyocyte viability (By similarity). In the central nervous system, may impair memory retention and may affect hippocampal excitability (By similarity). May also have anxiolytic and anorexigenic effects (By similarity). May play a role in arterial pressure regulation (By similarity). May inhibit basal, but not ghrelin- or GnRH-stimulated secretion of GH1 or LH, but does not affect the release of other pituitary hormones, including PRL, ACTH, FSH or TSH. Potentiates inhibitory action of somatostatin on ghrelin-stimulated secretion of GH1, but not that on GnRH-stimulated secretion of LH

PMID 29615476 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted推論支持
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000287641 · 607 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACAAGCCGCTTTAGGAGCGAGGTTCGGAGCCATCGCTGCT40
41GCCTGCTGATCCGCGCCTAGAGTTTGACCAGCCACTCTCC80
81AGCTCGGCTTTCGCGGCGCCGAGATGCTGTCCTGCCGCCT120
121CCAGTGCGCGCTGGCTGCGCTGTCCATCGTCCTGGCCCTG160
161GGCTGTGTCACCGGCGCTCCCTCGGACCCCAGACTCCGTC200
201AGTTTCTGCAGAAGTCCCTGGCTGCTGCCGCGGGGAAGCA240
241GGAACTGGCCAAGTACTTCTTGGCAGAGCTGCTGTCTGAA280
281CCCAACCAGACGGAGAATGATGCCCTGGAACCTGAAGATC320
321TGTCCCAGGCTGCTGAGCAGGATGAAATGAGGCTTGAGCT360
361GCAGAGATCTGCTAACTCAAACCCGGCTATGGCACCCCGA400
401GAACGCAAAGCTGGCTGCAAGAATTTCTTCTGGAAGACTT440
441TCACATCCTGTTAGCTTTCTTAACTAGTATTGTCCATATC480
481AGACCTCTGATCCCTCGCCCCCACACCCCATCTCTCTTCC520
521CTAATCCTCCAAGTCTTCAGCGAGACCCTTGCATTAGAAA560
561CTGAAAACTGTAAATACAAAATAAAATTATGGTGAAATTA600
601TGAAAAA607

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。