基因總覽
SST 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 somatostatin,產物屬於 somatostatin family。資料所述的主要角色與腦下垂體激素分泌調節有關;另有多項可能的生理作用,但這些內容標示為相似性推論,應視為推測而非已確立的結論。現有來源未提供足以進一步說明基因產物基本性質或家族結構特色的資料。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000287641 ★ | 187,668,912–187,670,394 | 2 |
| ENST00001143369 | 187,668,856–187,670,401 | 2 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
somatostatin 可抑制多種腦下垂體激素的分泌,來源列出的對象包括生長激素 GH1、PRL、ACTH、黃體生成素 LH 與 TSH。它也會削弱 ghrelin 或 GnRH 刺激下 GH1 與 LH 的分泌反應;其中,對 ghrelin 刺激所引起之 GH1 分泌的抑制,還可能因 neuronostatin 而進一步增強。
另一筆來源對基礎分泌與受刺激分泌作了區分:somatostatin 可能抑制基礎狀態下 GH1 或 LH 的分泌,但不抑制 ghrelin 或 GnRH 刺激下的這兩種激素分泌。該來源並指出,它不影響 PRL、ACTH、FSH 或 TSH 的釋放。就刺激條件而言,somatostatin 可增強對 ghrelin 刺激所引發 GH1 分泌的抑制作用,但不會增強對 GnRH 刺激所引發 LH 分泌的抑制作用。
其他可能作用多以「By similarity」標示,證據屬相似性推論。來源指出,它可能增強低血糖誘發的胰臟 alpha 細胞 glucagon 釋放;這項作用可能經由與 GPR107 結合及 PKA 活化介導。它也可能調節心臟收縮功能、降低心肌細胞存活能力,並在中樞神經系統影響記憶保留與海馬迴興奮性;此外,可能具有抗焦慮、抑制食慾的作用,並參與動脈壓調節。這些推論性敘述不應與腦下垂體分泌相關記載混為同等程度的確證。
Promoter 與基因調控
>SST ENST00000287641 GRCh38 chr3:187670294-187671394 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTCCTAGACCTTATATGTCTAAACTGGGGCTTCCTGACATAAAACTATGCTTACCGGCCAGGAATCTGTT AGAAAACTCAGAGCTCAGTAGAAGGAACACTGGCTTTGGAATGTGGAGGTCTGGTTTTGCTCAAAGTGTG CAGTATGTGAAGGAGAACAATTTACTGACCATTACTCTGCCTTACTGATTCAAATTCTGAGGTTTATTGA ATAATTTCTTAGATTGCCTTCCAGCTCTAAATTTCTCAGCACCAAAATGAAGTCCATTTCAATCTCTCTC TCTCTCTTTCCCTCCCGTACATATACACACACTCATACATATATATGGTCACAATAGAAAGGCAGGTAGA TCAGAAGTCTCAGTTGCTGAGAAAGAGGGAGGGAGGGTGAGCCAGAGGTACCTTCTCCCCCATTGTAGAG AAAAGTGAAGTTCTTTTAGAGCCCCGTTACATCTTCAAGGCTTTTTATGAGATAATGGAGGAAATAAAGA GGGCTCAGTCCTTCTACTGTCCATATTTCATTCTCAAATCTGTTATTAGAGGAATGATTCTGATCTCCAC CTACCATACACATGCCCTGTTGCTTGTTGGGCCTTCCTAAAATGTTAGAGTATGATGACAGATGGAGTTG TCTGGGTACATTTGTGTGCATTTAAGGGTGATAGTGTATTTGCTCTTTAAGAGCTGAGTGTTTGAGCCTC TGTTTGTGTGTAATTGAGTGTGCATGTGTGGGAGTGAAATTGTGGAATGTGTATGCTCATAGCACTGAGT GAAAATAAAAGATTGTATAAATCGTGGGGCATGTGGAATTGTGTGTGCCTGTGCGTGTGCAGTATTTTTT TTTTTTTAAGTAAGCCACTTTAGATCTTGTCACCTCCCCTGTCTTCTGTGATTGATTTTGCGAGGCTAAT GGTGCGTAAAAGGGCTGGTGAGATCTGGGGGCGCCTCCTAGCCTGACGTCAGAGAGAGAGTTTAAAACAG AGGGAGACGGTTGAGAGCACACAAGCCGCTTTAGGAGCGAGGTTCGGAGCCATCGCTGCTGCCTGCTGAT CCGCGCCTAGAGTTTGACCAGCCACTCTCCAGCTCGGCTTTCGCGGCGCCG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SST_1 ↗ | 3:187,670,392 | 負股 | 187,670,382–187,670,441 |
| SST_2 ↗ | 3:187,670,579 | 負股 | 187,670,569–187,670,628 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR3_7F2XT6 · promoter · 187670384–187670484 · regulatory
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:116 aa
somatostatin 蛋白質長 116 個胺基酸,屬於 somatostatin family。序列註解標示第 1 至 24 位胺基酸為 Signal;第 62 至 82 位則被註記為無序區域(Disordered)。
蛋白質三維結構
細胞內定位
somatostatin 的定位註記為分泌型(Secreted);來源未提供定位變化的條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- APPP05067 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- ATP1B1P05026 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | somatostatin 抑制多種腦下垂體激素分泌,包括 GH1、PRL、ACTH、LH 與 TSH;也會削弱 ghrelin 或 GnRH 刺激下 GH1 與 LH 的分泌,其中對 ghrelin 刺激所致 GH1 分泌的抑制可由 neuronostatin 進一步增強。 | 含實驗來源 | 證據與來源Inhibits the secretion of pituitary hormones, including that of growth hormone/somatotropin (GH1), PRL, ACTH, luteinizing hormone (LH) and TSH. Also impairs ghrelin- and GnRH-stimulated secretion of GH1 and LH; the inhibition of ghrelin-stimulated secretion of GH1 can be further increased by neuronostatin PMID 29615476 ↗ |
| 功能 | 相似性推論指出,somatostatin 可能增強低血糖誘發的胰臟 alpha 細胞 glucagon 釋放,可能經 GPR107 結合與 PKA 活化介導;也可能調節心臟收縮、影響心肌細胞存活、中樞神經系統的記憶保留與海馬迴興奮性,並具有抗焦慮、抑制食慾或調節動脈壓的作用。另有腦下垂體分泌條件差異:可能抑制基礎 GH1 或 LH 分泌,但不抑制 ghrelin 或 GnRH 刺激下的分泌,也不影響 PRL、ACTH、FSH 或 TSH 釋放;它可增強對 ghrelin 刺激所致 GH1 分泌的抑制,卻不增強對 GnRH 刺激所致 LH 分泌的抑制。 | 含實驗來源 | 證據與來源May enhance low-glucose-induced glucagon release by pancreatic alpha cells (By similarity). This effect may be mediated by binding to GPR107 and PKA activation (By similarity). May regulate cardiac contractile function (By similarity). May compromise cardiomyocyte viability (By similarity). In the central nervous system, may impair memory retention and may affect hippocampal excitability (By similarity). May also have anxiolytic and anorexigenic effects (By similarity). May play a role in arterial pressure regulation (By similarity). May inhibit basal, but not ghrelin- or GnRH-stimulated secretion of GH1 or LH, but does not affect the release of other pituitary hormones, including PRL, ACTH, FSH or TSH. Potentiates inhibitory action of somatostatin on ghrelin-stimulated secretion of GH1, but not that on GnRH-stimulated secretion of LH PMID 29615476 ↗ |
| 細胞定位 | Secreted | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
ACAAGCCGCTTTAGGAGCGAGGTTCGGAGCCATCGCTGCT40GCCTGCTGATCCGCGCCTAGAGTTTGACCAGCCACTCTCC80AGCTCGGCTTTCGCGGCGCCGAGATGCTGTCCTGCCGCCT120CCAGTGCGCGCTGGCTGCGCTGTCCATCGTCCTGGCCCTG160GGCTGTGTCACCGGCGCTCCCTCGGACCCCAGACTCCGTC200AGTTTCTGCAGAAGTCCCTGGCTGCTGCCGCGGGGAAGCA240GGAACTGGCCAAGTACTTCTTGGCAGAGCTGCTGTCTGAA280CCCAACCAGACGGAGAATGATGCCCTGGAACCTGAAGATC320TGTCCCAGGCTGCTGAGCAGGATGAAATGAGGCTTGAGCT360GCAGAGATCTGCTAACTCAAACCCGGCTATGGCACCCCGA400GAACGCAAAGCTGGCTGCAAGAATTTCTTCTGGAAGACTT440TCACATCCTGTTAGCTTTCTTAACTAGTATTGTCCATATC480AGACCTCTGATCCCTCGCCCCCACACCCCATCTCTCTTCC520CTAATCCTCCAAGTCTTCAGCGAGACCCTTGCATTAGAAA560CTGAAAACTGTAAATACAAAATAAAATTATGGTGAAATTA600TGAAAAA607cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。