基因總覽
SSR3 是蛋白質編碼基因，產物 signal sequence receptor subunit 3 屬於 TRAP-gamma family。它是 TRAP 蛋白複合體的組成部分；該複合體與內質網中蛋白質的保留調節相關。其蛋白質序列長 185 個胺基酸，包含多段跨膜螺旋，並有位於膜腔側與細胞質側的區域，呈現多次穿越膜的拓撲特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000265044 ★ | 156,539,553–156,555,117 | 5 |
| ENST00001105805 | 156,480,877–156,555,165 | 6 |
| ENST00001113806 | 156,537,621–156,555,165 | 5 |
| ENST00001139732 | 156,539,553–156,555,165 | 5 |
| ENST00000926887 | 156,540,142–156,555,165 | 4 |
| ENST00001052548 | 156,540,142–156,555,165 | 5 |
| ENST00001072685 | 156,540,150–156,555,165 | 5 |
| ENST00000896020 | 156,541,311–156,559,474 | 7 |
| ENST00001072688 | 156,541,311–156,555,165 | 5 |
| ENST00000896021 | 156,541,418–156,555,165 | 5 |
| ENST00000960095 | 156,541,437–156,555,165 | 5 |
| ENST00001072689 | 156,542,562–156,555,165 | 4 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SSR3 產物是 TRAP 蛋白複合體的一部分。來源所述的複合體功能，是結合鈣並調節內質網常駐蛋白的保留；因此，SSR3 所屬的複合體參與維持這類蛋白在內質網中的留存。
此功能描述將鈣結合與內質網蛋白保留調節連結在一起，但未進一步交代鈣結合發生的位置、作用步驟，或 SSR3 本身是否直接結合鈣。資料也未說明複合體如何辨識內質網常駐蛋白，或如何改變其保留狀態，因此不宜據此延伸出更細的分子機制。
現有資訊支持的功能範圍限於 TRAP 複合體與鈣結合及內質網常駐蛋白保留調節的關聯，並未提供其對特定蛋白質、細胞過程或生理結果的進一步說明。
Promoter 與基因調控
>SSR3 ENST00000265044 GRCh38 chr3:156555017-156556117 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACGGTTAATAAGGAGGCTGGAGGTTGAGGAAATTGTGCCTAATGCACTAGAGTGTTCTCAGTAATCAAAA GTAGCATTTGCTGGGAGTGATGTGGTTGAATTTTTTTTTGAAGAAAAAATGATAATGTGTTGAGTTAAAA ATGGAATCTAGCTGTTTTAATAGACATACTTAATCCTTCTGAGCTTCAGAGAGGGAGTCTTGCCTAGCCA ACCTGTTCTTAGTATTATGTTTTATTTAGCATGGCTTTGGAAGCCACAAAACTCTATAGGTCTAGTTGAA ATAAAATAAAATAGTAGTAACTTGTATCAGACATATATTAAATATTGCCTTCATCAATGAGATCATGAGT TTCTTAAAAGCAAGAGTCCCATTTTCTTCTTCCTACAGAGGTGGCCTATTGTTTAGTGAAAAGAGCCCAC GCCTTGGAGACCCACACCGCAGGTCTACGACCCTCAGGCTCTTCAGCTGCAATGGCGGTAATGATGCGCA CGTCATAAGATTCTTCAAGGTATTTAATGAAATAAAGGATGTGTAAAGGAGAAGGGATTTTACATGAGTT AGCTATACCTTTCTCTTCTTTCTTCTTCAACGTACTCAGTCCTGGGTACGCACAGAGGGCACTAATGGCG TGGGGCCAGAAGAGCTTTTAATTTTGGAATTCTGAAGAACTGAGAACTCGTGAGTCTGTCAGCAGCTCTG AAGTGGAATATCAATAAAGTTTTGTTAATTTTTTTTAAAGCACCGACTAAACTACAAATCCCTTCTCTCT CCTCCAGGTGGGTGGGTCACGTGGCTTGTCAGGAATCCGGAAGTCTGGCCCGCTCGCCCAATCACGCCCG GAAGCCTATCTAGTGGCGCCAAGCTGGCCAATCCTGGGGACGCTTGCTCTTCGCCAAACCGGGTCCCGCC TCCGCGCGCCGCGCTGACGGGTCGTTAGCGGATACGGCGGCCGCAGGGGCGGAGTCAAGGGCCTTTGCCC GCCTTGGCGGCCGGCTCTACGTTCCCTGTTCTCGCCTGCAGCTCCGCCATGGCTCCTAAAGGCAGCTCCA AACAGCAGTCTGAGGAGGACCTGCTCCTGCAGGATTTCAGCCGCAATCTCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SSR3_1 ↗ | 3:156,555,107 | 負股 | 156,555,097–156,555,156 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR3_B363T8 · enhancer · 156551264–156552085 · regulatory
ENSR3_94B5Q6 · enhancer · 156553760–156554114 · regulatory
ENSR3_94B5Q9 · promoter · 156554115–156554615 · regulatory
ENSR3_B363TQ · promoter · 156554835–156555639 · regulatory
· motif · 156550180–156550191 · motif
· motif · 156552354–156552367 · motif
· motif · 156552354–156552367 · motif
· motif · 156553894–156553903 · motif
· motif · 156554126–156554135 · motif
· motif · 156554228–156554244 · motif
· motif · 156554228–156554244 · motif
· motif · 156554484–156554493 · motif
· motif · 156554594–156554603 · motif
· motif · 156555086–156555096 · motif
· motif · 156555153–156555163 · motif
· motif · 156555200–156555213 · motif
· motif · 156555205–156555215 · motif
· motif · 156555272–156555281 · motif
· motif · 156555303–156555312 · motif
· motif · 156555303–156555314 · motif
· motif · 156555303–156555314 · motif
· motif · 156555303–156555316 · motif
· motif · 156555323–156555332 · motif
· motif · 156555323–156555332 · motif
· motif · 156555330–156555340 · motif
· motif · 156555336–156555345 · motif
· motif · 156555485–156555495 · motif
· motif · 156555638–156555648 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：185 aa
signal sequence receptor subunit 3 長 185 個胺基酸，具有四段預測為螺旋的跨膜區段，分別位於第 28–48、55–76、136–157 與 164–184 位。註解另標示兩段膜腔側區域，以及兩段細胞質側區域；蛋白質被歸入 TRAP-gamma family。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SSR3 位於內質網膜，屬於多次穿膜蛋白。 現有定位資訊未提供特定條件下的位置變化或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- RABAC1Q9UI14 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SSR3 所屬的 TRAP 複合體為異四聚體，由 TRAP-alpha、TRAP-beta、TRAP-delta 與 TRAP-gamma 組成。此資料支持複合體組成，未進一步說明各亞基間的直接結合細節。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRAP 蛋白是某個複合體的組成部分；該複合體能結合鈣，並藉此調節內質網常駐蛋白的保留。此敘述未具體指出鈣結合位置或調節步驟。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源TRAP proteins are part of a complex whose function is to bind calcium to the ER membrane and thereby regulate the retention of ER resident proteins |
| 交互作用 | TRAP 複合體是異四聚體，由 TRAP-alpha、TRAP-beta、TRAP-delta 與 TRAP-gamma 四種亞基構成。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | 此蛋白位於內質網膜，並屬於多次穿越膜的蛋白質。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GTTCCCTGTTCTCGCCTGCAGCTCCGCCATGGCTCCTAAA40GGCAGCTCCAAACAGCAGTCTGAGGAGGACCTGCTCCTGC80AGGATTTCAGCCGCAATCTCTCGGCCAAGTCCTCCGCGCT120CTTCTTCGGAAACGCGTTCATCGTGTCTGCCATCCCCATC160TGGTTATACTGGCGAATATGGCATATGGATCTTATTCAGT200CTGCTGTTTTGTATAGTGTGATGACCCTAGTAAGCACATA240TTTGGTAGCCTTTGCATACAAGAATGTGAAATTTGTTCTC280AAGCACAAAGTAGCACAGAAGAGGGAGGATGCTGTTTCCA320AAGAAGTGACTCGAAAACTTTCTGAAGCTGATAATAGAAA360GATGTCTCGGAAGGAGAAAGATGAAAGAATCTTGTGGAAG400AAGAATGAAGTTGCTGATTATGAAGCTACAACATTTTCCA440TCTTCTATAACAACACTCTGTTCCTGGTCGTGGTCATTGT480TGCTTCCTTCTTCATATTGAAGAACTTCAACCCCACAGTG520AACTACATATTGTCCATAAGTGCTTCATCAGGACTCATCG560CCCTCCTGTCTACTGGCTCCAAATAGACCATGTCAGCTTC600ACCCCCTGGCTTTGTGTCTATGGGTGGCCTGTGGTATATG640GAAAAGTAGCAGGGTGGTCAGGGTGGGAGACACAAGATGT680TTTTATAGTCTAGAGCCTTTAAAAAACCCAGCAGAATGTA720ATTCAGTATTTGTTTATTGGCTGTTTTTTGACAGATTGTT760GAAATTAAATGAATTGAAAGGGAAACTCAGAGTACTAGGA800CGTTTATTAAAAGGAAAAAAATGTCTTGCAATGTGCTGTA840ATCACAAGAGGAGAAAATAACTTGTTTCCTTGATCTGTCA880GAGGTCACAGTAACCTGGGCCGAGCTGTTATTATTTATTA920TATAATAGTAGTAGGAAGTTAATAACTGGTTCTCTGTGTT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。