基因總覽
SSR2 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 signal sequence receptor subunit 2。其產物屬於 TRAP-beta 家族，並作為 TRAP 複合體的組成部分。現有資料指出，這個複合體參與內質網膜上的鈣結合，並與內質網駐留蛋白的滯留調節相關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000295702 ★ | 156,009,048–156,020,951 | 6 |
| ENST00000923682 | 156,009,041–156,020,972 | 6 |
| ENST00000923683 | 156,009,048–156,020,972 | 6 |
| ENST00000923684 | 156,009,048–156,020,972 | 5 |
| ENST00000923685 | 156,009,048–156,020,972 | 6 |
| ENST00001084057 | 156,009,048–156,020,972 | 6 |
| ENST00001095508 | 156,009,048–156,020,889 | 6 |
| ENST00001144964 | 156,009,048–156,020,972 | 6 |
| ENST00000905734 | 156,009,049–156,020,972 | 6 |
| ENST00000905735 | 156,009,049–156,020,972 | 6 |
| ENST00000952326 | 156,009,049–156,020,972 | 7 |
| ENST00000952328 | 156,009,049–156,020,882 | 6 |
顯示 12/24 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SSR2 所屬的 TRAP 蛋白參與一個與內質網蛋白滯留調節有關的複合體。來源描述該複合體可在內質網膜結合鈣，並藉此調節內質網駐留蛋白的滯留。資料未進一步說明此調節作用的分子步驟或其他生物學效應。
Promoter 與基因調控
>SSR2 ENST00000295702 GRCh38 chr1:156020851-156021951 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TGCTTGTTCAAGGTTACCTAACCAGTAAGTGACAGAACTGGGATTGAATTCATGACTGCCTAACTTCACA GTTCATCCTCTGAACCTAAGATCTACTGTTCAAAATGCTGTTTTGGGAAGTTTGGCAGCTGATTAAAAAG TGCAGGGAGGCCGGGCGTGGTGGCTCAAGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATC ACTTGAGGACAGGAGTTTGAGACCAGTCTGGCCAACATGGTGAAACACCGTCTCTACTAAAAGGACAAAA AATTAGCCGGGCAGGTGGCACACTCCTGTAATCCCAGCTACTGGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTG AACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCCACTGCATTCCACCCTGGGGTACAGAGCAAG ACCCTGTCTCAAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAATAAAAATAAAAAGTGCAGGAAAGACCTAAGA TAGAAAGACTACTAGAGTAAAACCCACATCCAGAAACCAGCAAGAACTGAAGCAGTTATAGTAGGAATGG AGAAAAAAAGATCTACTTTTTTGGCACTTCAAAGGGCTTCTAAATAAAGCTCAGGGCTCGGTGACCTGCT GGATGTAGGGAATGTCTATGTGTCTTGTCTGAGAATAGAAAAAATACTGGTTGGAATAGCTTTTCTCTAA TTCTCTGTTCGACAGTACTAGTTGACATTTTAGATAGATGATCCAAATTTCTAGGTTTGCTAGTTTCCCA AAGCACCTAATGAGGTGCGGGTCACATACAGTAGTGAAAAATCAGCTTGAAAAGCCCCCCAAAGAGGGCC GAATAAGAAGCCTGGAGAACGCACAAACCTCTTAGGAGCGCTCACAGCCTCTCAGGCAGGCGGGCACTAC AAAGGGAAAGGTGGGGCTTCTCCAAGAACTACAACTCCCACAAGGCATTGGGCGGAACACCACGGTTTCC GGCCAGTGCTTATTTCCGGTCTTTCGGATGCTGACGCTCTCTTCCTGTCTTTGTGGCTCCGGAAAGGCGT TTGGGATGCCAACGGTAAGTCCGGAGGCTTAGGGCGTCCGAACGGGAGAGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SSR2_1 ↗ | 1:156,020,933 | 負股 | 156,020,923–156,020,982 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_949X2T · promoter · 156020363–156020863 · regulatory
ENSR1_53CNSGM · CTCF_binding_site · 156020385–156020406 · regulatory
ENSR1_B35Z2H · promoter · 156020879–156021432 · regulatory
ENSR1_949X4G · enhancer · 156025909–156026360 · regulatory
· motif · 156016327–156016339 · motif
· motif · 156020229–156020242 · motif
· motif · 156020387–156020403 · motif
· motif · 156020708–156020721 · motif
· motif · 156020715–156020722 · motif
· motif · 156020723–156020736 · motif
· motif · 156020950–156020961 · motif
· motif · 156020950–156020961 · motif
· motif · 156020952–156020961 · motif
· motif · 156020967–156020982 · motif
· motif · 156020984–156020995 · motif
· motif · 156025008–156025023 · motif
· motif · 156025008–156025023 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：183 aa
SSR2 蛋白長 183 個胺基酸，屬於 TRAP-beta 家族。序列註解將第 1–17 位標為訊號序列，第 18–149 位為腔內區域，第 150–169 位為螺旋型跨膜區，第 170–183 位為細胞質區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SSR2 是內質網膜上的單次穿膜型第一型膜蛋白。 此來源未提供定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- STING1Q86WV6 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
SSR2 所屬的 TRAP 複合體為異四聚體，由 TRAP-alpha、TRAP-beta、TRAP-delta 與 TRAP-gamma 組成。來源另記載 SSR2 與 STING1 有交互作用，但未說明該交互作用的性質或功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRAP 蛋白是某複合體的組成部分；該複合體可在內質網膜結合鈣，並藉此調節內質網駐留蛋白的滯留。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源TRAP proteins are part of a complex whose function is to bind calcium to the ER membrane and thereby regulate the retention of ER resident proteins |
| 交互作用 | TRAP 複合體是由 TRAP-alpha、TRAP-beta、TRAP-delta 與 TRAP-gamma 組成的異四聚體；資料另記載其與 STING1 交互作用，但未提供交互作用的細節。 | 含實驗來源 | 證據與來源Heterotetramer of TRAP-alpha, TRAP-beta, TRAP-delta and TRAP-gamma. Interacts with STING1 PMID 18724357 ↗ · PMID 36697828 ↗ |
| 細胞定位 | SSR2 位於內質網膜，屬於單次穿膜型第一型膜蛋白；此定位註解未提供不同條件下的變化資訊。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
CTTTCGGATGCTGACGCTCTCTTCCTGTCTTTGTGGCTCC40GGAAAGGCGTTTGGGATGCCAACGATGAGGCTGCTGTCAT80TTGTGGTGTTGGCTCTATTTGCTGTCACTCAAGCAGAGGA120AGGAGCCAGGCTTTTGGCTTCCAAATCACTGCTGAACAGA160TACGCCGTGGAGGGACGAGACCTGACCTTGCAGTACAACA200TCTACAATGTTGGCTCAAGTGCTGCATTAGACGTGGAACT240ATCTGATGATTCCTTCCCTCCAGAAGACTTTGGCATTGTG280TCTGGAATGCTCAATGTCAAATGGGACCGGATTGCCCCTG320CTAGCAATGTCTCCCACACTGTGGTCCTGCGCCCTCTCAA360GGCTGGTTATTTCAACTTCACCTCGGCAACAATTACTTAC400CTGGCCCAGGAGGATGGGCCCGTTGTGATTGGCTCTACCA440GTGCACCTGGACAGGGAGGAATCCTGGCTCAGCGGGAGTT480TGACAGGCGATTCTCCCCTCATTTTCTGGACTGGGCAGCC520TTTGGGGTCATGACCCTTCCCTCCATCGGCATCCCCCTGC560TATTGTGGTACTCCAGCAAGAGGAAATATGACACTCCCAA600AACGAAGAAGAACTGATTGGGGCTTCCACAGCCCTCCTCT640CCCAAGAAATCCAGGCTCCTCTCCCAAGAAATCCAGGTGC680TTTCCAGACTCCAAAGGGTATCTTAAATGCAATCTCTTCT720CTCTTAGCCCTTGGCCACTTTCTCCTGGATCCTGCCCTGC760TCTCAGCCATAGTGAAGGACCAGCCCTAGGAGTCTGCGAG800AGCCTCCTTGGTTCCATCGTGAAGCCATAAACAGGAATGC840CTTTGGCAATAGCCTTGAGCCTAGAGGGCCCTCTGATGCC880CCACTGAGGTGCTGTTGGTTTATTGCTGGCAACGTGAATT920CTCTCAGGGGTCTAGGAGGGGCATTTTGGAGACTGCCTGA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。