基因總覽
signal sequence receptor subunit 1 是由 SSR1 編碼的蛋白質，屬於 TRAP-alpha 家族，也是 TRAP 複合體的組成部分。此蛋白具有單次跨膜的結構特徵：序列包含位於 N 端的訊號區段、較長的腔內區域、跨膜區段，以及位於膜另一側的細胞質區域。來源將其描述為參與內質網相關蛋白質處理複合體的亞基；其具體作用與可能參與的過程，見功能段落。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000244763 ★ | 7,281,143–7,313,199 | 8 |
| ENST00000474597 | 7,268,306–7,313,225 | 10 |
| ENST00000998331 | 7,268,306–7,313,225 | 9 |
| ENST00001018376 | 7,268,306–7,313,225 | 10 |
| ENST00000650389 | 7,268,533–7,313,225 | 10 |
| ENST00001133792 | 7,281,143–7,313,225 | 8 |
| ENST00000397511 | 7,287,570–7,313,225 | 9 |
| ENST00000916205 | 7,287,570–7,313,225 | 8 |
| ENST00000998334 | 7,287,570–7,313,225 | 7 |
| ENST00000998336 | 7,287,570–7,313,225 | 6 |
| ENST00001018377 | 7,287,570–7,313,225 | 9 |
| ENST00000998337 | 7,287,571–7,313,225 | 8 |
顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
signal sequence receptor subunit 1 是 TRAP 複合體的一部分。來源指出，TRAP 複合體具有結合鈣離子至內質網膜的功能，並藉此調節內質網駐留蛋白的保留。這描述的是複合體層級的作用，資料並未進一步說明 SSR1 單獨如何促成鈣離子結合，或如何調控駐留蛋白的保留。
來源也提出兩種可能的功能方向，但未將其描述為確定機制。其一，SSR1 可能參與轉位完成後轉位裝置的回收；其二，SSR1 可能作為膜結合型分子伴護蛋白，協助已轉位蛋白質折疊。前者涉及轉位程序完成後裝置的再利用，後者則涉及蛋白質通過轉位後的折疊過程；來源未提供兩者的相對重要性或作用條件。
因此，現有描述將 SSR1 放在內質網蛋白保留、轉位裝置回收與轉位蛋白折疊等相關脈絡中，但其中部分功能仍以「可能」表述。資料沒有明確指出這些作用是否由 SSR1 直接執行，亦未提供可據以進一步界定其機制的細節。
Promoter 與基因調控
>SSR1 ENST00000244763 GRCh38 chr6:7313099-7314199 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATTTCCTCATCTTTATGACATCTCACTCTGGTCCAGACCAAGATTACTTAATATTCAGATTAATTTCATG AACTGCTATATTACTCCAGCAACTCAAATCCAAAATAGATGAAAAGGAAACTAAAGAAAACTGGACAGCC ATTGCTGCACCTATTGTATAGTTACAAATGCTGACTACATACCAAAACACTGTTTAGGTGACTTATAATT CTGGAATGTCACATACGAATTTAAGAATTGCTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACT TTGAGAGACCCAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGATTAGTCTGGCCAACATGGTGAAAC CCCCGTCTCCAGTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTAGTGGTGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTGCTTAG GAGGCTGAGGCGGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCGGTGAACAGAGATGGTGCCACTGA ACTCTGGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTTCGTCTCAAAAATAATAATTTAAGAATTGTCATTACTTAACC ATGGGAGAGGGTGTGGGCAGACAGGGGACAAAGATTTTCCACTGTGTATTTTCATGGTTTTTCCTTTGAA CAATGTCCTCTCTTCCAACAAAATTTTTTGCTTTTAAGTGCCACATAAAGGCAGCTCATGTTCCTTACAT CGCCGTTATCAAGAGGATCGTCATTCAAATAAAGTAACCACTGACAATGCTAATTAATTGGAAGTAAAGA ACTGGGCGGAAAGAACGGCTAACCGCAAGCTGCCGGGTCGCAACTGCGGCGGAAGGCGGACTCTCGCGGG AGCCACAAAGAGGCAGCAGCCGGCCACGTGACTTCCCGGTGGCCTGCTCTCCCCACCTCTCCGCGCTGAG CAGCCACGTCGGCGGCGGTCCCTGGTCCAGGGAGGGGCGTGGCAAAGGCCCGTGCGCGGTACGTGTCCCG CCCCTCGCTGCCCGGAGCCCGGATGAAGAGTAACGCCATTACCGCCGGAGCCGCCGAGAGCCTTAGCCGA CGGAAACTGGACACTGGACCGGCAGCGCCATGAGACTCCTCCCCCGCTTGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SSR1_1 ↗ | 6:7,313,199 | 負股 | 7,313,189–7,313,248 |
| SSR1_2 ↗ | 6:7,347,503 | 負股 | 7,347,493–7,347,552 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_CPKZ · enhancer · 7311968–7313163 · regulatory
ENSR6_53PFW6 · CTCF_binding_site · 7312702–7312723 · regulatory
ENSR6_B3G74 · promoter · 7313164–7313710 · regulatory
· motif · 7312224–7312236 · motif
· motif · 7312645–7312654 · motif
· motif · 7312704–7312720 · motif
· motif · 7313164–7313181 · motif
· motif · 7313179–7313189 · motif
· motif · 7313215–7313225 · motif
· motif · 7313225–7313241 · motif
· motif · 7313225–7313241 · motif
· motif · 7313232–7313243 · motif
· motif · 7313247–7313257 · motif
· motif · 7313319–7313330 · motif
· motif · 7313319–7313335 · motif
· motif · 7313319–7313335 · motif
· motif · 7313328–7313337 · motif
· motif · 7313328–7313337 · motif
· motif · 7313395–7313410 · motif
· motif · 7313402–7313410 · motif
· motif · 7313402–7313417 · motif
· motif · 7313443–7313456 · motif
· motif · 7314173–7314188 · motif
· motif · 7317315–7317329 · motif
· motif · 7317315–7317329 · motif
· motif · 7317322–7317333 · motif
· motif · 7317729–7317742 · motif
· motif · 7317729–7317742 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：286 aa
signal sequence receptor subunit 1 長 286 個胺基酸。其 N 端第 1–18 位為訊號區段；第 19–207 位是腔內區域，第 208–228 位為螺旋形跨膜區，第 229–286 位位於細胞質側。第 39–83 位及第 261–286 位另註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
signal sequence receptor subunit 1 位於內質網膜，屬單次跨膜的第一型膜蛋白。 來源未提供定位變化的條件或異構型間差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- CANXP27824 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- SEC61BP60468 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- SERPINA1P01009 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
TRAP-alpha、TRAP-beta、TRAP-delta 與 TRAP-gamma 組成異源四聚體複合體。signal sequence receptor subunit 1 也與棕櫚醯化的 calnexin（CALX）互作；該互作對糖基化蛋白質的有效折疊為必要。來源未將此關係描述為單純的功能關聯。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | TRAP 蛋白質屬於一個複合體；該複合體可結合鈣離子至內質網膜，並藉此調節內質網駐留蛋白的保留。來源另提出兩種可能性：在轉位完成後參與轉位裝置回收，或作為膜結合型分子伴護蛋白，協助已轉位蛋白質折疊。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源TRAP proteins are part of a complex whose function is to bind calcium to the ER membrane and thereby regulate the retention of ER resident proteins. May be involved in the recycling of the translocation apparatus after completion of the translocation process or may function as a membrane-bound chaperone facilitating folding of translocated proteins |
| 交互作用 | TRAP-alpha、TRAP-beta、TRAP-delta 與 TRAP-gamma 形成異源四聚體。SSR1 與棕櫚醯化的 calnexin（CALX）互作；此互作對糖基化蛋白質的有效折疊為必要。 | 含實驗來源 | 證據與來源Heterotetramer of TRAP-alpha, TRAP-beta, TRAP-delta and TRAP-gamma. Interacts with palmitoylated calnexin (CALX), the interaction is required for efficient folding of glycosylated proteins PMID 22314232 ↗ · PMID 36697828 ↗ |
| 細胞定位 | signal sequence receptor subunit 1 位於內質網膜，並屬於單次跨膜的第一型膜蛋白。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GGATGAAGAGTAACGCCATTACCGCCGGAGCCGCCGAGAG40CCTTAGCCGACGGAAACTGGACACTGGACCGGCAGCGCCA80TGAGACTCCTCCCCCGCTTGCTGCTGCTTCTCTTACTCGT120GTTCCCTGCCACTGTCTTGTTCCGAGGCGGCCCCAGAGGC160TTGTTAGCAGTGGCACAAGATCTTACAGAGGATGAAGAAA200CAGTAGAAGATTCCATAATTGAGGATGAAGATGATGAAGC240CGAGGTAGAAGAAGATGAACCCACAGATTTGGTAGAAGAT280AAAGAGGAAGAAGATGTGTCTGGTGAACCTGAAGCTTCAC320CGAGTGCAGATACAACTATACTGTTTGTAAAAGGAGAAGA360TTTTCCAGCAAATAACATTGTGAAGTTCCTGGTAGGCTTT400ACCAACAAGGGTACAGAAGATTTTATTGTTGAATCCTTAG440ATGCCTCATTCCGTTATCCTCAGGACTACCAGTTTTATAT480CCAGAATTTCACAGCTCTTCCTCTGAACACTGTAGTGCCA520CCCCAGAGACAGGCAACTTTTGAGTACTCTTTCATTCCTG560CAGAGCCCATGGGCGGACGACCATTTGGTTTGGTCATCAA600TCTGAACTACAAAGATTTGAACGGCAATGTATTCCAAGAT640GCAGTCTTCAATCAAACAGTTACAGTTATTGAAAGAGAGG680ATGGGTTAGATGGAGAAACAATCTTTATGTATATGTTCCT720TGCTGGTCTTGGGCTTCTGGTTATTGTTGGCCTTCATCAA760CTCCTAGAATCTAGAAAGCGTAAGAGACCCATACAGAAAG800TAGAAATGGGTACATCAAGTCAGAATGATGTTGACATGAG840TTGGATTCCTCAGGAAACATTGAATCAAATCAATAAAGCT880TCACCAAGAAGGTTGCCCAGGAAACGGGCACAGAAGAGAT920CAGTGGGATCTGATGAGTAAATGTTCCTTTGTGCAACAAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。