基因總覽
SSC4D 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 scavenger receptor cysteine rich family member with 4 domains。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 7q11.23。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000275560 ★ | 76,389,337–76,409,697 | 11 |
| ENST00000938539 | 76,389,017–76,409,744 | 9 |
| ENST00000938540 | 76,389,017–76,409,744 | 10 |
| ENST00000938541 | 76,389,017–76,409,744 | 10 |
| ENST00000938542 | 76,389,017–76,409,744 | 9 |
| ENST00000938543 | 76,389,017–76,409,744 | 10 |
| ENST00000938544 | 76,389,017–76,409,744 | 6 |
| ENST00000938545 | 76,389,017–76,409,744 | 11 |
| ENST00001136828 | 76,389,017–76,409,744 | 11 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>SSC4D ENST00000275560 GRCh38 chr7:76409597-76410697 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTTTCCAAGAAATAGGAAACAGCATCATGACCAGGAGTCAGGAAATTAAGTCCTGCCGGGCCCACACTCA TGCCACCTGTTTTCCTCCCTTGGCCTCAGTCTTCCCAGCCTCACCATAAAAAGCTGGGACTGGTCCCCAA TTTGTTTGATCCTCAGGAGCTTCTCAACATTTTTTTTTTTTGGCCAGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATC CCAACACTTTGGAAGGCTGAGGCAGGAGAATCCCTTGAACTCGGGGAGACGGACGTTGCTGTGAGCTGAG ATCACACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAGAACTAC ACAAGAAGGCAAAATTAGGCTGGGTGCGGTGGCTCACACCTGTAAACCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGC AGGCGGATCCCTTGAGGTCAGGATTTCAAGGCCATCCTGGCCAACATGGAGAAACCCAGTCTCTACTAAA AATACAAAATTAGCCTGGCATGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCAGGTACTCGGGCGCTGAGGCACGAGAA TTGATTAAGCCTGGGAGGCGGAGGATGCAGGGAGCCGAAATCGTGCCATTGCACTCCAGCAGCCTGGGTG ACAGAGAGAGACTCTGTCTGAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAAAAGAAGGCAAAATCAGCAGCCCCCAAG TGAGGTTGTGAGGTCCTGTCTATGTGGGAAACCCACTCCATACACTGTGGCTCCTGGGACCATTTCCAAA CCCTCAGCTGAGATGTGGGTCGGGACATCATCAGGCGGGACTCCTGGGCTGGATCAGGGCTACCTCCAAA GATCAGGATGCTTGGCTGCCCTGCAAAGGGGTGGAGACCTATCCAGGCCTTCCTGAAACCTGAACCCTGG GGTGGGGGGGCTGTGGGGGGAGGAGGGGCTGCCTGGCCTTGAGAGTCCATGCCTCCCCCAACCACATAGC TCCGCCTCCACCTGGGTGCCCTTTTTCTGGGGCCGCTCCAGCTGGTGCCGGCCACCTCCACTCCCCTTTG CTTCTTGCTGTCCCTAAGGTCGGATGGGGACAGGCTGGGGCCACCAGCCAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SSC4D_1 ↗ | 7:76,409,689 | 負股 | 76,409,679–76,409,738 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR7_848MPH · enhancer · 76409506–76409686 · regulatory
ENSR7_935BTB · promoter · 76409687–76409971 · regulatory
在 IL1A、IL6 與 dexamethasone 合併處理的條件下，SSC4D 未被誘導。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：575 aa
SSC4D 蛋白質長 575 個胺基酸，序列起始處含有訊號序列（第 1–47 位）。其後有四個 SRCR domain，分別位於第 58–158、189–289、344–444 與 473–573 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SSC4D 被註記為分泌型蛋白質。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | Secreted | 推論支持 | |
| 調控 | 在 IL1A、IL6 與 dexamethasone 合併處理的條件下，SSC4D 未被誘導。 | 含實驗來源 | 證據與來源Not induced by a combination of IL1A/interleukin-1 alpha, IL6/interleukin-6 and dexamethasone PMID 12466895 ↗ |
核酸與蛋白質序列
CTTTTTCTGGGGCCGCTCCAGCTGGTGCCGGCCACCTCCA40CTCCCCTTTGCTTCTTGCTGTCCCTAAGGTCGGATGGGGA80CAGGCTGGGGCCACCAGCCAGCTCCATGGACAGGGACTTT120GCCTCTGCTCACCTTCCAGCTGTGGAAAGAAAAGAAGAAA160CGCCTGTGTTGATTTCCATTTGGAAGATCCTTCCTCCTCC200TAAACTTCCAGGGGCAGACAAAGTGATTCGATCTTGGATT240GACTGTAGAAGAAGGGACAGAAAGAGCCCAGAACATTCCC280CCAGATGTTCCAACTGTGACTTCTCCCTGGCGCCTTGATG320GGAGCATCTGAAACACCCTTCACCATCTAGATGCACAAGG360AAGCAGAGATGCTAATTGGTCCCCAGCTGGATGAGAAGCG400CTGGGGGTGGAGGTTGGGAGATGGGAGTGCTGCCCCTCCC440TTCCTCCCCCAAGCCCTGTCTTTCCTTCTCCTCCTGCCAC480TGGCCAGCGCCCTACAGCCCACTCCACTGCCCTTTCAAGA520GCTGAGGCTGGTGGGGGGCCCCAGCCGCTGCCGGGGCCGC560CTGGAAGTCATGCACGGTGGCTCCTGGGGCAGCGTCTGTG600ATGACGACTGGGACGTGGTGGACGCCAACGTAGTGTGTCG640CCAGCTGGGCTGTGGCCTGGCACTGCCCGTGCCACGGCCC680CTTGCCTTTGGCCAAGGCCGAGGCCCCATCCTGCTGGACA720ACGTGGAGTGCCGCGGGCAGGAAGCTGCGCTGAGCGAGTG760CGGCAGCCGCGGCTGGGGCGTCCACAATTGCTTTCACTAC800GAGGATGTGGCTGTCCTGTGTGATGAATTCTTGCCAACGC840AGCCCCCAACAAGGAAGATGTTAACCAGTAGAGCACCTCC880TACGACACTGCCGAATGGAAAAAGTGAGGGCAGCGTACGC920CTGGTAGGGGGCGCGAACCTGTGTCAGGGCCGAGTGGAGA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。