基因總覽
sex determining region Y（SRY）是位於 Y 染色體 Yp11.2 的蛋白質編碼基因，屬於 SRY family。其產物 Sex-determining region Y protein 長 204 個胺基酸，含有 HMG box，是辨識 DNA 的主要結構區域；蛋白質其餘部分也包含與核定位及多種分子互作相關的區段，末端區域則被註記為無序區。SRY 的核心角色是參與男性性別決定，此外來源也記載其涉及基因調控、pre-mRNA 剪接，以及成年男性腦部多巴胺神經元運動功能的維持；後一項功能為相似性推論。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000383070 ★ | 2,786,855–2,787,682 | 1 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SRY 是參與男性發育遺傳開關的轉錄調節因子。來源指出，它對啟動男性性別決定既必要也足夠，作用之一是引導支持細胞前驅細胞（pre-Sertoli cells）發育成 Sertoli 細胞，而非 granulosa 細胞。這項細胞命運轉換是其性別決定功能的核心；SRY 也參與基因調控，能促進或抑制啟動子活性。
在分子層次上，SRY 透過 HMG box 辨識 DNA。它可結合共識序列 5'-[AT]AACAA[AT]-3'，並以部分插入 DNA 小溝的方式與 DNA 接觸，促使 DNA 彎曲。這些 DNA 結構變化與其轉錄調控角色相符，使 SRY 能參與目標基因表現的啟動或抑制；來源並未進一步列出特定目標基因或完整下游路徑。
SRY 也被報告參與 pre-mRNA 剪接，顯示其作用不只涉及轉錄調節。來源沒有提供此剪接功能的具體作用機制或受影響的 RNA，因此不宜據此延伸至特定剪接事件。
此外，依相似性推論，SRY 在成年男性腦部可能參與維持多巴胺神經元的運動功能。這項描述帶有推論性質，與其在性別決定及基因調控中的功能證據層級不同。
Promoter 與基因調控
>SRY ENST00000383070 GRCh38 chrY:2787582-2788682 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TATTAATAGGTTCTGTGTACTATGCAACCTGTAGTTGTTACTCCTGTTTTGCAAATATGGCATTAAAACA TTGGTGAGTGGGGGGACTTTCCTCCCATTTTATTTCAGCAAAGAAATCTTGTCATTTCTCTTCAGACTTT AAGATTTATTGAGGAGAGTTATTCACTTGTTTAGTCTGGTAAACTGTGACCTTTAAATTTTGAAGGAGGT TGAACTAAAAGGTGAAATATGATAAATTGATGGCTCTATTTGTTGTGAATGGAAATTTAATTTAGACTTG TAAAAGATTGTTTTTTAAATTGCTAATTGTGTGACAGTGAAGAGAATGACTTCAAAATATCCCACTATAC AATCTGCAAAGAAAAGAATTGTGTCCCCTTTTTAGTGTAGCTTAACACTTCACTGAAACTGTTTTGAGTT CTTAGGTCATATTTTTTTTTCTCTAAACGAAACAATTACTTTTCTAAAAGTCAAATGTTAGCCATCCTAG AAGTTGGGCATAAAATACTTGTAAGTATATGCTAATATTCTGATACTTAATGCCTGTGAAAAATGTGTAT AGAATTTTCAATTTTTAAATAGAAGTGAAGAAAAAGCGATAATAATTACTATAAATTCAATATGCAGTTA TGTATGTATGTGTGTGGTTAAGACAATTAGGTTCTCATTAAGCTTTGTTTTTTTAAAGATAACATACACA TATATTGATAATGATAAACAATTCATATAGCTTTTTGTGTCCTCTCGTTTTGTGACATAAAAGGTCAATG AAAAAATTGGCGATTAAGTCAAATTCGCATTTTTCAGGACAGCAGTAGAGCAGTCAGGGAGGCAGATCAG CAGGGCAAGTAGTCAACGTTACTGAATTACCATGTTTTGCTTGAGAATGAATACATTGTCAGGGTACTAG GGGGTAGGCTGGTTGGGCGGGGTTGAGGGGGTGTTGAGGGCGGAGAAATGCAAGTTTCATTACAAAAGTT AACGTAACAAAGAATCTGGTAGAAGTGAGTTTTGGATAGTAAAATAAGTTTCGAACTCTGGCACCTTTCA ATTTTGTCGCACTCTCCTTGTTTTTGACAATGCAATCATATGCTTCTGCTA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：204 aa
Sex-determining region Y protein 長 204 個胺基酸，屬於 SRY family。其 HMG box 位於第 60–128 個胺基酸，具有 DNA 結合註解；第 59–136 個胺基酸區段足以與 KPNB1 互作，第 107–139 個胺基酸區段足以與 EP300 互作。第 61–77 與 130–136 個胺基酸區段分別被註記為核定位所需；末端第 175–204 個胺基酸為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SRY 可位於細胞核、核斑點及細胞質。 乙醯化有助於其核定位；HDAC3 使其去乙醯化後，SRY 會轉移至細胞質。 XPO4 可促進其核輸入。 來源亦記載它與 SOX6 在核斑點共定位，並與 CAML、ZNF208 isoform KRAB-O 及 tyrosine hydroxylase 在細胞核共定位；其中部分共定位資料為相似性推論。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- NHERF2Q15599 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
SRY 與 CALM、EP300、HDAC3、KPNB1、ZNF208 isoform KRAB-O、PARP1、SLC9A3R2 及 WT1 有互作記載。EP300 互作會調節 SRY 的 DNA 結合活性；PARP1 互作則會削弱該活性。SRY 與 KPNB1 的互作可被 GTP 結合型 Ran 解離。來源未將這些關係描述為同一複合體。
疾病與遺傳關聯
SRY 變異與 46,XY sex reversal 1 有關，患者具有正常 46,XY 核型，但發生男性轉女性性別逆轉；其性腺可能早期退化並形成主要由纖維組織構成的條索狀性腺，且青春期不會出現第二性徵。SRY 相關變異也與 46,XX sex reversal 1 有關，此狀況為遺傳女性發育出男性性腺。另有涉及 SRY 的 45,X 染色體異常見於 Turner syndrome；資料描述其表現型為女性，並可伴隨性腺發育不全及其他變異特徵。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SRY 是調節轉錄並控制男性發育遺傳開關的因子，對啟動男性性別決定既必要也足夠，可引導支持細胞前驅細胞發育成 Sertoli 細胞而非 granulosa 細胞。它參與啟動子活化或抑制，HMG box 可辨識特定 DNA 共識序列，透過部分插入小溝促使 DNA 彎曲。SRY 也參與 pre-mRNA 剪接；成年男性腦部維持多巴胺神經元運動功能則屬相似性推論。 | 含實驗來源 | 證據與來源Transcriptional regulator that controls a genetic switch in male development. It is necessary and sufficient for initiating male sex determination by directing the development of supporting cell precursors (pre-Sertoli cells) as Sertoli rather than granulosa cells. Involved in different aspects of gene regulation including promoter activation or repression. Binds to the DNA consensus sequence 5'-[AT]AACAA[AT]-3'. SRY HMG box recognizes DNA by partial intercalation in the minor groove and promotes DNA bending. Also involved in pre-mRNA splicing. In male adult brain involved in the maintenance of motor functions of dopaminergic neurons (By similarity) PMID 11563911 ↗ · PMID 11818535 ↗ · PMID 1425584 ↗ · PMID 15170344 ↗ · PMID 16762365 ↗ · PMID 8159753 ↗ · PMID 8265659 ↗ · PMID 9525897 ↗ · PMID 16414182 ↗ · PMID 16996051 ↗ |
| 交互作用 | SRY 與 CALM、EP300、HDAC3、KPNB1、ZNF208 isoform KRAB-O、PARP1、SLC9A3R2 及 WT1 有互作。EP300 互作會調節 SRY 的 DNA 結合活性，PARP1 互作會削弱其 DNA 結合活性；SRY 與 KPNB1 的互作可被 GTP 結合型 Ran 解離。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with CALM, EP300, HDAC3, KPNB1, ZNF208 isoform KRAB-O, PARP1, SLC9A3R2 and WT1. The interaction with EP300 modulates its DNA-binding activity. The interaction with KPNB1 is sensitive to dissociation by Ran in the GTP-bound form. Interaction with PARP1 impaired its DNA-binding activity PMID 12871148 ↗ · PMID 12970737 ↗ · PMID 15297880 ↗ · PMID 15469996 ↗ · PMID 15746192 ↗ · PMID 16904257 ↗ · PMID 9054412 ↗ |
| 細胞定位 | SRY 位於細胞核、核斑點及細胞質。乙醯化有助於核定位，HDAC3 去乙醯化則促使其轉移到細胞質；XPO4 可促進核輸入。SRY 與 SOX6 在核斑點共定位，並與 CAML、ZNF208 isoform KRAB-O 及 tyrosine hydroxylase 在細胞核共定位，其中 ZNF208 isoform KRAB-O 與 tyrosine hydroxylase 的共定位為相似性推論。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus speckle; Cytoplasm; Nucleus; Acetylation contributes to its nuclear localization and deacetylation by HDAC3 induces a cytoplasmic delocalization. Colocalizes with SOX6 in speckles. Colocalizes with CAML in the nucleus. Colocalizes in the nucleus with ZNF208 isoform KRAB-O and tyrosine hydroxylase (TH) (By similarity). Nuclear import is facilitated by XPO4, a protein that usually acts as a nuclear export signal receptor PMID 11818535 ↗ · PMID 15297880 ↗ · PMID 19349578 ↗ · PMID 15746192 ↗ · PMID 16762365 ↗ · PMID 28030592 ↗ |
| 疾病關聯 | 46,XY sex reversal 1 是男性轉女性性別逆轉，患者具有正常 46,XY 核型。患者性腺會快速且早期退化，成年時呈條索狀，主要由纖維組織及不同比例的卵巢基質構成；患者青春期不發育第二性徵，外生殖器為女性，苗勒氏結構正常。此病由影響 SRY 的變異造成。 | 含實驗來源 | 證據與來源46,XY sex reversal 1 SRXY1 A condition characterized by male-to-female sex reversal in the presence of a normal 46,XY karyotype. Patients manifest rapid and early degeneration of their gonads, which are present in the adult as 'streak gonads', consisting mainly of fibrous tissue and variable amounts of ovarian stroma. As a result these patients do not develop secondary sexual characteristics at puberty. The external genitalia in these subjects are completely female, and Muellerian structures are normal. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 400044 PMID 10670762 ↗ · PMID 10721678 ↗ · PMID 10843173 ↗ · PMID 10852465 ↗ · PMID 11563911 ↗ · PMID 12107262 ↗ · PMID 12793612 ↗ · PMID 1339396 ↗ · PMID 1415266 ↗ · PMID 1483689 ↗ · PMID 1570829 ↗ · PMID 16762365 ↗ · PMID 17063144 ↗ · PMID 2247149 ↗ · PMID 28030592 ↗ · PMID 7717397 ↗ · PMID 7776083 ↗ · PMID 7985018 ↗ · PMID 8019555 ↗ · PMID 8105086 ↗ · PMID 8353496 ↗ · PMID 8447323 ↗ · PMID 9450909 ↗ · PMID 9521592 ↗ · PMID 9678356 ↗ |
| 疾病關聯 | 涉及 SRY 的 45,X 染色體異常見於 Turner syndrome。該疾病的表現型為女性，特徵包括性腺發育不全、身材矮小及條索狀性腺；也可能出現頸部蹼狀、肘外翻、心臟缺陷及後髮線較低等不同異常。 | 含實驗來源 | 證據與來源A 45,X chromosomal aberration involving SRY is found in Turner syndrome, a disease characterized by gonadal dysgenesis with short stature, 'streak gonads', variable abnormalities such as webbing of the neck, cubitus valgus, cardiac defects, low posterior hair line. The phenotype is female PMID 10843173 ↗ |
| 疾病關聯 | 46,XX sex reversal 1 是遺傳女性發育出男性性腺的狀況，也就是女性轉男性性別逆轉。此病由影響 SRY 的變異造成。 | 含實驗來源 | 證據與來源46,XX sex reversal 1 SRXX1 A condition in which male gonads develop in a genetic female (female to male sex reversal). The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 400045 PMID 10602113 ↗ · PMID 9652903 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGAAGTGAGTTTTGGATAGTAAAATAAGTTTCGAACTCTG40GCACCTTTCAATTTTGTCGCACTCTCCTTGTTTTTGACAA80TGCAATCATATGCTTCTGCTATGTTAAGCGTATTCAACAG120CGATGATTACAGTCCAGCTGTGCAAGAGAATATTCCCGCT160CTCCGGAGAAGCTCTTCCTTCCTTTGCACTGAAAGCTGTA200ACTCTAAGTATCAGTGTGAAACGGGAGAAAACAGTAAAGG240CAACGTCCAGGATAGAGTGAAGCGACCCATGAACGCATTC280ATCGTGTGGTCTCGCGATCAGAGGCGCAAGATGGCTCTAG320AGAATCCCAGAATGCGAAACTCAGAGATCAGCAAGCAGCT360GGGATACCAGTGGAAAATGCTTACTGAAGCCGAAAAATGG400CCATTCTTCCAGGAGGCACAGAAATTACAGGCCATGCACA440GAGAGAAATACCCGAATTATAAGTATCGACCTCGTCGGAA480GGCGAAGATGCTGCCGAAGAATTGCAGTTTGCTTCCCGCA520GATCCCGCTTCGGTACTCTGCAGCGAAGTGCAACTGGACA560ACAGGTTGTACAGGGATGACTGTACGAAAGCCACACACTC600AAGAATGGAGCACCAGCTAGGCCACTTACCGCCCATCAAC640GCAGCCAGCTCACCGCAGCAACGGGACCGCTACAGCCACT680GGACAAAGCTGTAGGACAATCGGGTAACATTGGCTACAAA720GACCTACCTAGATGCTCCTTTTTACGATAACTTACAGCCC760TCACTTTCTTATGTTTAGTTTCAATATTGTTTTCTTTTCT800CTGGCTAATAAAGGCCTTATTCATTTCA828cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。